MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_020540	TCA	2	6	1660273	1660278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415393
29002	NC_020540	CAT	2	6	1660347	1660352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415393
29003	NC_020540	GCT	2	6	1660411	1660416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415393
29004	NC_020540	TTG	2	6	1660442	1660447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415393
29005	NC_020540	TAA	2	6	1660475	1660480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415393
29006	NC_020540	CATTC	2	10	1660485	1660494	20 %	40 %	0 %	40 %	523415393
29007	NC_020540	AAT	2	6	1660504	1660509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415393
29008	NC_020540	TCT	2	6	1660585	1660590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415393
29009	NC_020540	AAT	2	6	1660605	1660610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415393
29010	NC_020540	CTT	2	6	1660661	1660666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415393
29011	NC_020540	A	7	7	1660714	1660720	100 %	0 %	0 %	0 %	523415393
29012	NC_020540	CAT	2	6	1660779	1660784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415393
29013	NC_020540	CAC	2	6	1660818	1660823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523415393
29014	NC_020540	A	6	6	1660911	1660916	100 %	0 %	0 %	0 %	523415393
29015	NC_020540	ACA	2	6	1660981	1660986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415393
29016	NC_020540	GTAA	2	8	1660990	1660997	50 %	25 %	25 %	0 %	523415393
29017	NC_020540	TA	3	6	1661003	1661008	50 %	50 %	0 %	0 %	523415393
29018	NC_020540	TCA	2	6	1661039	1661044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415393
29019	NC_020540	TAA	2	6	1661119	1661124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415393
29020	NC_020540	AAG	2	6	1661164	1661169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415393
29021	NC_020540	TAAAA	2	10	1661246	1661255	80 %	20 %	0 %	0 %	523415393
29022	NC_020540	A	6	6	1661260	1661265	100 %	0 %	0 %	0 %	523415393
29023	NC_020540	TCA	2	6	1661276	1661281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415393
29024	NC_020540	CTC	2	6	1661285	1661290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201836
29025	NC_020540	CCTT	2	8	1661291	1661298	0 %	50 %	0 %	50 %	470201836
29026	NC_020540	ATT	2	6	1661330	1661335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201836
29027	NC_020540	CCA	2	6	1661338	1661343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201836
29028	NC_020540	GT	3	6	1661351	1661356	0 %	50 %	50 %	0 %	470201836
29029	NC_020540	T	6	6	1661422	1661427	0 %	100 %	0 %	0 %	470201836
29030	NC_020540	CAA	2	6	1661431	1661436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201836
29031	NC_020540	CTT	2	6	1661473	1661478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201836
29032	NC_020540	GAT	2	6	1661542	1661547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201836
29033	NC_020540	AGAC	2	8	1661567	1661574	50 %	0 %	25 %	25 %	470201836
29034	NC_020540	TAC	2	6	1661599	1661604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201836
29035	NC_020540	TTGC	2	8	1661659	1661666	0 %	50 %	25 %	25 %	470201836
29036	NC_020540	GTT	2	6	1661793	1661798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201836
29037	NC_020540	TCC	2	6	1661822	1661827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201836
29038	NC_020540	TCA	3	9	1661967	1661975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201836
29039	NC_020540	TTTTCA	2	12	1662033	1662044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470201836
29040	NC_020540	AACC	2	8	1662127	1662134	50 %	0 %	0 %	50 %	470201836
29041	NC_020540	AAT	2	6	1662137	1662142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201836
29042	NC_020540	CAT	2	6	1662158	1662163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201836
29043	NC_020540	ACA	2	6	1662225	1662230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201836
29044	NC_020540	TTG	3	9	1662356	1662364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201836
29045	NC_020540	GCGAT	2	10	1662414	1662423	20 %	20 %	40 %	20 %	470201836
29046	NC_020540	ATG	2	6	1662489	1662494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201836
29047	NC_020540	ACA	2	6	1662516	1662521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201836
29048	NC_020540	CCA	2	6	1662527	1662532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201836
29049	NC_020540	ATA	2	6	1662558	1662563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201836
29050	NC_020540	CAT	3	9	1662608	1662616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201836
29051	NC_020540	TGAT	2	8	1662633	1662640	25 %	50 %	25 %	0 %	470201836
29052	NC_020540	TTAG	2	8	1662645	1662652	25 %	50 %	25 %	0 %	470201836
29053	NC_020540	TCT	2	6	1662724	1662729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201836
29054	NC_020540	CAG	2	6	1662739	1662744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201836
29055	NC_020540	AGC	2	6	1662764	1662769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201836
29056	NC_020540	AAT	2	6	1662812	1662817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201836
29057	NC_020540	ATT	2	6	1662854	1662859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201836
29058	NC_020540	ACT	2	6	1662908	1662913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201836
29059	NC_020540	CAA	2	6	1662916	1662921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201836
29060	NC_020540	A	6	6	1662935	1662940	100 %	0 %	0 %	0 %	470201836
29061	NC_020540	T	6	6	1663038	1663043	0 %	100 %	0 %	0 %	470201837
29062	NC_020540	CTT	2	6	1663058	1663063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201837
29063	NC_020540	A	6	6	1663078	1663083	100 %	0 %	0 %	0 %	470201837
29064	NC_020540	CAA	2	6	1663113	1663118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201837
29065	NC_020540	ACT	2	6	1663150	1663155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201837
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29067	NC_020540	A	7	7	1663306	1663312	100 %	0 %	0 %	0 %	470201837
29068	NC_020540	CAT	2	6	1663349	1663354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201837
29069	NC_020540	T	7	7	1663356	1663362	0 %	100 %	0 %	0 %	470201837
29070	NC_020540	TCA	2	6	1663369	1663374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201837
29071	NC_020540	ACAAA	2	10	1663731	1663740	80 %	0 %	0 %	20 %	470201838
29072	NC_020540	ACT	2	6	1663876	1663881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201838
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29104	NC_020540	GAA	2	6	1665233	1665238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415394
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29112	NC_020540	CAT	2	6	1665634	1665639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415394
29113	NC_020540	AGA	2	6	1665660	1665665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415394
29114	NC_020540	AC	3	6	1665795	1665800	50 %	0 %	0 %	50 %	470201840
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29116	NC_020540	TTC	2	6	1665848	1665853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201840
29117	NC_020540	CAC	2	6	1665900	1665905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201840
29118	NC_020540	TCA	2	6	1665957	1665962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201840
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29143	NC_020540	CAT	2	6	1667494	1667499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415396
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29215	NC_020540	TGC	2	6	1671054	1671059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415398
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29217	NC_020540	CTGCTC	2	12	1671080	1671091	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	523415398
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29222	NC_020540	T	6	6	1671162	1671167	0 %	100 %	0 %	0 %	523415398
29223	NC_020540	CTA	2	6	1671248	1671253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415398
29224	NC_020540	TTG	2	6	1671292	1671297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415398
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29227	NC_020540	T	6	6	1671446	1671451	0 %	100 %	0 %	0 %	523415398
29228	NC_020540	TAA	2	6	1671465	1671470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415398
29229	NC_020540	T	6	6	1671582	1671587	0 %	100 %	0 %	0 %	523415398
29230	NC_020540	ATCTT	2	10	1671598	1671607	20 %	60 %	0 %	20 %	523415398
29231	NC_020540	ATC	2	6	1671663	1671668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415398
29232	NC_020540	AGCATA	2	12	1671687	1671698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523415398
29233	NC_020540	TTG	2	6	1671728	1671733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415398
29234	NC_020540	AAG	2	6	1671812	1671817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415398
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29237	NC_020540	CTA	2	6	1671910	1671915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415398
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29346	NC_020540	T	7	7	1678220	1678226	0 %	100 %	0 %	0 %	523415401
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29349	NC_020540	TCA	2	6	1678345	1678350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415401
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29459	NC_020540	AGGAT	2	10	1684212	1684221	40 %	20 %	40 %	0 %	470201854
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29462	NC_020540	T	6	6	1684363	1684368	0 %	100 %	0 %	0 %	470201854
29463	NC_020540	TC	3	6	1684379	1684384	0 %	50 %	0 %	50 %	470201854
29464	NC_020540	TCA	2	6	1684416	1684421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201854
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29466	NC_020540	AG	3	6	1684442	1684447	50 %	0 %	50 %	0 %	470201854
29467	NC_020540	TAA	2	6	1684465	1684470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201854
29468	NC_020540	TTGA	2	8	1684561	1684568	25 %	50 %	25 %	0 %	470201854
29469	NC_020540	T	6	6	1684827	1684832	0 %	100 %	0 %	0 %	470201854
29470	NC_020540	TAA	2	6	1684890	1684895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201854
29471	NC_020540	T	6	6	1684922	1684927	0 %	100 %	0 %	0 %	470201854
29472	NC_020540	GAT	2	6	1684949	1684954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201854
29473	NC_020540	TCA	2	6	1684979	1684984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201854
29474	NC_020540	CTT	2	6	1685043	1685048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201854
29475	NC_020540	T	6	6	1685074	1685079	0 %	100 %	0 %	0 %	470201854
29476	NC_020540	TAC	2	6	1685112	1685117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201854
29477	NC_020540	T	7	7	1685118	1685124	0 %	100 %	0 %	0 %	470201854
29478	NC_020540	TGC	2	6	1685151	1685156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201854
29479	NC_020540	GAT	2	6	1685197	1685202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201854
29480	NC_020540	ATA	2	6	1685234	1685239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201854
29481	NC_020540	TG	3	6	1685271	1685276	0 %	50 %	50 %	0 %	470201854
29482	NC_020540	ATA	2	6	1685277	1685282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201854
29483	NC_020540	AAT	2	6	1685299	1685304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201854
29484	NC_020540	ATT	2	6	1685312	1685317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201854
29485	NC_020540	ATCTT	2	10	1686048	1686057	20 %	60 %	0 %	20 %	470201856
29486	NC_020540	T	6	6	1686122	1686127	0 %	100 %	0 %	0 %	470201856
29487	NC_020540	CA	3	6	1686150	1686155	50 %	0 %	0 %	50 %	470201856
29488	NC_020540	TTTC	2	8	1686187	1686194	0 %	75 %	0 %	25 %	470201856
29489	NC_020540	TTG	2	6	1686222	1686227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201856
29490	NC_020540	GT	3	6	1686243	1686248	0 %	50 %	50 %	0 %	470201856
29491	NC_020540	GCT	2	6	1686262	1686267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201856
29492	NC_020540	TTG	2	6	1686323	1686328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201856
29493	NC_020540	T	6	6	1686407	1686412	0 %	100 %	0 %	0 %	470201856
29494	NC_020540	T	6	6	1686542	1686547	0 %	100 %	0 %	0 %	470201856
29495	NC_020540	TGAT	2	8	1686554	1686561	25 %	50 %	25 %	0 %	470201856
29496	NC_020540	CTG	2	6	1686700	1686705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201856
29497	NC_020540	TCT	2	6	1686738	1686743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201856
29498	NC_020540	TGC	2	6	1686848	1686853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201856
29499	NC_020540	ACA	2	6	1686966	1686971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201856
29500	NC_020540	T	6	6	1686977	1686982	0 %	100 %	0 %	0 %	470201856

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