MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_020560	GAT	2	6	1547696	1547701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186833
32003	NC_020560	CGGC	2	8	1547710	1547717	0 %	0 %	50 %	50 %	470186833
32004	NC_020560	TCC	2	6	1547806	1547811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186833
32005	NC_020560	CGGC	2	8	1547819	1547826	0 %	0 %	50 %	50 %	470186833
32006	NC_020560	CGCC	2	8	1547838	1547845	0 %	0 %	25 %	75 %	470186833
32007	NC_020560	GGC	2	6	1547904	1547909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186833
32008	NC_020560	GAT	2	6	1547933	1547938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186833
32009	NC_020560	GACCG	2	10	1547959	1547968	20 %	0 %	40 %	40 %	470186833
32010	NC_020560	CGG	2	6	1547974	1547979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186833
32011	NC_020560	TCGAGG	2	12	1548010	1548021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470186833
32012	NC_020560	GCA	2	6	1548059	1548064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186833
32013	NC_020560	ACC	2	6	1548090	1548095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186833
32014	NC_020560	CGG	2	6	1548119	1548124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186833
32015	NC_020560	CGCA	2	8	1548155	1548162	25 %	0 %	25 %	50 %	470186833
32016	NC_020560	CGC	2	6	1548167	1548172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186833
32017	NC_020560	GC	3	6	1548206	1548211	0 %	0 %	50 %	50 %	470186833
32018	NC_020560	ACC	2	6	1548238	1548243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186833
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32031	NC_020560	CCA	2	6	1549183	1549188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186834
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32042	NC_020560	TCGATC	2	12	1549665	1549676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470186834
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32051	NC_020560	CG	3	6	1549865	1549870	0 %	0 %	50 %	50 %	470186834
32052	NC_020560	CTC	2	6	1549872	1549877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186834
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32056	NC_020560	CGA	2	6	1550060	1550065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186834
32057	NC_020560	CCGC	2	8	1550092	1550099	0 %	0 %	25 %	75 %	470186834
32058	NC_020560	GCA	2	6	1550126	1550131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186834
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32088	NC_020560	GCG	2	6	1551116	1551121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186834
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32114	NC_020560	GC	4	8	1552069	1552076	0 %	0 %	50 %	50 %	470186836
32115	NC_020560	CGA	2	6	1552113	1552118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186836
32116	NC_020560	CGG	4	12	1552182	1552193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186836
32117	NC_020560	GCT	2	6	1552272	1552277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186836
32118	NC_020560	CGCC	2	8	1552296	1552303	0 %	0 %	25 %	75 %	470186836
32119	NC_020560	CTT	2	6	1552440	1552445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186836
32120	NC_020560	TGA	2	6	1552468	1552473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186836
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32123	NC_020560	CAT	2	6	1552571	1552576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186837
32124	NC_020560	CGGC	2	8	1552577	1552584	0 %	0 %	50 %	50 %	470186837
32125	NC_020560	CTG	2	6	1552591	1552596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186837
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32132	NC_020560	GCC	2	6	1552971	1552976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186837
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32146	NC_020560	GC	3	6	1553310	1553315	0 %	0 %	50 %	50 %	470186838
32147	NC_020560	CAC	2	6	1553322	1553327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186838
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32153	NC_020560	GC	3	6	1553641	1553646	0 %	0 %	50 %	50 %	470186838
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32173	NC_020560	CG	3	6	1554295	1554300	0 %	0 %	50 %	50 %	470186839
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32217	NC_020560	CGA	2	6	1555789	1555794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186840
32218	NC_020560	CG	3	6	1555797	1555802	0 %	0 %	50 %	50 %	470186840
32219	NC_020560	CTC	2	6	1555817	1555822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186840
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32223	NC_020560	CGG	2	6	1556005	1556010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186841
32224	NC_020560	CGA	2	6	1556068	1556073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186841
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32228	NC_020560	CG	3	6	1556196	1556201	0 %	0 %	50 %	50 %	470186841
32229	NC_020560	TCG	2	6	1556217	1556222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186841
32230	NC_020560	GGC	2	6	1556248	1556253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186841
32231	NC_020560	GC	3	6	1556269	1556274	0 %	0 %	50 %	50 %	470186841
32232	NC_020560	GCT	2	6	1556281	1556286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186841
32233	NC_020560	GCC	2	6	1556323	1556328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186841
32234	NC_020560	CGG	2	6	1556341	1556346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186841
32235	NC_020560	AGC	3	9	1556349	1556357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186841
32236	NC_020560	TCA	2	6	1556379	1556384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186841
32237	NC_020560	CTC	2	6	1556402	1556407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186841
32238	NC_020560	GAA	2	6	1556434	1556439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186841
32239	NC_020560	GTG	3	9	1556447	1556455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186841
32240	NC_020560	GAA	2	6	1556470	1556475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186841
32241	NC_020560	GGC	2	6	1556476	1556481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186841
32242	NC_020560	GAG	2	6	1556513	1556518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186841
32243	NC_020560	CAT	2	6	1556542	1556547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186841
32244	NC_020560	CGC	2	6	1556578	1556583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186841
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32246	NC_020560	CGT	2	6	1556631	1556636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186842
32247	NC_020560	CGA	2	6	1556685	1556690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186842
32248	NC_020560	CAT	2	6	1556715	1556720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186842
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32250	NC_020560	CCA	2	6	1556792	1556797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186842
32251	NC_020560	ACC	2	6	1556798	1556803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186842
32252	NC_020560	GGCG	2	8	1556810	1556817	0 %	0 %	75 %	25 %	470186842
32253	NC_020560	CAT	2	6	1556824	1556829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186842
32254	NC_020560	GGC	3	9	1556891	1556899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186842
32255	NC_020560	ACG	2	6	1556921	1556926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186842
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32257	NC_020560	CGT	2	6	1557000	1557005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186842
32258	NC_020560	TCG	2	6	1557032	1557037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186842
32259	NC_020560	TGG	2	6	1557109	1557114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186842
32260	NC_020560	CGG	2	6	1557167	1557172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186842
32261	NC_020560	TTTGG	2	10	1557346	1557355	0 %	60 %	40 %	0 %	470186843
32262	NC_020560	CGG	3	9	1557389	1557397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186843
32263	NC_020560	GGCG	2	8	1557487	1557494	0 %	0 %	75 %	25 %	470186843
32264	NC_020560	ATC	2	6	1557519	1557524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186843
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32292	NC_020560	CGG	2	6	1559373	1559378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186844
32293	NC_020560	GCA	2	6	1559397	1559402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186844
32294	NC_020560	GC	4	8	1559418	1559425	0 %	0 %	50 %	50 %	470186844
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32300	NC_020560	TTC	2	6	1559578	1559583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186844
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32302	NC_020560	AAG	2	6	1559650	1559655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186844
32303	NC_020560	TCGC	2	8	1559681	1559688	0 %	25 %	25 %	50 %	470186844
32304	NC_020560	CCGAGC	2	12	1559732	1559743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470186844
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32308	NC_020560	TCG	2	6	1559864	1559869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186844
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32311	NC_020560	GCA	2	6	1560029	1560034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186844
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32317	NC_020560	ACG	2	6	1560272	1560277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186844
32318	NC_020560	CTT	2	6	1560400	1560405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186845
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32322	NC_020560	GCC	2	6	1560525	1560530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186845
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32325	NC_020560	TTC	2	6	1560821	1560826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186845
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32328	NC_020560	TTC	2	6	1560891	1560896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186845
32329	NC_020560	TCT	2	6	1560928	1560933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186845
32330	NC_020560	GAA	2	6	1560953	1560958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186845
32331	NC_020560	CGG	3	9	1560985	1560993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186845
32332	NC_020560	GA	3	6	1561094	1561099	50 %	0 %	50 %	0 %	470186845
32333	NC_020560	CCG	2	6	1561132	1561137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186845
32334	NC_020560	CGC	2	6	1561214	1561219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186845
32335	NC_020560	CTC	2	6	1561223	1561228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186845
32336	NC_020560	ATC	2	6	1561281	1561286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186845
32337	NC_020560	GCG	2	6	1561324	1561329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186845
32338	NC_020560	GCC	2	6	1561391	1561396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186846
32339	NC_020560	CGC	2	6	1561407	1561412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186846
32340	NC_020560	CTTGCG	2	12	1561432	1561443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186846
32341	NC_020560	AGA	3	9	1561461	1561469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186846
32342	NC_020560	GCG	2	6	1561470	1561475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186846
32343	NC_020560	AGC	2	6	1561481	1561486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186846
32344	NC_020560	AGA	2	6	1561530	1561535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186846
32345	NC_020560	GCC	2	6	1561546	1561551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186846
32346	NC_020560	GCG	2	6	1561617	1561622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186846
32347	NC_020560	CTT	2	6	1561639	1561644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186846
32348	NC_020560	GAG	2	6	1561657	1561662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186846
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32351	NC_020560	CGA	2	6	1561818	1561823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186846
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32442	NC_020560	GCG	2	6	1565516	1565521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186849
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32446	NC_020560	GTC	2	6	1565667	1565672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186849
32447	NC_020560	AAATC	2	10	1565879	1565888	60 %	20 %	0 %	20 %	470186850
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32450	NC_020560	ATC	2	6	1565974	1565979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186850
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32453	NC_020560	GCGA	2	8	1566079	1566086	25 %	0 %	50 %	25 %	470186850
32454	NC_020560	TGG	2	6	1566092	1566097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186850
32455	NC_020560	CGT	2	6	1566120	1566125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186850
32456	NC_020560	TGC	2	6	1566167	1566172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186850
32457	NC_020560	GGA	2	6	1566180	1566185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186850
32458	NC_020560	GCAG	2	8	1566190	1566197	25 %	0 %	50 %	25 %	470186850
32459	NC_020560	ACG	2	6	1566251	1566256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186850
32460	NC_020560	GGCG	2	8	1566276	1566283	0 %	0 %	75 %	25 %	470186850
32461	NC_020560	TGC	2	6	1566348	1566353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186850
32462	NC_020560	CATG	2	8	1566363	1566370	25 %	25 %	25 %	25 %	470186850
32463	NC_020560	TGC	2	6	1566374	1566379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186850
32464	NC_020560	CGC	2	6	1566465	1566470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186850
32465	NC_020560	GC	3	6	1566478	1566483	0 %	0 %	50 %	50 %	470186850
32466	NC_020560	CAG	2	6	1566635	1566640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186851
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32469	NC_020560	CGT	2	6	1566830	1566835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186851
32470	NC_020560	TGC	2	6	1566934	1566939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186851
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32473	NC_020560	CGT	2	6	1567063	1567068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186851
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32484	NC_020560	GC	3	6	1567519	1567524	0 %	0 %	50 %	50 %	470186852
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32488	NC_020560	GCC	3	9	1567692	1567700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186852
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32490	NC_020560	CGT	2	6	1567769	1567774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186852
32491	NC_020560	GC	3	6	1567843	1567848	0 %	0 %	50 %	50 %	470186852
32492	NC_020560	GATCGT	2	12	1567856	1567867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470186852
32493	NC_020560	GC	3	6	1567974	1567979	0 %	0 %	50 %	50 %	470186852
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32495	NC_020560	CCCG	2	8	1568002	1568009	0 %	0 %	25 %	75 %	470186852
32496	NC_020560	GGC	2	6	1568117	1568122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186852
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