MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020537	TTC	2	6	54631	54636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198211
1003	NC_020537	AATT	2	8	54652	54659	50 %	50 %	0 %	0 %	470198211
1004	NC_020537	T	6	6	54688	54693	0 %	100 %	0 %	0 %	470198211
1005	NC_020537	GTTA	2	8	55157	55164	25 %	50 %	25 %	0 %	470198212
1006	NC_020537	AGG	2	6	55175	55180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470198212
1007	NC_020537	ATTT	2	8	55181	55188	25 %	75 %	0 %	0 %	470198212
1008	NC_020537	CT	3	6	55231	55236	0 %	50 %	0 %	50 %	470198212
1009	NC_020537	TAT	2	6	55237	55242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1010	NC_020537	ACC	2	6	55244	55249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198212
1011	NC_020537	ATT	2	6	55250	55255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1012	NC_020537	T	6	6	55311	55316	0 %	100 %	0 %	0 %	470198212
1013	NC_020537	ATAAAA	2	12	55345	55356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470198212
1014	NC_020537	GTA	2	6	55405	55410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198212
1015	NC_020537	TTA	2	6	55422	55427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1016	NC_020537	TA	3	6	55464	55469	50 %	50 %	0 %	0 %	470198212
1017	NC_020537	ATT	2	6	55470	55475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1018	NC_020537	TTA	2	6	55501	55506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1019	NC_020537	CTA	2	6	55519	55524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198212
1020	NC_020537	GGT	2	6	55563	55568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198212
1021	NC_020537	ATC	2	6	55569	55574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198212
1022	NC_020537	TGG	2	6	55601	55606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198212
1023	NC_020537	CATT	2	8	55609	55616	25 %	50 %	0 %	25 %	470198212
1024	NC_020537	ATT	3	9	55614	55622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1025	NC_020537	TAC	2	6	55627	55632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198212
1026	NC_020537	GTT	2	6	55662	55667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198212
1027	NC_020537	CATT	2	8	55687	55694	25 %	50 %	0 %	25 %	470198212
1028	NC_020537	TCT	2	6	55695	55700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198212
1029	NC_020537	TAT	2	6	55712	55717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1030	NC_020537	ATT	2	6	55721	55726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198212
1031	NC_020537	GTA	2	6	55771	55776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198212
1032	NC_020537	A	6	6	55810	55815	100 %	0 %	0 %	0 %	470198212
1033	NC_020537	AT	3	6	56698	56703	50 %	50 %	0 %	0 %	470198213
1034	NC_020537	AGG	2	6	56711	56716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470198213
1035	NC_020537	ATA	2	6	56765	56770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198213
1036	NC_020537	TAA	2	6	56781	56786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198213
1037	NC_020537	T	8	8	56792	56799	0 %	100 %	0 %	0 %	470198213
1038	NC_020537	TTA	2	6	56836	56841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198213
1039	NC_020537	A	8	8	56841	56848	100 %	0 %	0 %	0 %	470198213
1040	NC_020537	A	6	6	56951	56956	100 %	0 %	0 %	0 %	470198213
1041	NC_020537	TAT	2	6	56957	56962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198213
1042	NC_020537	A	8	8	56973	56980	100 %	0 %	0 %	0 %	470198213
1043	NC_020537	AAG	2	6	56994	56999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198213
1044	NC_020537	GAA	2	6	57058	57063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198213
1045	NC_020537	ATA	2	6	57092	57097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198213
1046	NC_020537	CTA	2	6	57098	57103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198213
1047	NC_020537	TTTC	2	8	57112	57119	0 %	75 %	0 %	25 %	470198213
1048	NC_020537	A	7	7	57122	57128	100 %	0 %	0 %	0 %	470198213
1049	NC_020537	AAT	2	6	57133	57138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198213
1050	NC_020537	TAC	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198213
1051	NC_020537	TTA	2	6	57203	57208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198213
1052	NC_020537	TGA	2	6	57237	57242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198213
1053	NC_020537	TA	3	6	57257	57262	50 %	50 %	0 %	0 %	470198213
1054	NC_020537	A	6	6	57274	57279	100 %	0 %	0 %	0 %	470198213
1055	NC_020537	AAT	2	6	57304	57309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198213
1056	NC_020537	AATT	2	8	57320	57327	50 %	50 %	0 %	0 %	470198213
1057	NC_020537	AGT	2	6	57331	57336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198213
1058	NC_020537	TGT	2	6	57356	57361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198213
1059	NC_020537	AT	3	6	57375	57380	50 %	50 %	0 %	0 %	470198213
1060	NC_020537	CTT	2	6	57440	57445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198213
1061	NC_020537	TGA	2	6	57567	57572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198213
1062	NC_020537	ATT	2	6	57781	57786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198213
1063	NC_020537	AGC	2	6	57801	57806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198213
1064	NC_020537	GCTT	2	8	57807	57814	0 %	50 %	25 %	25 %	470198213
1065	NC_020537	GAA	2	6	57891	57896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198213
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1069	NC_020537	TAAT	2	8	58151	58158	50 %	50 %	0 %	0 %	470198213
1070	NC_020537	TTA	2	6	58247	58252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198213
1071	NC_020537	TGA	2	6	58278	58283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198213
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1073	NC_020537	AATT	2	8	58512	58519	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1074	NC_020537	ATCT	2	8	58527	58534	25 %	50 %	0 %	25 %	470198214
1075	NC_020537	TAA	2	6	58621	58626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198214
1076	NC_020537	TA	3	6	58644	58649	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1077	NC_020537	TTAA	2	8	58670	58677	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1078	NC_020537	ATT	2	6	58690	58695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
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1080	NC_020537	TAAAT	2	10	58774	58783	60 %	40 %	0 %	0 %	470198214
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1083	NC_020537	TAAT	2	8	58962	58969	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1084	NC_020537	TGA	2	6	58988	58993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198214
1085	NC_020537	TAT	3	9	59037	59045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
1086	NC_020537	ATT	2	6	59056	59061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
1087	NC_020537	TCA	2	6	59084	59089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198214
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1089	NC_020537	ATT	2	6	59125	59130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
1090	NC_020537	AT	3	6	59142	59147	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1091	NC_020537	TTG	2	6	59152	59157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198214
1092	NC_020537	TAT	2	6	59307	59312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
1093	NC_020537	ATT	2	6	59407	59412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
1094	NC_020537	ATA	2	6	59444	59449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198214
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1097	NC_020537	TAA	2	6	59519	59524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198214
1098	NC_020537	ACT	2	6	59534	59539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198214
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1101	NC_020537	ACAT	2	8	59675	59682	50 %	25 %	0 %	25 %	470198214
1102	NC_020537	T	6	6	59694	59699	0 %	100 %	0 %	0 %	470198214
1103	NC_020537	AT	3	6	59701	59706	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1104	NC_020537	TTTATA	2	12	59792	59803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198214
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1106	NC_020537	AT	3	6	59832	59837	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1107	NC_020537	ATC	2	6	59948	59953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198214
1108	NC_020537	ATTT	2	8	59973	59980	25 %	75 %	0 %	0 %	470198214
1109	NC_020537	AT	3	6	60001	60006	50 %	50 %	0 %	0 %	470198214
1110	NC_020537	T	8	8	60025	60032	0 %	100 %	0 %	0 %	470198215
1111	NC_020537	TAT	2	6	60036	60041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198215
1112	NC_020537	ATA	2	6	60086	60091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198215
1113	NC_020537	TTTATC	2	12	60094	60105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470198215
1114	NC_020537	TAT	2	6	60120	60125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198215
1115	NC_020537	AAT	2	6	60136	60141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198215
1116	NC_020537	GTC	2	6	60199	60204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198215
1117	NC_020537	TC	3	6	60224	60229	0 %	50 %	0 %	50 %	470198215
1118	NC_020537	AT	3	6	60299	60304	50 %	50 %	0 %	0 %	470198215
1119	NC_020537	AAAT	2	8	60328	60335	75 %	25 %	0 %	0 %	470198215
1120	NC_020537	AAG	2	6	60351	60356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198215
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1123	NC_020537	TTG	2	6	60438	60443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198215
1124	NC_020537	TCT	2	6	60467	60472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198215
1125	NC_020537	ATC	2	6	60481	60486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198215
1126	NC_020537	AAT	2	6	60498	60503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198215
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