MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_020540	CTT	2	6	1456790	1456795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201644
25503	NC_020540	TCC	2	6	1456861	1456866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201644
25504	NC_020540	TATC	2	8	1456933	1456940	25 %	50 %	0 %	25 %	470201644
25505	NC_020540	TGG	2	6	1457051	1457056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201644
25506	NC_020540	CT	3	6	1457105	1457110	0 %	50 %	0 %	50 %	470201644
25507	NC_020540	GAA	2	6	1457162	1457167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201644
25508	NC_020540	A	6	6	1457166	1457171	100 %	0 %	0 %	0 %	470201644
25509	NC_020540	ATC	3	9	1457187	1457195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201644
25510	NC_020540	TAT	2	6	1457234	1457239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201644
25511	NC_020540	ATCA	2	8	1457516	1457523	50 %	25 %	0 %	25 %	470201645
25512	NC_020540	A	7	7	1457545	1457551	100 %	0 %	0 %	0 %	470201645
25513	NC_020540	GCC	2	6	1457556	1457561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470201645
25514	NC_020540	ATTAC	2	10	1457663	1457672	40 %	40 %	0 %	20 %	470201645
25515	NC_020540	TTA	2	6	1457691	1457696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201645
25516	NC_020540	T	6	6	1457702	1457707	0 %	100 %	0 %	0 %	470201645
25517	NC_020540	A	7	7	1457715	1457721	100 %	0 %	0 %	0 %	470201645
25518	NC_020540	A	6	6	1458161	1458166	100 %	0 %	0 %	0 %	470201646
25519	NC_020540	TGA	2	6	1458209	1458214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201646
25520	NC_020540	CGT	2	6	1458219	1458224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201646
25521	NC_020540	AGA	2	6	1458242	1458247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201646
25522	NC_020540	AGA	2	6	1458305	1458310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201646
25523	NC_020540	CAA	2	6	1458318	1458323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201646
25524	NC_020540	TAG	2	6	1458376	1458381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201646
25525	NC_020540	CAT	2	6	1458404	1458409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201646
25526	NC_020540	CTC	2	6	1458427	1458432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201646
25527	NC_020540	GAA	2	6	1458459	1458464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201646
25528	NC_020540	TGACTT	2	12	1458500	1458511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470201646
25529	NC_020540	AAG	2	6	1458667	1458672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201646
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25531	NC_020540	CTG	2	6	1458796	1458801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201646
25532	NC_020540	ATT	2	6	1458817	1458822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201646
25533	NC_020540	TTTAC	2	10	1458859	1458868	20 %	60 %	0 %	20 %	470201646
25534	NC_020540	AC	3	6	1458916	1458921	50 %	0 %	0 %	50 %	470201646
25535	NC_020540	AGA	2	6	1458980	1458985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201646
25536	NC_020540	A	6	6	1459003	1459008	100 %	0 %	0 %	0 %	470201646
25537	NC_020540	TTC	2	6	1459030	1459035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201646
25538	NC_020540	GCT	2	6	1459095	1459100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201646
25539	NC_020540	TCA	2	6	1459155	1459160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201646
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25541	NC_020540	CGT	2	6	1459188	1459193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201646
25542	NC_020540	TGA	2	6	1459211	1459216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201646
25543	NC_020540	GTCG	2	8	1459269	1459276	0 %	25 %	50 %	25 %	470201646
25544	NC_020540	AGC	2	6	1459283	1459288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201646
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25546	NC_020540	TGT	2	6	1459602	1459607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201647
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25548	NC_020540	TGA	2	6	1459699	1459704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201647
25549	NC_020540	AAT	2	6	1459742	1459747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201647
25550	NC_020540	CTA	2	6	1459753	1459758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201647
25551	NC_020540	TCA	2	6	1459792	1459797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201647
25552	NC_020540	CATA	2	8	1459870	1459877	50 %	25 %	0 %	25 %	470201647
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25556	NC_020540	TTC	2	6	1460024	1460029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201647
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25559	NC_020540	CAT	2	6	1460251	1460256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201647
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25566	NC_020540	ATA	2	6	1460570	1460575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201648
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25585	NC_020540	AGG	2	6	1461468	1461473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523415324
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25589	NC_020540	CTG	2	6	1461659	1461664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415324
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25601	NC_020540	CTT	2	6	1462184	1462189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415324
25602	NC_020540	CA	3	6	1462328	1462333	50 %	0 %	0 %	50 %	523415324
25603	NC_020540	GCT	2	6	1462405	1462410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415324
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25606	NC_020540	T	7	7	1462601	1462607	0 %	100 %	0 %	0 %	523415324
25607	NC_020540	TCC	2	6	1462624	1462629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415324
25608	NC_020540	TGC	2	6	1462678	1462683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201650
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25612	NC_020540	TCT	2	6	1462841	1462846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201650
25613	NC_020540	AAAG	2	8	1462936	1462943	75 %	0 %	25 %	0 %	470201650
25614	NC_020540	GTC	2	6	1462981	1462986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201650
25615	NC_020540	AC	3	6	1462998	1463003	50 %	0 %	0 %	50 %	470201650
25616	NC_020540	CAT	2	6	1463062	1463067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201650
25617	NC_020540	TCA	2	6	1463162	1463167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201651
25618	NC_020540	T	7	7	1463202	1463208	0 %	100 %	0 %	0 %	470201651
25619	NC_020540	TGG	2	6	1463232	1463237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201651
25620	NC_020540	CAA	2	6	1463285	1463290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201651
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25622	NC_020540	CTGGA	2	10	1463357	1463366	20 %	20 %	40 %	20 %	470201651
25623	NC_020540	TTGAT	2	10	1463427	1463436	20 %	60 %	20 %	0 %	470201651
25624	NC_020540	GTT	2	6	1463453	1463458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201651
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25627	NC_020540	CTG	2	6	1463772	1463777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201652
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25630	NC_020540	CT	3	6	1463855	1463860	0 %	50 %	0 %	50 %	470201652
25631	NC_020540	TAAT	2	8	1463903	1463910	50 %	50 %	0 %	0 %	470201652
25632	NC_020540	CTT	2	6	1463931	1463936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201652
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25644	NC_020540	T	6	6	1464601	1464606	0 %	100 %	0 %	0 %	470201652
25645	NC_020540	CAG	2	6	1464642	1464647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201652
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25647	NC_020540	ACT	2	6	1464779	1464784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201652
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25651	NC_020540	AGGA	2	8	1464963	1464970	50 %	0 %	50 %	0 %	470201653
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25662	NC_020540	T	6	6	1465528	1465533	0 %	100 %	0 %	0 %	470201653
25663	NC_020540	CT	3	6	1465555	1465560	0 %	50 %	0 %	50 %	523415325
25664	NC_020540	TTC	2	6	1465625	1465630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415325
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25717	NC_020540	GCT	2	6	1468643	1468648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201657
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25720	NC_020540	GCTA	2	8	1468858	1468865	25 %	25 %	25 %	25 %	470201657
25721	NC_020540	ATT	2	6	1468870	1468875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201657
25722	NC_020540	CTG	2	6	1468885	1468890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201657
25723	NC_020540	CTGA	2	8	1468909	1468916	25 %	25 %	25 %	25 %	470201657
25724	NC_020540	A	6	6	1468923	1468928	100 %	0 %	0 %	0 %	470201657
25725	NC_020540	TCC	2	6	1468943	1468948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415326
25726	NC_020540	TCA	2	6	1468997	1469002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415326
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25728	NC_020540	ATTT	2	8	1469151	1469158	25 %	75 %	0 %	0 %	523415326
25729	NC_020540	TTC	2	6	1469302	1469307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415326
25730	NC_020540	CCT	2	6	1469375	1469380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415326
25731	NC_020540	CTTA	2	8	1469443	1469450	25 %	50 %	0 %	25 %	470201659
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25733	NC_020540	AGCT	2	8	1469516	1469523	25 %	25 %	25 %	25 %	470201659
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25965	NC_020540	ATC	3	9	1484764	1484772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415333
25966	NC_020540	AAAT	2	8	1484803	1484810	75 %	25 %	0 %	0 %	523415333
25967	NC_020540	ATAA	2	8	1484866	1484873	75 %	25 %	0 %	0 %	523415333
25968	NC_020540	CCT	2	6	1484897	1484902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415333
25969	NC_020540	TGAT	2	8	1484923	1484930	25 %	50 %	25 %	0 %	523415333
25970	NC_020540	CCT	2	6	1484933	1484938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415333
25971	NC_020540	AAC	2	6	1484950	1484955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415333
25972	NC_020540	TTG	2	6	1484956	1484961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415333
25973	NC_020540	CCAT	2	8	1485051	1485058	25 %	25 %	0 %	50 %	523415333
25974	NC_020540	A	6	6	1485114	1485119	100 %	0 %	0 %	0 %	523415333
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25976	NC_020540	CCAT	2	8	1485158	1485165	25 %	25 %	0 %	50 %	523415333
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25978	NC_020540	TCT	2	6	1485233	1485238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415333
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25981	NC_020540	TTTGA	2	10	1485317	1485326	20 %	60 %	20 %	0 %	523415333
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25984	NC_020540	TCC	2	6	1485385	1485390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415333
25985	NC_020540	CA	3	6	1485400	1485405	50 %	0 %	0 %	50 %	523415333
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25987	NC_020540	AAAT	2	8	1485509	1485516	75 %	25 %	0 %	0 %	523415333
25988	NC_020540	A	6	6	1485582	1485587	100 %	0 %	0 %	0 %	523415333
25989	NC_020540	AGC	2	6	1485673	1485678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415333
25990	NC_020540	T	6	6	1485705	1485710	0 %	100 %	0 %	0 %	523415333
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25992	NC_020540	TGA	2	6	1485784	1485789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415333
25993	NC_020540	AAT	2	6	1485796	1485801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415333
25994	NC_020540	AAT	2	6	1485944	1485949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415334
25995	NC_020540	A	6	6	1485971	1485976	100 %	0 %	0 %	0 %	523415334
25996	NC_020540	A	7	7	1485987	1485993	100 %	0 %	0 %	0 %	523415334
25997	NC_020540	AGG	2	6	1486024	1486029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523415334
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25999	NC_020540	TAC	2	6	1486144	1486149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415334
26000	NC_020540	AAG	2	6	1486225	1486230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415334

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