MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020561	GC	3	6	495968	495973	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13002	NC_020561	CCA	2	6	496060	496065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212423
13003	NC_020561	CGA	2	6	496070	496075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212423
13004	NC_020561	GCT	2	6	496085	496090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212423
13005	NC_020561	CGA	2	6	496103	496108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212423
13006	NC_020561	CG	3	6	496113	496118	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13007	NC_020561	CCG	2	6	496144	496149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212423
13008	NC_020561	TGG	2	6	496192	496197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212423
13009	NC_020561	CCG	3	9	496207	496215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212423
13010	NC_020561	CG	3	6	496214	496219	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13011	NC_020561	GGCC	2	8	496256	496263	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13012	NC_020561	CGG	2	6	496274	496279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212423
13013	NC_020561	CGA	2	6	496280	496285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212423
13014	NC_020561	CCGG	2	8	496288	496295	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13015	NC_020561	CGGC	2	8	496308	496315	0 %	0 %	50 %	50 %	470212423
13016	NC_020561	GGC	2	6	496322	496327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212423
13017	NC_020561	CGC	2	6	496363	496368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13018	NC_020561	CCG	2	6	496404	496409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13019	NC_020561	ATG	2	6	496424	496429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212424
13020	NC_020561	GCC	2	6	496447	496452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13021	NC_020561	GAT	2	6	496453	496458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212424
13022	NC_020561	CCA	2	6	496479	496484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212424
13023	NC_020561	C	6	6	496492	496497	0 %	0 %	0 %	100 %	470212424
13024	NC_020561	CCA	2	6	496524	496529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212424
13025	NC_020561	CCGA	2	8	496562	496569	25 %	0 %	25 %	50 %	470212424
13026	NC_020561	GC	3	6	496590	496595	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13027	NC_020561	TCG	2	6	496616	496621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13028	NC_020561	CCCGGC	2	12	496631	496642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13029	NC_020561	CCGCG	2	10	496650	496659	0 %	0 %	40 %	60 %	470212424
13030	NC_020561	CGC	4	12	496762	496773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13031	NC_020561	ATCGG	2	10	496775	496784	20 %	20 %	40 %	20 %	470212424
13032	NC_020561	CAC	2	6	496822	496827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212424
13033	NC_020561	ATT	2	6	496873	496878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212424
13034	NC_020561	AT	3	6	496997	497002	50 %	50 %	0 %	0 %	470212424
13035	NC_020561	CACCGC	2	12	497077	497088	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470212424
13036	NC_020561	GAT	2	6	497091	497096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212424
13037	NC_020561	GCA	2	6	497130	497135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13038	NC_020561	GCC	2	6	497162	497167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13039	NC_020561	CAG	2	6	497188	497193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13040	NC_020561	GCG	2	6	497196	497201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212424
13041	NC_020561	GC	3	6	497256	497261	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13042	NC_020561	GC	3	6	497288	497293	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13043	NC_020561	GC	3	6	497322	497327	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13044	NC_020561	CCG	2	6	497347	497352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13045	NC_020561	CG	4	8	497355	497362	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13046	NC_020561	GGC	2	6	497374	497379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212424
13047	NC_020561	GCT	2	6	497383	497388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13048	NC_020561	CGC	2	6	497393	497398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13049	NC_020561	GCCG	2	8	497485	497492	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13050	NC_020561	GC	4	8	497501	497508	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13051	NC_020561	CGGC	2	8	497527	497534	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13052	NC_020561	GTC	2	6	497566	497571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13053	NC_020561	CCG	2	6	497596	497601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13054	NC_020561	GCA	2	6	497610	497615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13055	NC_020561	GCCG	2	8	497641	497648	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13056	NC_020561	CGGC	2	8	497667	497674	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13057	NC_020561	CGA	2	6	497704	497709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13058	NC_020561	C	6	6	497714	497719	0 %	0 %	0 %	100 %	470212424
13059	NC_020561	CCCG	2	8	497724	497731	0 %	0 %	25 %	75 %	470212424
13060	NC_020561	CG	3	6	497730	497735	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13061	NC_020561	CAT	2	6	497806	497811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212424
13062	NC_020561	GCA	2	6	497817	497822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13063	NC_020561	GCCC	2	8	497823	497830	0 %	0 %	25 %	75 %	470212424
13064	NC_020561	GC	3	6	497832	497837	0 %	0 %	50 %	50 %	470212424
13065	NC_020561	CGCC	3	12	497858	497869	0 %	0 %	25 %	75 %	470212424
13066	NC_020561	CAG	2	6	497875	497880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212424
13067	NC_020561	CCG	3	9	497936	497944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212424
13068	NC_020561	GGC	2	6	497981	497986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212425
13069	NC_020561	GCCG	2	8	498035	498042	0 %	0 %	50 %	50 %	470212425
13070	NC_020561	GCC	2	6	498057	498062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212425
13071	NC_020561	CCGG	2	8	498067	498074	0 %	0 %	50 %	50 %	470212425
13072	NC_020561	GAT	2	6	498086	498091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212425
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13074	NC_020561	GCCGC	2	10	498175	498184	0 %	0 %	40 %	60 %	470212425
13075	NC_020561	GAA	2	6	498218	498223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212425
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13077	NC_020561	GCA	2	6	498316	498321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212425
13078	NC_020561	GCCCA	2	10	498323	498332	20 %	0 %	20 %	60 %	470212425
13079	NC_020561	CGA	2	6	498337	498342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212425
13080	NC_020561	CAG	2	6	498377	498382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212425
13081	NC_020561	GTG	2	6	498399	498404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212425
13082	NC_020561	GCA	2	6	498451	498456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212425
13083	NC_020561	GC	4	8	498520	498527	0 %	0 %	50 %	50 %	470212425
13084	NC_020561	CTT	3	9	498650	498658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212425
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13086	NC_020561	CG	3	6	498714	498719	0 %	0 %	50 %	50 %	470212425
13087	NC_020561	GAT	2	6	498806	498811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212425
13088	NC_020561	TTG	2	6	498849	498854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212425
13089	NC_020561	CAGCC	2	10	498855	498864	20 %	0 %	20 %	60 %	470212425
13090	NC_020561	GGCCAT	2	12	498986	498997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212426
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13092	NC_020561	TGC	2	6	499090	499095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212426
13093	NC_020561	GAT	2	6	499097	499102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212426
13094	NC_020561	TCA	2	6	499141	499146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212426
13095	NC_020561	GCA	2	6	499150	499155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212426
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13099	NC_020561	CG	3	6	499449	499454	0 %	0 %	50 %	50 %	470212426
13100	NC_020561	GAAG	2	8	499625	499632	50 %	0 %	50 %	0 %	470212426
13101	NC_020561	CGC	3	9	499763	499771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212426
13102	NC_020561	GGC	2	6	499809	499814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212426
13103	NC_020561	GCC	2	6	499851	499856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212426
13104	NC_020561	GCGCG	2	10	499862	499871	0 %	0 %	60 %	40 %	470212426
13105	NC_020561	CTGG	2	8	499877	499884	0 %	25 %	50 %	25 %	470212426
13106	NC_020561	GCC	2	6	499916	499921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212426
13107	NC_020561	ATC	2	6	499941	499946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212426
13108	NC_020561	TGG	2	6	499950	499955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212426
13109	NC_020561	CG	3	6	499975	499980	0 %	0 %	50 %	50 %	470212426
13110	NC_020561	GCT	2	6	499985	499990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212426
13111	NC_020561	TCT	2	6	499993	499998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212426
13112	NC_020561	TCGA	2	8	500019	500026	25 %	25 %	25 %	25 %	470212426
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13114	NC_020561	CAC	2	6	500120	500125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212426
13115	NC_020561	CGATC	2	10	500132	500141	20 %	20 %	20 %	40 %	470212426
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13118	NC_020561	CG	3	6	500234	500239	0 %	0 %	50 %	50 %	470212426
13119	NC_020561	GCC	2	6	500277	500282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212426
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13121	NC_020561	CCG	2	6	500426	500431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212427
13122	NC_020561	CGA	2	6	500487	500492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212427
13123	NC_020561	CCG	2	6	500517	500522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212427
13124	NC_020561	GAC	2	6	500551	500556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212427
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13128	NC_020561	GCT	2	6	500777	500782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212428
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13130	NC_020561	GCT	2	6	500822	500827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212428
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13137	NC_020561	CCGG	2	8	500965	500972	0 %	0 %	50 %	50 %	470212428
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13149	NC_020561	GCCCT	2	10	501330	501339	0 %	20 %	20 %	60 %	470212428
13150	NC_020561	CAGC	2	8	501348	501355	25 %	0 %	25 %	50 %	470212428
13151	NC_020561	CGGG	2	8	501466	501473	0 %	0 %	75 %	25 %	470212428
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13156	NC_020561	CGA	2	6	501587	501592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212428
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13200	NC_020561	GTC	3	9	503444	503452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212429
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13223	NC_020561	GCCC	2	8	503950	503957	0 %	0 %	25 %	75 %	470212429
13224	NC_020561	CCA	2	6	503959	503964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212429
13225	NC_020561	GC	3	6	503975	503980	0 %	0 %	50 %	50 %	470212429
13226	NC_020561	CAG	2	6	504005	504010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212429
13227	NC_020561	CG	3	6	504012	504017	0 %	0 %	50 %	50 %	470212429
13228	NC_020561	CCGCC	2	10	504038	504047	0 %	0 %	20 %	80 %	470212429
13229	NC_020561	C	6	6	504096	504101	0 %	0 %	0 %	100 %	470212429
13230	NC_020561	TCG	2	6	504174	504179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212429
13231	NC_020561	CG	3	6	504224	504229	0 %	0 %	50 %	50 %	470212429
13232	NC_020561	GAT	2	6	504230	504235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212429
13233	NC_020561	CCG	2	6	504294	504299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212429
13234	NC_020561	GCG	2	6	504306	504311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212429
13235	NC_020561	CGC	2	6	504316	504321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212429
13236	NC_020561	CGC	2	6	504341	504346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212429
13237	NC_020561	CGA	2	6	504349	504354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212429
13238	NC_020561	GCCG	2	8	504383	504390	0 %	0 %	50 %	50 %	470212429
13239	NC_020561	AGC	2	6	504417	504422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212429
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13241	NC_020561	GGCCC	2	10	504429	504438	0 %	0 %	40 %	60 %	470212429
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13362	NC_020561	TCC	2	6	508527	508532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212435
13363	NC_020561	CGG	2	6	508602	508607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212435
13364	NC_020561	AGC	2	6	508608	508613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212435
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13367	NC_020561	GAT	2	6	508691	508696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212435
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13369	NC_020561	GCTCG	2	10	508730	508739	0 %	20 %	40 %	40 %	470212435
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13373	NC_020561	GCCA	2	8	508863	508870	25 %	0 %	25 %	50 %	470212435
13374	NC_020561	CGCCAG	2	12	508901	508912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212435
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13381	NC_020561	CGC	2	6	509033	509038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212435
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13443	NC_020561	GC	4	8	511457	511464	0 %	0 %	50 %	50 %	470212438
13444	NC_020561	GCA	2	6	511542	511547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212438
13445	NC_020561	GCATC	2	10	511578	511587	20 %	20 %	20 %	40 %	470212438
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13454	NC_020561	CGG	2	6	511815	511820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212438
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13461	NC_020561	GCCG	2	8	512044	512051	0 %	0 %	50 %	50 %	470212438
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13464	NC_020561	GTC	2	6	512098	512103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212438
13465	NC_020561	GGT	2	6	512128	512133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212438
13466	NC_020561	GCG	2	6	512140	512145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212438
13467	NC_020561	GCGCC	2	10	512148	512157	0 %	0 %	40 %	60 %	470212438
13468	NC_020561	CGC	4	12	512202	512213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212438
13469	NC_020561	GGCA	2	8	512281	512288	25 %	0 %	50 %	25 %	470212438
13470	NC_020561	CGG	2	6	512298	512303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212438
13471	NC_020561	GGCCT	2	10	512338	512347	0 %	20 %	40 %	40 %	470212438
13472	NC_020561	TCA	2	6	512397	512402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212438
13473	NC_020561	GGC	2	6	512431	512436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212439
13474	NC_020561	GGC	2	6	512475	512480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212439
13475	NC_020561	AGC	2	6	512503	512508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212439
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13477	NC_020561	TCGA	2	8	512530	512537	25 %	25 %	25 %	25 %	470212439
13478	NC_020561	CGC	2	6	512556	512561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
13479	NC_020561	CGC	2	6	512564	512569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
13480	NC_020561	GCC	2	6	512586	512591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
13481	NC_020561	CGC	2	6	512595	512600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
13482	NC_020561	GCC	2	6	512608	512613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
13483	NC_020561	CGG	2	6	512708	512713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212439
13484	NC_020561	CGA	3	9	512798	512806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212439
13485	NC_020561	CG	3	6	512813	512818	0 %	0 %	50 %	50 %	470212439
13486	NC_020561	GCA	2	6	512870	512875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212439
13487	NC_020561	TGG	2	6	512972	512977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212439
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13489	NC_020561	TCG	2	6	513019	513024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212439
13490	NC_020561	GCG	2	6	513038	513043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212439
13491	NC_020561	CCAGCG	2	12	513059	513070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212439
13492	NC_020561	GCC	2	6	513073	513078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212439
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13494	NC_020561	GTC	2	6	513156	513161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212439
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13499	NC_020561	GC	3	6	513298	513303	0 %	0 %	50 %	50 %	470212439
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