MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_020536	ATA	2	6	2300130	2300135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41503	NC_020536	TTATCT	2	12	2300169	2300180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470197834
41504	NC_020536	TTG	2	6	2300219	2300224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197834
41505	NC_020536	CAAA	2	8	2300282	2300289	75 %	0 %	0 %	25 %	470197834
41506	NC_020536	ATC	2	6	2300325	2300330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41507	NC_020536	ATAA	2	8	2300342	2300349	75 %	25 %	0 %	0 %	470197834
41508	NC_020536	ATTT	2	8	2300411	2300418	25 %	75 %	0 %	0 %	470197834
41509	NC_020536	ATA	2	6	2300451	2300456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41510	NC_020536	TTA	2	6	2300499	2300504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197834
41511	NC_020536	T	6	6	2300521	2300526	0 %	100 %	0 %	0 %	470197834
41512	NC_020536	ATT	2	6	2300537	2300542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197834
41513	NC_020536	GAT	2	6	2300635	2300640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470197834
41514	NC_020536	GAT	2	6	2300683	2300688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470197834
41515	NC_020536	AT	3	6	2300687	2300692	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41516	NC_020536	TA	3	6	2300708	2300713	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41517	NC_020536	AGT	2	6	2300747	2300752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470197834
41518	NC_020536	TTAA	2	8	2300763	2300770	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41519	NC_020536	CTA	2	6	2300821	2300826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41520	NC_020536	TAC	2	6	2300891	2300896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41521	NC_020536	TAA	2	6	2300927	2300932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41522	NC_020536	TAA	2	6	2301036	2301041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41523	NC_020536	TCCA	2	8	2301042	2301049	25 %	25 %	0 %	50 %	470197834
41524	NC_020536	GAA	2	6	2301144	2301149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470197834
41525	NC_020536	TAT	2	6	2301160	2301165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470197834
41526	NC_020536	AAT	2	6	2301168	2301173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41527	NC_020536	TAAT	2	8	2301247	2301254	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41528	NC_020536	AAT	2	6	2301301	2301306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41529	NC_020536	ACT	2	6	2301320	2301325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
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41531	NC_020536	CTT	2	6	2301344	2301349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197834
41532	NC_020536	TTTG	2	8	2301449	2301456	0 %	75 %	25 %	0 %	470197834
41533	NC_020536	TGG	2	6	2301501	2301506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470197834
41534	NC_020536	TTGT	2	8	2301507	2301514	0 %	75 %	25 %	0 %	470197834
41535	NC_020536	AAT	2	6	2301517	2301522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41536	NC_020536	CTT	2	6	2301529	2301534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197834
41537	NC_020536	CTA	2	6	2301538	2301543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41538	NC_020536	GAC	2	6	2301547	2301552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470197834
41539	NC_020536	GTAT	2	8	2301560	2301567	25 %	50 %	25 %	0 %	470197834
41540	NC_020536	AC	3	6	2301585	2301590	50 %	0 %	0 %	50 %	470197834
41541	NC_020536	TAAT	2	8	2301594	2301601	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41542	NC_020536	TGT	2	6	2301627	2301632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197834
41543	NC_020536	CAT	2	6	2301710	2301715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41544	NC_020536	ACTT	2	8	2301752	2301759	25 %	50 %	0 %	25 %	470197834
41545	NC_020536	CAA	2	6	2301760	2301765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470197834
41546	NC_020536	ATC	2	6	2301779	2301784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41547	NC_020536	ATA	2	6	2301816	2301821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197834
41548	NC_020536	CAT	2	6	2301829	2301834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41549	NC_020536	CAT	2	6	2301844	2301849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
41550	NC_020536	TTG	2	6	2301851	2301856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470197834
41551	NC_020536	GATT	2	8	2301859	2301866	25 %	50 %	25 %	0 %	470197834
41552	NC_020536	AT	3	6	2301893	2301898	50 %	50 %	0 %	0 %	470197834
41553	NC_020536	CTTC	2	8	2301913	2301920	0 %	50 %	0 %	50 %	470197834
41554	NC_020536	ACT	2	6	2301923	2301928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197834
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41556	NC_020536	GAA	2	6	2302585	2302590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470197835
41557	NC_020536	CTA	2	6	2302602	2302607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197835
41558	NC_020536	CAT	2	6	2302704	2302709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197835
41559	NC_020536	CTA	2	6	2302801	2302806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197835
41560	NC_020536	TAC	3	9	2302814	2302822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197835
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41563	NC_020536	AAT	2	6	2302868	2302873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197835
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41565	NC_020536	ACT	2	6	2302890	2302895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197835
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41567	NC_020536	ATCA	2	8	2302905	2302912	50 %	25 %	0 %	25 %	470197835
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41588	NC_020536	TAA	2	6	2304612	2304617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197836
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41590	NC_020536	TCG	2	6	2304638	2304643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470197836
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41593	NC_020536	GGA	2	6	2304778	2304783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470197836
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41596	NC_020536	ATA	2	6	2304927	2304932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470197836
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41600	NC_020536	A	6	6	2305134	2305139	100 %	0 %	0 %	0 %	470197836
41601	NC_020536	ACA	3	9	2305153	2305161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470197836
41602	NC_020536	GGTT	2	8	2305200	2305207	0 %	50 %	50 %	0 %	470197836
41603	NC_020536	TCA	2	6	2305214	2305219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470197836
41604	NC_020536	TTC	2	6	2305357	2305362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470197837
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41606	NC_020536	CAATTA	2	12	2305410	2305421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470197837
41607	NC_020536	AAAC	2	8	2305564	2305571	75 %	0 %	0 %	25 %	470197837
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41611	NC_020536	CGAC	2	8	2305763	2305770	25 %	0 %	25 %	50 %	470197837
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41970	NC_020536	AAAT	2	8	2326366	2326373	75 %	25 %	0 %	0 %	470197852
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