MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_020560	CTGA	2	8	1233800	1233807	25 %	25 %	25 %	25 %	470186503
25502	NC_020560	GAT	2	6	1233815	1233820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186503
25503	NC_020560	CAGA	2	8	1233821	1233828	50 %	0 %	25 %	25 %	470186503
25504	NC_020560	CGA	2	6	1233832	1233837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186503
25505	NC_020560	CCAT	2	8	1233859	1233866	25 %	25 %	0 %	50 %	470186503
25506	NC_020560	GAT	2	6	1233887	1233892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186503
25507	NC_020560	ATG	3	9	1233945	1233953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186503
25508	NC_020560	CTCGCC	2	12	1234178	1234189	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470186504
25509	NC_020560	CCG	3	9	1234193	1234201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186504
25510	NC_020560	AGC	2	6	1234217	1234222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186504
25511	NC_020560	TCG	3	9	1234230	1234238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186504
25512	NC_020560	GC	3	6	1234251	1234256	0 %	0 %	50 %	50 %	470186504
25513	NC_020560	GGCGA	2	10	1234291	1234300	20 %	0 %	60 %	20 %	470186504
25514	NC_020560	GC	3	6	1234305	1234310	0 %	0 %	50 %	50 %	470186504
25515	NC_020560	TTTCC	2	10	1234321	1234330	0 %	60 %	0 %	40 %	470186504
25516	NC_020560	TGA	2	6	1234341	1234346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186504
25517	NC_020560	GAA	2	6	1234585	1234590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186504
25518	NC_020560	GAA	2	6	1234636	1234641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186504
25519	NC_020560	ATG	2	6	1234722	1234727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186504
25520	NC_020560	TCG	2	6	1234764	1234769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186504
25521	NC_020560	CCGG	2	8	1234819	1234826	0 %	0 %	50 %	50 %	470186504
25522	NC_020560	GAG	2	6	1234901	1234906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186504
25523	NC_020560	GGAA	2	8	1234938	1234945	50 %	0 %	50 %	0 %	470186504
25524	NC_020560	CGG	2	6	1234999	1235004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186504
25525	NC_020560	GGCG	2	8	1235013	1235020	0 %	0 %	75 %	25 %	470186504
25526	NC_020560	TC	3	6	1235032	1235037	0 %	50 %	0 %	50 %	470186504
25527	NC_020560	GCA	2	6	1235046	1235051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186504
25528	NC_020560	GAAG	2	8	1235109	1235116	50 %	0 %	50 %	0 %	470186504
25529	NC_020560	TCG	2	6	1235211	1235216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186505
25530	NC_020560	CGA	2	6	1235266	1235271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186505
25531	NC_020560	TCG	2	6	1235272	1235277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186505
25532	NC_020560	ATCGG	2	10	1235511	1235520	20 %	20 %	40 %	20 %	470186505
25533	NC_020560	TTCC	2	8	1235552	1235559	0 %	50 %	0 %	50 %	470186505
25534	NC_020560	GACC	2	8	1235642	1235649	25 %	0 %	25 %	50 %	470186505
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25536	NC_020560	ACCG	2	8	1235942	1235949	25 %	0 %	25 %	50 %	470186505
25537	NC_020560	CTG	2	6	1236004	1236009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186505
25538	NC_020560	CTG	2	6	1236035	1236040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186505
25539	NC_020560	ACC	2	6	1236198	1236203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186505
25540	NC_020560	ATA	2	6	1236206	1236211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470186505
25541	NC_020560	TCCTG	2	10	1236267	1236276	0 %	40 %	20 %	40 %	470186505
25542	NC_020560	GCG	2	6	1236283	1236288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186505
25543	NC_020560	C	6	6	1236317	1236322	0 %	0 %	0 %	100 %	470186505
25544	NC_020560	CGG	2	6	1236358	1236363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186505
25545	NC_020560	GAA	2	6	1236392	1236397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186505
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25547	NC_020560	ACG	2	6	1236629	1236634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
25548	NC_020560	TCCGC	2	10	1236669	1236678	0 %	20 %	20 %	60 %	470186506
25549	NC_020560	AGCC	2	8	1236680	1236687	25 %	0 %	25 %	50 %	470186506
25550	NC_020560	CGA	2	6	1236702	1236707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
25551	NC_020560	GGC	2	6	1236724	1236729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186506
25552	NC_020560	GCCG	2	8	1236774	1236781	0 %	0 %	50 %	50 %	470186506
25553	NC_020560	CAT	2	6	1236805	1236810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186506
25554	NC_020560	CGA	2	6	1236837	1236842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
25555	NC_020560	GCG	2	6	1236843	1236848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186506
25556	NC_020560	CAG	2	6	1236898	1236903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
25557	NC_020560	CAGCG	2	10	1236967	1236976	20 %	0 %	40 %	40 %	470186506
25558	NC_020560	GCC	2	6	1237018	1237023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186506
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25560	NC_020560	CGA	2	6	1237044	1237049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
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25565	NC_020560	GC	3	6	1237218	1237223	0 %	0 %	50 %	50 %	470186506
25566	NC_020560	GCG	2	6	1237272	1237277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186506
25567	NC_020560	CGC	2	6	1237320	1237325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186506
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25570	NC_020560	GAT	2	6	1237435	1237440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186506
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25574	NC_020560	CGA	2	6	1237497	1237502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186506
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25606	NC_020560	GC	3	6	1239785	1239790	0 %	0 %	50 %	50 %	470186508
25607	NC_020560	GCC	2	6	1239795	1239800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186508
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25616	NC_020560	CGC	2	6	1240444	1240449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186509
25617	NC_020560	GGAG	2	8	1240490	1240497	25 %	0 %	75 %	0 %	470186509
25618	NC_020560	CTT	2	6	1240501	1240506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186509
25619	NC_020560	TGT	2	6	1240528	1240533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186509
25620	NC_020560	GCCT	2	8	1240596	1240603	0 %	25 %	25 %	50 %	470186510
25621	NC_020560	TCG	2	6	1240626	1240631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186510
25622	NC_020560	GCCG	2	8	1240682	1240689	0 %	0 %	50 %	50 %	470186510
25623	NC_020560	AGCGC	2	10	1240701	1240710	20 %	0 %	40 %	40 %	470186510
25624	NC_020560	GAA	2	6	1240715	1240720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186510
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25643	NC_020560	GC	4	8	1241675	1241682	0 %	0 %	50 %	50 %	470186512
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25647	NC_020560	TCG	2	6	1241775	1241780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186513
25648	NC_020560	GCG	2	6	1241827	1241832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186513
25649	NC_020560	GC	3	6	1241848	1241853	0 %	0 %	50 %	50 %	470186513
25650	NC_020560	GGC	2	6	1241866	1241871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186513
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25652	NC_020560	AG	3	6	1242004	1242009	50 %	0 %	50 %	0 %	470186513
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25656	NC_020560	GCG	2	6	1242408	1242413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186514
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25673	NC_020560	AG	3	6	1243124	1243129	50 %	0 %	50 %	0 %	470186514
25674	NC_020560	GCA	2	6	1243175	1243180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186514
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25679	NC_020560	GC	3	6	1243364	1243369	0 %	0 %	50 %	50 %	470186514
25680	NC_020560	AGC	2	6	1243384	1243389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186514
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25688	NC_020560	GAC	2	6	1243647	1243652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186514
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25692	NC_020560	CGT	2	6	1243776	1243781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186514
25693	NC_020560	GATC	2	8	1243787	1243794	25 %	25 %	25 %	25 %	470186514
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25704	NC_020560	ATC	2	6	1244516	1244521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186515
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25708	NC_020560	CG	3	6	1244715	1244720	0 %	0 %	50 %	50 %	470186515
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25714	NC_020560	TGGCA	2	10	1244930	1244939	20 %	20 %	40 %	20 %	470186516
25715	NC_020560	GCT	2	6	1245014	1245019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186516
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25719	NC_020560	A	6	6	1245135	1245140	100 %	0 %	0 %	0 %	470186516
25720	NC_020560	GCA	2	6	1245251	1245256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186516
25721	NC_020560	TGG	2	6	1245262	1245267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186516
25722	NC_020560	CG	3	6	1245354	1245359	0 %	0 %	50 %	50 %	470186516
25723	NC_020560	GC	3	6	1245419	1245424	0 %	0 %	50 %	50 %	470186516
25724	NC_020560	CT	3	6	1245457	1245462	0 %	50 %	0 %	50 %	470186516
25725	NC_020560	GC	3	6	1245498	1245503	0 %	0 %	50 %	50 %	470186516
25726	NC_020560	GCG	2	6	1245544	1245549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186516
25727	NC_020560	ATC	2	6	1245604	1245609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186516
25728	NC_020560	CGA	2	6	1245616	1245621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186516
25729	NC_020560	TCG	2	6	1245622	1245627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186516
25730	NC_020560	GCTC	2	8	1245670	1245677	0 %	25 %	25 %	50 %	470186516
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25732	NC_020560	TCA	2	6	1245691	1245696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186516
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25849	NC_020560	TCGG	2	8	1250289	1250296	0 %	25 %	50 %	25 %	470186519
25850	NC_020560	GCG	2	6	1250427	1250432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186519
25851	NC_020560	TGGC	2	8	1250553	1250560	0 %	25 %	50 %	25 %	470186520
25852	NC_020560	GCTG	2	8	1250572	1250579	0 %	25 %	50 %	25 %	470186520
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25958	NC_020560	CT	3	6	1255552	1255557	0 %	50 %	0 %	50 %	470186524
25959	NC_020560	CCGT	2	8	1255558	1255565	0 %	25 %	25 %	50 %	470186524
25960	NC_020560	GC	4	8	1255693	1255700	0 %	0 %	50 %	50 %	470186524
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