MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_020532	GTT	2	6	1042080	1042085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193029
19002	NC_020532	ATT	2	6	1042166	1042171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19003	NC_020532	TTC	2	6	1042188	1042193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193029
19004	NC_020532	TA	3	6	1042214	1042219	50 %	50 %	0 %	0 %	470193029
19005	NC_020532	TA	3	6	1042222	1042227	50 %	50 %	0 %	0 %	470193029
19006	NC_020532	AAAT	2	8	1042244	1042251	75 %	25 %	0 %	0 %	470193029
19007	NC_020532	ATT	2	6	1042281	1042286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19008	NC_020532	CTT	2	6	1042304	1042309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193029
19009	NC_020532	GAA	2	6	1042358	1042363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470193029
19010	NC_020532	TAC	2	6	1042439	1042444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193029
19011	NC_020532	AGC	2	6	1042481	1042486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193029
19012	NC_020532	ATT	2	6	1042493	1042498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19013	NC_020532	TTG	2	6	1042558	1042563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193029
19014	NC_020532	ACTTT	2	10	1042575	1042584	20 %	60 %	0 %	20 %	470193029
19015	NC_020532	AGC	2	6	1042643	1042648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193029
19016	NC_020532	ATT	4	12	1042685	1042696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19017	NC_020532	GT	3	6	1042699	1042704	0 %	50 %	50 %	0 %	470193029
19018	NC_020532	ATA	2	6	1042771	1042776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193029
19019	NC_020532	ATT	2	6	1042843	1042848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19020	NC_020532	ATT	2	6	1042970	1042975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193029
19021	NC_020532	GCTA	2	8	1042994	1043001	25 %	25 %	25 %	25 %	470193029
19022	NC_020532	AGC	2	6	1043075	1043080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193029
19023	NC_020532	CAT	2	6	1043132	1043137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193029
19024	NC_020532	AAG	2	6	1043217	1043222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470193029
19025	NC_020532	AGG	2	6	1043225	1043230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470193029
19026	NC_020532	GTT	2	6	1043278	1043283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193030
19027	NC_020532	ATT	2	6	1043300	1043305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19028	NC_020532	GCATT	2	10	1043336	1043345	20 %	40 %	20 %	20 %	470193030
19029	NC_020532	TGA	2	6	1043359	1043364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193030
19030	NC_020532	TCT	2	6	1043436	1043441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193030
19031	NC_020532	TTTC	2	8	1043458	1043465	0 %	75 %	0 %	25 %	470193030
19032	NC_020532	TCAA	2	8	1043471	1043478	50 %	25 %	0 %	25 %	470193030
19033	NC_020532	GAT	2	6	1043590	1043595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193030
19034	NC_020532	ATT	2	6	1043614	1043619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19035	NC_020532	GTA	2	6	1043738	1043743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193030
19036	NC_020532	ATT	2	6	1043753	1043758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19037	NC_020532	TA	3	6	1043766	1043771	50 %	50 %	0 %	0 %	470193030
19038	NC_020532	TCA	2	6	1043774	1043779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193030
19039	NC_020532	A	6	6	1043801	1043806	100 %	0 %	0 %	0 %	470193030
19040	NC_020532	GAT	2	6	1043866	1043871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193030
19041	NC_020532	ACT	2	6	1043943	1043948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193030
19042	NC_020532	A	6	6	1044011	1044016	100 %	0 %	0 %	0 %	470193030
19043	NC_020532	ATG	2	6	1044050	1044055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193030
19044	NC_020532	TTA	2	6	1044185	1044190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19045	NC_020532	ATT	3	9	1044205	1044213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19046	NC_020532	ATT	2	6	1044217	1044222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193030
19047	NC_020532	GAAA	2	8	1044249	1044256	75 %	0 %	25 %	0 %	470193030
19048	NC_020532	GTA	2	6	1044438	1044443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193031
19049	NC_020532	TCGT	2	8	1044444	1044451	0 %	50 %	25 %	25 %	470193031
19050	NC_020532	ATG	2	6	1044492	1044497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193031
19051	NC_020532	TGAA	2	8	1044507	1044514	50 %	25 %	25 %	0 %	470193031
19052	NC_020532	GTT	2	6	1044539	1044544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193031
19053	NC_020532	ACA	2	6	1044551	1044556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470193031
19054	NC_020532	TCAA	2	8	1044628	1044635	50 %	25 %	0 %	25 %	470193031
19055	NC_020532	GAC	2	6	1044643	1044648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193031
19056	NC_020532	A	7	7	1044673	1044679	100 %	0 %	0 %	0 %	470193031
19057	NC_020532	TAAA	2	8	1044720	1044727	75 %	25 %	0 %	0 %	470193031
19058	NC_020532	ATT	2	6	1044920	1044925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193031
19059	NC_020532	TCA	2	6	1044948	1044953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193031
19060	NC_020532	CCAAAT	2	12	1044959	1044970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470193031
19061	NC_020532	A	7	7	1045035	1045041	100 %	0 %	0 %	0 %	470193031
19062	NC_020532	CGA	2	6	1045047	1045052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193031
19063	NC_020532	ATT	2	6	1045302	1045307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
19064	NC_020532	T	6	6	1045374	1045379	0 %	100 %	0 %	0 %	470193032
19065	NC_020532	AAAT	2	8	1045381	1045388	75 %	25 %	0 %	0 %	470193032
19066	NC_020532	AGA	2	6	1045411	1045416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470193032
19067	NC_020532	TAA	2	6	1045461	1045466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
19068	NC_020532	CAT	2	6	1045491	1045496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193032
19069	NC_020532	AATT	2	8	1045498	1045505	50 %	50 %	0 %	0 %	470193032
19070	NC_020532	AT	3	6	1045520	1045525	50 %	50 %	0 %	0 %	470193032
19071	NC_020532	AAT	2	6	1045540	1045545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
19072	NC_020532	ATTT	2	8	1045563	1045570	25 %	75 %	0 %	0 %	470193032
19073	NC_020532	AAC	3	9	1045588	1045596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470193032
19074	NC_020532	CTT	2	6	1045608	1045613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193032
19075	NC_020532	ATA	2	6	1045617	1045622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
19076	NC_020532	TTA	2	6	1045635	1045640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
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19078	NC_020532	GT	3	6	1045723	1045728	0 %	50 %	50 %	0 %	470193032
19079	NC_020532	TCT	2	6	1045769	1045774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193032
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19081	NC_020532	TTG	2	6	1045876	1045881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193032
19082	NC_020532	TGA	2	6	1046005	1046010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193032
19083	NC_020532	TAATTT	2	12	1046037	1046048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
19084	NC_020532	TGC	2	6	1046080	1046085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470193032
19085	NC_020532	CGGTA	2	10	1046134	1046143	20 %	20 %	40 %	20 %	470193032
19086	NC_020532	TTA	2	6	1046150	1046155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
19087	NC_020532	GGT	2	6	1046174	1046179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470193032
19088	NC_020532	AGC	2	6	1046266	1046271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193032
19089	NC_020532	TTG	2	6	1046281	1046286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193032
19090	NC_020532	ATA	2	6	1046321	1046326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
19091	NC_020532	TTG	2	6	1046409	1046414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193032
19092	NC_020532	CTT	2	6	1046439	1046444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193032
19093	NC_020532	ACT	2	6	1046522	1046527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193032
19094	NC_020532	AGAA	2	8	1046589	1046596	75 %	0 %	25 %	0 %	470193032
19095	NC_020532	TTTAG	2	10	1046642	1046651	20 %	60 %	20 %	0 %	470193032
19096	NC_020532	TAA	2	6	1046659	1046664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
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19098	NC_020532	TTC	2	6	1046671	1046676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193032
19099	NC_020532	TTA	2	6	1046681	1046686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
19100	NC_020532	ACC	2	6	1046710	1046715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470193032
19101	NC_020532	GTT	2	6	1046733	1046738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193032
19102	NC_020532	CAA	2	6	1046796	1046801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470193032
19103	NC_020532	AATC	2	8	1046847	1046854	50 %	25 %	0 %	25 %	470193032
19104	NC_020532	TAA	2	6	1046857	1046862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193032
19105	NC_020532	ATC	2	6	1046866	1046871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193032
19106	NC_020532	ATT	2	6	1046999	1047004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193032
19107	NC_020532	TAT	2	6	1047873	1047878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193033
19108	NC_020532	ATC	2	6	1047904	1047909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193033
19109	NC_020532	CTT	2	6	1047945	1047950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470193033
19110	NC_020532	CAT	2	6	1048011	1048016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470193033
19111	NC_020532	CT	3	6	1048135	1048140	0 %	50 %	0 %	50 %	470193033
19112	NC_020532	TTTCTT	2	12	1048155	1048166	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470193033
19113	NC_020532	GCT	2	6	1048193	1048198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470193033
19114	NC_020532	ATG	2	6	1048229	1048234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470193033
19115	NC_020532	AT	3	6	1048250	1048255	50 %	50 %	0 %	0 %	470193033
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19117	NC_020532	GTT	2	6	1048303	1048308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193033
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19233	NC_020532	AAAT	2	8	1054872	1054879	75 %	25 %	0 %	0 %	470193039
19234	NC_020532	TAA	2	6	1054889	1054894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470193039
19235	NC_020532	AGA	2	6	1054908	1054913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470193039
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19239	NC_020532	TGAAAA	2	12	1055072	1055083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470193039
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19245	NC_020532	TA	3	6	1055136	1055141	50 %	50 %	0 %	0 %	470193039
19246	NC_020532	ATATG	2	10	1055171	1055180	40 %	40 %	20 %	0 %	470193039
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19249	NC_020532	GTCAG	2	10	1055264	1055273	20 %	20 %	40 %	20 %	470193039
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19254	NC_020532	TTA	2	6	1055439	1055444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470193040
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19262	NC_020532	ACC	2	6	1055642	1055647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470193040
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19266	NC_020532	A	6	6	1055812	1055817	100 %	0 %	0 %	0 %	470193040
19267	NC_020532	AATGA	2	10	1055826	1055835	60 %	20 %	20 %	0 %	470193040
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19332	NC_020532	TA	3	6	1058559	1058564	50 %	50 %	0 %	0 %	470193043
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19344	NC_020532	T	6	6	1058977	1058982	0 %	100 %	0 %	0 %	470193043
19345	NC_020532	GCT	2	6	1059044	1059049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470193043
19346	NC_020532	TTG	2	6	1059056	1059061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193043
19347	NC_020532	GAC	2	6	1059077	1059082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470193043
19348	NC_020532	AAGA	2	8	1059101	1059108	75 %	0 %	25 %	0 %	470193043
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19467	NC_020532	TTG	2	6	1066231	1066236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470193048
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19490	NC_020532	TA	3	6	1068132	1068137	50 %	50 %	0 %	0 %	470193050
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19496	NC_020532	TA	3	6	1068444	1068449	50 %	50 %	0 %	0 %	470193050
19497	NC_020532	A	7	7	1068467	1068473	100 %	0 %	0 %	0 %	470193050
19498	NC_020532	AATT	2	8	1068498	1068505	50 %	50 %	0 %	0 %	470193050
19499	NC_020532	ATTA	2	8	1068583	1068590	50 %	50 %	0 %	0 %	470193050
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