MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020561	CG	4	8	273528	273535	0 %	0 %	50 %	50 %	470212221
7002	NC_020561	CGAT	2	8	273542	273549	25 %	25 %	25 %	25 %	470212221
7003	NC_020561	GC	5	10	273636	273645	0 %	0 %	50 %	50 %	470212221
7004	NC_020561	TCG	2	6	273713	273718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212221
7005	NC_020561	GGA	2	6	273729	273734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212221
7006	NC_020561	ATG	2	6	273845	273850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212222
7007	NC_020561	GCC	2	6	273864	273869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212222
7008	NC_020561	ATCGT	2	10	273921	273930	20 %	40 %	20 %	20 %	470212222
7009	NC_020561	TGGC	2	8	273965	273972	0 %	25 %	50 %	25 %	470212222
7010	NC_020561	CTGG	2	8	274054	274061	0 %	25 %	50 %	25 %	470212222
7011	NC_020561	GGGCG	2	10	274075	274084	0 %	0 %	80 %	20 %	470212222
7012	NC_020561	GAT	2	6	274109	274114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212222
7013	NC_020561	GTC	2	6	274130	274135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212222
7014	NC_020561	GGCT	2	8	274136	274143	0 %	25 %	50 %	25 %	470212222
7015	NC_020561	GC	3	6	274145	274150	0 %	0 %	50 %	50 %	470212222
7016	NC_020561	GGC	2	6	274154	274159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7017	NC_020561	TCA	2	6	274167	274172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212222
7018	NC_020561	CGG	2	6	274242	274247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7019	NC_020561	GAC	2	6	274264	274269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212222
7020	NC_020561	CTCGC	2	10	274310	274319	0 %	20 %	20 %	60 %	470212222
7021	NC_020561	CG	3	6	274325	274330	0 %	0 %	50 %	50 %	470212222
7022	NC_020561	GTG	2	6	274343	274348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212222
7023	NC_020561	CGAT	2	8	274359	274366	25 %	25 %	25 %	25 %	470212222
7024	NC_020561	CGG	2	6	274374	274379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7025	NC_020561	CGG	2	6	274443	274448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7026	NC_020561	CGATC	2	10	274477	274486	20 %	20 %	20 %	40 %	470212222
7027	NC_020561	GGC	2	6	274540	274545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7028	NC_020561	GCG	2	6	274557	274562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212222
7029	NC_020561	GCGCC	2	10	274575	274584	0 %	0 %	40 %	60 %	470212222
7030	NC_020561	GCCC	2	8	274593	274600	0 %	0 %	25 %	75 %	470212223
7031	NC_020561	GC	4	8	274652	274659	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7032	NC_020561	GGA	2	6	274707	274712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212223
7033	NC_020561	TCG	2	6	274721	274726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7034	NC_020561	GGC	2	6	274755	274760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212223
7035	NC_020561	GCC	2	6	274784	274789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212223
7036	NC_020561	CGT	2	6	274792	274797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212223
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7038	NC_020561	GCA	2	6	274805	274810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7039	NC_020561	GAT	2	6	274815	274820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212223
7040	NC_020561	CGC	2	6	274867	274872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212223
7041	NC_020561	GC	3	6	274871	274876	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7042	NC_020561	TCG	3	9	274889	274897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7043	NC_020561	GGC	2	6	274948	274953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212223
7044	NC_020561	GC	5	10	274958	274967	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7045	NC_020561	CCG	2	6	274985	274990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212223
7046	NC_020561	CG	3	6	275013	275018	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7047	NC_020561	GCAG	2	8	275021	275028	25 %	0 %	50 %	25 %	470212223
7048	NC_020561	AGG	2	6	275054	275059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212223
7049	NC_020561	GGC	2	6	275104	275109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212223
7050	NC_020561	CCCG	2	8	275117	275124	0 %	0 %	25 %	75 %	470212223
7051	NC_020561	CGA	2	6	275139	275144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7052	NC_020561	CGG	2	6	275247	275252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212223
7053	NC_020561	CG	3	6	275260	275265	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7054	NC_020561	CTTC	2	8	275373	275380	0 %	50 %	0 %	50 %	470212223
7055	NC_020561	GATC	2	8	275460	275467	25 %	25 %	25 %	25 %	470212223
7056	NC_020561	GC	3	6	275472	275477	0 %	0 %	50 %	50 %	470212223
7057	NC_020561	TCG	2	6	275513	275518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212223
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7060	NC_020561	CGCC	2	8	275624	275631	0 %	0 %	25 %	75 %	470212223
7061	NC_020561	CGA	2	6	275633	275638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7062	NC_020561	CGG	2	6	275654	275659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212223
7063	NC_020561	CAA	2	6	275700	275705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212223
7064	NC_020561	GCA	3	9	275706	275714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7065	NC_020561	TCG	2	6	275822	275827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212223
7066	NC_020561	GCTC	2	8	275846	275853	0 %	25 %	25 %	50 %	470212223
7067	NC_020561	ATA	2	6	275866	275871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212223
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7069	NC_020561	CGGGG	2	10	276122	276131	0 %	0 %	80 %	20 %	470212224
7070	NC_020561	TGA	2	6	276133	276138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212224
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7074	NC_020561	AAGGC	2	10	276280	276289	40 %	0 %	40 %	20 %	470212224
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7089	NC_020561	GC	3	6	276724	276729	0 %	0 %	50 %	50 %	470212224
7090	NC_020561	CGC	2	6	276785	276790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212224
7091	NC_020561	CATCGC	2	12	276825	276836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212224
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7106	NC_020561	TGA	2	6	277324	277329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212224
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7119	NC_020561	CGCC	2	8	277922	277929	0 %	0 %	25 %	75 %	470212225
7120	NC_020561	CCA	2	6	277970	277975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212225
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7122	NC_020561	CCG	2	6	278033	278038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212225
7123	NC_020561	GCA	2	6	278076	278081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212225
7124	NC_020561	CGG	2	6	278123	278128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212225
7125	NC_020561	CCGC	2	8	278193	278200	0 %	0 %	25 %	75 %	470212225
7126	NC_020561	CCG	2	6	278228	278233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212225
7127	NC_020561	CGC	2	6	278245	278250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212225
7128	NC_020561	GAGATC	2	12	278263	278274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470212225
7129	NC_020561	TCA	2	6	278318	278323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212225
7130	NC_020561	CGA	2	6	278328	278333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212225
7131	NC_020561	GCG	2	6	278408	278413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212225
7132	NC_020561	TCG	2	6	278540	278545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212225
7133	NC_020561	TCG	2	6	278552	278557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212225
7134	NC_020561	CCG	2	6	278596	278601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212226
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7136	NC_020561	GCC	2	6	278667	278672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212226
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7139	NC_020561	TCT	2	6	278831	278836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212226
7140	NC_020561	CGA	2	6	278855	278860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212226
7141	NC_020561	CAT	2	6	278882	278887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212226
7142	NC_020561	TGCG	2	8	278904	278911	0 %	25 %	50 %	25 %	470212226
7143	NC_020561	CCAC	2	8	278941	278948	25 %	0 %	0 %	75 %	470212226
7144	NC_020561	TCG	2	6	278959	278964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212226
7145	NC_020561	CGA	2	6	279002	279007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212226
7146	NC_020561	AGGCG	2	10	279008	279017	20 %	0 %	60 %	20 %	470212226
7147	NC_020561	GC	3	6	279038	279043	0 %	0 %	50 %	50 %	470212226
7148	NC_020561	CTCGC	2	10	279048	279057	0 %	20 %	20 %	60 %	470212226
7149	NC_020561	GAT	2	6	279087	279092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212226
7150	NC_020561	GC	3	6	279255	279260	0 %	0 %	50 %	50 %	470212227
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7153	NC_020561	TGC	2	6	279377	279382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212227
7154	NC_020561	CCT	2	6	279387	279392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212227
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7156	NC_020561	CAT	2	6	279441	279446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212227
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7158	NC_020561	TCG	2	6	279491	279496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212227
7159	NC_020561	CGGG	2	8	279590	279597	0 %	0 %	75 %	25 %	470212227
7160	NC_020561	CACC	2	8	279696	279703	25 %	0 %	0 %	75 %	470212227
7161	NC_020561	TCG	2	6	279761	279766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212227
7162	NC_020561	TCG	2	6	279773	279778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212227
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7230	NC_020561	TTGC	2	8	282244	282251	0 %	50 %	25 %	25 %	470212230
7231	NC_020561	CGA	2	6	282296	282301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212230
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7235	NC_020561	CGG	2	6	282780	282785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212231
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7238	NC_020561	GC	3	6	282826	282831	0 %	0 %	50 %	50 %	470212231
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7240	NC_020561	GCG	2	6	282870	282875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212231
7241	NC_020561	CGCC	2	8	282894	282901	0 %	0 %	25 %	75 %	470212231
7242	NC_020561	GC	3	6	282927	282932	0 %	0 %	50 %	50 %	470212231
7243	NC_020561	TCG	2	6	283037	283042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212231
7244	NC_020561	GTC	2	6	283090	283095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212231
7245	NC_020561	AAC	2	6	283100	283105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212231
7246	NC_020561	TGCA	2	8	283112	283119	25 %	25 %	25 %	25 %	470212231
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7252	NC_020561	TCC	2	6	283328	283333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212231
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7366	NC_020561	TCG	2	6	287944	287949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212235
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7487	NC_020561	GCT	2	6	292899	292904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212241
7488	NC_020561	GAG	2	6	292909	292914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212241
7489	NC_020561	CGG	2	6	292992	292997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212241
7490	NC_020561	CCGT	2	8	293007	293014	0 %	25 %	25 %	50 %	470212241
7491	NC_020561	CG	3	6	293044	293049	0 %	0 %	50 %	50 %	470212241
7492	NC_020561	GGC	2	6	293115	293120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212241
7493	NC_020561	CCCG	2	8	293134	293141	0 %	0 %	25 %	75 %	470212241
7494	NC_020561	CGATG	2	10	293148	293157	20 %	20 %	40 %	20 %	470212241
7495	NC_020561	GCCGAT	2	12	293179	293190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212241
7496	NC_020561	CCG	2	6	293207	293212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212241
7497	NC_020561	CAC	2	6	293238	293243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212241
7498	NC_020561	GGC	2	6	293266	293271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212241
7499	NC_020561	CGG	3	9	293297	293305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212241
7500	NC_020561	TCGA	2	8	293338	293345	25 %	25 %	25 %	25 %	470212241

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