MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020564	AATT	2	8	594726	594733	50 %	50 %	0 %	0 %	470218365
11003	NC_020564	TGC	2	6	594847	594852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218365
11004	NC_020564	TA	3	6	594905	594910	50 %	50 %	0 %	0 %	470218365
11005	NC_020564	TG	3	6	594953	594958	0 %	50 %	50 %	0 %	470218365
11006	NC_020564	CTA	2	6	594974	594979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218365
11007	NC_020564	AAAT	2	8	595041	595048	75 %	25 %	0 %	0 %	470218365
11008	NC_020564	GTT	2	6	595064	595069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218365
11009	NC_020564	ATT	2	6	595098	595103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218365
11010	NC_020564	TTGT	2	8	595113	595120	0 %	75 %	25 %	0 %	470218365
11011	NC_020564	AAT	2	6	595134	595139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218365
11012	NC_020564	T	6	6	595139	595144	0 %	100 %	0 %	0 %	470218365
11013	NC_020564	TGTT	2	8	595227	595234	0 %	75 %	25 %	0 %	470218365
11014	NC_020564	CAA	2	6	595241	595246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218365
11015	NC_020564	CTA	2	6	595252	595257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218365
11016	NC_020564	CAT	2	6	595277	595282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218365
11017	NC_020564	AT	3	6	595392	595397	50 %	50 %	0 %	0 %	470218365
11018	NC_020564	TCA	2	6	595444	595449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218365
11019	NC_020564	CTT	2	6	595499	595504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218365
11020	NC_020564	GAA	2	6	595506	595511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218365
11021	NC_020564	CATA	2	8	595514	595521	50 %	25 %	0 %	25 %	470218365
11022	NC_020564	TA	3	6	595562	595567	50 %	50 %	0 %	0 %	470218365
11023	NC_020564	TAAA	2	8	595619	595626	75 %	25 %	0 %	0 %	470218365
11024	NC_020564	TAA	2	6	595637	595642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218365
11025	NC_020564	AAT	2	6	595691	595696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218365
11026	NC_020564	CCAAAC	2	12	596073	596084	50 %	0 %	0 %	50 %	470218366
11027	NC_020564	AT	3	6	596155	596160	50 %	50 %	0 %	0 %	470218366
11028	NC_020564	A	7	7	596191	596197	100 %	0 %	0 %	0 %	470218366
11029	NC_020564	TTG	2	6	596245	596250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218366
11030	NC_020564	TTACT	2	10	596304	596313	20 %	60 %	0 %	20 %	470218366
11031	NC_020564	AAC	2	6	596352	596357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218366
11032	NC_020564	TTG	2	6	596406	596411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218366
11033	NC_020564	AGA	2	6	596455	596460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218366
11034	NC_020564	CTA	2	6	596463	596468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218366
11035	NC_020564	AGA	2	6	596494	596499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218366
11036	NC_020564	TC	3	6	596508	596513	0 %	50 %	0 %	50 %	470218366
11037	NC_020564	ATG	2	6	596667	596672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218366
11038	NC_020564	CGATT	2	10	596726	596735	20 %	40 %	20 %	20 %	470218366
11039	NC_020564	A	6	6	596737	596742	100 %	0 %	0 %	0 %	470218366
11040	NC_020564	ACA	2	6	596746	596751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218366
11041	NC_020564	ATT	2	6	596794	596799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218366
11042	NC_020564	TAT	2	6	596824	596829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218366
11043	NC_020564	TAA	2	6	596872	596877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
11044	NC_020564	ATGA	2	8	596894	596901	50 %	25 %	25 %	0 %	470218366
11045	NC_020564	TAA	2	6	596908	596913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
11046	NC_020564	A	6	6	596912	596917	100 %	0 %	0 %	0 %	470218366
11047	NC_020564	TAC	2	6	597069	597074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218366
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11050	NC_020564	TAA	2	6	597256	597261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
11051	NC_020564	TAA	3	9	597280	597288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
11052	NC_020564	CAA	2	6	597331	597336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218366
11053	NC_020564	ATG	2	6	597353	597358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218366
11054	NC_020564	A	7	7	597381	597387	100 %	0 %	0 %	0 %	470218366
11055	NC_020564	AAT	2	6	597404	597409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
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11057	NC_020564	TAA	3	9	597422	597430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218366
11058	NC_020564	ATT	2	6	597501	597506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218367
11059	NC_020564	CAT	2	6	597531	597536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218367
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11061	NC_020564	TCA	2	6	597755	597760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218367
11062	NC_020564	AT	3	6	597782	597787	50 %	50 %	0 %	0 %	470218367
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11064	NC_020564	GTTG	2	8	597810	597817	0 %	50 %	50 %	0 %	470218367
11065	NC_020564	TTG	2	6	598158	598163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218367
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11069	NC_020564	TAG	3	9	598293	598301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218367
11070	NC_020564	T	7	7	598380	598386	0 %	100 %	0 %	0 %	470218367
11071	NC_020564	TGT	2	6	598442	598447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218368
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11074	NC_020564	CTG	2	6	598665	598670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218368
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11081	NC_020564	TAAAT	2	10	599075	599084	60 %	40 %	0 %	0 %	470218368
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11086	NC_020564	TGG	2	6	599817	599822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218369
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11089	NC_020564	TAT	2	6	599953	599958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218369
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11091	NC_020564	GAT	2	6	600031	600036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218369
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11093	NC_020564	GAT	2	6	600229	600234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218369
11094	NC_020564	AAGC	2	8	600241	600248	50 %	0 %	25 %	25 %	470218369
11095	NC_020564	TTC	2	6	600272	600277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218369
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11100	NC_020564	GATT	2	8	600463	600470	25 %	50 %	25 %	0 %	470218369
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11104	NC_020564	ACA	2	6	600690	600695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218370
11105	NC_020564	AGA	2	6	600805	600810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218370
11106	NC_020564	AGC	2	6	600823	600828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218370
11107	NC_020564	GAA	2	6	600833	600838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218370
11108	NC_020564	ATA	2	6	600849	600854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218370
11109	NC_020564	AC	3	6	600943	600948	50 %	0 %	0 %	50 %	470218370
11110	NC_020564	TTA	2	6	601011	601016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218370
11111	NC_020564	A	6	6	601016	601021	100 %	0 %	0 %	0 %	470218370
11112	NC_020564	TTG	2	6	601098	601103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218370
11113	NC_020564	GAT	2	6	601124	601129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218370
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11115	NC_020564	AATT	2	8	601201	601208	50 %	50 %	0 %	0 %	470218371
11116	NC_020564	TAC	2	6	601276	601281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218371
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11118	NC_020564	TGT	2	6	601376	601381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218371
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11121	NC_020564	ATTA	2	8	601505	601512	50 %	50 %	0 %	0 %	470218371
11122	NC_020564	ATG	2	6	601582	601587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218371
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11241	NC_020564	ATG	2	6	607029	607034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218375
11242	NC_020564	TTA	2	6	607050	607055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218375
11243	NC_020564	TAT	2	6	607098	607103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218375
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11350	NC_020564	ATC	2	6	615181	615186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218381
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11352	NC_020564	TTC	2	6	615274	615279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218381
11353	NC_020564	ACG	2	6	615313	615318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218381
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11359	NC_020564	TGA	2	6	615607	615612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218381
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11478	NC_020564	CTT	2	6	622190	622195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218387
11479	NC_020564	TGG	2	6	622221	622226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218387
11480	NC_020564	ATC	2	6	622314	622319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218387
11481	NC_020564	AT	3	6	622325	622330	50 %	50 %	0 %	0 %	470218387
11482	NC_020564	GCA	2	6	622363	622368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218387
11483	NC_020564	TGT	2	6	622530	622535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218387
11484	NC_020564	ATG	2	6	622536	622541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218387
11485	NC_020564	ATGCA	2	10	622578	622587	40 %	20 %	20 %	20 %	470218387
11486	NC_020564	CAC	2	6	622658	622663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218387
11487	NC_020564	TAC	2	6	622682	622687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218387
11488	NC_020564	TAA	2	6	622773	622778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218387
11489	NC_020564	TAA	2	6	622853	622858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218387
11490	NC_020564	CGA	2	6	622883	622888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218387
11491	NC_020564	TAA	2	6	622905	622910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218387
11492	NC_020564	TGT	2	6	622961	622966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218387
11493	NC_020564	TAA	2	6	622977	622982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218387
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11499	NC_020564	T	6	6	623280	623285	0 %	100 %	0 %	0 %	470218387
11500	NC_020564	TAA	2	6	623298	623303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218387

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