MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_020540	CT	3	6	909676	909681	0 %	50 %	0 %	50 %	470201056
16003	NC_020540	TGC	2	6	909791	909796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201056
16004	NC_020540	TGT	2	6	909818	909823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201056
16005	NC_020540	GTT	2	6	909825	909830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201056
16006	NC_020540	CTGG	2	8	909837	909844	0 %	25 %	50 %	25 %	470201056
16007	NC_020540	AGC	2	6	909860	909865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201056
16008	NC_020540	AGC	2	6	909884	909889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201056
16009	NC_020540	CCAA	2	8	909916	909923	50 %	0 %	0 %	50 %	470201056
16010	NC_020540	TAT	2	6	909986	909991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201056
16011	NC_020540	A	6	6	910023	910028	100 %	0 %	0 %	0 %	470201056
16012	NC_020540	CCGTAT	2	12	910034	910045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470201056
16013	NC_020540	ATC	2	6	910095	910100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201056
16014	NC_020540	TAG	2	6	910108	910113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201056
16015	NC_020540	TTA	2	6	910170	910175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201056
16016	NC_020540	GTGTG	2	10	910181	910190	0 %	40 %	60 %	0 %	470201056
16017	NC_020540	ATT	2	6	910233	910238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470201056
16018	NC_020540	CTTG	2	8	910244	910251	0 %	50 %	25 %	25 %	470201056
16019	NC_020540	GCAG	2	8	910274	910281	25 %	0 %	50 %	25 %	470201056
16020	NC_020540	ATC	2	6	910311	910316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201056
16021	NC_020540	AGA	2	6	910396	910401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201056
16022	NC_020540	A	6	6	910462	910467	100 %	0 %	0 %	0 %	470201056
16023	NC_020540	GGT	2	6	910554	910559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201056
16024	NC_020540	TTG	2	6	910560	910565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470201056
16025	NC_020540	AAAC	2	8	910780	910787	75 %	0 %	0 %	25 %	470201057
16026	NC_020540	AGT	2	6	910873	910878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201057
16027	NC_020540	TCAT	2	8	910913	910920	25 %	50 %	0 %	25 %	470201057
16028	NC_020540	GCT	2	6	910948	910953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201057
16029	NC_020540	GCT	2	6	911026	911031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470201057
16030	NC_020540	AAG	2	6	911078	911083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201057
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16032	NC_020540	ATT	2	6	911239	911244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415159
16033	NC_020540	GTT	2	6	911259	911264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415159
16034	NC_020540	TGT	2	6	911309	911314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415159
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16036	NC_020540	ATG	2	6	911436	911441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523415159
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16038	NC_020540	CGT	2	6	911556	911561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415159
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16040	NC_020540	GCT	2	6	911610	911615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415159
16041	NC_020540	TGC	2	6	911618	911623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415159
16042	NC_020540	TGC	2	6	911630	911635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415159
16043	NC_020540	AAT	2	6	911661	911666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415159
16044	NC_020540	TCA	2	6	911728	911733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415159
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16046	NC_020540	A	7	7	911777	911783	100 %	0 %	0 %	0 %	523415159
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16050	NC_020540	TTTC	2	8	912156	912163	0 %	75 %	0 %	25 %	470201060
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16052	NC_020540	GGA	2	6	912208	912213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470201060
16053	NC_020540	TGAT	2	8	912282	912289	25 %	50 %	25 %	0 %	470201060
16054	NC_020540	TGG	2	6	912400	912405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201060
16055	NC_020540	TGAT	2	8	912537	912544	25 %	50 %	25 %	0 %	470201060
16056	NC_020540	GGT	2	6	912562	912567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201060
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16058	NC_020540	AAG	2	6	912768	912773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201060
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16060	NC_020540	AGCT	2	8	912859	912866	25 %	25 %	25 %	25 %	470201060
16061	NC_020540	TGG	2	6	912874	912879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201060
16062	NC_020540	TGG	2	6	912894	912899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470201060
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16065	NC_020540	ATCA	2	8	913043	913050	50 %	25 %	0 %	25 %	470201060
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16104	NC_020540	TGCC	2	8	915708	915715	0 %	25 %	25 %	50 %	470201063
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16109	NC_020540	TCT	2	6	915946	915951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201063
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16111	NC_020540	CTT	2	6	916037	916042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201063
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16115	NC_020540	TCA	2	6	916226	916231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201063
16116	NC_020540	T	7	7	916250	916256	0 %	100 %	0 %	0 %	470201063
16117	NC_020540	A	6	6	916318	916323	100 %	0 %	0 %	0 %	470201063
16118	NC_020540	GCA	2	6	916324	916329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470201063
16119	NC_020540	GAT	2	6	916355	916360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201063
16120	NC_020540	TTC	2	6	916377	916382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201063
16121	NC_020540	AAG	2	6	916410	916415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470201063
16122	NC_020540	CAT	2	6	916490	916495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201063
16123	NC_020540	ATG	2	6	916507	916512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201063
16124	NC_020540	CTT	2	6	916550	916555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470201063
16125	NC_020540	GTA	2	6	916620	916625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201063
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16127	NC_020540	T	6	6	916779	916784	0 %	100 %	0 %	0 %	470201064
16128	NC_020540	TAA	2	6	916819	916824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470201064
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16130	NC_020540	GTA	2	6	916858	916863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470201064
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16132	NC_020540	CTA	2	6	916974	916979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470201064
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16152	NC_020540	T	6	6	918539	918544	0 %	100 %	0 %	0 %	523415162
16153	NC_020540	T	6	6	918553	918558	0 %	100 %	0 %	0 %	523415162
16154	NC_020540	TGG	2	6	918681	918686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523415162
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16177	NC_020540	A	6	6	920050	920055	100 %	0 %	0 %	0 %	470201066
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16182	NC_020540	CATATC	2	12	920367	920378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415163
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16231	NC_020540	TGTT	2	8	922144	922151	0 %	75 %	25 %	0 %	470201068
16232	NC_020540	T	6	6	922150	922155	0 %	100 %	0 %	0 %	470201068
16233	NC_020540	ATT	2	6	922266	922271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523415164
16234	NC_020540	ACTG	2	8	922304	922311	25 %	25 %	25 %	25 %	523415164
16235	NC_020540	AGG	2	6	922397	922402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523415164
16236	NC_020540	A	6	6	922482	922487	100 %	0 %	0 %	0 %	523415164
16237	NC_020540	ATA	2	6	922667	922672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523415164
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16239	NC_020540	GTC	2	6	922688	922693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415164
16240	NC_020540	TTG	2	6	922721	922726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523415164
16241	NC_020540	T	6	6	922736	922741	0 %	100 %	0 %	0 %	523415164
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16361	NC_020540	ATC	2	6	929048	929053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415165
16362	NC_020540	TCA	2	6	929103	929108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415165
16363	NC_020540	TTC	2	6	929384	929389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415165
16364	NC_020540	TCA	2	6	929398	929403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415165
16365	NC_020540	A	6	6	929403	929408	100 %	0 %	0 %	0 %	523415165
16366	NC_020540	CTTTT	2	10	929547	929556	0 %	80 %	0 %	20 %	470201074
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16369	NC_020540	AGTA	2	8	929692	929699	50 %	25 %	25 %	0 %	470201074
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16471	NC_020540	CAGA	2	8	934560	934567	50 %	0 %	25 %	25 %	523415167
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16475	NC_020540	TAAT	2	8	934821	934828	50 %	50 %	0 %	0 %	523415167
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16479	NC_020540	ATC	2	6	934922	934927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415167
16480	NC_020540	TCA	2	6	935091	935096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523415168
16481	NC_020540	CAA	2	6	935112	935117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415168
16482	NC_020540	CAAG	2	8	935181	935188	50 %	0 %	25 %	25 %	523415168
16483	NC_020540	CCA	2	6	935309	935314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523415168
16484	NC_020540	TTC	2	6	935344	935349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415168
16485	NC_020540	CAG	2	6	935385	935390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523415168
16486	NC_020540	CTT	2	6	935391	935396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523415168
16487	NC_020540	ATCA	2	8	935398	935405	50 %	25 %	0 %	25 %	523415168
16488	NC_020540	CCTC	2	8	935435	935442	0 %	25 %	0 %	75 %	523415168
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16491	NC_020540	CAA	2	6	935697	935702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523415168
16492	NC_020540	C	6	6	935872	935877	0 %	0 %	0 %	100 %	523415168
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16494	NC_020540	GCG	2	6	936202	936207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523415168
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16496	NC_020540	TCAA	2	8	936248	936255	50 %	25 %	0 %	25 %	523415168
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16498	NC_020540	GCAT	2	8	936287	936294	25 %	25 %	25 %	25 %	523415168
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16500	NC_020540	TGC	2	6	936355	936360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523415168

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