MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020536	GTA	2	6	178096	178101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3502	NC_020536	AT	3	6	178169	178174	50 %	50 %	0 %	0 %	470196338
3503	NC_020536	TCA	2	6	178228	178233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3504	NC_020536	CAT	2	6	178248	178253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3505	NC_020536	TAT	2	6	178316	178321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196338
3506	NC_020536	AT	3	6	178394	178399	50 %	50 %	0 %	0 %	470196338
3507	NC_020536	AAT	2	6	178434	178439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196338
3508	NC_020536	GTG	2	6	178468	178473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196338
3509	NC_020536	GAA	2	6	178516	178521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196338
3510	NC_020536	TGA	2	6	178562	178567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3511	NC_020536	TGT	2	6	178610	178615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196338
3512	NC_020536	AT	3	6	178642	178647	50 %	50 %	0 %	0 %	470196338
3513	NC_020536	TTA	2	6	178655	178660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196338
3514	NC_020536	CAA	2	6	178671	178676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196338
3515	NC_020536	TAC	2	6	178787	178792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3516	NC_020536	ACA	2	6	178817	178822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196338
3517	NC_020536	TAA	2	6	178826	178831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196338
3518	NC_020536	TTG	2	6	178870	178875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196338
3519	NC_020536	ATG	2	6	178903	178908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3520	NC_020536	GAT	2	6	178920	178925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3521	NC_020536	TGG	2	6	178937	178942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196338
3522	NC_020536	CAT	2	6	178992	178997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3523	NC_020536	CAA	2	6	179064	179069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196338
3524	NC_020536	T	6	6	179201	179206	0 %	100 %	0 %	0 %	470196338
3525	NC_020536	TGA	2	6	179299	179304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3526	NC_020536	ATT	2	6	179317	179322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196338
3527	NC_020536	AGA	2	6	179327	179332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196338
3528	NC_020536	ATG	2	6	179343	179348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3529	NC_020536	TTG	2	6	179368	179373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196338
3530	NC_020536	GAT	2	6	179391	179396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3531	NC_020536	GTT	2	6	179397	179402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196338
3532	NC_020536	ATT	2	6	179424	179429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196338
3533	NC_020536	TGA	4	12	179459	179470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196338
3534	NC_020536	CAA	2	6	179520	179525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196338
3535	NC_020536	CAT	2	6	179526	179531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3536	NC_020536	AT	3	6	179541	179546	50 %	50 %	0 %	0 %	470196338
3537	NC_020536	AGA	2	6	179588	179593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196338
3538	NC_020536	ACT	2	6	179630	179635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196338
3539	NC_020536	AAT	2	6	179694	179699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196338
3540	NC_020536	AATG	2	8	179798	179805	50 %	25 %	25 %	0 %	470196338
3541	NC_020536	AC	3	6	179911	179916	50 %	0 %	0 %	50 %	470196338
3542	NC_020536	TAA	2	6	179945	179950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196338
3543	NC_020536	AAC	3	9	180082	180090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196338
3544	NC_020536	GATA	2	8	180098	180105	50 %	25 %	25 %	0 %	470196338
3545	NC_020536	AACATT	2	12	180107	180118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470196338
3546	NC_020536	AAT	2	6	180122	180127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196338
3547	NC_020536	TAAC	2	8	180157	180164	50 %	25 %	0 %	25 %	470196338
3548	NC_020536	AT	3	6	180188	180193	50 %	50 %	0 %	0 %	470196338
3549	NC_020536	TAAG	2	8	180209	180216	50 %	25 %	25 %	0 %	470196338
3550	NC_020536	GAA	2	6	180273	180278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196339
3551	NC_020536	A	6	6	180306	180311	100 %	0 %	0 %	0 %	470196339
3552	NC_020536	TTA	2	6	180405	180410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196339
3553	NC_020536	GT	4	8	180522	180529	0 %	50 %	50 %	0 %	470196339
3554	NC_020536	AAAG	2	8	180669	180676	75 %	0 %	25 %	0 %	470196339
3555	NC_020536	ATTG	2	8	180686	180693	25 %	50 %	25 %	0 %	470196339
3556	NC_020536	TATGA	2	10	180723	180732	40 %	40 %	20 %	0 %	470196339
3557	NC_020536	ATCA	2	8	180748	180755	50 %	25 %	0 %	25 %	470196339
3558	NC_020536	GTGAA	2	10	180757	180766	40 %	20 %	40 %	0 %	470196339
3559	NC_020536	ATTT	2	8	180776	180783	25 %	75 %	0 %	0 %	470196339
3560	NC_020536	A	6	6	180837	180842	100 %	0 %	0 %	0 %	470196339
3561	NC_020536	AGT	2	6	180864	180869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196339
3562	NC_020536	TTAAT	2	10	181200	181209	40 %	60 %	0 %	0 %	470196340
3563	NC_020536	TGT	2	6	181228	181233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196340
3564	NC_020536	TCA	2	6	181250	181255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196340
3565	NC_020536	CA	3	6	181309	181314	50 %	0 %	0 %	50 %	470196340
3566	NC_020536	AAT	2	6	181354	181359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196340
3567	NC_020536	TAAG	2	8	181401	181408	50 %	25 %	25 %	0 %	470196340
3568	NC_020536	T	6	6	181413	181418	0 %	100 %	0 %	0 %	470196340
3569	NC_020536	AAT	2	6	181434	181439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196340
3570	NC_020536	ACT	2	6	181530	181535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196340
3571	NC_020536	TTG	2	6	181545	181550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196340
3572	NC_020536	TTG	2	6	181963	181968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196341
3573	NC_020536	CAA	2	6	181972	181977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196341
3574	NC_020536	ATT	2	6	181982	181987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196341
3575	NC_020536	AT	3	6	182115	182120	50 %	50 %	0 %	0 %	470196341
3576	NC_020536	TGA	2	6	182121	182126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196341
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3578	NC_020536	TGA	2	6	182164	182169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196341
3579	NC_020536	ATG	3	9	182212	182220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196341
3580	NC_020536	CAT	2	6	182266	182271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196341
3581	NC_020536	TGA	2	6	182293	182298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196341
3582	NC_020536	TTG	2	6	182372	182377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196341
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3586	NC_020536	TGT	2	6	182620	182625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196341
3587	NC_020536	TGT	2	6	182644	182649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196341
3588	NC_020536	TAA	2	6	182650	182655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196341
3589	NC_020536	GATG	2	8	182658	182665	25 %	25 %	50 %	0 %	470196341
3590	NC_020536	CCA	2	6	182685	182690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196341
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3592	NC_020536	TCA	2	6	182868	182873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196342
3593	NC_020536	TTG	2	6	183103	183108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
3594	NC_020536	CAA	2	6	183169	183174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196342
3595	NC_020536	TAA	2	6	183311	183316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196342
3596	NC_020536	TGA	2	6	183318	183323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196342
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3598	NC_020536	AGCA	2	8	183362	183369	50 %	0 %	25 %	25 %	470196342
3599	NC_020536	ACC	2	6	183413	183418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196342
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3601	NC_020536	AGCAAC	2	12	183596	183607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470196342
3602	NC_020536	GTT	2	6	183628	183633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
3603	NC_020536	TGTTTG	2	12	183644	183655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
3604	NC_020536	CAT	2	6	183661	183666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196342
3605	NC_020536	TTG	2	6	183674	183679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
3606	NC_020536	AAC	2	6	183710	183715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196342
3607	NC_020536	GTG	2	6	183769	183774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196342
3608	NC_020536	TA	3	6	183796	183801	50 %	50 %	0 %	0 %	470196342
3609	NC_020536	T	6	6	183848	183853	0 %	100 %	0 %	0 %	470196342
3610	NC_020536	ACC	2	6	183878	183883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196342
3611	NC_020536	TAA	2	6	183922	183927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196342
3612	NC_020536	TTG	2	6	183941	183946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196342
3613	NC_020536	TGAT	2	8	183997	184004	25 %	50 %	25 %	0 %	470196343
3614	NC_020536	ATATA	2	10	184030	184039	60 %	40 %	0 %	0 %	470196343
3615	NC_020536	ATCA	2	8	184084	184091	50 %	25 %	0 %	25 %	470196343
3616	NC_020536	TGT	2	6	184114	184119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196343
3617	NC_020536	AGT	2	6	184146	184151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196343
3618	NC_020536	TAC	2	6	184152	184157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196343
3619	NC_020536	CTT	2	6	184164	184169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196343
3620	NC_020536	ATA	2	6	184222	184227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196343
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3622	NC_020536	GATA	2	8	184360	184367	50 %	25 %	25 %	0 %	470196343
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3988	NC_020536	CAT	2	6	202409	202414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196355
3989	NC_020536	A	6	6	202537	202542	100 %	0 %	0 %	0 %	470196355
3990	NC_020536	ATG	2	6	202655	202660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196355
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4000	NC_020536	ATA	3	9	203329	203337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196356

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