MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_020532	CAT	2	6	2549450	2549455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194093
46003	NC_020532	ATA	2	6	2549466	2549471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194093
46004	NC_020532	ATTAA	2	10	2549564	2549573	60 %	40 %	0 %	0 %	470194094
46005	NC_020532	TTA	2	6	2549576	2549581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194094
46006	NC_020532	AAT	2	6	2549593	2549598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194094
46007	NC_020532	AAT	2	6	2549620	2549625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194094
46008	NC_020532	ATT	2	6	2549659	2549664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194094
46009	NC_020532	GAC	2	6	2549755	2549760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194094
46010	NC_020532	CCA	2	6	2549861	2549866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194094
46011	NC_020532	AATAA	2	10	2549882	2549891	80 %	20 %	0 %	0 %	470194094
46012	NC_020532	TAA	2	6	2549956	2549961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194094
46013	NC_020532	TGAT	2	8	2550111	2550118	25 %	50 %	25 %	0 %	470194094
46014	NC_020532	CAC	2	6	2550154	2550159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194094
46015	NC_020532	CTTT	2	8	2550183	2550190	0 %	75 %	0 %	25 %	470194094
46016	NC_020532	A	6	6	2550206	2550211	100 %	0 %	0 %	0 %	470194094
46017	NC_020532	TAA	2	6	2550241	2550246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194094
46018	NC_020532	CAA	2	6	2550270	2550275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194094
46019	NC_020532	CCA	2	6	2550392	2550397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194094
46020	NC_020532	TGT	2	6	2551462	2551467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194095
46021	NC_020532	AAT	2	6	2551503	2551508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194095
46022	NC_020532	GGT	2	6	2551572	2551577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194095
46023	NC_020532	GTG	2	6	2551651	2551656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194095
46024	NC_020532	CTTA	2	8	2551661	2551668	25 %	50 %	0 %	25 %	470194095
46025	NC_020532	ATG	2	6	2551680	2551685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194095
46026	NC_020532	TGC	2	6	2551811	2551816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194095
46027	NC_020532	TAC	2	6	2551828	2551833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194095
46028	NC_020532	TAT	3	9	2551853	2551861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46029	NC_020532	ATT	2	6	2551895	2551900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46030	NC_020532	TGCT	2	8	2551906	2551913	0 %	50 %	25 %	25 %	470194095
46031	NC_020532	TAT	2	6	2551942	2551947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46032	NC_020532	GTC	2	6	2551974	2551979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194095
46033	NC_020532	ATTAT	2	10	2552169	2552178	40 %	60 %	0 %	0 %	470194095
46034	NC_020532	TAT	2	6	2552192	2552197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46035	NC_020532	GGT	2	6	2552199	2552204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194095
46036	NC_020532	GAAA	2	8	2552255	2552262	75 %	0 %	25 %	0 %	470194095
46037	NC_020532	ATT	2	6	2552267	2552272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46038	NC_020532	CAT	2	6	2552354	2552359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194095
46039	NC_020532	TTA	2	6	2552362	2552367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46040	NC_020532	ATTTTA	2	12	2552370	2552381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194095
46041	NC_020532	TAAT	2	8	2552505	2552512	50 %	50 %	0 %	0 %	470194096
46042	NC_020532	CAA	2	6	2552624	2552629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194096
46043	NC_020532	CTT	2	6	2552662	2552667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194096
46044	NC_020532	GT	3	6	2552746	2552751	0 %	50 %	50 %	0 %	470194096
46045	NC_020532	AC	3	6	2552776	2552781	50 %	0 %	0 %	50 %	470194096
46046	NC_020532	TCTT	2	8	2552805	2552812	0 %	75 %	0 %	25 %	470194096
46047	NC_020532	AGT	2	6	2552815	2552820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194096
46048	NC_020532	TGC	2	6	2552835	2552840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194096
46049	NC_020532	CCGC	2	8	2552937	2552944	0 %	0 %	25 %	75 %	470194096
46050	NC_020532	ATG	2	6	2553069	2553074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194096
46051	NC_020532	TCA	2	6	2553102	2553107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194096
46052	NC_020532	CTG	2	6	2553280	2553285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194096
46053	NC_020532	T	6	6	2553298	2553303	0 %	100 %	0 %	0 %	470194096
46054	NC_020532	CTT	3	9	2553319	2553327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194096
46055	NC_020532	ACG	2	6	2553338	2553343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194096
46056	NC_020532	TGC	2	6	2553425	2553430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194096
46057	NC_020532	T	6	6	2553461	2553466	0 %	100 %	0 %	0 %	470194096
46058	NC_020532	ATT	2	6	2554780	2554785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194097
46059	NC_020532	TAA	2	6	2554861	2554866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194097
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46066	NC_020532	TCTTCA	2	12	2555562	2555573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470194097
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46099	NC_020532	ATA	2	6	2556625	2556630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194097
46100	NC_020532	CTG	2	6	2556658	2556663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194097
46101	NC_020532	CGA	2	6	2556674	2556679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194097
46102	NC_020532	T	6	6	2556699	2556704	0 %	100 %	0 %	0 %	470194097
46103	NC_020532	CTA	2	6	2556721	2556726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194097
46104	NC_020532	TAA	2	6	2556758	2556763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194097
46105	NC_020532	GCT	2	6	2556771	2556776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194097
46106	NC_020532	A	7	7	2556885	2556891	100 %	0 %	0 %	0 %	470194097
46107	NC_020532	AACA	2	8	2556901	2556908	75 %	0 %	0 %	25 %	470194097
46108	NC_020532	GTT	2	6	2556928	2556933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194097
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46111	NC_020532	CTT	2	6	2557252	2557257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194098
46112	NC_020532	GCA	2	6	2557284	2557289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194098
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46114	NC_020532	TGC	2	6	2557397	2557402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194098
46115	NC_020532	GCT	2	6	2557461	2557466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194098
46116	NC_020532	TGT	2	6	2557467	2557472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194098
46117	NC_020532	TAA	2	6	2557480	2557485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194098
46118	NC_020532	TGTT	2	8	2557494	2557501	0 %	75 %	25 %	0 %	470194098
46119	NC_020532	CTG	2	6	2557540	2557545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194098
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46121	NC_020532	TTG	2	6	2557686	2557691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194098
46122	NC_020532	CTG	2	6	2557744	2557749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194098
46123	NC_020532	CAT	2	6	2557759	2557764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194098
46124	NC_020532	TAA	2	6	2557768	2557773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194098
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46135	NC_020532	T	6	6	2558303	2558308	0 %	100 %	0 %	0 %	470194098
46136	NC_020532	T	6	6	2558380	2558385	0 %	100 %	0 %	0 %	470194098
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46185	NC_020532	TGC	2	6	2562634	2562639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194101
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46210	NC_020532	CAAA	2	8	2564071	2564078	75 %	0 %	0 %	25 %	470194102
46211	NC_020532	AATTGG	2	12	2564084	2564095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194102
46212	NC_020532	GCT	2	6	2564154	2564159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194102
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46218	NC_020532	TGAAA	2	10	2564297	2564306	60 %	20 %	20 %	0 %	470194102
46219	NC_020532	TGC	2	6	2564318	2564323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194102
46220	NC_020532	CAATT	2	10	2564332	2564341	40 %	40 %	0 %	20 %	470194102
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46222	NC_020532	GGC	2	6	2564424	2564429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194102
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46224	NC_020532	GAAT	2	8	2564621	2564628	50 %	25 %	25 %	0 %	470194102
46225	NC_020532	TGA	2	6	2564735	2564740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194102
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46227	NC_020532	ATT	2	6	2564981	2564986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194102
46228	NC_020532	TTC	2	6	2565027	2565032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194102
46229	NC_020532	TGA	2	6	2565041	2565046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194102
46230	NC_020532	GAA	2	6	2565060	2565065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194102
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46232	NC_020532	TAT	2	6	2565388	2565393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194103
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46341	NC_020532	TA	3	6	2570512	2570517	50 %	50 %	0 %	0 %	470194105
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46349	NC_020532	ATC	2	6	2571242	2571247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194106
46350	NC_020532	CAT	2	6	2571265	2571270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194106
46351	NC_020532	TTG	2	6	2571304	2571309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194106
46352	NC_020532	AAT	2	6	2571431	2571436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194106
46353	NC_020532	CAT	2	6	2571503	2571508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194106
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46452	NC_020532	A	7	7	2577603	2577609	100 %	0 %	0 %	0 %	470194110
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46457	NC_020532	TAAA	2	8	2577871	2577878	75 %	25 %	0 %	0 %	470194110
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46500	NC_020532	AT	3	6	2579293	2579298	50 %	50 %	0 %	0 %	470194110

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