MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020561	CCT	2	6	381370	381375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212309
10002	NC_020561	GCCAGC	2	12	381453	381464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212309
10003	NC_020561	CGC	2	6	381469	381474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10004	NC_020561	GATC	2	8	381487	381494	25 %	25 %	25 %	25 %	470212309
10005	NC_020561	GGC	2	6	381511	381516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10006	NC_020561	CAG	2	6	381548	381553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10007	NC_020561	TGC	2	6	381583	381588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10008	NC_020561	TGG	2	6	381613	381618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212309
10009	NC_020561	GC	3	6	381630	381635	0 %	0 %	50 %	50 %	470212309
10010	NC_020561	CGT	2	6	381670	381675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10011	NC_020561	GCC	2	6	381681	381686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10012	NC_020561	ATC	2	6	381744	381749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212309
10013	NC_020561	CCGT	2	8	381751	381758	0 %	25 %	25 %	50 %	470212309
10014	NC_020561	GGC	2	6	381770	381775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10015	NC_020561	CGGC	2	8	381823	381830	0 %	0 %	50 %	50 %	470212309
10016	NC_020561	CTC	2	6	381833	381838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212309
10017	NC_020561	CG	3	6	381844	381849	0 %	0 %	50 %	50 %	470212309
10018	NC_020561	CGG	2	6	381877	381882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10019	NC_020561	GCG	2	6	381893	381898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10020	NC_020561	CGC	2	6	381915	381920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10021	NC_020561	ACC	2	6	381925	381930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212309
10022	NC_020561	GCA	2	6	381940	381945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10023	NC_020561	GCG	3	9	382009	382017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10024	NC_020561	GAC	2	6	382022	382027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10025	NC_020561	CG	3	6	382040	382045	0 %	0 %	50 %	50 %	470212309
10026	NC_020561	GCC	2	6	382053	382058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10027	NC_020561	GAA	2	6	382070	382075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212309
10028	NC_020561	CGC	2	6	382084	382089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10029	NC_020561	GAAG	2	8	382136	382143	50 %	0 %	50 %	0 %	470212309
10030	NC_020561	GAA	2	6	382160	382165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212309
10031	NC_020561	CCGG	2	8	382183	382190	0 %	0 %	50 %	50 %	470212309
10032	NC_020561	GCG	2	6	382262	382267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212309
10033	NC_020561	CGC	2	6	382297	382302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10034	NC_020561	CCGC	2	8	382314	382321	0 %	0 %	25 %	75 %	470212309
10035	NC_020561	ACG	2	6	382377	382382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212309
10036	NC_020561	GCC	2	6	382410	382415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212309
10037	NC_020561	CCAGCA	2	12	382423	382434	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470212309
10038	NC_020561	CCA	2	6	382488	382493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212310
10039	NC_020561	CGGAT	2	10	382532	382541	20 %	20 %	40 %	20 %	470212310
10040	NC_020561	CTT	2	6	382555	382560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212310
10041	NC_020561	GGC	2	6	382566	382571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212310
10042	NC_020561	GCG	2	6	382707	382712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212310
10043	NC_020561	CGG	2	6	382714	382719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212310
10044	NC_020561	CGA	2	6	382746	382751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212310
10045	NC_020561	CCGC	2	8	382809	382816	0 %	0 %	25 %	75 %	470212310
10046	NC_020561	CGC	3	9	382814	382822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212310
10047	NC_020561	GAT	2	6	382903	382908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212310
10048	NC_020561	CGGT	2	8	382910	382917	0 %	25 %	50 %	25 %	470212310
10049	NC_020561	GCC	2	6	382954	382959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212310
10050	NC_020561	TCC	2	6	382994	382999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212310
10051	NC_020561	CAT	2	6	383005	383010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212310
10052	NC_020561	ACG	2	6	383021	383026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212310
10053	NC_020561	GGC	2	6	383074	383079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212310
10054	NC_020561	CCA	2	6	383118	383123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212310
10055	NC_020561	CGA	3	9	383148	383156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212310
10056	NC_020561	CGGC	2	8	383219	383226	0 %	0 %	50 %	50 %	470212311
10057	NC_020561	TGG	2	6	383234	383239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212311
10058	NC_020561	CCG	2	6	383240	383245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212311
10059	NC_020561	GC	3	6	383282	383287	0 %	0 %	50 %	50 %	470212311
10060	NC_020561	GCT	2	6	383318	383323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212311
10061	NC_020561	GCC	2	6	383326	383331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212311
10062	NC_020561	CCG	2	6	383375	383380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212311
10063	NC_020561	TGA	2	6	383402	383407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212311
10064	NC_020561	GCG	2	6	383429	383434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212311
10065	NC_020561	CTT	3	9	383454	383462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212311
10066	NC_020561	CG	3	6	383497	383502	0 %	0 %	50 %	50 %	470212311
10067	NC_020561	GAT	2	6	383556	383561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212311
10068	NC_020561	GAA	2	6	383592	383597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212311
10069	NC_020561	ATCGGC	2	12	383601	383612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212311
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10071	NC_020561	CCGTCC	2	12	383644	383655	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470212311
10072	NC_020561	CCGGC	2	10	383693	383702	0 %	0 %	40 %	60 %	470212311
10073	NC_020561	CAT	2	6	383829	383834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212312
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10076	NC_020561	CCG	2	6	383911	383916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212312
10077	NC_020561	AAAGGC	2	12	383918	383929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470212312
10078	NC_020561	GCGCCA	2	12	383977	383988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212312
10079	NC_020561	GAT	2	6	384017	384022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212312
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10082	NC_020561	CCA	2	6	384052	384057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212312
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10085	NC_020561	ATG	2	6	384153	384158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212312
10086	NC_020561	GCC	2	6	384164	384169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212312
10087	NC_020561	CAG	2	6	384173	384178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10088	NC_020561	CCG	2	6	384184	384189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212312
10089	NC_020561	CAG	2	6	384200	384205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10090	NC_020561	GTG	2	6	384222	384227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212312
10091	NC_020561	CCG	2	6	384299	384304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212312
10092	NC_020561	GCA	2	6	384310	384315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
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10100	NC_020561	CAC	2	6	384563	384568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212312
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10102	NC_020561	CGG	2	6	384610	384615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212312
10103	NC_020561	CTG	2	6	384647	384652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10104	NC_020561	TCG	2	6	384666	384671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10105	NC_020561	GTG	2	6	384687	384692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212312
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10107	NC_020561	CCGC	2	8	384748	384755	0 %	0 %	25 %	75 %	470212312
10108	NC_020561	GGC	2	6	384807	384812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212312
10109	NC_020561	CGC	3	9	384820	384828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212312
10110	NC_020561	GGCCG	2	10	384844	384853	0 %	0 %	60 %	40 %	470212312
10111	NC_020561	ACG	2	6	384936	384941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10112	NC_020561	AGGA	2	8	384975	384982	50 %	0 %	50 %	0 %	470212312
10113	NC_020561	GCA	2	6	384985	384990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
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10116	NC_020561	CAG	2	6	385034	385039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212312
10117	NC_020561	ATG	2	6	385110	385115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212312
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10119	NC_020561	CG	3	6	385271	385276	0 %	0 %	50 %	50 %	470212313
10120	NC_020561	TCG	2	6	385298	385303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212313
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10123	NC_020561	GCT	3	9	385353	385361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212313
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10226	NC_020561	GATC	2	8	388608	388615	25 %	25 %	25 %	25 %	470212315
10227	NC_020561	GGCGCC	2	12	388667	388678	0 %	0 %	50 %	50 %	470212315
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10231	NC_020561	CGG	2	6	388958	388963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212316
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10233	NC_020561	CGGC	2	8	388981	388988	0 %	0 %	50 %	50 %	470212316
10234	NC_020561	GCA	2	6	389005	389010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212316
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10237	NC_020561	GC	4	8	389134	389141	0 %	0 %	50 %	50 %	470212316
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10346	NC_020561	GCC	2	6	393014	393019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212321
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10348	NC_020561	CTT	2	6	393059	393064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212321
10349	NC_020561	CTCG	2	8	393101	393108	0 %	25 %	25 %	50 %	470212321
10350	NC_020561	AGA	2	6	393163	393168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212321
10351	NC_020561	GCC	2	6	393188	393193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212321
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10354	NC_020561	ATCGC	2	10	393243	393252	20 %	20 %	20 %	40 %	470212321
10355	NC_020561	GGC	2	6	393259	393264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212321
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10357	NC_020561	GCG	2	6	393403	393408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212321
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10359	NC_020561	CAC	3	9	393503	393511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212321
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10478	NC_020561	GAA	2	6	398433	398438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212328
10479	NC_020561	GCG	2	6	398542	398547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
10480	NC_020561	CAC	2	6	398549	398554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212329
10481	NC_020561	GCT	2	6	398567	398572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212329
10482	NC_020561	CGC	2	6	398623	398628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
10483	NC_020561	CGC	2	6	398654	398659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
10484	NC_020561	CGCC	2	8	398695	398702	0 %	0 %	25 %	75 %	470212329
10485	NC_020561	CGCC	2	8	398743	398750	0 %	0 %	25 %	75 %	470212329
10486	NC_020561	GCG	2	6	398758	398763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
10487	NC_020561	CGC	2	6	398777	398782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
10488	NC_020561	CG	3	6	398812	398817	0 %	0 %	50 %	50 %	470212329
10489	NC_020561	CAGC	2	8	398822	398829	25 %	0 %	25 %	50 %	470212329
10490	NC_020561	GCC	2	6	398840	398845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
10491	NC_020561	GCG	4	12	398850	398861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
10492	NC_020561	GCC	2	6	398890	398895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
10493	NC_020561	CGG	2	6	398932	398937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
10494	NC_020561	GCGAA	2	10	398983	398992	40 %	0 %	40 %	20 %	470212329
10495	NC_020561	CG	4	8	399032	399039	0 %	0 %	50 %	50 %	470212329
10496	NC_020561	CAG	2	6	399053	399058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212329
10497	NC_020561	CAG	2	6	399104	399109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212329
10498	NC_020561	GGC	2	6	399134	399139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
10499	NC_020561	ACC	2	6	399207	399212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212329
10500	NC_020561	CCA	2	6	399277	399282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212329

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