MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_020536	GTC	2	6	2548262	2548267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198022
46002	NC_020536	TCA	2	6	2548325	2548330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198022
46003	NC_020536	TCT	2	6	2548355	2548360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198022
46004	NC_020536	ATT	2	6	2548387	2548392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198022
46005	NC_020536	TC	3	6	2548413	2548418	0 %	50 %	0 %	50 %	470198022
46006	NC_020536	TA	3	6	2548454	2548459	50 %	50 %	0 %	0 %	470198023
46007	NC_020536	TTTA	2	8	2548520	2548527	25 %	75 %	0 %	0 %	470198023
46008	NC_020536	ATCT	2	8	2548556	2548563	25 %	50 %	0 %	25 %	470198023
46009	NC_020536	TAA	2	6	2548564	2548569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198023
46010	NC_020536	AATGA	2	10	2548610	2548619	60 %	20 %	20 %	0 %	470198023
46011	NC_020536	CAA	2	6	2548648	2548653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198023
46012	NC_020536	TTTAAT	2	12	2548709	2548720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198023
46013	NC_020536	ACC	3	9	2548724	2548732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198023
46014	NC_020536	CAT	2	6	2548765	2548770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198023
46015	NC_020536	GAT	2	6	2548776	2548781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198023
46016	NC_020536	CTT	3	9	2548822	2548830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198023
46017	NC_020536	GAT	2	6	2548832	2548837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198023
46018	NC_020536	CAT	2	6	2548852	2548857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198023
46019	NC_020536	CCAC	2	8	2548917	2548924	25 %	0 %	0 %	75 %	470198023
46020	NC_020536	GT	3	6	2548952	2548957	0 %	50 %	50 %	0 %	470198023
46021	NC_020536	ATA	2	6	2548973	2548978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198023
46022	NC_020536	CAT	2	6	2549072	2549077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198023
46023	NC_020536	ATA	2	6	2549088	2549093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198023
46024	NC_020536	ATTAA	2	10	2549186	2549195	60 %	40 %	0 %	0 %	470198024
46025	NC_020536	TTA	2	6	2549198	2549203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198024
46026	NC_020536	AAT	2	6	2549215	2549220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198024
46027	NC_020536	AAT	2	6	2549242	2549247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198024
46028	NC_020536	ATT	2	6	2549281	2549286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198024
46029	NC_020536	GAC	2	6	2549377	2549382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198024
46030	NC_020536	CCA	2	6	2549483	2549488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198024
46031	NC_020536	AATAA	2	10	2549504	2549513	80 %	20 %	0 %	0 %	470198024
46032	NC_020536	TAA	2	6	2549578	2549583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198024
46033	NC_020536	TGAT	2	8	2549733	2549740	25 %	50 %	25 %	0 %	470198024
46034	NC_020536	CAC	2	6	2549776	2549781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198024
46035	NC_020536	CTTT	2	8	2549805	2549812	0 %	75 %	0 %	25 %	470198024
46036	NC_020536	A	6	6	2549828	2549833	100 %	0 %	0 %	0 %	470198024
46037	NC_020536	TAA	2	6	2549863	2549868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198024
46038	NC_020536	CAA	2	6	2549892	2549897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198024
46039	NC_020536	CCA	2	6	2550014	2550019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198024
46040	NC_020536	TGT	2	6	2551084	2551089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198025
46041	NC_020536	AAT	2	6	2551125	2551130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198025
46042	NC_020536	GGT	2	6	2551194	2551199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198025
46043	NC_020536	GTG	2	6	2551273	2551278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198025
46044	NC_020536	CTTA	2	8	2551283	2551290	25 %	50 %	0 %	25 %	470198025
46045	NC_020536	ATG	2	6	2551302	2551307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198025
46046	NC_020536	TGC	2	6	2551433	2551438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198025
46047	NC_020536	TAC	2	6	2551450	2551455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198025
46048	NC_020536	TAT	3	9	2551475	2551483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46049	NC_020536	ATT	2	6	2551517	2551522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46050	NC_020536	TGCT	2	8	2551528	2551535	0 %	50 %	25 %	25 %	470198025
46051	NC_020536	TAT	2	6	2551564	2551569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46052	NC_020536	GTC	2	6	2551596	2551601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198025
46053	NC_020536	ATTAT	2	10	2551791	2551800	40 %	60 %	0 %	0 %	470198025
46054	NC_020536	TAT	2	6	2551814	2551819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46055	NC_020536	GGT	2	6	2551821	2551826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198025
46056	NC_020536	GAAA	2	8	2551877	2551884	75 %	0 %	25 %	0 %	470198025
46057	NC_020536	ATT	2	6	2551889	2551894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46058	NC_020536	CAT	2	6	2551976	2551981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198025
46059	NC_020536	TTA	2	6	2551984	2551989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46060	NC_020536	ATTTTA	2	12	2551992	2552003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198025
46061	NC_020536	TAAT	2	8	2552127	2552134	50 %	50 %	0 %	0 %	470198026
46062	NC_020536	CAA	2	6	2552246	2552251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198026
46063	NC_020536	CTT	2	6	2552284	2552289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198026
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46065	NC_020536	AC	3	6	2552398	2552403	50 %	0 %	0 %	50 %	470198026
46066	NC_020536	TCTT	2	8	2552427	2552434	0 %	75 %	0 %	25 %	470198026
46067	NC_020536	AGT	2	6	2552437	2552442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198026
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46069	NC_020536	CCGC	2	8	2552559	2552566	0 %	0 %	25 %	75 %	470198026
46070	NC_020536	ATG	2	6	2552691	2552696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198026
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46074	NC_020536	CTT	3	9	2552941	2552949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198026
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46096	NC_020536	T	6	6	2555528	2555533	0 %	100 %	0 %	0 %	470198027
46097	NC_020536	GCC	2	6	2555568	2555573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470198027
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46100	NC_020536	CAG	2	6	2555623	2555628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46101	NC_020536	CAC	2	6	2555674	2555679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198027
46102	NC_020536	ATG	2	6	2555744	2555749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198027
46103	NC_020536	AAT	2	6	2555777	2555782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198027
46104	NC_020536	GTT	2	6	2555796	2555801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198027
46105	NC_020536	TAA	2	6	2555819	2555824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198027
46106	NC_020536	TGG	2	6	2555858	2555863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198027
46107	NC_020536	TGG	2	6	2555954	2555959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198027
46108	NC_020536	TGT	2	6	2555980	2555985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198027
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46110	NC_020536	CCA	2	6	2556018	2556023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198027
46111	NC_020536	AC	3	6	2556025	2556030	50 %	0 %	0 %	50 %	470198027
46112	NC_020536	GCT	2	6	2556081	2556086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46113	NC_020536	TCA	2	6	2556126	2556131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198027
46114	NC_020536	TTG	2	6	2556157	2556162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198027
46115	NC_020536	CTA	2	6	2556181	2556186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198027
46116	NC_020536	GCT	2	6	2556189	2556194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46117	NC_020536	TGC	2	6	2556197	2556202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46118	NC_020536	TCC	2	6	2556212	2556217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470198027
46119	NC_020536	ATA	2	6	2556247	2556252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198027
46120	NC_020536	CTG	2	6	2556280	2556285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46121	NC_020536	CGA	2	6	2556296	2556301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46122	NC_020536	T	6	6	2556321	2556326	0 %	100 %	0 %	0 %	470198027
46123	NC_020536	CTA	2	6	2556343	2556348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198027
46124	NC_020536	TAA	2	6	2556380	2556385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198027
46125	NC_020536	GCT	2	6	2556393	2556398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198027
46126	NC_020536	A	7	7	2556507	2556513	100 %	0 %	0 %	0 %	470198027
46127	NC_020536	AACA	2	8	2556523	2556530	75 %	0 %	0 %	25 %	470198027
46128	NC_020536	GTT	2	6	2556550	2556555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198027
46129	NC_020536	TGC	2	6	2556785	2556790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46130	NC_020536	ATCTAA	2	12	2556812	2556823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470198028
46131	NC_020536	CTT	2	6	2556874	2556879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198028
46132	NC_020536	GCA	2	6	2556906	2556911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46133	NC_020536	ACC	2	6	2557013	2557018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198028
46134	NC_020536	TGC	2	6	2557019	2557024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46135	NC_020536	GCT	2	6	2557083	2557088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46136	NC_020536	TGT	2	6	2557089	2557094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198028
46137	NC_020536	TAA	2	6	2557102	2557107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198028
46138	NC_020536	TGTT	2	8	2557116	2557123	0 %	75 %	25 %	0 %	470198028
46139	NC_020536	CTG	2	6	2557162	2557167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46140	NC_020536	ATG	2	6	2557299	2557304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198028
46141	NC_020536	TTG	2	6	2557308	2557313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198028
46142	NC_020536	CTG	2	6	2557366	2557371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198028
46143	NC_020536	CAT	2	6	2557381	2557386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198028
46144	NC_020536	TAA	2	6	2557390	2557395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198028
46145	NC_020536	TAT	3	9	2557441	2557449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198028
46146	NC_020536	TCCA	2	8	2557461	2557468	25 %	25 %	0 %	50 %	470198028
46147	NC_020536	ATGCA	2	10	2557550	2557559	40 %	20 %	20 %	20 %	470198028
46148	NC_020536	CAA	2	6	2557573	2557578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198028
46149	NC_020536	GTAA	2	8	2557657	2557664	50 %	25 %	25 %	0 %	470198028
46150	NC_020536	ACCA	2	8	2557685	2557692	50 %	0 %	0 %	50 %	470198028
46151	NC_020536	TAAT	2	8	2557693	2557700	50 %	50 %	0 %	0 %	470198028
46152	NC_020536	GAT	2	6	2557771	2557776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198028
46153	NC_020536	AATG	3	12	2557803	2557814	50 %	25 %	25 %	0 %	470198028
46154	NC_020536	ATTA	2	8	2557907	2557914	50 %	50 %	0 %	0 %	470198028
46155	NC_020536	T	6	6	2557925	2557930	0 %	100 %	0 %	0 %	470198028
46156	NC_020536	T	6	6	2558002	2558007	0 %	100 %	0 %	0 %	470198028
46157	NC_020536	TAA	2	6	2558012	2558017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198028
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46170	NC_020536	TAC	2	6	2558766	2558771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198029
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46174	NC_020536	TAAG	2	8	2559105	2559112	50 %	25 %	25 %	0 %	470198029
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46188	NC_020536	CT	3	6	2560213	2560218	0 %	50 %	0 %	50 %	470198030
46189	NC_020536	GTA	2	6	2560253	2560258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198030
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46192	NC_020536	TGC	2	6	2560325	2560330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198030
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46195	NC_020536	CAA	2	6	2560512	2560517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198030
46196	NC_020536	A	6	6	2560536	2560541	100 %	0 %	0 %	0 %	470198030
46197	NC_020536	CATTT	2	10	2560600	2560609	20 %	60 %	0 %	20 %	470198030
46198	NC_020536	AT	3	6	2560649	2560654	50 %	50 %	0 %	0 %	470198030
46199	NC_020536	CCT	2	6	2560679	2560684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470198030
46200	NC_020536	CAT	2	6	2560732	2560737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198030
46201	NC_020536	TTG	2	6	2562076	2562081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198031
46202	NC_020536	TCA	2	6	2562164	2562169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198031
46203	NC_020536	ACA	2	6	2562182	2562187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198031
46204	NC_020536	GC	3	6	2562246	2562251	0 %	0 %	50 %	50 %	470198031
46205	NC_020536	TGC	2	6	2562256	2562261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198031
46206	NC_020536	GCA	2	6	2562284	2562289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198031
46207	NC_020536	AAG	2	6	2562336	2562341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198031
46208	NC_020536	ACC	2	6	2562367	2562372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198031
46209	NC_020536	ATGC	2	8	2562483	2562490	25 %	25 %	25 %	25 %	470198031
46210	NC_020536	CAC	2	6	2562504	2562509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198031
46211	NC_020536	AAC	2	6	2562532	2562537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198031
46212	NC_020536	TAT	2	6	2562564	2562569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198031
46213	NC_020536	GCA	2	6	2562575	2562580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198031
46214	NC_020536	TC	3	6	2562646	2562651	0 %	50 %	0 %	50 %	470198031
46215	NC_020536	AAC	2	6	2562694	2562699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198031
46216	NC_020536	T	6	6	2562758	2562763	0 %	100 %	0 %	0 %	470198031
46217	NC_020536	CAA	2	6	2562828	2562833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198031
46218	NC_020536	ACC	3	9	2562892	2562900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198031
46219	NC_020536	CTG	2	6	2562969	2562974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198031
46220	NC_020536	ATA	2	6	2563022	2563027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198031
46221	NC_020536	AGA	2	6	2563033	2563038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198031
46222	NC_020536	CCA	2	6	2563113	2563118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198031
46223	NC_020536	ACA	2	6	2563127	2563132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198031
46224	NC_020536	TAA	2	6	2563162	2563167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198031
46225	NC_020536	TCA	2	6	2563226	2563231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198031
46226	NC_020536	GAT	2	6	2563239	2563244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198031
46227	NC_020536	TCT	2	6	2563265	2563270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198031
46228	NC_020536	TTG	2	6	2563294	2563299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198031
46229	NC_020536	TTG	2	6	2563306	2563311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198031
46230	NC_020536	CAAA	2	8	2563693	2563700	75 %	0 %	0 %	25 %	470198032
46231	NC_020536	AATTGG	2	12	2563706	2563717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198032
46232	NC_020536	GCT	2	6	2563776	2563781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198032
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46466	NC_020536	T	6	6	2576291	2576296	0 %	100 %	0 %	0 %	470198040
46467	NC_020536	TGT	3	9	2576356	2576364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198040
46468	NC_020536	AAT	2	6	2576369	2576374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198040
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46470	NC_020536	T	6	6	2576511	2576516	0 %	100 %	0 %	0 %	470198040
46471	NC_020536	A	7	7	2577211	2577217	100 %	0 %	0 %	0 %	470198041
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46474	NC_020536	TTA	2	6	2577371	2577376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198041
46475	NC_020536	TGC	2	6	2577447	2577452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198041
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46485	NC_020536	TAT	2	6	2577807	2577812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198041
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46499	NC_020536	TACTAT	2	12	2578305	2578316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470198041
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