MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_020540	AAG	2	6	1218013	1218018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201403
21503	NC_020540	CAT	2	6	1218086	1218091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21504	NC_020540	GAA	2	6	1218122	1218127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201403
21505	NC_020540	CAT	2	6	1218152	1218157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21506	NC_020540	T	6	6	1218191	1218196	0 %	100 %	0 %	0 %	470201403
21507	NC_020540	AACC	2	8	1218289	1218296	50 %	0 %	0 %	50 %	470201403
21508	NC_020540	AAG	2	6	1218374	1218379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201403
21509	NC_020540	CAAAC	2	10	1218389	1218398	60 %	0 %	0 %	40 %	470201403
21510	NC_020540	CTT	2	6	1218479	1218484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201403
21511	NC_020540	CCA	2	6	1218489	1218494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201403
21512	NC_020540	TGAT	2	8	1218497	1218504	25 %	50 %	25 %	0 %	470201403
21513	NC_020540	CTT	2	6	1218542	1218547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201403
21514	NC_020540	ATA	2	6	1218553	1218558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201403
21515	NC_020540	AGA	2	6	1218578	1218583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201403
21516	NC_020540	ATG	2	6	1218671	1218676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201403
21517	NC_020540	GTT	2	6	1218685	1218690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201403
21518	NC_020540	T	6	6	1218689	1218694	0 %	100 %	0 %	0 %	470201403
21519	NC_020540	GAT	2	6	1218762	1218767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201403
21520	NC_020540	T	6	6	1218771	1218776	0 %	100 %	0 %	0 %	470201403
21521	NC_020540	TGAT	2	8	1218802	1218809	25 %	50 %	25 %	0 %	470201403
21522	NC_020540	CTT	2	6	1218812	1218817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201403
21523	NC_020540	CAT	2	6	1218906	1218911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21524	NC_020540	TCA	2	6	1218922	1218927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21525	NC_020540	TG	3	6	1218996	1219001	0 %	50 %	50 %	0 %	470201403
21526	NC_020540	TCCCTG	2	12	1219007	1219018	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470201403
21527	NC_020540	TTC	2	6	1219053	1219058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201403
21528	NC_020540	GCTA	2	8	1219116	1219123	25 %	25 %	25 %	25 %	470201403
21529	NC_020540	CAG	2	6	1219205	1219210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201403
21530	NC_020540	CAC	2	6	1219215	1219220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201403
21531	NC_020540	AAC	2	6	1219290	1219295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201403
21532	NC_020540	GTA	2	6	1219347	1219352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201403
21533	NC_020540	CAC	2	6	1219439	1219444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201403
21534	NC_020540	ATC	2	6	1219563	1219568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21535	NC_020540	GAC	2	6	1219601	1219606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201403
21536	NC_020540	GT	4	8	1219686	1219693	0 %	50 %	50 %	0 %	470201403
21537	NC_020540	TTA	2	6	1219765	1219770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201403
21538	NC_020540	CAT	2	6	1219814	1219819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201403
21539	NC_020540	AGGC	2	8	1219829	1219836	25 %	0 %	50 %	25 %	470201403
21540	NC_020540	T	6	6	1219860	1219865	0 %	100 %	0 %	0 %	470201403
21541	NC_020540	GCT	2	6	1219888	1219893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201403
21542	NC_020540	TTA	2	6	1219909	1219914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201403
21543	NC_020540	GC	3	6	1219924	1219929	0 %	0 %	50 %	50 %	470201403
21544	NC_020540	ATT	2	6	1219975	1219980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201403
21545	NC_020540	TTTA	2	8	1220244	1220251	25 %	75 %	0 %	0 %	470201404
21546	NC_020540	ATTTA	2	10	1220255	1220264	40 %	60 %	0 %	0 %	470201404
21547	NC_020540	TCA	2	6	1220355	1220360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201404
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21550	NC_020540	ATC	2	6	1220426	1220431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201404
21551	NC_020540	AGAT	2	8	1220499	1220506	50 %	25 %	25 %	0 %	470201404
21552	NC_020540	TGG	2	6	1220586	1220591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201404
21553	NC_020540	AC	3	6	1220593	1220598	50 %	0 %	0 %	50 %	470201404
21554	NC_020540	TTC	2	6	1220615	1220620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201404
21555	NC_020540	TCA	2	6	1220646	1220651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201404
21556	NC_020540	GCTTTA	2	12	1220676	1220687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470201404
21557	NC_020540	TAA	2	6	1220696	1220701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201404
21558	NC_020540	CAT	2	6	1220710	1220715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201404
21559	NC_020540	TTG	2	6	1220737	1220742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201404
21560	NC_020540	TTTCA	2	10	1220816	1220825	20 %	60 %	0 %	20 %	470201404
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21562	NC_020540	ATC	2	6	1220903	1220908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201404
21563	NC_020540	AAC	2	6	1220909	1220914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201404
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21565	NC_020540	TTAT	2	8	1221017	1221024	25 %	75 %	0 %	0 %	470201405
21566	NC_020540	T	6	6	1221046	1221051	0 %	100 %	0 %	0 %	470201405
21567	NC_020540	TTA	2	6	1221150	1221155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201405
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21569	NC_020540	TAG	2	6	1221229	1221234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201405
21570	NC_020540	A	6	6	1221369	1221374	100 %	0 %	0 %	0 %	470201405
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21572	NC_020540	AAAT	2	8	1221437	1221444	75 %	25 %	0 %	0 %	470201405
21573	NC_020540	ATTA	2	8	1221464	1221471	50 %	50 %	0 %	0 %	470201405
21574	NC_020540	CTA	2	6	1221529	1221534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201405
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21576	NC_020540	GTA	2	6	1221608	1221613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201405
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21584	NC_020540	ATCA	2	8	1222271	1222278	50 %	25 %	0 %	25 %	523415259
21585	NC_020540	CATT	2	8	1222284	1222291	25 %	50 %	0 %	25 %	523415259
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21590	NC_020540	CTG	2	6	1222469	1222474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415259
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21601	NC_020540	CTT	2	6	1222776	1222781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415260
21602	NC_020540	TTCT	2	8	1222838	1222845	0 %	75 %	0 %	25 %	523415260
21603	NC_020540	T	8	8	1222845	1222852	0 %	100 %	0 %	0 %	523415260
21604	NC_020540	T	6	6	1222862	1222867	0 %	100 %	0 %	0 %	523415260
21605	NC_020540	CTTT	2	8	1222904	1222911	0 %	75 %	0 %	25 %	523415260
21606	NC_020540	AACT	2	8	1222945	1222952	50 %	25 %	0 %	25 %	523415260
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21610	NC_020540	CT	3	6	1223073	1223078	0 %	50 %	0 %	50 %	523415260
21611	NC_020540	AAT	2	6	1223121	1223126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415260
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21613	NC_020540	CAT	2	6	1223208	1223213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415260
21614	NC_020540	TGC	2	6	1223344	1223349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415260
21615	NC_020540	ATT	2	6	1223405	1223410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415260
21616	NC_020540	TCA	3	9	1223443	1223451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201409
21617	NC_020540	TTGATT	2	12	1223562	1223573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470201409
21618	NC_020540	TCAAAA	2	12	1223626	1223637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470201409
21619	NC_020540	CGA	2	6	1223644	1223649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201409
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21728	NC_020540	ATC	2	6	1229024	1229029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415264
21729	NC_020540	TGT	2	6	1229080	1229085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415264
21730	NC_020540	TGG	2	6	1229209	1229214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523415264
21731	NC_020540	ATC	2	6	1229289	1229294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415264
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21733	NC_020540	TGA	2	6	1229359	1229364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415264
21734	NC_020540	AAC	2	6	1229453	1229458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415264
21735	NC_020540	ATA	2	6	1229574	1229579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415264
21736	NC_020540	TAA	2	6	1229711	1229716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415264
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21740	NC_020540	AATATT	2	12	1229874	1229885	50 %	50 %	0 %	0 %	523415264
21741	NC_020540	T	7	7	1229884	1229890	0 %	100 %	0 %	0 %	523415264
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21753	NC_020540	GAT	2	6	1231239	1231244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201418
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21833	NC_020540	AACT	2	8	1235283	1235290	50 %	25 %	0 %	25 %	523415265
21834	NC_020540	A	6	6	1235340	1235345	100 %	0 %	0 %	0 %	523415265
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21838	NC_020540	TAT	2	6	1235442	1235447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415265
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21840	NC_020540	CTA	2	6	1235558	1235563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415265
21841	NC_020540	TTA	2	6	1235567	1235572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415265
21842	NC_020540	T	6	6	1235608	1235613	0 %	100 %	0 %	0 %	523415265
21843	NC_020540	TAGCT	2	10	1235623	1235632	20 %	40 %	20 %	20 %	523415265
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21845	NC_020540	TGCT	2	8	1235695	1235702	0 %	50 %	25 %	25 %	523415265
21846	NC_020540	ATT	2	6	1235752	1235757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415265
21847	NC_020540	T	6	6	1235897	1235902	0 %	100 %	0 %	0 %	470201423
21848	NC_020540	CAC	2	6	1235963	1235968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470201423
21849	NC_020540	CAT	2	6	1235995	1236000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201423
21850	NC_020540	CTA	2	6	1236030	1236035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201423
21851	NC_020540	GCTT	2	8	1236126	1236133	0 %	50 %	25 %	25 %	470201423
21852	NC_020540	ACG	2	6	1236179	1236184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201423
21853	NC_020540	T	6	6	1236190	1236195	0 %	100 %	0 %	0 %	470201423
21854	NC_020540	ATA	2	6	1236255	1236260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201423
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21856	NC_020540	TGCA	2	8	1236284	1236291	25 %	25 %	25 %	25 %	470201423
21857	NC_020540	ATC	2	6	1236401	1236406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201423
21858	NC_020540	TGA	2	6	1236409	1236414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201423
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21862	NC_020540	AAAT	2	8	1236701	1236708	75 %	25 %	0 %	0 %	470201423
21863	NC_020540	T	7	7	1236835	1236841	0 %	100 %	0 %	0 %	470201423
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21866	NC_020540	TGA	2	6	1236967	1236972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415266
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21879	NC_020540	CGG	2	6	1238116	1238121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470201425
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21951	NC_020540	TCA	2	6	1242260	1242265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201430
21952	NC_020540	AAC	2	6	1242286	1242291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201430
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21954	NC_020540	AATG	2	8	1242350	1242357	50 %	25 %	25 %	0 %	470201430
21955	NC_020540	CCCGA	2	10	1242445	1242454	20 %	0 %	20 %	60 %	470201430
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21959	NC_020540	GTTT	2	8	1242966	1242973	0 %	75 %	25 %	0 %	470201431
21960	NC_020540	CAA	2	6	1242975	1242980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470201431
21961	NC_020540	TAC	2	6	1243011	1243016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201431
21962	NC_020540	TG	3	6	1243034	1243039	0 %	50 %	50 %	0 %	470201431
21963	NC_020540	GA	3	6	1243056	1243061	50 %	0 %	50 %	0 %	470201431
21964	NC_020540	CTT	2	6	1243068	1243073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201431
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