MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020536	GCC	2	6	706987	706992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470196719
13002	NC_020536	CAC	2	6	707133	707138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196719
13003	NC_020536	ATGA	2	8	707183	707190	50 %	25 %	25 %	0 %	470196720
13004	NC_020536	ACC	2	6	707258	707263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196720
13005	NC_020536	TA	3	6	707285	707290	50 %	50 %	0 %	0 %	470196720
13006	NC_020536	GTT	2	6	707305	707310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196720
13007	NC_020536	ATG	2	6	707342	707347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196720
13008	NC_020536	TAA	2	6	707372	707377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196720
13009	NC_020536	ATC	2	6	707411	707416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196720
13010	NC_020536	CAT	2	6	707461	707466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196720
13011	NC_020536	GGA	2	6	707490	707495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196720
13012	NC_020536	AAT	2	6	707528	707533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196720
13013	NC_020536	GTT	2	6	707556	707561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196720
13014	NC_020536	CAA	2	6	707578	707583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196720
13015	NC_020536	AAT	3	9	707603	707611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196720
13016	NC_020536	TTG	2	6	707650	707655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196721
13017	NC_020536	T	6	6	707686	707691	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13018	NC_020536	CTT	2	6	707718	707723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196721
13019	NC_020536	TTC	2	6	707737	707742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196721
13020	NC_020536	T	7	7	707762	707768	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13021	NC_020536	T	7	7	707804	707810	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13022	NC_020536	T	6	6	707827	707832	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13023	NC_020536	TTA	2	6	707852	707857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196721
13024	NC_020536	TTC	2	6	707875	707880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196721
13025	NC_020536	T	6	6	707893	707898	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13026	NC_020536	CTT	2	6	707946	707951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196721
13027	NC_020536	T	7	7	707969	707975	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13028	NC_020536	T	6	6	708034	708039	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13029	NC_020536	T	6	6	708106	708111	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13030	NC_020536	TGC	2	6	708154	708159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196721
13031	NC_020536	TGT	2	6	708215	708220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196721
13032	NC_020536	TACGTT	2	12	708225	708236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196721
13033	NC_020536	CAA	2	6	708237	708242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196721
13034	NC_020536	TGA	2	6	708285	708290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196721
13035	NC_020536	T	6	6	708292	708297	0 %	100 %	0 %	0 %	470196721
13036	NC_020536	TTA	2	6	708329	708334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196721
13037	NC_020536	AAGTA	2	10	708506	708515	60 %	20 %	20 %	0 %	470196722
13038	NC_020536	TAA	2	6	708685	708690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196722
13039	NC_020536	GCT	2	6	708704	708709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196722
13040	NC_020536	ATA	2	6	708728	708733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196722
13041	NC_020536	TGC	2	6	708748	708753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196722
13042	NC_020536	TTG	2	6	708789	708794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196722
13043	NC_020536	GA	3	6	708834	708839	50 %	0 %	50 %	0 %	470196722
13044	NC_020536	TTGAT	2	10	708866	708875	20 %	60 %	20 %	0 %	470196722
13045	NC_020536	TTTAAC	2	12	708892	708903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470196722
13046	NC_020536	AAT	2	6	708919	708924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196722
13047	NC_020536	ATAG	2	8	708928	708935	50 %	25 %	25 %	0 %	470196722
13048	NC_020536	TAAA	2	8	708972	708979	75 %	25 %	0 %	0 %	470196722
13049	NC_020536	TTC	2	6	708982	708987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196722
13050	NC_020536	ATC	2	6	708994	708999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196722
13051	NC_020536	CTG	2	6	709020	709025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196722
13052	NC_020536	TAA	2	6	709048	709053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196722
13053	NC_020536	TTG	2	6	709081	709086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196722
13054	NC_020536	AAG	2	6	709136	709141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196722
13055	NC_020536	TGC	3	9	709159	709167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196722
13056	NC_020536	TAAATG	2	12	709197	709208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470196722
13057	NC_020536	GAT	2	6	709232	709237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196722
13058	NC_020536	ATC	2	6	709249	709254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196722
13059	NC_020536	CGA	2	6	709308	709313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196722
13060	NC_020536	ATA	2	6	709322	709327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196722
13061	NC_020536	TTA	2	6	709332	709337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196722
13062	NC_020536	A	6	6	709575	709580	100 %	0 %	0 %	0 %	470196723
13063	NC_020536	AAC	2	6	709583	709588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196723
13064	NC_020536	T	6	6	709685	709690	0 %	100 %	0 %	0 %	470196723
13065	NC_020536	TAT	2	6	709732	709737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196723
13066	NC_020536	TTATT	2	10	709738	709747	20 %	80 %	0 %	0 %	470196723
13067	NC_020536	TTAT	2	8	709843	709850	25 %	75 %	0 %	0 %	470196723
13068	NC_020536	AAT	2	6	709854	709859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196723
13069	NC_020536	ATG	2	6	709956	709961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196723
13070	NC_020536	TCA	2	6	709969	709974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196723
13071	NC_020536	ATTA	2	8	710012	710019	50 %	50 %	0 %	0 %	470196723
13072	NC_020536	TAA	2	6	710023	710028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196723
13073	NC_020536	TAT	2	6	710054	710059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196723
13074	NC_020536	ACG	2	6	710200	710205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196723
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13076	NC_020536	ATTGG	2	10	710295	710304	20 %	40 %	40 %	0 %	470196723
13077	NC_020536	TAG	2	6	710329	710334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196723
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13079	NC_020536	ATT	2	6	710373	710378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196723
13080	NC_020536	AAC	2	6	710479	710484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196723
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13084	NC_020536	AT	3	6	710762	710767	50 %	50 %	0 %	0 %	470196723
13085	NC_020536	ATA	2	6	710818	710823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196723
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13088	NC_020536	AAT	2	6	710894	710899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196723
13089	NC_020536	AGG	2	6	710906	710911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196723
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13091	NC_020536	TGA	2	6	710990	710995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196723
13092	NC_020536	GAT	2	6	711071	711076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196723
13093	NC_020536	ATA	2	6	711094	711099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196723
13094	NC_020536	ACG	2	6	711116	711121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196723
13095	NC_020536	TA	3	6	711126	711131	50 %	50 %	0 %	0 %	470196723
13096	NC_020536	TGA	2	6	711152	711157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196723
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13098	NC_020536	TGA	2	6	711348	711353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196724
13099	NC_020536	AT	4	8	711567	711574	50 %	50 %	0 %	0 %	470196724
13100	NC_020536	TAT	2	6	711584	711589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196724
13101	NC_020536	CCA	2	6	711590	711595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196724
13102	NC_020536	TGT	2	6	711681	711686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196724
13103	NC_020536	TTACT	2	10	711687	711696	20 %	60 %	0 %	20 %	470196724
13104	NC_020536	A	7	7	711718	711724	100 %	0 %	0 %	0 %	470196724
13105	NC_020536	TAAAT	2	10	711856	711865	60 %	40 %	0 %	0 %	470196724
13106	NC_020536	ATT	2	6	711929	711934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196724
13107	NC_020536	TAGTT	2	10	711955	711964	20 %	60 %	20 %	0 %	470196724
13108	NC_020536	ATT	2	6	712001	712006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196724
13109	NC_020536	TAT	2	6	712076	712081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196724
13110	NC_020536	CTA	2	6	712137	712142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196724
13111	NC_020536	A	7	7	712147	712153	100 %	0 %	0 %	0 %	470196724
13112	NC_020536	ATG	2	6	712170	712175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196724
13113	NC_020536	TGT	2	6	712236	712241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196724
13114	NC_020536	TTCAGG	2	12	712294	712305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470196724
13115	NC_020536	TAC	2	6	712317	712322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196724
13116	NC_020536	CAA	2	6	712439	712444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196724
13117	NC_020536	ATTT	2	8	712470	712477	25 %	75 %	0 %	0 %	470196724
13118	NC_020536	GCAA	2	8	712501	712508	50 %	0 %	25 %	25 %	470196724
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13360	NC_020536	GTA	2	6	728877	728882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196734
13361	NC_020536	GAT	3	9	728918	728926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196734
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13479	NC_020536	CAT	2	6	734375	734380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196739
13480	NC_020536	TCA	2	6	734508	734513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196740
13481	NC_020536	T	6	6	734540	734545	0 %	100 %	0 %	0 %	470196740
13482	NC_020536	TAAT	2	8	734572	734579	50 %	50 %	0 %	0 %	470196740
13483	NC_020536	AAAG	2	8	734634	734641	75 %	0 %	25 %	0 %	470196740
13484	NC_020536	ATATC	2	10	734663	734672	40 %	40 %	0 %	20 %	470196740
13485	NC_020536	AGC	2	6	734715	734720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196740
13486	NC_020536	TC	3	6	734762	734767	0 %	50 %	0 %	50 %	470196740
13487	NC_020536	ACA	2	6	734776	734781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196740
13488	NC_020536	CGT	2	6	734796	734801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196740
13489	NC_020536	TAACA	2	10	734922	734931	60 %	20 %	0 %	20 %	470196740
13490	NC_020536	AAT	2	6	734971	734976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196740
13491	NC_020536	ATG	2	6	734983	734988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196740
13492	NC_020536	ACA	2	6	736079	736084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196741
13493	NC_020536	CAT	2	6	736134	736139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196741
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13499	NC_020536	ACC	2	6	736254	736259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196741
13500	NC_020536	ATG	2	6	736261	736266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196741

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