MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP3

Total Repeats: 766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020544	CCA	2	6	29641	29646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433951
502	NC_020544	CG	4	8	29692	29699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433951
503	NC_020544	CGA	2	6	29711	29716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433951
504	NC_020544	GAG	2	6	29826	29831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433951
505	NC_020544	GTT	2	6	29832	29837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433951
506	NC_020544	GAC	2	6	29870	29875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433951
507	NC_020544	GCCC	2	8	29909	29916	0 %	0 %	25 %	75 %	472433951
508	NC_020544	GT	3	6	30001	30006	0 %	50 %	50 %	0 %	472433951
509	NC_020544	TGG	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433951
510	NC_020544	AGGA	2	8	30190	30197	50 %	0 %	50 %	0 %	472433951
511	NC_020544	CTC	2	6	30285	30290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433951
512	NC_020544	CGC	2	6	30322	30327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433951
513	NC_020544	GCA	2	6	30340	30345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433951
514	NC_020544	GAT	2	6	30417	30422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433951
515	NC_020544	GAA	2	6	30471	30476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433951
516	NC_020544	AAT	2	6	30754	30759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433952
517	NC_020544	TGCCGG	2	12	30784	30795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	472433952
518	NC_020544	CGA	2	6	30802	30807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433952
519	NC_020544	CTG	2	6	30854	30859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433952
520	NC_020544	CGG	2	6	30886	30891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433952
521	NC_020544	C	7	7	30899	30905	0 %	0 %	0 %	100 %	472433952
522	NC_020544	CGC	2	6	30914	30919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433952
523	NC_020544	GCCCG	2	10	30931	30940	0 %	0 %	40 %	60 %	472433952
524	NC_020544	GC	3	6	30960	30965	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
525	NC_020544	GCT	2	6	30973	30978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433952
526	NC_020544	ATC	2	6	30987	30992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433952
527	NC_020544	CG	3	6	30994	30999	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
528	NC_020544	CGC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433952
529	NC_020544	GTCC	2	8	31021	31028	0 %	25 %	25 %	50 %	472433952
530	NC_020544	TCA	2	6	31069	31074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433952
531	NC_020544	CGC	2	6	31131	31136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433952
532	NC_020544	GAT	2	6	31190	31195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433952
533	NC_020544	CG	3	6	31212	31217	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
534	NC_020544	CGC	2	6	31274	31279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433952
535	NC_020544	TGC	2	6	31293	31298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433952
536	NC_020544	GAT	2	6	31333	31338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433952
537	NC_020544	GC	3	6	31343	31348	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
538	NC_020544	CG	3	6	31624	31629	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
539	NC_020544	CGCC	2	8	31678	31685	0 %	0 %	25 %	75 %	472433952
540	NC_020544	CG	3	6	31706	31711	0 %	0 %	50 %	50 %	472433952
541	NC_020544	GAC	2	6	31760	31765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433952
542	NC_020544	GTC	2	6	31805	31810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433952
543	NC_020544	CCG	2	6	31822	31827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433952
544	NC_020544	TGA	2	6	31873	31878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433952
545	NC_020544	GAA	2	6	32149	32154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433953
546	NC_020544	CAG	2	6	32159	32164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433953
547	NC_020544	CTCGAT	2	12	32201	32212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472433953
548	NC_020544	TGC	2	6	32226	32231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433953
549	NC_020544	CGC	2	6	32233	32238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433953
550	NC_020544	CGA	2	6	32257	32262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433953
551	NC_020544	AGG	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433953
552	NC_020544	GC	3	6	32275	32280	0 %	0 %	50 %	50 %	472433953
553	NC_020544	CTT	2	6	32293	32298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433953
554	NC_020544	GGC	2	6	32333	32338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433953
555	NC_020544	CGC	2	6	32430	32435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433954
556	NC_020544	GGC	2	6	32463	32468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433954
557	NC_020544	CGA	3	9	32501	32509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433954
558	NC_020544	GC	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
559	NC_020544	GCC	2	6	32544	32549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433954
560	NC_020544	GC	3	6	32553	32558	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
561	NC_020544	GCG	2	6	32588	32593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433954
562	NC_020544	GC	3	6	32600	32605	0 %	0 %	50 %	50 %	472433954
563	NC_020544	CGGAAG	2	12	32614	32625	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472433954
564	NC_020544	GA	3	6	32627	32632	50 %	0 %	50 %	0 %	472433954
565	NC_020544	CG	3	6	32678	32683	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
566	NC_020544	CG	3	6	32694	32699	0 %	0 %	50 %	50 %	472433955
567	NC_020544	ACGC	2	8	32742	32749	25 %	0 %	25 %	50 %	472433955
568	NC_020544	CCCCT	2	10	32829	32838	0 %	20 %	0 %	80 %	472433955
569	NC_020544	CTC	2	6	32861	32866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433955
570	NC_020544	ATC	2	6	32868	32873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433955
571	NC_020544	CCGAC	2	10	32880	32889	20 %	0 %	20 %	60 %	472433955
572	NC_020544	CGA	2	6	32907	32912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433955
573	NC_020544	CCG	2	6	32948	32953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433956
574	NC_020544	GGC	2	6	33043	33048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433956
575	NC_020544	ACGC	2	8	33080	33087	25 %	0 %	25 %	50 %	472433956
576	NC_020544	TCG	3	9	33140	33148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433956
577	NC_020544	TGG	2	6	33181	33186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433956
578	NC_020544	CGA	2	6	33195	33200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433956
579	NC_020544	CG	4	8	33291	33298	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
580	NC_020544	CTT	2	6	33306	33311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433956
581	NC_020544	ACGCC	2	10	33396	33405	20 %	0 %	20 %	60 %	472433956
582	NC_020544	CGC	2	6	33441	33446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433956
583	NC_020544	CG	3	6	33491	33496	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
584	NC_020544	CCA	2	6	33513	33518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433956
585	NC_020544	TGC	2	6	33545	33550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433956
586	NC_020544	GCTC	2	8	33599	33606	0 %	25 %	25 %	50 %	472433956
587	NC_020544	CG	3	6	33644	33649	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
588	NC_020544	CGC	2	6	33657	33662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433956
589	NC_020544	CCG	2	6	33663	33668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433956
590	NC_020544	GC	3	6	33687	33692	0 %	0 %	50 %	50 %	472433956
591	NC_020544	CCG	2	6	33731	33736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433956
592	NC_020544	CTGGC	2	10	33742	33751	0 %	20 %	40 %	40 %	472433956
593	NC_020544	CGA	2	6	33816	33821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433956
594	NC_020544	ATGA	2	8	33845	33852	50 %	25 %	25 %	0 %	472433956
595	NC_020544	GAC	2	6	33866	33871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433957
596	NC_020544	CGAT	2	8	33894	33901	25 %	25 %	25 %	25 %	472433957
597	NC_020544	CG	3	6	33904	33909	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
598	NC_020544	CT	3	6	33936	33941	0 %	50 %	0 %	50 %	472433957
599	NC_020544	GGC	2	6	33952	33957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433957
600	NC_020544	TCG	2	6	33972	33977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433957
601	NC_020544	CGC	3	9	34006	34014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433957
602	NC_020544	GCTC	2	8	34015	34022	0 %	25 %	25 %	50 %	472433957
603	NC_020544	GC	3	6	34044	34049	0 %	0 %	50 %	50 %	472433957
604	NC_020544	TGA	2	6	34158	34163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433958
605	NC_020544	CG	3	6	34187	34192	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
606	NC_020544	GC	3	6	34205	34210	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
607	NC_020544	CG	3	6	34213	34218	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
608	NC_020544	TCA	2	6	34305	34310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433958
609	NC_020544	GCT	2	6	34354	34359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
610	NC_020544	TGA	2	6	34395	34400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433958
611	NC_020544	GC	3	6	34435	34440	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
612	NC_020544	CGA	2	6	34483	34488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433958
613	NC_020544	CACG	2	8	34489	34496	25 %	0 %	25 %	50 %	472433958
614	NC_020544	CTG	2	6	34556	34561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
615	NC_020544	GCT	2	6	34588	34593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
616	NC_020544	CTG	2	6	34616	34621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
617	NC_020544	CAT	2	6	34660	34665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433958
618	NC_020544	CCGC	2	8	34734	34741	0 %	0 %	25 %	75 %	472433958
619	NC_020544	CGA	2	6	34855	34860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433958
620	NC_020544	TCC	2	6	34956	34961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433958
621	NC_020544	CGCAAG	2	12	34980	34991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433958
622	NC_020544	TGC	2	6	35058	35063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
623	NC_020544	GCA	2	6	35076	35081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433958
624	NC_020544	CG	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
625	NC_020544	GCC	2	6	35108	35113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433958
626	NC_020544	TGC	2	6	35274	35279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433958
627	NC_020544	GCTG	2	8	35307	35314	0 %	25 %	50 %	25 %	472433958
628	NC_020544	GC	4	8	35348	35355	0 %	0 %	50 %	50 %	472433958
629	NC_020544	GCCC	2	8	35369	35376	0 %	0 %	25 %	75 %	472433958
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755	NC_020544	CCA	2	6	43206	43211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433968
756	NC_020544	TCG	2	6	43265	43270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433968
757	NC_020544	ACC	2	6	43271	43276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433968
758	NC_020544	ATG	2	6	43304	43309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433968
759	NC_020544	GA	3	6	43376	43381	50 %	0 %	50 %	0 %	472433968
760	NC_020544	GCG	2	6	43420	43425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433968
761	NC_020544	GGCGAC	2	12	43447	43458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472433968
762	NC_020544	GCCC	2	8	43462	43469	0 %	0 %	25 %	75 %	472433968
763	NC_020544	GCG	2	6	43489	43494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433968
764	NC_020544	CAG	2	6	43495	43500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433968
765	NC_020544	GAC	2	6	43531	43536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433968
766	NC_020544	CGGG	2	8	43624	43631	0 %	0 %	75 %	25 %	472433968

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