MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_020564	CAT	2	6	448858	448863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8502	NC_020564	AT	3	6	448862	448867	50 %	50 %	0 %	0 %	470218274
8503	NC_020564	ATGTTG	2	12	448879	448890	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218274
8504	NC_020564	CTA	2	6	448899	448904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8505	NC_020564	ATCAT	2	10	448934	448943	40 %	40 %	0 %	20 %	470218274
8506	NC_020564	ATG	2	6	448948	448953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8507	NC_020564	AAT	2	6	448973	448978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218274
8508	NC_020564	CATG	2	8	449100	449107	25 %	25 %	25 %	25 %	470218274
8509	NC_020564	TGT	2	6	449287	449292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218274
8510	NC_020564	AAC	2	6	449320	449325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218274
8511	NC_020564	ATT	2	6	449338	449343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218274
8512	NC_020564	TGA	2	6	449381	449386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8513	NC_020564	AGTC	2	8	449392	449399	25 %	25 %	25 %	25 %	470218274
8514	NC_020564	CAT	2	6	449449	449454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8515	NC_020564	TAC	2	6	449460	449465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8516	NC_020564	TAC	2	6	449488	449493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8517	NC_020564	GCA	2	6	449532	449537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218274
8518	NC_020564	A	6	6	449611	449616	100 %	0 %	0 %	0 %	470218274
8519	NC_020564	GGCG	2	8	449639	449646	0 %	0 %	75 %	25 %	470218274
8520	NC_020564	AC	3	6	449719	449724	50 %	0 %	0 %	50 %	470218274
8521	NC_020564	TGA	2	6	449732	449737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8522	NC_020564	ATA	2	6	449740	449745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218274
8523	NC_020564	GTTC	2	8	449802	449809	0 %	50 %	25 %	25 %	470218274
8524	NC_020564	AGC	2	6	449834	449839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218274
8525	NC_020564	CCG	2	6	449943	449948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470218274
8526	NC_020564	ACA	2	6	449999	450004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218274
8527	NC_020564	TGA	2	6	450043	450048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8528	NC_020564	AAT	2	6	450051	450056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218274
8529	NC_020564	CG	3	6	450144	450149	0 %	0 %	50 %	50 %	470218274
8530	NC_020564	A	6	6	450157	450162	100 %	0 %	0 %	0 %	470218274
8531	NC_020564	GAGCAA	2	12	450252	450263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218274
8532	NC_020564	CGTT	2	8	450319	450326	0 %	50 %	25 %	25 %	470218274
8533	NC_020564	AAT	2	6	450357	450362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218274
8534	NC_020564	CAT	2	6	450366	450371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8535	NC_020564	TGG	2	6	450395	450400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218274
8536	NC_020564	TTA	2	6	450426	450431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218274
8537	NC_020564	GAT	2	6	450434	450439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8538	NC_020564	GT	3	6	450481	450486	0 %	50 %	50 %	0 %	470218274
8539	NC_020564	GCA	2	6	450513	450518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218274
8540	NC_020564	CAT	2	6	450522	450527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8541	NC_020564	GAT	2	6	450620	450625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218274
8542	NC_020564	ATC	2	6	450682	450687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8543	NC_020564	GAA	2	6	450693	450698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218274
8544	NC_020564	CAT	2	6	450760	450765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8545	NC_020564	GAC	2	6	450775	450780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218274
8546	NC_020564	TAAAGA	2	12	450842	450853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218274
8547	NC_020564	CAT	2	6	450872	450877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218274
8548	NC_020564	CGTCA	2	10	450977	450986	20 %	20 %	20 %	40 %	470218274
8549	NC_020564	GCT	2	6	451053	451058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218274
8550	NC_020564	TGT	2	6	451118	451123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218274
8551	NC_020564	AAT	2	6	451140	451145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218274
8552	NC_020564	TG	3	6	451998	452003	0 %	50 %	50 %	0 %	470218275
8553	NC_020564	A	6	6	452034	452039	100 %	0 %	0 %	0 %	470218275
8554	NC_020564	TTG	2	6	452056	452061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218275
8555	NC_020564	ATA	2	6	452116	452121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218275
8556	NC_020564	GATG	2	8	452151	452158	25 %	25 %	50 %	0 %	470218275
8557	NC_020564	CTAA	2	8	452175	452182	50 %	25 %	0 %	25 %	470218275
8558	NC_020564	TA	3	6	452198	452203	50 %	50 %	0 %	0 %	470218275
8559	NC_020564	TAA	2	6	452244	452249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218275
8560	NC_020564	AAAATG	2	12	452403	452414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218276
8561	NC_020564	GAG	2	6	452422	452427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218276
8562	NC_020564	GAT	2	6	452435	452440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218276
8563	NC_020564	A	6	6	452445	452450	100 %	0 %	0 %	0 %	470218276
8564	NC_020564	ATT	2	6	452584	452589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218276
8565	NC_020564	ATT	2	6	452629	452634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218276
8566	NC_020564	TTA	2	6	452710	452715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218276
8567	NC_020564	GGTTT	2	10	452732	452741	0 %	60 %	40 %	0 %	470218276
8568	NC_020564	TCA	2	6	452764	452769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218276
8569	NC_020564	ATTA	2	8	452777	452784	50 %	50 %	0 %	0 %	470218276
8570	NC_020564	ATT	2	6	452873	452878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218276
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8572	NC_020564	TGC	2	6	452912	452917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218276
8573	NC_020564	ATT	2	6	452975	452980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218276
8574	NC_020564	GGC	2	6	453024	453029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218276
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8578	NC_020564	CATT	2	8	453213	453220	25 %	50 %	0 %	25 %	470218277
8579	NC_020564	GTT	2	6	453280	453285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218277
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8581	NC_020564	TGG	2	6	453351	453356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218277
8582	NC_020564	GAA	2	6	453357	453362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218277
8583	NC_020564	GT	3	6	453421	453426	0 %	50 %	50 %	0 %	470218277
8584	NC_020564	GCA	2	6	453458	453463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218277
8585	NC_020564	TGTCA	2	10	453485	453494	20 %	40 %	20 %	20 %	470218277
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8591	NC_020564	TGA	2	6	453611	453616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218277
8592	NC_020564	TGA	2	6	453653	453658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218277
8593	NC_020564	TTA	2	6	453679	453684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218277
8594	NC_020564	AT	3	6	453697	453702	50 %	50 %	0 %	0 %	470218277
8595	NC_020564	TGG	2	6	453707	453712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218277
8596	NC_020564	TTTA	2	8	453747	453754	25 %	75 %	0 %	0 %	470218277
8597	NC_020564	CAT	2	6	453804	453809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218277
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8602	NC_020564	ATTT	2	8	454291	454298	25 %	75 %	0 %	0 %	470218278
8603	NC_020564	AT	3	6	454348	454353	50 %	50 %	0 %	0 %	470218278
8604	NC_020564	GGC	2	6	454367	454372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218278
8605	NC_020564	TTG	2	6	454410	454415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218278
8606	NC_020564	GGAC	2	8	454457	454464	25 %	0 %	50 %	25 %	470218278
8607	NC_020564	ACA	2	6	454469	454474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218278
8608	NC_020564	AT	3	6	454478	454483	50 %	50 %	0 %	0 %	470218278
8609	NC_020564	A	6	6	454499	454504	100 %	0 %	0 %	0 %	470218278
8610	NC_020564	TTTAT	2	10	454544	454553	20 %	80 %	0 %	0 %	470218278
8611	NC_020564	GGT	2	6	454574	454579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218278
8612	NC_020564	TAT	2	6	454605	454610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218278
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8617	NC_020564	ATTT	2	8	454858	454865	25 %	75 %	0 %	0 %	470218278
8618	NC_020564	CTG	2	6	454890	454895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218278
8619	NC_020564	TCA	2	6	455000	455005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218278
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