MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020532	TTGT	2	8	595074	595081	0 %	75 %	25 %	0 %	470192698
11003	NC_020532	AAT	2	6	595095	595100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192698
11004	NC_020532	T	6	6	595100	595105	0 %	100 %	0 %	0 %	470192698
11005	NC_020532	TGTT	2	8	595188	595195	0 %	75 %	25 %	0 %	470192698
11006	NC_020532	CAA	2	6	595202	595207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192698
11007	NC_020532	CTA	2	6	595213	595218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192698
11008	NC_020532	CAT	2	6	595238	595243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192698
11009	NC_020532	AT	3	6	595353	595358	50 %	50 %	0 %	0 %	470192698
11010	NC_020532	TCA	2	6	595405	595410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192698
11011	NC_020532	CTT	2	6	595460	595465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192698
11012	NC_020532	GAA	2	6	595467	595472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192698
11013	NC_020532	CATA	2	8	595475	595482	50 %	25 %	0 %	25 %	470192698
11014	NC_020532	TA	3	6	595523	595528	50 %	50 %	0 %	0 %	470192698
11015	NC_020532	TAAA	2	8	595580	595587	75 %	25 %	0 %	0 %	470192698
11016	NC_020532	TAA	2	6	595598	595603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192698
11017	NC_020532	AAT	2	6	595652	595657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192698
11018	NC_020532	CCAAAC	2	12	596034	596045	50 %	0 %	0 %	50 %	470192699
11019	NC_020532	AT	3	6	596116	596121	50 %	50 %	0 %	0 %	470192699
11020	NC_020532	A	7	7	596152	596158	100 %	0 %	0 %	0 %	470192699
11021	NC_020532	TTG	2	6	596206	596211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192699
11022	NC_020532	TTACT	2	10	596265	596274	20 %	60 %	0 %	20 %	470192699
11023	NC_020532	AAC	2	6	596313	596318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192699
11024	NC_020532	TTG	2	6	596367	596372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192699
11025	NC_020532	AGA	2	6	596416	596421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192699
11026	NC_020532	CTA	2	6	596424	596429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192699
11027	NC_020532	AGA	2	6	596455	596460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192699
11028	NC_020532	TC	3	6	596469	596474	0 %	50 %	0 %	50 %	470192699
11029	NC_020532	ATG	2	6	596628	596633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192699
11030	NC_020532	CGATT	2	10	596687	596696	20 %	40 %	20 %	20 %	470192699
11031	NC_020532	A	6	6	596698	596703	100 %	0 %	0 %	0 %	470192699
11032	NC_020532	ACA	2	6	596707	596712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192699
11033	NC_020532	ATT	2	6	596755	596760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192699
11034	NC_020532	TAT	2	6	596785	596790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192699
11035	NC_020532	TAA	2	6	596833	596838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192699
11036	NC_020532	ATGA	2	8	596855	596862	50 %	25 %	25 %	0 %	470192699
11037	NC_020532	TAA	2	6	596869	596874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192699
11038	NC_020532	A	6	6	596873	596878	100 %	0 %	0 %	0 %	470192699
11039	NC_020532	TAC	2	6	597030	597035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192699
11040	NC_020532	TTA	2	6	597099	597104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192699
11041	NC_020532	TTA	2	6	597202	597207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192699
11042	NC_020532	TAA	2	6	597217	597222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192699
11043	NC_020532	TAA	3	9	597241	597249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192699
11044	NC_020532	CAA	2	6	597292	597297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192699
11045	NC_020532	ATG	2	6	597314	597319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192699
11046	NC_020532	A	7	7	597342	597348	100 %	0 %	0 %	0 %	470192699
11047	NC_020532	AAT	2	6	597365	597370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192699
11048	NC_020532	GCC	2	6	597377	597382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470192699
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11050	NC_020532	ATT	2	6	597462	597467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192700
11051	NC_020532	CAT	2	6	597492	597497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192700
11052	NC_020532	TCA	2	6	597638	597643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192700
11053	NC_020532	TCA	2	6	597716	597721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192700
11054	NC_020532	AT	3	6	597743	597748	50 %	50 %	0 %	0 %	470192700
11055	NC_020532	ACA	2	6	597761	597766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192700
11056	NC_020532	GTTG	2	8	597771	597778	0 %	50 %	50 %	0 %	470192700
11057	NC_020532	TTG	2	6	598119	598124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192700
11058	NC_020532	CAA	2	6	598158	598163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192700
11059	NC_020532	CTT	2	6	598194	598199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192700
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11061	NC_020532	TAG	3	9	598254	598262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192700
11062	NC_020532	T	7	7	598341	598347	0 %	100 %	0 %	0 %	470192700
11063	NC_020532	TGT	2	6	598403	598408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192701
11064	NC_020532	CAT	2	6	598548	598553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192701
11065	NC_020532	TTC	2	6	598585	598590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192701
11066	NC_020532	CTG	2	6	598626	598631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192701
11067	NC_020532	ATG	2	6	598683	598688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192701
11068	NC_020532	ATC	2	6	598696	598701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192701
11069	NC_020532	CTT	2	6	598809	598814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192701
11070	NC_020532	TCA	3	9	598970	598978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192701
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11072	NC_020532	CCT	2	6	599027	599032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192701
11073	NC_020532	TAAAT	2	10	599036	599045	60 %	40 %	0 %	0 %	470192701
11074	NC_020532	TGC	2	6	599066	599071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192701
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11076	NC_020532	CAT	2	6	599705	599710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192702
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11081	NC_020532	TAT	2	6	599914	599919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192702
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11085	NC_020532	GAT	2	6	600190	600195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192702
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11088	NC_020532	TGC	2	6	600282	600287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192702
11089	NC_020532	TTA	2	6	600298	600303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192702
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11091	NC_020532	GAC	2	6	600373	600378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192702
11092	NC_020532	GATT	2	8	600424	600431	25 %	50 %	25 %	0 %	470192702
11093	NC_020532	TTA	2	6	600530	600535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192703
11094	NC_020532	AGA	2	6	600541	600546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192703
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11098	NC_020532	AGC	2	6	600784	600789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192703
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11101	NC_020532	AC	3	6	600904	600909	50 %	0 %	0 %	50 %	470192703
11102	NC_020532	TTA	2	6	600972	600977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192703
11103	NC_020532	A	6	6	600977	600982	100 %	0 %	0 %	0 %	470192703
11104	NC_020532	TTG	2	6	601059	601064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192703
11105	NC_020532	GAT	2	6	601085	601090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192703
11106	NC_020532	GTAA	2	8	601131	601138	50 %	25 %	25 %	0 %	470192703
11107	NC_020532	AATT	2	8	601162	601169	50 %	50 %	0 %	0 %	470192704
11108	NC_020532	TAC	2	6	601237	601242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192704
11109	NC_020532	AT	3	6	601252	601257	50 %	50 %	0 %	0 %	470192704
11110	NC_020532	TGT	2	6	601337	601342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192704
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11117	NC_020532	TGA	2	6	601627	601632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192704
11118	NC_020532	AATG	2	8	601637	601644	50 %	25 %	25 %	0 %	470192704
11119	NC_020532	CAA	2	6	601662	601667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192704
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11121	NC_020532	TTTTGA	2	12	601821	601832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470192705
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11241	NC_020532	CAA	2	6	608963	608968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192709
11242	NC_020532	TCAT	2	8	608971	608978	25 %	50 %	0 %	25 %	470192709
11243	NC_020532	CGA	2	6	609005	609010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192709
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11264	NC_020532	GTT	2	6	610068	610073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192711
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11348	NC_020532	TCAAT	2	10	615396	615405	40 %	40 %	0 %	20 %	470192714
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11350	NC_020532	TTATA	2	10	615537	615546	40 %	60 %	0 %	0 %	470192714
11351	NC_020532	TGA	2	6	615568	615573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192714
11352	NC_020532	ATG	2	6	615654	615659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192714
11353	NC_020532	ATAAA	2	10	615673	615682	80 %	20 %	0 %	0 %	470192714
11354	NC_020532	ACCA	2	8	615693	615700	50 %	0 %	0 %	50 %	470192714
11355	NC_020532	GCT	2	6	615713	615718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192714
11356	NC_020532	TTA	2	6	615903	615908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192715
11357	NC_020532	TGA	2	6	616037	616042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192715
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11359	NC_020532	AATT	2	8	616096	616103	50 %	50 %	0 %	0 %	470192715
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11477	NC_020532	ATGCA	2	10	622539	622548	40 %	20 %	20 %	20 %	470192720
11478	NC_020532	CAC	2	6	622619	622624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192720
11479	NC_020532	TAC	2	6	622643	622648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192720
11480	NC_020532	TAA	2	6	622734	622739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192720
11481	NC_020532	TAA	2	6	622814	622819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192720
11482	NC_020532	CGA	2	6	622844	622849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192720
11483	NC_020532	TAA	2	6	622866	622871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192720
11484	NC_020532	TGT	2	6	622922	622927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192720
11485	NC_020532	TAA	2	6	622938	622943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192720
11486	NC_020532	ACA	2	6	622972	622977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192720
11487	NC_020532	CAT	2	6	623024	623029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192720
11488	NC_020532	GCC	2	6	623073	623078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470192720
11489	NC_020532	GCA	2	6	623128	623133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192720
11490	NC_020532	TCC	2	6	623204	623209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192720
11491	NC_020532	T	6	6	623241	623246	0 %	100 %	0 %	0 %	470192720
11492	NC_020532	TAA	2	6	623259	623264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192720
11493	NC_020532	ATG	2	6	624329	624334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192721
11494	NC_020532	ATG	3	9	624365	624373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192721
11495	NC_020532	T	6	6	624409	624414	0 %	100 %	0 %	0 %	470192721
11496	NC_020532	CAA	2	6	624437	624442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192721
11497	NC_020532	AAGC	2	8	624469	624476	50 %	0 %	25 %	25 %	470192721
11498	NC_020532	GAA	2	6	624544	624549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192721
11499	NC_020532	CAA	2	6	624568	624573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192721
11500	NC_020532	TAAC	2	8	624593	624600	50 %	25 %	0 %	25 %	470192721

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