MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_020560	ATC	2	6	1120440	1120445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186403
23002	NC_020560	CCG	2	6	1120748	1120753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186404
23003	NC_020560	GAA	2	6	1120796	1120801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186404
23004	NC_020560	GCG	2	6	1120839	1120844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186404
23005	NC_020560	TTCC	2	8	1120916	1120923	0 %	50 %	0 %	50 %	470186404
23006	NC_020560	CCG	3	9	1120951	1120959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186404
23007	NC_020560	CG	3	6	1120958	1120963	0 %	0 %	50 %	50 %	470186404
23008	NC_020560	GAC	2	6	1121041	1121046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186404
23009	NC_020560	GCA	2	6	1121125	1121130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186404
23010	NC_020560	TGC	2	6	1121172	1121177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186404
23011	NC_020560	TGGAC	2	10	1121179	1121188	20 %	20 %	40 %	20 %	470186404
23012	NC_020560	CG	3	6	1121273	1121278	0 %	0 %	50 %	50 %	470186404
23013	NC_020560	CGC	2	6	1121287	1121292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186404
23014	NC_020560	GTC	2	6	1121360	1121365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186404
23015	NC_020560	TGA	2	6	1121496	1121501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186404
23016	NC_020560	CGA	2	6	1121566	1121571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186404
23017	NC_020560	AGCA	2	8	1121604	1121611	50 %	0 %	25 %	25 %	470186404
23018	NC_020560	CGC	2	6	1121757	1121762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186404
23019	NC_020560	GGC	2	6	1121791	1121796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186404
23020	NC_020560	TGT	2	6	1121916	1121921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186405
23021	NC_020560	GGC	2	6	1121929	1121934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186405
23022	NC_020560	AGGA	2	8	1121944	1121951	50 %	0 %	50 %	0 %	470186405
23023	NC_020560	ATCG	2	8	1121958	1121965	25 %	25 %	25 %	25 %	470186405
23024	NC_020560	TCG	2	6	1121984	1121989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23025	NC_020560	TGC	2	6	1122029	1122034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23026	NC_020560	GGC	2	6	1122075	1122080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186405
23027	NC_020560	CCGG	2	8	1122097	1122104	0 %	0 %	50 %	50 %	470186405
23028	NC_020560	GCT	2	6	1122126	1122131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23029	NC_020560	GTC	2	6	1122139	1122144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23030	NC_020560	TTTCG	2	10	1122147	1122156	0 %	60 %	20 %	20 %	470186405
23031	NC_020560	TCG	2	6	1122164	1122169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23032	NC_020560	CGG	2	6	1122223	1122228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186405
23033	NC_020560	GCTG	2	8	1122269	1122276	0 %	25 %	50 %	25 %	470186405
23034	NC_020560	CG	3	6	1122290	1122295	0 %	0 %	50 %	50 %	470186405
23035	NC_020560	TCC	2	6	1122350	1122355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186405
23036	NC_020560	TTG	2	6	1122416	1122421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186405
23037	NC_020560	TGC	2	6	1122477	1122482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23038	NC_020560	CGT	2	6	1122521	1122526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186405
23039	NC_020560	TTC	2	6	1122565	1122570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186406
23040	NC_020560	GAA	2	6	1122578	1122583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186406
23041	NC_020560	CGG	2	6	1122743	1122748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186406
23042	NC_020560	GTG	2	6	1122759	1122764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186406
23043	NC_020560	GAT	2	6	1122768	1122773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186406
23044	NC_020560	AGG	2	6	1122811	1122816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186406
23045	NC_020560	GGA	2	6	1122818	1122823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186406
23046	NC_020560	CGC	2	6	1122853	1122858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186406
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23048	NC_020560	CGA	2	6	1122889	1122894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186406
23049	NC_020560	TGG	2	6	1123029	1123034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186407
23050	NC_020560	CGT	2	6	1123058	1123063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186407
23051	NC_020560	ACG	2	6	1123078	1123083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186407
23052	NC_020560	CG	3	6	1123093	1123098	0 %	0 %	50 %	50 %	470186407
23053	NC_020560	GCG	2	6	1123106	1123111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186407
23054	NC_020560	GAA	3	9	1123128	1123136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186407
23055	NC_020560	GAG	2	6	1123146	1123151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186407
23056	NC_020560	ATC	2	6	1123194	1123199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186407
23057	NC_020560	TCGC	2	8	1123205	1123212	0 %	25 %	25 %	50 %	470186407
23058	NC_020560	CGG	2	6	1123241	1123246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186407
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23061	NC_020560	CGT	2	6	1123313	1123318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186407
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23063	NC_020560	TAT	2	6	1123347	1123352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470186407
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23065	NC_020560	ATC	2	6	1123429	1123434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186407
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23076	NC_020560	CG	3	6	1124003	1124008	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23077	NC_020560	TCG	2	6	1124055	1124060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186408
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23084	NC_020560	CCGG	2	8	1124385	1124392	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23085	NC_020560	CG	3	6	1124464	1124469	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23086	NC_020560	CG	3	6	1124501	1124506	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23087	NC_020560	ACCG	2	8	1124543	1124550	25 %	0 %	25 %	50 %	470186408
23088	NC_020560	CGA	2	6	1124557	1124562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186408
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23099	NC_020560	GCGG	2	8	1124974	1124981	0 %	0 %	75 %	25 %	470186408
23100	NC_020560	GAT	2	6	1124986	1124991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186408
23101	NC_020560	CGC	2	6	1124992	1124997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186408
23102	NC_020560	CCG	2	6	1125054	1125059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186408
23103	NC_020560	GGC	2	6	1125078	1125083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186408
23104	NC_020560	CG	3	6	1125091	1125096	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23105	NC_020560	CCT	2	6	1125157	1125162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186408
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23107	NC_020560	G	6	6	1125268	1125273	0 %	0 %	100 %	0 %	470186408
23108	NC_020560	CGAG	2	8	1125279	1125286	25 %	0 %	50 %	25 %	470186408
23109	NC_020560	CGC	2	6	1125301	1125306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186408
23110	NC_020560	GAT	2	6	1125328	1125333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186408
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23112	NC_020560	TGT	2	6	1125409	1125414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186408
23113	NC_020560	CGG	3	9	1125430	1125438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186408
23114	NC_020560	GCT	2	6	1125478	1125483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186408
23115	NC_020560	ATC	2	6	1125486	1125491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186408
23116	NC_020560	GCA	2	6	1125494	1125499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186408
23117	NC_020560	GC	3	6	1125504	1125509	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23118	NC_020560	GCC	2	6	1125536	1125541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186408
23119	NC_020560	CGG	2	6	1125586	1125591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186408
23120	NC_020560	GC	3	6	1125650	1125655	0 %	0 %	50 %	50 %	470186408
23121	NC_020560	TGC	2	6	1125678	1125683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186408
23122	NC_020560	T	6	6	1125714	1125719	0 %	100 %	0 %	0 %	470186409
23123	NC_020560	TAT	2	6	1125748	1125753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470186409
23124	NC_020560	ACG	2	6	1125754	1125759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186409
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23126	NC_020560	TGC	2	6	1125827	1125832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186409
23127	NC_020560	GAC	2	6	1125838	1125843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186409
23128	NC_020560	CTG	2	6	1125847	1125852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186409
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23130	NC_020560	GCT	2	6	1125900	1125905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186409
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23134	NC_020560	ATC	2	6	1126135	1126140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186409
23135	NC_020560	ATC	2	6	1126196	1126201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186409
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23137	NC_020560	CGG	2	6	1126236	1126241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186409
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23143	NC_020560	TGC	2	6	1126939	1126944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186410
23144	NC_020560	GCC	2	6	1126967	1126972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186410
23145	NC_020560	TCG	3	9	1126977	1126985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186410
23146	NC_020560	GATCG	2	10	1126996	1127005	20 %	20 %	40 %	20 %	470186410
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23150	NC_020560	GTC	2	6	1127168	1127173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186410
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23152	NC_020560	CGA	2	6	1127257	1127262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186410
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23200	NC_020560	ATC	2	6	1129320	1129325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186411
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23213	NC_020560	CGT	2	6	1129714	1129719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186412
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23220	NC_020560	ATC	2	6	1129901	1129906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
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23222	NC_020560	TCA	2	6	1129950	1129955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
23223	NC_020560	CTGG	2	8	1130044	1130051	0 %	25 %	50 %	25 %	470186412
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23227	NC_020560	GCG	2	6	1130201	1130206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186412
23228	NC_020560	CAT	2	6	1130215	1130220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
23229	NC_020560	CGC	3	9	1130221	1130229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186412
23230	NC_020560	CAA	2	6	1130251	1130256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470186412
23231	NC_020560	GGT	2	6	1130293	1130298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470186412
23232	NC_020560	CGG	2	6	1130302	1130307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186412
23233	NC_020560	GCT	2	6	1130314	1130319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186412
23234	NC_020560	CGG	2	6	1130320	1130325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186412
23235	NC_020560	GCG	2	6	1130339	1130344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186412
23236	NC_020560	TCA	2	6	1130361	1130366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
23237	NC_020560	TCA	3	9	1130421	1130429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
23238	NC_020560	GCG	2	6	1130432	1130437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186412
23239	NC_020560	ATC	3	9	1130438	1130446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186412
23240	NC_020560	CAGC	2	8	1130511	1130518	25 %	0 %	25 %	50 %	470186412
23241	NC_020560	CCGA	2	8	1130522	1130529	25 %	0 %	25 %	50 %	470186412
23242	NC_020560	CGA	2	6	1130570	1130575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186413
23243	NC_020560	CGC	2	6	1130682	1130687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186413
23244	NC_020560	GGC	2	6	1130716	1130721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186413
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23246	NC_020560	CGT	2	6	1130772	1130777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186413
23247	NC_020560	GGC	2	6	1130788	1130793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186413
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23260	NC_020560	GCC	2	6	1131256	1131261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186413
23261	NC_020560	CCG	2	6	1131287	1131292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186413
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23293	NC_020560	GCGG	2	8	1132902	1132909	0 %	0 %	75 %	25 %	470186415
23294	NC_020560	CTG	2	6	1132912	1132917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186415
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23329	NC_020560	TCG	2	6	1134619	1134624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186417
23330	NC_020560	CAT	2	6	1134629	1134634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186417
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23332	NC_020560	CCGA	2	8	1134723	1134730	25 %	0 %	25 %	50 %	470186417
23333	NC_020560	GAT	2	6	1134773	1134778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186417
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23335	NC_020560	TGT	2	6	1134820	1134825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186417
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23337	NC_020560	GA	3	6	1134879	1134884	50 %	0 %	50 %	0 %	470186417
23338	NC_020560	ACG	2	6	1134955	1134960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186417
23339	NC_020560	AGA	2	6	1134979	1134984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470186417
23340	NC_020560	GAG	2	6	1135052	1135057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470186417
23341	NC_020560	TCA	2	6	1135162	1135167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186417
23342	NC_020560	TCT	2	6	1135472	1135477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186418
23343	NC_020560	GCC	2	6	1135480	1135485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186418
23344	NC_020560	GCC	2	6	1135525	1135530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470186418
23345	NC_020560	GCG	2	6	1135676	1135681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186418
23346	NC_020560	GTC	2	6	1135710	1135715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186418
23347	NC_020560	CGAAA	2	10	1135719	1135728	60 %	0 %	20 %	20 %	470186418
23348	NC_020560	CTT	2	6	1135748	1135753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186418
23349	NC_020560	GCA	2	6	1135835	1135840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186418
23350	NC_020560	CGAT	2	8	1135879	1135886	25 %	25 %	25 %	25 %	470186418
23351	NC_020560	GCGAG	2	10	1135973	1135982	20 %	0 %	60 %	20 %	470186418
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23359	NC_020560	CGA	2	6	1136171	1136176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186418
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23362	NC_020560	AGT	2	6	1136324	1136329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186418
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23458	NC_020560	TCG	2	6	1141510	1141515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186423
23459	NC_020560	CT	4	8	1141531	1141538	0 %	50 %	0 %	50 %	470186423
23460	NC_020560	CTT	2	6	1141566	1141571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186423
23461	NC_020560	TCA	2	6	1141619	1141624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186423
23462	NC_020560	TCGTC	2	10	1141634	1141643	0 %	40 %	20 %	40 %	470186423
23463	NC_020560	TCCT	2	8	1141662	1141669	0 %	50 %	0 %	50 %	470186423
23464	NC_020560	TCGG	2	8	1141674	1141681	0 %	25 %	50 %	25 %	470186423
23465	NC_020560	GC	3	6	1141688	1141693	0 %	0 %	50 %	50 %	470186423
23466	NC_020560	GCA	2	6	1141701	1141706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186423
23467	NC_020560	AGC	2	6	1141713	1141718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186423
23468	NC_020560	TCG	2	6	1141736	1141741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186423
23469	NC_020560	TCG	2	6	1142127	1142132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186424
23470	NC_020560	ATG	2	6	1142156	1142161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186424
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23472	NC_020560	CCA	2	6	1142279	1142284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470186424
23473	NC_020560	GTCG	2	8	1142305	1142312	0 %	25 %	50 %	25 %	470186424
23474	NC_020560	CGG	2	6	1142419	1142424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470186424
23475	NC_020560	CCGT	2	8	1142443	1142450	0 %	25 %	25 %	50 %	470186424
23476	NC_020560	CG	3	6	1142494	1142499	0 %	0 %	50 %	50 %	470186424
23477	NC_020560	GTT	2	6	1142573	1142578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470186424
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23480	NC_020560	TCT	2	6	1142719	1142724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470186424
23481	NC_020560	GGCC	2	8	1142764	1142771	0 %	0 %	50 %	50 %	470186424
23482	NC_020560	GGTT	2	8	1142788	1142795	0 %	50 %	50 %	0 %	470186424
23483	NC_020560	CGT	2	6	1142798	1142803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186424
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23486	NC_020560	GAC	2	6	1143102	1143107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470186425
23487	NC_020560	CGT	2	6	1143217	1143222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186425
23488	NC_020560	TG	3	6	1143228	1143233	0 %	50 %	50 %	0 %	470186425
23489	NC_020560	TCA	2	6	1143250	1143255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470186425
23490	NC_020560	TCC	2	6	1143258	1143263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470186425
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23492	NC_020560	TGA	2	6	1143316	1143321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470186425
23493	NC_020560	CGT	2	6	1143332	1143337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470186425
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