MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020532	TTTA	2	8	202278	202285	25 %	75 %	0 %	0 %	470192424
4003	NC_020532	GA	3	6	202311	202316	50 %	0 %	50 %	0 %	470192424
4004	NC_020532	AGA	2	6	202320	202325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192424
4005	NC_020532	GTAT	2	8	202401	202408	25 %	50 %	25 %	0 %	470192424
4006	NC_020532	CAT	2	6	202410	202415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192424
4007	NC_020532	A	6	6	202538	202543	100 %	0 %	0 %	0 %	470192424
4008	NC_020532	ATG	2	6	202656	202661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192424
4009	NC_020532	AAC	2	6	202682	202687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192424
4010	NC_020532	TAA	2	6	202741	202746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192424
4011	NC_020532	TGA	2	6	202780	202785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192424
4012	NC_020532	AAT	2	6	202877	202882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192424
4013	NC_020532	TAA	2	6	202894	202899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192424
4014	NC_020532	ATT	2	6	202952	202957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192424
4015	NC_020532	TTAA	2	8	202988	202995	50 %	50 %	0 %	0 %	470192424
4016	NC_020532	AATG	2	8	203011	203018	50 %	25 %	25 %	0 %	470192424
4017	NC_020532	TTTG	2	8	203229	203236	0 %	75 %	25 %	0 %	470192425
4018	NC_020532	ATA	3	9	203330	203338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192425
4019	NC_020532	TA	3	6	203369	203374	50 %	50 %	0 %	0 %	470192425
4020	NC_020532	CAA	3	9	203479	203487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192425
4021	NC_020532	AAT	2	6	203515	203520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192425
4022	NC_020532	TAT	2	6	203529	203534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192425
4023	NC_020532	ATT	2	6	203578	203583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192425
4024	NC_020532	CAT	2	6	203597	203602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192425
4025	NC_020532	TAC	2	6	203619	203624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192425
4026	NC_020532	ATT	2	6	203626	203631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192425
4027	NC_020532	CA	3	6	203637	203642	50 %	0 %	0 %	50 %	470192425
4028	NC_020532	AAT	2	6	203673	203678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192425
4029	NC_020532	ACA	2	6	203700	203705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192425
4030	NC_020532	ATC	2	6	203808	203813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192426
4031	NC_020532	TCT	2	6	203820	203825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192426
4032	NC_020532	TTA	2	6	203827	203832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192426
4033	NC_020532	A	7	7	203859	203865	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4034	NC_020532	CTG	3	9	203866	203874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192426
4035	NC_020532	AAG	2	6	203905	203910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192426
4036	NC_020532	TGA	2	6	203936	203941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192426
4037	NC_020532	AGA	2	6	204032	204037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192426
4038	NC_020532	A	7	7	204069	204075	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4039	NC_020532	A	7	7	204092	204098	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4040	NC_020532	GTAG	2	8	204120	204127	25 %	25 %	50 %	0 %	470192426
4041	NC_020532	AAT	3	9	204204	204212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192426
4042	NC_020532	TA	3	6	204229	204234	50 %	50 %	0 %	0 %	470192426
4043	NC_020532	ACT	2	6	204322	204327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192426
4044	NC_020532	ATT	2	6	204369	204374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192426
4045	NC_020532	A	7	7	204390	204396	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4046	NC_020532	A	6	6	204405	204410	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4047	NC_020532	TAAA	2	8	204424	204431	75 %	25 %	0 %	0 %	470192426
4048	NC_020532	A	6	6	204429	204434	100 %	0 %	0 %	0 %	470192426
4049	NC_020532	TATACA	2	12	204459	204470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192426
4050	NC_020532	GAA	2	6	204477	204482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192426
4051	NC_020532	AGC	2	6	204530	204535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192426
4052	NC_020532	TA	3	6	204588	204593	50 %	50 %	0 %	0 %	470192426
4053	NC_020532	AGA	2	6	204611	204616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192426
4054	NC_020532	ACG	2	6	204626	204631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192426
4055	NC_020532	AG	3	6	204677	204682	50 %	0 %	50 %	0 %	470192426
4056	NC_020532	TG	3	6	204693	204698	0 %	50 %	50 %	0 %	470192426
4057	NC_020532	GTGTT	2	10	204727	204736	0 %	60 %	40 %	0 %	470192426
4058	NC_020532	CAA	2	6	204739	204744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192426
4059	NC_020532	GTA	2	6	204780	204785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192426
4060	NC_020532	GT	3	6	204814	204819	0 %	50 %	50 %	0 %	470192426
4061	NC_020532	CTT	2	6	204834	204839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192426
4062	NC_020532	TGGA	2	8	204842	204849	25 %	25 %	50 %	0 %	470192426
4063	NC_020532	GCA	2	6	204861	204866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192426
4064	NC_020532	AAGA	2	8	204870	204877	75 %	0 %	25 %	0 %	470192426
4065	NC_020532	AAT	2	6	205401	205406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192427
4066	NC_020532	TAC	2	6	205493	205498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192427
4067	NC_020532	TTAA	2	8	205512	205519	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4068	NC_020532	T	6	6	205525	205530	0 %	100 %	0 %	0 %	470192427
4069	NC_020532	TAT	3	9	205537	205545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4070	NC_020532	TAT	2	6	205556	205561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4071	NC_020532	ATT	2	6	205603	205608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4072	NC_020532	TTTA	2	8	205623	205630	25 %	75 %	0 %	0 %	470192427
4073	NC_020532	ATT	2	6	205664	205669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4074	NC_020532	TA	3	6	205696	205701	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4075	NC_020532	GA	3	6	205712	205717	50 %	0 %	50 %	0 %	470192427
4076	NC_020532	AT	3	6	205737	205742	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4077	NC_020532	A	6	6	205757	205762	100 %	0 %	0 %	0 %	470192427
4078	NC_020532	TTG	2	6	205765	205770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192427
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4084	NC_020532	ATG	2	6	205965	205970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192427
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4088	NC_020532	TAA	2	6	206059	206064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192427
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4091	NC_020532	TA	3	6	206157	206162	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4092	NC_020532	AT	3	6	206200	206205	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4093	NC_020532	ATT	2	6	206214	206219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
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4095	NC_020532	TAT	2	6	206244	206249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
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4100	NC_020532	AAC	2	6	206342	206347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192427
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4104	NC_020532	T	7	7	206549	206555	0 %	100 %	0 %	0 %	470192427
4105	NC_020532	TAT	2	6	206690	206695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4106	NC_020532	TTA	2	6	206697	206702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4107	NC_020532	AT	3	6	206724	206729	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4108	NC_020532	TA	4	8	206731	206738	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
4109	NC_020532	ATA	2	6	206751	206756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192427
4110	NC_020532	ATC	2	6	206757	206762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192427
4111	NC_020532	TAA	2	6	206770	206775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192427
4112	NC_020532	ATT	2	6	206789	206794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4113	NC_020532	ATC	2	6	206821	206826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192427
4114	NC_020532	GAA	2	6	206853	206858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192427
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4116	NC_020532	TCA	2	6	206910	206915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192427
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4121	NC_020532	ATTTAT	2	12	207070	207081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
4122	NC_020532	TAA	2	6	207125	207130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192428
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4124	NC_020532	TTA	2	6	207163	207168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192428
4125	NC_020532	TAATT	2	10	207231	207240	40 %	60 %	0 %	0 %	470192428
4126	NC_020532	TCT	2	6	207245	207250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192428
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4129	NC_020532	TCTAT	2	10	207364	207373	20 %	60 %	0 %	20 %	470192428
4130	NC_020532	T	6	6	207441	207446	0 %	100 %	0 %	0 %	470192428
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4136	NC_020532	CAT	2	6	207551	207556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192428
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4146	NC_020532	T	7	7	207846	207852	0 %	100 %	0 %	0 %	470192429
4147	NC_020532	TA	3	6	207898	207903	50 %	50 %	0 %	0 %	470192429
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4153	NC_020532	AAAGA	2	10	208134	208143	80 %	0 %	20 %	0 %	470192429
4154	NC_020532	TAA	2	6	208144	208149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192429
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4235	NC_020532	TA	4	8	212119	212126	50 %	50 %	0 %	0 %	470192431
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4238	NC_020532	ACA	2	6	212237	212242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192432
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4241	NC_020532	AACA	2	8	212412	212419	75 %	0 %	0 %	25 %	470192432
4242	NC_020532	CAT	2	6	212426	212431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192432
4243	NC_020532	TCG	2	6	212448	212453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192432
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4245	NC_020532	TTG	2	6	212465	212470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192432
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4247	NC_020532	ACT	2	6	212582	212587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192432
4248	NC_020532	CTA	2	6	212679	212684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192432
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4369	NC_020532	T	6	6	218715	218720	0 %	100 %	0 %	0 %	470192436
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4491	NC_020532	ATG	2	6	224860	224865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
4492	NC_020532	GTG	2	6	224891	224896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192442
4493	NC_020532	AGC	2	6	224982	224987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
4494	NC_020532	ATG	2	6	225029	225034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
4495	NC_020532	ATGTG	2	10	225140	225149	20 %	40 %	40 %	0 %	470192442
4496	NC_020532	CAG	2	6	225173	225178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
4497	NC_020532	A	6	6	225185	225190	100 %	0 %	0 %	0 %	470192442
4498	NC_020532	GATA	2	8	225192	225199	50 %	25 %	25 %	0 %	470192442
4499	NC_020532	A	6	6	225217	225222	100 %	0 %	0 %	0 %	470192442
4500	NC_020532	AGC	2	6	225276	225281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442

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