MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_020561	CCTTCG	2	12	309996	310007	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212250
8003	NC_020561	CGG	2	6	310026	310031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8004	NC_020561	CGG	2	6	310036	310041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8005	NC_020561	CGG	2	6	310069	310074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8006	NC_020561	GGC	2	6	310079	310084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8007	NC_020561	CGG	2	6	310093	310098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8008	NC_020561	CGC	2	6	310102	310107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8009	NC_020561	CGGGC	2	10	310117	310126	0 %	0 %	60 %	40 %	470212250
8010	NC_020561	TGC	2	6	310131	310136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212250
8011	NC_020561	CAT	2	6	310153	310158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212250
8012	NC_020561	CGG	2	6	310171	310176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8013	NC_020561	GCC	2	6	310202	310207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8014	NC_020561	GGC	2	6	310229	310234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8015	NC_020561	GGC	2	6	310256	310261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8016	NC_020561	CCG	2	6	310290	310295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8017	NC_020561	CGG	3	9	310312	310320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8018	NC_020561	CGGC	2	8	310338	310345	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8019	NC_020561	CGG	2	6	310348	310353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8020	NC_020561	CGG	2	6	310363	310368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8021	NC_020561	CGG	2	6	310390	310395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8022	NC_020561	GGC	2	6	310439	310444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8023	NC_020561	GGC	2	6	310448	310453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8024	NC_020561	CGG	2	6	310486	310491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8025	NC_020561	CACCGG	2	12	310492	310503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212250
8026	NC_020561	CGC	2	6	310540	310545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8027	NC_020561	GGC	2	6	310577	310582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8028	NC_020561	GCG	2	6	310623	310628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8029	NC_020561	GGC	2	6	310637	310642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8030	NC_020561	CCG	2	6	310680	310685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8031	NC_020561	CG	3	6	310762	310767	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8032	NC_020561	CGC	2	6	310771	310776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8033	NC_020561	GGC	2	6	310781	310786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8034	NC_020561	TCGGG	2	10	310797	310806	0 %	20 %	60 %	20 %	470212250
8035	NC_020561	CGG	2	6	310867	310872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8036	NC_020561	CGAT	2	8	310905	310912	25 %	25 %	25 %	25 %	470212250
8037	NC_020561	TCC	2	6	310953	310958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212250
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8039	NC_020561	CTTCGC	2	12	310996	311007	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212250
8040	NC_020561	GCA	2	6	311034	311039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212250
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8042	NC_020561	GCG	2	6	311103	311108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8043	NC_020561	GCC	3	9	311123	311131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8044	NC_020561	CGG	2	6	311164	311169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8045	NC_020561	GCG	3	9	311184	311192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
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8049	NC_020561	GCG	2	6	311298	311303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8050	NC_020561	GTC	2	6	311306	311311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212250
8051	NC_020561	CGC	2	6	311314	311319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8052	NC_020561	CGG	2	6	311344	311349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8053	NC_020561	GTC	2	6	311360	311365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212250
8054	NC_020561	CCG	2	6	311400	311405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212250
8055	NC_020561	CG	3	6	311423	311428	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8056	NC_020561	CGG	2	6	311449	311454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8057	NC_020561	GC	4	8	311539	311546	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8058	NC_020561	ATCGCC	2	12	311555	311566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212250
8059	NC_020561	CGGC	2	8	311595	311602	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8060	NC_020561	GGC	3	9	311600	311608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
8061	NC_020561	CGG	2	6	311619	311624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212250
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8063	NC_020561	GC	3	6	311734	311739	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
8064	NC_020561	CGATAT	2	12	311749	311760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470212250
8065	NC_020561	GCA	2	6	311763	311768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212250
8066	NC_020561	GATC	2	8	311805	311812	25 %	25 %	25 %	25 %	470212250
8067	NC_020561	TCG	2	6	311838	311843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212250
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8069	NC_020561	GCCACG	2	12	311888	311899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212250
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8073	NC_020561	CGAT	2	8	312072	312079	25 %	25 %	25 %	25 %	470212250
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8079	NC_020561	GGCC	2	8	312346	312353	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
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8085	NC_020561	TCG	2	6	312483	312488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212250
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8092	NC_020561	GCCG	2	8	312704	312711	0 %	0 %	50 %	50 %	470212250
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8105	NC_020561	ACC	2	6	313070	313075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212250
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8110	NC_020561	CG	3	6	313449	313454	0 %	0 %	50 %	50 %	470212251
8111	NC_020561	CGAT	2	8	313473	313480	25 %	25 %	25 %	25 %	470212251
8112	NC_020561	GC	3	6	313546	313551	0 %	0 %	50 %	50 %	470212251
8113	NC_020561	CCAC	2	8	313605	313612	25 %	0 %	0 %	75 %	470212251
8114	NC_020561	TCA	2	6	313614	313619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212251
8115	NC_020561	CACCT	2	10	313637	313646	20 %	20 %	0 %	60 %	470212251
8116	NC_020561	CGA	2	6	313663	313668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212251
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8119	NC_020561	GCC	2	6	313908	313913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212251
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8121	NC_020561	GCA	2	6	314013	314018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212251
8122	NC_020561	GC	3	6	314055	314060	0 %	0 %	50 %	50 %	470212251
8123	NC_020561	TGA	2	6	314085	314090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212251
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8125	NC_020561	CCG	2	6	314196	314201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212251
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8130	NC_020561	GCT	2	6	314416	314421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212251
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8144	NC_020561	GGA	2	6	314767	314772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212251
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8230	NC_020561	GCG	2	6	317997	318002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8231	NC_020561	GCT	2	6	318007	318012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212254
8232	NC_020561	GGCGGA	3	18	318026	318043	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470212254
8233	NC_020561	GGC	3	9	318062	318070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8234	NC_020561	GCC	2	6	318128	318133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8235	NC_020561	CG	3	6	318155	318160	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8236	NC_020561	GGA	2	6	318163	318168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212254
8237	NC_020561	CCGC	2	8	318174	318181	0 %	0 %	25 %	75 %	470212254
8238	NC_020561	CGG	2	6	318189	318194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8239	NC_020561	GC	3	6	318249	318254	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8240	NC_020561	CGCC	2	8	318276	318283	0 %	0 %	25 %	75 %	470212254
8241	NC_020561	CGC	2	6	318346	318351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8242	NC_020561	GTC	2	6	318388	318393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212254
8243	NC_020561	CAC	2	6	318409	318414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212254
8244	NC_020561	GCCA	2	8	318422	318429	25 %	0 %	25 %	50 %	470212254
8245	NC_020561	GCA	3	9	318436	318444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212254
8246	NC_020561	CCCG	2	8	318448	318455	0 %	0 %	25 %	75 %	470212254
8247	NC_020561	CAGC	2	8	318505	318512	25 %	0 %	25 %	50 %	470212254
8248	NC_020561	CGC	2	6	318529	318534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8249	NC_020561	CGG	2	6	318555	318560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8250	NC_020561	CGC	2	6	318585	318590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8251	NC_020561	CGC	2	6	318598	318603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8252	NC_020561	GGC	2	6	318611	318616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8253	NC_020561	GTG	3	9	318638	318646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212254
8254	NC_020561	GGC	2	6	318647	318652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8255	NC_020561	TGGACG	2	12	318699	318710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470212254
8256	NC_020561	GGCC	2	8	318736	318743	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8257	NC_020561	GCCG	2	8	318757	318764	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8258	NC_020561	ATCGC	2	10	318780	318789	20 %	20 %	20 %	40 %	470212254
8259	NC_020561	CCG	3	9	318825	318833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8260	NC_020561	CCG	2	6	318852	318857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
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8262	NC_020561	CGC	2	6	318880	318885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
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8264	NC_020561	TCC	2	6	318998	319003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212254
8265	NC_020561	GCA	2	6	319005	319010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212254
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8269	NC_020561	GCT	2	6	319126	319131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212254
8270	NC_020561	TGA	2	6	319149	319154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212254
8271	NC_020561	CG	3	6	319155	319160	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8272	NC_020561	CCG	2	6	319174	319179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8273	NC_020561	CG	3	6	319193	319198	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8274	NC_020561	GC	3	6	319298	319303	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8275	NC_020561	CCG	2	6	319305	319310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212254
8276	NC_020561	CTT	2	6	319312	319317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212254
8277	NC_020561	CGG	2	6	319359	319364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8278	NC_020561	CG	5	10	319385	319394	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8279	NC_020561	CTT	2	6	319396	319401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212254
8280	NC_020561	TCA	3	9	319566	319574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212254
8281	NC_020561	ACGCC	2	10	319625	319634	20 %	0 %	20 %	60 %	470212254
8282	NC_020561	ACGCC	2	10	319653	319662	20 %	0 %	20 %	60 %	470212254
8283	NC_020561	CGG	2	6	319723	319728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8284	NC_020561	TGG	2	6	319734	319739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212254
8285	NC_020561	GAC	2	6	319775	319780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212254
8286	NC_020561	GC	3	6	319797	319802	0 %	0 %	50 %	50 %	470212254
8287	NC_020561	CGG	2	6	319822	319827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212254
8288	NC_020561	CCCG	2	8	319844	319851	0 %	0 %	25 %	75 %	470212254
8289	NC_020561	GCC	2	6	320032	320037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212255
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8291	NC_020561	GCC	4	12	320115	320126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212255
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8293	NC_020561	CCGC	2	8	320182	320189	0 %	0 %	25 %	75 %	470212255
8294	NC_020561	CCG	2	6	320192	320197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212255
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8302	NC_020561	CGG	2	6	320545	320550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
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8309	NC_020561	TTTCGA	2	12	320752	320763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470212255
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8311	NC_020561	TTC	2	6	320843	320848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212255
8312	NC_020561	GGC	2	6	320895	320900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
8313	NC_020561	CGT	2	6	320932	320937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212255
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8315	NC_020561	CCAG	2	8	321009	321016	25 %	0 %	25 %	50 %	470212255
8316	NC_020561	GCTCG	2	10	321094	321103	0 %	20 %	40 %	40 %	470212255
8317	NC_020561	TCCG	2	8	321105	321112	0 %	25 %	25 %	50 %	470212255
8318	NC_020561	ACG	2	6	321120	321125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212255
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8320	NC_020561	GC	3	6	321192	321197	0 %	0 %	50 %	50 %	470212255
8321	NC_020561	CTT	2	6	321217	321222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212255
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8323	NC_020561	CGGCGA	2	12	321322	321333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470212255
8324	NC_020561	CGG	3	9	321436	321444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
8325	NC_020561	CG	3	6	321446	321451	0 %	0 %	50 %	50 %	470212255
8326	NC_020561	CTC	2	6	321493	321498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212255
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8328	NC_020561	TGC	2	6	321540	321545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212255
8329	NC_020561	CGG	2	6	321553	321558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
8330	NC_020561	CCA	2	6	321591	321596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212255
8331	NC_020561	GCA	2	6	321654	321659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212255
8332	NC_020561	ATT	2	6	321681	321686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212255
8333	NC_020561	GGC	2	6	321691	321696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
8334	NC_020561	GGC	2	6	321702	321707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212255
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8337	NC_020561	CGA	2	6	321799	321804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212255
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8339	NC_020561	CGC	2	6	321888	321893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8340	NC_020561	GCT	2	6	321894	321899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
8341	NC_020561	GGCG	2	8	321909	321916	0 %	0 %	75 %	25 %	470212256
8342	NC_020561	TCG	2	6	321919	321924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
8343	NC_020561	CG	3	6	321950	321955	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
8344	NC_020561	CCG	2	6	321986	321991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8345	NC_020561	GGCGGA	2	12	322002	322013	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470212256
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8347	NC_020561	GTG	2	6	322084	322089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212256
8348	NC_020561	GC	3	6	322138	322143	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
8349	NC_020561	CGC	2	6	322170	322175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8350	NC_020561	GCT	2	6	322257	322262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
8351	NC_020561	AT	3	6	322281	322286	50 %	50 %	0 %	0 %	470212256
8352	NC_020561	ATCC	2	8	322298	322305	25 %	25 %	0 %	50 %	470212256
8353	NC_020561	CG	4	8	322317	322324	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
8354	NC_020561	GCG	2	6	322331	322336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
8355	NC_020561	ATC	2	6	322351	322356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212256
8356	NC_020561	GCC	2	6	322360	322365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8357	NC_020561	G	7	7	322400	322406	0 %	0 %	100 %	0 %	470212256
8358	NC_020561	CGC	2	6	322407	322412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8359	NC_020561	TAA	2	6	322416	322421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212256
8360	NC_020561	CCCG	2	8	322506	322513	0 %	0 %	25 %	75 %	470212256
8361	NC_020561	GC	3	6	322544	322549	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
8362	NC_020561	GCC	2	6	322587	322592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
8363	NC_020561	GCG	2	6	322619	322624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
8364	NC_020561	GGA	2	6	322692	322697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
8365	NC_020561	CCAAT	2	10	322719	322728	40 %	20 %	0 %	40 %	470212256
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8487	NC_020561	ATG	2	6	327875	327880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212260
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