MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 5506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020542	CT	3	6	225368	225373	0 %	50 %	0 %	50 %	472433883
4502	NC_020542	AAGCC	2	10	225427	225436	40 %	0 %	20 %	40 %	472433883
4503	NC_020542	GCGCG	2	10	225460	225469	0 %	0 %	60 %	40 %	472433883
4504	NC_020542	CGA	2	6	225488	225493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4505	NC_020542	GGC	2	6	225600	225605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4506	NC_020542	GCC	2	6	225632	225637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433883
4507	NC_020542	CTC	2	6	225714	225719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433883
4508	NC_020542	GAT	2	6	225831	225836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433883
4509	NC_020542	CTG	2	6	225837	225842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4510	NC_020542	GCC	2	6	225849	225854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433883
4511	NC_020542	GCG	2	6	225889	225894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4512	NC_020542	GGCG	2	8	225905	225912	0 %	0 %	75 %	25 %	472433883
4513	NC_020542	CGC	2	6	225917	225922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433883
4514	NC_020542	CCG	2	6	225963	225968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433883
4515	NC_020542	GTCGCC	2	12	226032	226043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472433883
4516	NC_020542	CTGC	2	8	226082	226089	0 %	25 %	25 %	50 %	472433883
4517	NC_020542	GC	5	10	226088	226097	0 %	0 %	50 %	50 %	472433883
4518	NC_020542	GAA	2	6	226101	226106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433883
4519	NC_020542	GGC	2	6	226107	226112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4520	NC_020542	TGA	2	6	226151	226156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433883
4521	NC_020542	ATG	2	6	226198	226203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433883
4522	NC_020542	CGG	2	6	226232	226237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4523	NC_020542	CTT	3	9	226244	226252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433883
4524	NC_020542	CG	4	8	226253	226260	0 %	0 %	50 %	50 %	472433883
4525	NC_020542	GTT	2	6	226286	226291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433883
4526	NC_020542	CG	3	6	226346	226351	0 %	0 %	50 %	50 %	472433883
4527	NC_020542	GC	3	6	226402	226407	0 %	0 %	50 %	50 %	472433883
4528	NC_020542	TCCC	2	8	226465	226472	0 %	25 %	0 %	75 %	472433883
4529	NC_020542	CGG	2	6	226500	226505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4530	NC_020542	ATTTC	2	10	226525	226534	20 %	60 %	0 %	20 %	472433883
4531	NC_020542	GCCA	2	8	226560	226567	25 %	0 %	25 %	50 %	472433883
4532	NC_020542	CGGC	2	8	226612	226619	0 %	0 %	50 %	50 %	472433883
4533	NC_020542	GTC	2	6	226635	226640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4534	NC_020542	GCG	2	6	226677	226682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433883
4535	NC_020542	CAT	2	6	226763	226768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433883
4536	NC_020542	CGT	2	6	226769	226774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4537	NC_020542	AGC	2	6	226821	226826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4538	NC_020542	CGA	2	6	226904	226909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4539	NC_020542	TCT	2	6	226933	226938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433883
4540	NC_020542	GCA	3	9	227023	227031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433883
4541	NC_020542	CCG	2	6	227070	227075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433883
4542	NC_020542	TCC	2	6	227116	227121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433884
4543	NC_020542	GC	3	6	227174	227179	0 %	0 %	50 %	50 %	472433884
4544	NC_020542	GC	3	6	227193	227198	0 %	0 %	50 %	50 %	472433884
4545	NC_020542	GCC	2	6	227232	227237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433884
4546	NC_020542	TGG	2	6	227346	227351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433884
4547	NC_020542	CGG	2	6	227384	227389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433884
4548	NC_020542	CGTC	2	8	227402	227409	0 %	25 %	25 %	50 %	472433884
4549	NC_020542	ATC	2	6	227427	227432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433884
4550	NC_020542	GCT	2	6	227477	227482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433884
4551	NC_020542	CTC	2	6	227493	227498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433884
4552	NC_020542	CGA	2	6	227513	227518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433884
4553	NC_020542	CCGA	2	8	227520	227527	25 %	0 %	25 %	50 %	472433884
4554	NC_020542	CG	3	6	227603	227608	0 %	0 %	50 %	50 %	472433884
4555	NC_020542	CG	3	6	227640	227645	0 %	0 %	50 %	50 %	472433884
4556	NC_020542	TGGCA	2	10	227682	227691	20 %	20 %	40 %	20 %	472433884
4557	NC_020542	TGA	2	6	227773	227778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433884
4558	NC_020542	GCT	2	6	227840	227845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433884
4559	NC_020542	GCC	2	6	227871	227876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433884
4560	NC_020542	CGG	2	6	227881	227886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433884
4561	NC_020542	TGC	2	6	227896	227901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433884
4562	NC_020542	GCT	2	6	227927	227932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433884
4563	NC_020542	CGGC	2	8	228050	228057	0 %	0 %	50 %	50 %	472433884
4564	NC_020542	GGCGC	2	10	228161	228170	0 %	0 %	60 %	40 %	472433884
4565	NC_020542	ATC	2	6	228196	228201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433884
4566	NC_020542	CAA	2	6	228244	228249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433885
4567	NC_020542	CAT	3	9	228304	228312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433885
4568	NC_020542	TGCG	2	8	228354	228361	0 %	25 %	50 %	25 %	472433885
4569	NC_020542	TTC	2	6	228365	228370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433885
4570	NC_020542	GAA	2	6	228385	228390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433885
4571	NC_020542	TAG	2	6	228592	228597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433885
4572	NC_020542	GTG	2	6	228603	228608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433885
4573	NC_020542	ACC	2	6	228614	228619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433885
4574	NC_020542	GC	3	6	228624	228629	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4575	NC_020542	CGCAGG	2	12	228648	228659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	472433885
4576	NC_020542	GCA	2	6	228681	228686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4577	NC_020542	GCA	3	9	228693	228701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4578	NC_020542	TCG	2	6	228735	228740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4579	NC_020542	GCG	2	6	228741	228746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433885
4580	NC_020542	GCG	2	6	228839	228844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433885
4581	NC_020542	CAG	2	6	228857	228862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4582	NC_020542	CG	4	8	228934	228941	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4583	NC_020542	GC	3	6	228994	228999	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4584	NC_020542	GCT	2	6	229031	229036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4585	NC_020542	GCA	2	6	229114	229119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
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4587	NC_020542	GAAG	2	8	229129	229136	50 %	0 %	50 %	0 %	472433885
4588	NC_020542	CCG	2	6	229173	229178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433885
4589	NC_020542	TGA	2	6	229258	229263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433885
4590	NC_020542	GGA	2	6	229297	229302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433885
4591	NC_020542	TCGC	2	8	229434	229441	0 %	25 %	25 %	50 %	472433885
4592	NC_020542	GGC	2	6	229541	229546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433885
4593	NC_020542	TCCG	2	8	229623	229630	0 %	25 %	25 %	50 %	472433885
4594	NC_020542	CGGCAA	2	12	229632	229643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4595	NC_020542	GGCC	2	8	229711	229718	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4596	NC_020542	CGC	2	6	229720	229725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433885
4597	NC_020542	GC	3	6	229748	229753	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4598	NC_020542	TGA	2	6	229891	229896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433885
4599	NC_020542	GC	3	6	229957	229962	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4600	NC_020542	CCGC	2	8	230017	230024	0 %	0 %	25 %	75 %	472433885
4601	NC_020542	GCC	2	6	230027	230032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433885
4602	NC_020542	GGCG	2	8	230038	230045	0 %	0 %	75 %	25 %	472433885
4603	NC_020542	CGAG	2	8	230047	230054	25 %	0 %	50 %	25 %	472433885
4604	NC_020542	ATCGC	2	10	230073	230082	20 %	20 %	20 %	40 %	472433885
4605	NC_020542	CG	3	6	230181	230186	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4606	NC_020542	ATG	2	6	230199	230204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433885
4607	NC_020542	CGAT	2	8	230232	230239	25 %	25 %	25 %	25 %	472433885
4608	NC_020542	AGGGC	2	10	230249	230258	20 %	0 %	60 %	20 %	472433885
4609	NC_020542	CGG	2	6	230264	230269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433885
4610	NC_020542	CGCC	2	8	230290	230297	0 %	0 %	25 %	75 %	472433885
4611	NC_020542	GAA	2	6	230360	230365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433885
4612	NC_020542	GCTCG	2	10	230390	230399	0 %	20 %	40 %	40 %	472433885
4613	NC_020542	GGC	2	6	230407	230412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433885
4614	NC_020542	GC	4	8	230447	230454	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4615	NC_020542	GC	3	6	230491	230496	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4616	NC_020542	GAA	2	6	230546	230551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433885
4617	NC_020542	AGC	2	6	230622	230627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4618	NC_020542	GCCTT	2	10	230643	230652	0 %	40 %	20 %	40 %	472433885
4619	NC_020542	TGC	2	6	230661	230666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4620	NC_020542	CGA	2	6	230698	230703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4621	NC_020542	CGA	2	6	230719	230724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433885
4622	NC_020542	CGGC	2	8	230725	230732	0 %	0 %	50 %	50 %	472433885
4623	NC_020542	TGA	2	6	230739	230744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433885
4624	NC_020542	GGA	2	6	230755	230760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433885
4625	NC_020542	CG	3	6	231064	231069	0 %	0 %	50 %	50 %	472433886
4626	NC_020542	GAC	2	6	231092	231097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4627	NC_020542	TCG	2	6	231192	231197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4629	NC_020542	T	6	6	231368	231373	0 %	100 %	0 %	0 %	472433886
4630	NC_020542	GCA	2	6	231472	231477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4631	NC_020542	GGA	2	6	231478	231483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433886
4632	NC_020542	AAG	2	6	231561	231566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433886
4633	NC_020542	CAT	2	6	231601	231606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433886
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4635	NC_020542	CTG	2	6	231632	231637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4636	NC_020542	CAG	2	6	231662	231667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4637	NC_020542	CGA	2	6	231706	231711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4638	NC_020542	GCT	2	6	231751	231756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4641	NC_020542	TCCA	2	8	231994	232001	25 %	25 %	0 %	50 %	472433886
4642	NC_020542	GAG	2	6	232127	232132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433886
4643	NC_020542	GCT	2	6	232283	232288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4644	NC_020542	GGC	2	6	232309	232314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
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4647	NC_020542	GAT	2	6	232409	232414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433886
4648	NC_020542	CG	3	6	232426	232431	0 %	0 %	50 %	50 %	472433886
4649	NC_020542	CGAT	2	8	232434	232441	25 %	25 %	25 %	25 %	472433886
4650	NC_020542	GA	3	6	232450	232455	50 %	0 %	50 %	0 %	472433886
4651	NC_020542	TGA	2	6	232462	232467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433886
4652	NC_020542	GAT	2	6	232535	232540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433886
4653	NC_020542	TGA	2	6	232546	232551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433886
4654	NC_020542	TCC	2	6	232592	232597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433886
4655	NC_020542	GCC	2	6	232617	232622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433886
4656	NC_020542	TGA	2	6	232623	232628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433886
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4661	NC_020542	TGGC	2	8	232752	232759	0 %	25 %	50 %	25 %	472433886
4662	NC_020542	ACG	2	6	232787	232792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4665	NC_020542	CGC	2	6	232853	232858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433886
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4686	NC_020542	CGG	2	6	233833	233838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
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4690	NC_020542	CACC	2	8	234015	234022	25 %	0 %	0 %	75 %	472433886
4691	NC_020542	AT	3	6	234039	234044	50 %	50 %	0 %	0 %	472433886
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4694	NC_020542	ATT	2	6	234183	234188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472433886
4695	NC_020542	TCG	2	6	234207	234212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4696	NC_020542	TCA	2	6	234243	234248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433886
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4698	NC_020542	GACCGA	2	12	234340	234351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4699	NC_020542	GTC	3	9	234431	234439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4700	NC_020542	GAA	2	6	234572	234577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433886
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4702	NC_020542	AGG	2	6	234633	234638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433886
4703	NC_020542	GGC	2	6	234655	234660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
4704	NC_020542	CTG	2	6	234677	234682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4707	NC_020542	ACA	2	6	234936	234941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433886
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4710	NC_020542	TTGC	2	8	235017	235024	0 %	50 %	25 %	25 %	472433886
4711	NC_020542	GGC	2	6	235047	235052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
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4713	NC_020542	GCG	2	6	235129	235134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
4714	NC_020542	CTG	2	6	235190	235195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4715	NC_020542	GAC	2	6	235202	235207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4718	NC_020542	TCGACA	2	12	235302	235313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472433886
4719	NC_020542	CGA	2	6	235363	235368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
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4721	NC_020542	GCT	3	9	235426	235434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4722	NC_020542	CGA	2	6	235564	235569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433886
4723	NC_020542	CTGC	2	8	235750	235757	0 %	25 %	25 %	50 %	472433886
4724	NC_020542	CAAC	2	8	235768	235775	50 %	0 %	0 %	50 %	472433886
4725	NC_020542	CCG	2	6	235869	235874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433886
4726	NC_020542	ATGG	2	8	235894	235901	25 %	25 %	50 %	0 %	472433886
4727	NC_020542	GC	3	6	235920	235925	0 %	0 %	50 %	50 %	472433886
4728	NC_020542	GGC	2	6	235949	235954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433886
4729	NC_020542	ATC	2	6	235962	235967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433886
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4731	NC_020542	GCC	2	6	236089	236094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433886
4732	NC_020542	GAA	2	6	236254	236259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433887
4733	NC_020542	CAT	3	9	236265	236273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433887
4734	NC_020542	CGG	3	9	236324	236332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433887
4735	NC_020542	ATC	2	6	236333	236338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433887
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4739	NC_020542	CG	3	6	236441	236446	0 %	0 %	50 %	50 %	472433887
4740	NC_020542	GCT	2	6	236496	236501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433887
4741	NC_020542	TCC	2	6	236549	236554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433887
4742	NC_020542	GAT	2	6	236559	236564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433887
4743	NC_020542	CGAGG	2	10	236569	236578	20 %	0 %	60 %	20 %	472433887
4744	NC_020542	CCG	2	6	236602	236607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433887
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4746	NC_020542	CGT	2	6	236745	236750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433887
4747	NC_020542	CGG	2	6	236779	236784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433887
4748	NC_020542	CGG	2	6	236844	236849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433887
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4750	NC_020542	ACGCT	2	10	236871	236880	20 %	20 %	20 %	40 %	472433887
4751	NC_020542	CCTGCT	2	12	236916	236927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	472433887
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4862	NC_020542	CGCGA	2	10	241816	241825	20 %	0 %	40 %	40 %	472433888
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4864	NC_020542	AGG	2	6	242014	242019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433888
4865	NC_020542	CGC	2	6	242046	242051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433888
4866	NC_020542	CGC	2	6	242088	242093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433888
4867	NC_020542	GGT	2	6	242147	242152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433888
4868	NC_020542	CATT	2	8	242162	242169	25 %	50 %	0 %	25 %	472433888
4869	NC_020542	CGAAG	2	10	242192	242201	40 %	0 %	40 %	20 %	472433888
4870	NC_020542	CCA	2	6	242207	242212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433888
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4894	NC_020542	CTG	2	6	243590	243595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433889
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4945	NC_020542	CGC	2	6	246457	246462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433892
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4972	NC_020542	TGA	2	6	247512	247517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433892
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4981	NC_020542	G	6	6	248090	248095	0 %	0 %	100 %	0 %	472433893
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4985	NC_020542	GGA	2	6	248314	248319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433893
4986	NC_020542	ATC	2	6	248324	248329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433893
4987	NC_020542	CGAG	2	8	248350	248357	25 %	0 %	50 %	25 %	472433893
4988	NC_020542	CGC	2	6	248410	248415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433893
4989	NC_020542	A	6	6	248552	248557	100 %	0 %	0 %	0 %	472433893
4990	NC_020542	AGG	2	6	248598	248603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433893
4991	NC_020542	CGT	2	6	248611	248616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433893
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4998	NC_020542	AAG	2	6	248879	248884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433893
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