MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_020540	ACCC	2	8	1364567	1364574	25 %	0 %	0 %	75 %	523415304
24002	NC_020540	TTG	2	6	1364601	1364606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415304
24003	NC_020540	TTG	2	6	1364613	1364618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415304
24004	NC_020540	AGC	2	6	1364676	1364681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24005	NC_020540	CTG	2	6	1364708	1364713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24006	NC_020540	CAC	2	6	1364777	1364782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523415304
24007	NC_020540	CAG	2	6	1364819	1364824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24008	NC_020540	TGA	2	6	1364839	1364844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415304
24009	NC_020540	T	6	6	1364859	1364864	0 %	100 %	0 %	0 %	523415304
24010	NC_020540	AAT	2	6	1364940	1364945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415304
24011	NC_020540	GAT	2	6	1364958	1364963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415304
24012	NC_020540	GGTT	2	8	1364964	1364971	0 %	50 %	50 %	0 %	523415304
24013	NC_020540	GCT	2	6	1364989	1364994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24014	NC_020540	AGC	2	6	1365000	1365005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24015	NC_020540	TCT	2	6	1365013	1365018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415304
24016	NC_020540	TCT	2	6	1365082	1365087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415304
24017	NC_020540	AG	3	6	1365115	1365120	50 %	0 %	50 %	0 %	523415304
24018	NC_020540	TGC	2	6	1365180	1365185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24019	NC_020540	GTCACC	2	12	1365210	1365221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	523415304
24020	NC_020540	GCT	2	6	1365277	1365282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24021	NC_020540	TG	3	6	1365363	1365368	0 %	50 %	50 %	0 %	523415304
24022	NC_020540	TCT	2	6	1365424	1365429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415304
24023	NC_020540	CTG	2	6	1365488	1365493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24024	NC_020540	TGC	2	6	1365582	1365587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415304
24025	NC_020540	CT	3	6	1365702	1365707	0 %	50 %	0 %	50 %	523415304
24026	NC_020540	TTA	2	6	1365710	1365715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415304
24027	NC_020540	T	6	6	1365767	1365772	0 %	100 %	0 %	0 %	523415304
24028	NC_020540	TCC	2	6	1365780	1365785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415304
24029	NC_020540	A	7	7	1365820	1365826	100 %	0 %	0 %	0 %	523415304
24030	NC_020540	CAT	2	6	1365837	1365842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415304
24031	NC_020540	AG	3	6	1365871	1365876	50 %	0 %	50 %	0 %	523415304
24032	NC_020540	T	6	6	1365913	1365918	0 %	100 %	0 %	0 %	470201539
24033	NC_020540	TCG	2	6	1366005	1366010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201539
24034	NC_020540	TG	3	6	1366014	1366019	0 %	50 %	50 %	0 %	470201539
24035	NC_020540	TGT	2	6	1366051	1366056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201539
24036	NC_020540	TGC	2	6	1366066	1366071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201539
24037	NC_020540	GAT	2	6	1366072	1366077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201539
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24039	NC_020540	TGTT	2	8	1366269	1366276	0 %	75 %	25 %	0 %	470201539
24040	NC_020540	ACG	2	6	1366310	1366315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201539
24041	NC_020540	CTT	2	6	1366347	1366352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201539
24042	NC_020540	CTG	2	6	1366365	1366370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201539
24043	NC_020540	CGA	2	6	1366404	1366409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201539
24044	NC_020540	TGG	2	6	1366473	1366478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201539
24045	NC_020540	ATTTC	2	10	1366548	1366557	20 %	60 %	0 %	20 %	470201539
24046	NC_020540	CA	3	6	1366681	1366686	50 %	0 %	0 %	50 %	523415305
24047	NC_020540	TG	3	6	1366691	1366696	0 %	50 %	50 %	0 %	523415305
24048	NC_020540	GCT	2	6	1366711	1366716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415305
24049	NC_020540	TGAG	2	8	1366721	1366728	25 %	25 %	50 %	0 %	523415305
24050	NC_020540	T	7	7	1366747	1366753	0 %	100 %	0 %	0 %	523415305
24051	NC_020540	ACAG	2	8	1366851	1366858	50 %	0 %	25 %	25 %	523415305
24052	NC_020540	TGA	2	6	1366891	1366896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415305
24053	NC_020540	GCT	2	6	1366963	1366968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415305
24054	NC_020540	CTA	2	6	1366997	1367002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415305
24055	NC_020540	TGG	2	6	1367014	1367019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523415305
24056	NC_020540	A	6	6	1367030	1367035	100 %	0 %	0 %	0 %	523415305
24057	NC_020540	CAA	2	6	1367037	1367042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415305
24058	NC_020540	CGT	2	6	1367051	1367056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415305
24059	NC_020540	CTG	2	6	1367064	1367069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415305
24060	NC_020540	GCA	2	6	1367096	1367101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415305
24061	NC_020540	CTA	2	6	1367147	1367152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415305
24062	NC_020540	TTGG	2	8	1367173	1367180	0 %	50 %	50 %	0 %	523415305
24063	NC_020540	A	6	6	1367202	1367207	100 %	0 %	0 %	0 %	523415305
24064	NC_020540	A	7	7	1367219	1367225	100 %	0 %	0 %	0 %	523415305
24065	NC_020540	TCC	2	6	1367248	1367253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523415305
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24067	NC_020540	A	6	6	1367509	1367514	100 %	0 %	0 %	0 %	523415305
24068	NC_020540	CCAA	2	8	1367561	1367568	50 %	0 %	0 %	50 %	523415305
24069	NC_020540	AAT	2	6	1367572	1367577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415305
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24071	NC_020540	AAT	2	6	1368197	1368202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415305
24072	NC_020540	GAT	2	6	1368222	1368227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415305
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24075	NC_020540	CTT	3	9	1368468	1368476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415306
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24082	NC_020540	TTA	3	9	1368872	1368880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415306
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24087	NC_020540	TGC	2	6	1369300	1369305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415306
24088	NC_020540	AGGC	2	8	1369307	1369314	25 %	0 %	50 %	25 %	523415306
24089	NC_020540	AAT	2	6	1369358	1369363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415306
24090	NC_020540	CAA	2	6	1369452	1369457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415306
24091	NC_020540	ATA	2	6	1369514	1369519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415306
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24099	NC_020540	CTG	2	6	1369854	1369859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201542
24100	NC_020540	CATAT	2	10	1369861	1369870	40 %	40 %	0 %	20 %	470201542
24101	NC_020540	CAG	2	6	1369995	1370000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201542
24102	NC_020540	CTGAA	2	10	1370015	1370024	40 %	20 %	20 %	20 %	470201542
24103	NC_020540	AACC	2	8	1370040	1370047	50 %	0 %	0 %	50 %	470201542
24104	NC_020540	CCAG	2	8	1370197	1370204	25 %	0 %	25 %	50 %	470201542
24105	NC_020540	CCAG	2	8	1370218	1370225	25 %	0 %	25 %	50 %	470201542
24106	NC_020540	CCT	2	6	1370332	1370337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201543
24107	NC_020540	CGA	2	6	1370379	1370384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201543
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24109	NC_020540	TCAA	2	8	1370457	1370464	50 %	25 %	0 %	25 %	470201543
24110	NC_020540	ATAA	2	8	1370484	1370491	75 %	25 %	0 %	0 %	470201543
24111	NC_020540	TTC	2	6	1370503	1370508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201543
24112	NC_020540	AAT	2	6	1370515	1370520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201543
24113	NC_020540	GCT	2	6	1370595	1370600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201543
24114	NC_020540	CAT	2	6	1370668	1370673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24115	NC_020540	GATT	2	8	1370740	1370747	25 %	50 %	25 %	0 %	470201543
24116	NC_020540	CCT	2	6	1370751	1370756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201543
24117	NC_020540	CTT	2	6	1370806	1370811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201543
24118	NC_020540	AAT	2	6	1370822	1370827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201543
24119	NC_020540	ACC	2	6	1370873	1370878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201543
24120	NC_020540	TCA	2	6	1370901	1370906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24121	NC_020540	ATC	2	6	1371059	1371064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24122	NC_020540	CCA	2	6	1371084	1371089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201543
24123	NC_020540	ATC	2	6	1371152	1371157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24124	NC_020540	AAT	2	6	1371205	1371210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201543
24125	NC_020540	TCT	2	6	1371216	1371221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201543
24126	NC_020540	GTCCGT	2	12	1371257	1371268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201543
24127	NC_020540	T	6	6	1371283	1371288	0 %	100 %	0 %	0 %	470201543
24128	NC_020540	CAT	2	6	1371319	1371324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24129	NC_020540	TGA	2	6	1371411	1371416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201543
24130	NC_020540	GA	3	6	1371433	1371438	50 %	0 %	50 %	0 %	470201543
24131	NC_020540	TCA	2	6	1371450	1371455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201543
24132	NC_020540	TGA	2	6	1371475	1371480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201543
24133	NC_020540	CAG	2	6	1371515	1371520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201543
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24135	NC_020540	TCT	2	6	1371570	1371575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201543
24136	NC_020540	ATT	2	6	1371650	1371655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201543
24137	NC_020540	CAC	2	6	1371676	1371681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201543
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24140	NC_020540	CTT	3	9	1371724	1371732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201543
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24145	NC_020540	C	6	6	1371962	1371967	0 %	0 %	0 %	100 %	470201543
24146	NC_020540	GCC	2	6	1372050	1372055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470201543
24147	NC_020540	AAT	2	6	1372091	1372096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201543
24148	NC_020540	TCTT	2	8	1372112	1372119	0 %	75 %	0 %	25 %	470201543
24149	NC_020540	T	6	6	1372123	1372128	0 %	100 %	0 %	0 %	470201543
24150	NC_020540	ATTCC	2	10	1372159	1372168	20 %	40 %	0 %	40 %	470201543
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24153	NC_020540	ATTC	2	8	1372276	1372283	25 %	50 %	0 %	25 %	470201544
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24156	NC_020540	ATT	2	6	1372457	1372462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201544
24157	NC_020540	TCT	2	6	1372581	1372586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201544
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24179	NC_020540	TAC	2	6	1374416	1374421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415307
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24186	NC_020540	CTGC	2	8	1375176	1375183	0 %	25 %	25 %	50 %	470201547
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24188	NC_020540	CTG	2	6	1375309	1375314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201547
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24194	NC_020540	GCA	2	6	1375725	1375730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201547
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24198	NC_020540	CACC	2	8	1375831	1375838	25 %	0 %	0 %	75 %	470201547
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24202	NC_020540	T	6	6	1375978	1375983	0 %	100 %	0 %	0 %	470201547
24203	NC_020540	AGA	2	6	1376050	1376055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201547
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24222	NC_020540	CAA	2	6	1377492	1377497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201548
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24233	NC_020540	TCCAT	2	10	1377917	1377926	20 %	40 %	0 %	40 %	470201548
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24337	NC_020540	A	6	6	1383867	1383872	100 %	0 %	0 %	0 %	523415310
24338	NC_020540	ATT	2	6	1383918	1383923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415310
24339	NC_020540	CTTCAG	2	12	1384045	1384056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523415310
24340	NC_020540	ATC	2	6	1384136	1384141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415310
24341	NC_020540	TCC	2	6	1384304	1384309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470201554
24342	NC_020540	GATTT	2	10	1384377	1384386	20 %	60 %	20 %	0 %	470201554
24343	NC_020540	T	6	6	1384384	1384389	0 %	100 %	0 %	0 %	470201554
24344	NC_020540	TGAGCA	2	12	1384419	1384430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470201554
24345	NC_020540	TCT	2	6	1384470	1384475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201554
24346	NC_020540	T	8	8	1384493	1384500	0 %	100 %	0 %	0 %	470201554
24347	NC_020540	GAA	2	6	1384516	1384521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201554
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24349	NC_020540	T	6	6	1384657	1384662	0 %	100 %	0 %	0 %	470201554
24350	NC_020540	CTT	2	6	1384690	1384695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201554
24351	NC_020540	CTG	2	6	1384759	1384764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201554
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24354	NC_020540	TCA	2	6	1384870	1384875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201554
24355	NC_020540	GAC	2	6	1384950	1384955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201554
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24357	NC_020540	TAT	2	6	1384975	1384980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201554
24358	NC_020540	CAT	3	9	1384993	1385001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201554
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24453	NC_020540	T	6	6	1390558	1390563	0 %	100 %	0 %	0 %	523415314
24454	NC_020540	AAT	2	6	1390610	1390615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415314
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24457	NC_020540	AAT	2	6	1390699	1390704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415314
24458	NC_020540	TCAA	2	8	1390754	1390761	50 %	25 %	0 %	25 %	523415314
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24460	NC_020540	T	7	7	1391076	1391082	0 %	100 %	0 %	0 %	523415314
24461	NC_020540	AGC	2	6	1391092	1391097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415314
24462	NC_020540	TCA	2	6	1391169	1391174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415314
24463	NC_020540	AAG	2	6	1391221	1391226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523415314
24464	NC_020540	TCA	2	6	1391228	1391233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415314
24465	NC_020540	TCA	2	6	1391244	1391249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415314
24466	NC_020540	CAA	2	6	1391277	1391282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415314
24467	NC_020540	T	7	7	1391415	1391421	0 %	100 %	0 %	0 %	523415314
24468	NC_020540	ACC	2	6	1391444	1391449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523415314
24469	NC_020540	TTG	2	6	1391496	1391501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415314
24470	NC_020540	AAT	2	6	1391524	1391529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415314
24471	NC_020540	AAT	2	6	1391599	1391604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415314
24472	NC_020540	TAA	2	6	1391754	1391759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415314
24473	NC_020540	A	6	6	1391765	1391770	100 %	0 %	0 %	0 %	523415314
24474	NC_020540	CAT	2	6	1391776	1391781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415314
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24476	NC_020540	CTA	2	6	1391899	1391904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201564
24477	NC_020540	TTC	2	6	1391975	1391980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201564
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24482	NC_020540	ATA	2	6	1392259	1392264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201565
24483	NC_020540	AAG	2	6	1392265	1392270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201565
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24487	NC_020540	A	6	6	1393004	1393009	100 %	0 %	0 %	0 %	470201566
24488	NC_020540	AAAC	2	8	1393028	1393035	75 %	0 %	0 %	25 %	470201566
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24490	NC_020540	ATG	2	6	1393089	1393094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201566
24491	NC_020540	AAC	2	6	1393120	1393125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201566
24492	NC_020540	A	6	6	1393150	1393155	100 %	0 %	0 %	0 %	470201566
24493	NC_020540	GGT	2	6	1393238	1393243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201566
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24496	NC_020540	AGCT	2	8	1393392	1393399	25 %	25 %	25 %	25 %	470201566
24497	NC_020540	TAA	2	6	1393402	1393407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201566
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24500	NC_020540	ACA	2	6	1393482	1393487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201566

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