MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020537	TAA	2	6	26379	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198192
503	NC_020537	AAG	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
504	NC_020537	TAT	2	6	26472	26477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198192
505	NC_020537	CCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470198192
506	NC_020537	AGA	2	6	26547	26552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
507	NC_020537	CAT	2	6	26553	26558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198192
508	NC_020537	GAA	2	6	26608	26613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
509	NC_020537	AAT	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198192
510	NC_020537	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	470198192
511	NC_020537	GAA	3	9	26653	26661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
512	NC_020537	AAC	3	9	26750	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198192
513	NC_020537	CGT	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198192
514	NC_020537	TTG	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198192
515	NC_020537	GAA	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
516	NC_020537	GAA	2	6	26908	26913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198192
517	NC_020537	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470198192
518	NC_020537	TAA	2	6	27018	27023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198192
519	NC_020537	ATT	2	6	27025	27030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198192
520	NC_020537	ACA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198192
521	NC_020537	GGT	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198192
522	NC_020537	ATCT	2	8	27417	27424	25 %	50 %	0 %	25 %	470198192
523	NC_020537	AAT	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198192
524	NC_020537	TGA	2	6	27516	27521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198193
525	NC_020537	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470198193
526	NC_020537	AAG	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198193
527	NC_020537	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470198193
528	NC_020537	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198193
529	NC_020537	ATC	2	6	27681	27686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198193
530	NC_020537	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470198193
531	NC_020537	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198193
532	NC_020537	TGA	2	6	27789	27794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198193
533	NC_020537	ATT	2	6	27820	27825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198193
534	NC_020537	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470198193
535	NC_020537	ATG	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198193
536	NC_020537	TGA	2	6	27937	27942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198193
537	NC_020537	AAC	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198193
538	NC_020537	T	6	6	28018	28023	0 %	100 %	0 %	0 %	470198193
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541	NC_020537	ATC	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198193
542	NC_020537	ACAA	2	8	28076	28083	75 %	0 %	0 %	25 %	470198193
543	NC_020537	ACG	2	6	28100	28105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198193
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545	NC_020537	TCGT	2	8	28212	28219	0 %	50 %	25 %	25 %	470198193
546	NC_020537	GTG	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198193
547	NC_020537	ACA	2	6	28245	28250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198193
548	NC_020537	ATA	2	6	28251	28256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198193
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550	NC_020537	TTA	2	6	28368	28373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198193
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553	NC_020537	TAA	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198193
554	NC_020537	TCG	2	6	28537	28542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198193
555	NC_020537	ATA	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198193
556	NC_020537	AACA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	470198193
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558	NC_020537	TAA	2	6	28879	28884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198194
559	NC_020537	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470198194
560	NC_020537	AAG	2	6	28941	28946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198194
561	NC_020537	TGG	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198194
562	NC_020537	ATT	2	6	29080	29085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198194
563	NC_020537	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470198194
564	NC_020537	AATT	2	8	29194	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	470198194
565	NC_020537	AGA	2	6	29281	29286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198194
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567	NC_020537	GATG	2	8	29317	29324	25 %	25 %	50 %	0 %	470198194
568	NC_020537	AAG	2	6	29351	29356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198194
569	NC_020537	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470198194
570	NC_020537	A	6	6	29414	29419	100 %	0 %	0 %	0 %	470198194
571	NC_020537	TGA	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198194
572	NC_020537	TAC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198194
573	NC_020537	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470198194
574	NC_020537	TACT	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	470198194
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576	NC_020537	ATT	2	6	29576	29581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198194
577	NC_020537	GTA	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198195
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580	NC_020537	AAAG	2	8	30251	30258	75 %	0 %	25 %	0 %	470198195
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592	NC_020537	CAA	2	6	31153	31158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198196
593	NC_020537	CAA	2	6	31166	31171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198196
594	NC_020537	TCA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198196
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596	NC_020537	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	470198196
597	NC_020537	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470198196
598	NC_020537	TGA	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198196
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601	NC_020537	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470198196
602	NC_020537	ACA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198196
603	NC_020537	CAC	2	6	31409	31414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198196
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606	NC_020537	TACA	2	8	31460	31467	50 %	25 %	0 %	25 %	470198196
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609	NC_020537	AATG	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	470198196
610	NC_020537	ATG	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198196
611	NC_020537	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470198196
612	NC_020537	CAA	2	6	31784	31789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198196
613	NC_020537	ATT	2	6	31819	31824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198196
614	NC_020537	CAG	2	6	31910	31915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198196
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619	NC_020537	ATG	2	6	32111	32116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198196
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621	NC_020537	TTA	2	6	32306	32311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198196
622	NC_020537	ATA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198196
623	NC_020537	GACT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	25 %	25 %	470198196
624	NC_020537	TGG	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198196
625	NC_020537	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470198196
626	NC_020537	CAA	2	6	32600	32605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198196
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