MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_020560	GCGT	2	8	1680641	1680648	0 %	25 %	50 %	25 %	470186951
35002	NC_020560	GCT	2	6	1680660	1680665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186951
35003	NC_020560	GGA	2	6	1680699	1680704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186951
35004	NC_020560	GGCG	2	8	1680706	1680713	0 %	0 %	75 %	25 %	470186951
35005	NC_020560	TTC	2	6	1680721	1680726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186951
35006	NC_020560	CAT	2	6	1680792	1680797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186951
35007	NC_020560	CGG	2	6	1680855	1680860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186951
35008	NC_020560	GGC	2	6	1680897	1680902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186951
35009	NC_020560	GAA	2	6	1680949	1680954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186951
35010	NC_020560	GCA	2	6	1680966	1680971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186951
35011	NC_020560	GATC	2	8	1680975	1680982	25 %	25 %	25 %	25 %	470186951
35012	NC_020560	GAG	2	6	1681018	1681023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186951
35013	NC_020560	CG	3	6	1681026	1681031	0 %	0 %	50 %	50 %	470186951
35014	NC_020560	CGC	2	6	1681071	1681076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186951
35015	NC_020560	GCC	2	6	1681089	1681094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186951
35016	NC_020560	TGC	2	6	1681106	1681111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186951
35017	NC_020560	GCT	2	6	1681137	1681142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186951
35018	NC_020560	CCG	2	6	1681224	1681229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186951
35019	NC_020560	CCGA	2	8	1681246	1681253	25 %	0 %	25 %	50 %	470186951
35020	NC_020560	CAC	2	6	1681260	1681265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186951
35021	NC_020560	TCG	2	6	1681460	1681465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186952
35022	NC_020560	CG	3	6	1681476	1681481	0 %	0 %	50 %	50 %	470186952
35023	NC_020560	CCA	2	6	1681512	1681517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186952
35024	NC_020560	CGG	2	6	1681542	1681547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186952
35025	NC_020560	GCC	2	6	1681586	1681591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35026	NC_020560	TAT	2	6	1681667	1681672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470186952
35027	NC_020560	GTC	2	6	1681724	1681729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186952
35028	NC_020560	CGA	2	6	1681761	1681766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186952
35029	NC_020560	GTG	2	6	1681787	1681792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186952
35030	NC_020560	GCC	2	6	1681833	1681838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35031	NC_020560	GCC	2	6	1681842	1681847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35032	NC_020560	CCG	2	6	1681872	1681877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35033	NC_020560	ACA	2	6	1682004	1682009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186952
35034	NC_020560	CCG	2	6	1682150	1682155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35035	NC_020560	TCA	2	6	1682163	1682168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186952
35036	NC_020560	GCC	2	6	1682287	1682292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35037	NC_020560	CGG	2	6	1682313	1682318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186952
35038	NC_020560	CCG	2	6	1682334	1682339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186952
35039	NC_020560	CTG	2	6	1682345	1682350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186952
35040	NC_020560	AAG	2	6	1682381	1682386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186952
35041	NC_020560	GCA	2	6	1682418	1682423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186952
35042	NC_020560	CGCCGG	2	12	1682424	1682435	0 %	0 %	50 %	50 %	470186952
35043	NC_020560	GAT	2	6	1682456	1682461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186952
35044	NC_020560	CGCC	2	8	1682553	1682560	0 %	0 %	25 %	75 %	470186953
35045	NC_020560	ATC	2	6	1682583	1682588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186953
35046	NC_020560	CGC	2	6	1682654	1682659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186953
35047	NC_020560	TTC	2	6	1682660	1682665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186953
35048	NC_020560	GCC	2	6	1682698	1682703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186953
35049	NC_020560	TGC	2	6	1682718	1682723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186953
35050	NC_020560	CGGC	2	8	1682727	1682734	0 %	0 %	50 %	50 %	470186953
35051	NC_020560	GC	3	6	1682733	1682738	0 %	0 %	50 %	50 %	470186953
35052	NC_020560	CAT	2	6	1682809	1682814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186953
35053	NC_020560	CT	4	8	1682924	1682931	0 %	50 %	0 %	50 %	470186954
35054	NC_020560	GC	3	6	1682977	1682982	0 %	0 %	50 %	50 %	470186954
35055	NC_020560	CGA	2	6	1683045	1683050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186954
35056	NC_020560	TC	3	6	1683069	1683074	0 %	50 %	0 %	50 %	470186954
35057	NC_020560	GC	3	6	1683088	1683093	0 %	0 %	50 %	50 %	470186954

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.