MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020564	CAT	2	6	734387	734392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218476
13502	NC_020564	TCA	2	6	734520	734525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218477
13503	NC_020564	T	6	6	734552	734557	0 %	100 %	0 %	0 %	470218477
13504	NC_020564	TAAT	2	8	734584	734591	50 %	50 %	0 %	0 %	470218477
13505	NC_020564	AAAG	2	8	734646	734653	75 %	0 %	25 %	0 %	470218477
13506	NC_020564	ATATC	2	10	734675	734684	40 %	40 %	0 %	20 %	470218477
13507	NC_020564	AGC	2	6	734727	734732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218477
13508	NC_020564	TC	3	6	734774	734779	0 %	50 %	0 %	50 %	470218477
13509	NC_020564	ACA	2	6	734788	734793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218477
13510	NC_020564	CGT	2	6	734808	734813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218477
13511	NC_020564	TAACA	2	10	734934	734943	60 %	20 %	0 %	20 %	470218477
13512	NC_020564	AAT	2	6	734983	734988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218477
13513	NC_020564	ATG	2	6	734995	735000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218477
13514	NC_020564	ACA	2	6	736091	736096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218478
13515	NC_020564	CAT	2	6	736146	736151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218478
13516	NC_020564	AAATG	2	10	736158	736167	60 %	20 %	20 %	0 %	470218478
13517	NC_020564	TAA	2	6	736169	736174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218478
13518	NC_020564	TTA	2	6	736210	736215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218478
13519	NC_020564	CAG	2	6	736220	736225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218478
13520	NC_020564	ACA	2	6	736256	736261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218478
13521	NC_020564	ACC	2	6	736266	736271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218478
13522	NC_020564	ATG	2	6	736273	736278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218478
13523	NC_020564	AT	4	8	736309	736316	50 %	50 %	0 %	0 %	470218478
13524	NC_020564	ACA	2	6	736360	736365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218478
13525	NC_020564	T	6	6	736419	736424	0 %	100 %	0 %	0 %	470218478
13526	NC_020564	GTA	2	6	736439	736444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218478
13527	NC_020564	TAA	2	6	736481	736486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218478
13528	NC_020564	AAC	2	6	736540	736545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218478
13529	NC_020564	TA	3	6	736580	736585	50 %	50 %	0 %	0 %	470218478
13530	NC_020564	ACG	2	6	736606	736611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218478
13531	NC_020564	ATTA	2	8	736620	736627	50 %	50 %	0 %	0 %	470218478
13532	NC_020564	AT	4	8	736628	736635	50 %	50 %	0 %	0 %	470218478
13533	NC_020564	ATG	2	6	736642	736647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218478
13534	NC_020564	T	6	6	736751	736756	0 %	100 %	0 %	0 %	470218479
13535	NC_020564	CCA	2	6	736831	736836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218479
13536	NC_020564	AAC	2	6	736854	736859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218479
13537	NC_020564	GGT	2	6	736936	736941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218479
13538	NC_020564	TCG	2	6	736971	736976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218479
13539	NC_020564	ACT	2	6	736983	736988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218479
13540	NC_020564	T	6	6	737037	737042	0 %	100 %	0 %	0 %	470218479
13541	NC_020564	TGG	2	6	737066	737071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218479
13542	NC_020564	ATC	2	6	737090	737095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218479
13543	NC_020564	AACT	2	8	737174	737181	50 %	25 %	0 %	25 %	470218479
13544	NC_020564	TAAT	2	8	737194	737201	50 %	50 %	0 %	0 %	470218479
13545	NC_020564	ACC	2	6	737210	737215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218479
13546	NC_020564	TAAA	2	8	737233	737240	75 %	25 %	0 %	0 %	470218479
13547	NC_020564	CCA	2	6	737244	737249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218479
13548	NC_020564	TCA	2	6	737262	737267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218479
13549	NC_020564	TTC	2	6	737273	737278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218479
13550	NC_020564	CAC	2	6	737948	737953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218480
13551	NC_020564	TCA	2	6	738022	738027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218480
13552	NC_020564	ATGA	2	8	738072	738079	50 %	25 %	25 %	0 %	470218480
13553	NC_020564	TAA	2	6	738182	738187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218480
13554	NC_020564	ATT	2	6	738282	738287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218480
13555	NC_020564	TGT	2	6	738304	738309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218480
13556	NC_020564	ATA	2	6	738335	738340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218480
13557	NC_020564	CTT	2	6	738449	738454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218480
13558	NC_020564	T	7	7	738462	738468	0 %	100 %	0 %	0 %	470218480
13559	NC_020564	TGT	2	6	738483	738488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218480
13560	NC_020564	ACC	2	6	738498	738503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218480
13561	NC_020564	ATT	2	6	738528	738533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218480
13562	NC_020564	ATA	2	6	738915	738920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218481
13563	NC_020564	GTT	2	6	738983	738988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218481
13564	NC_020564	CTG	2	6	739001	739006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218481
13565	NC_020564	AGA	2	6	739009	739014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218481
13566	NC_020564	GAT	2	6	739070	739075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218481
13567	NC_020564	TGAA	2	8	739086	739093	50 %	25 %	25 %	0 %	470218481
13568	NC_020564	TGG	2	6	739168	739173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218481
13569	NC_020564	ATC	2	6	739191	739196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218481
13570	NC_020564	TAC	2	6	739210	739215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218481
13571	NC_020564	TCAT	2	8	739282	739289	25 %	50 %	0 %	25 %	470218481
13572	NC_020564	A	6	6	739336	739341	100 %	0 %	0 %	0 %	470218481
13573	NC_020564	ATT	2	6	739352	739357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218481
13574	NC_020564	ATC	2	6	739401	739406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218481
13575	NC_020564	ATT	2	6	739447	739452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218481
13576	NC_020564	AGGT	2	8	739461	739468	25 %	25 %	50 %	0 %	470218481
13577	NC_020564	GAATA	2	10	739480	739489	60 %	20 %	20 %	0 %	470218481
13578	NC_020564	GCA	2	6	739616	739621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218482
13579	NC_020564	CATT	2	8	739695	739702	25 %	50 %	0 %	25 %	470218482
13580	NC_020564	GAT	2	6	739710	739715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218482
13581	NC_020564	CTT	2	6	739780	739785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218482
13582	NC_020564	CAT	2	6	739797	739802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218482
13583	NC_020564	TCT	2	6	739818	739823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218482
13584	NC_020564	ATG	2	6	739830	739835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218482
13585	NC_020564	CAA	2	6	739854	739859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218482
13586	NC_020564	TTG	2	6	739864	739869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218482
13587	NC_020564	GC	3	6	739899	739904	0 %	0 %	50 %	50 %	470218482
13588	NC_020564	TAT	2	6	739920	739925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218482
13589	NC_020564	TTA	2	6	739983	739988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218482
13590	NC_020564	TGA	2	6	739994	739999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218482
13591	NC_020564	ATT	2	6	740027	740032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218482
13592	NC_020564	T	6	6	740031	740036	0 %	100 %	0 %	0 %	470218482
13593	NC_020564	TAT	2	6	740133	740138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218482
13594	NC_020564	CTT	2	6	740152	740157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218482
13595	NC_020564	TTG	2	6	740185	740190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218482
13596	NC_020564	T	6	6	740253	740258	0 %	100 %	0 %	0 %	470218482
13597	NC_020564	AT	3	6	740399	740404	50 %	50 %	0 %	0 %	470218482
13598	NC_020564	TA	3	6	740432	740437	50 %	50 %	0 %	0 %	470218482
13599	NC_020564	GAT	2	6	740472	740477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218482
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13601	NC_020564	AT	3	6	740662	740667	50 %	50 %	0 %	0 %	470218483
13602	NC_020564	ACTT	2	8	740674	740681	25 %	50 %	0 %	25 %	470218483
13603	NC_020564	TTC	2	6	740704	740709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218483
13604	NC_020564	TGA	2	6	740731	740736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218483
13605	NC_020564	CATG	2	8	740738	740745	25 %	25 %	25 %	25 %	470218483
13606	NC_020564	AAC	2	6	740767	740772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218483
13607	NC_020564	AGT	2	6	740861	740866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218483
13608	NC_020564	AGT	2	6	740896	740901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218483
13609	NC_020564	A	6	6	740917	740922	100 %	0 %	0 %	0 %	470218483
13610	NC_020564	CA	3	6	740949	740954	50 %	0 %	0 %	50 %	470218483
13611	NC_020564	AC	3	6	741051	741056	50 %	0 %	0 %	50 %	470218483
13612	NC_020564	GAT	2	6	741068	741073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218483
13613	NC_020564	ATGC	2	8	741085	741092	25 %	25 %	25 %	25 %	470218483
13614	NC_020564	ATT	2	6	741096	741101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218483
13615	NC_020564	ATAG	2	8	741104	741111	50 %	25 %	25 %	0 %	470218483
13616	NC_020564	TTG	2	6	741120	741125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218483
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13618	NC_020564	AT	3	6	741601	741606	50 %	50 %	0 %	0 %	470218484
13619	NC_020564	AAG	2	6	741644	741649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218484
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