MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_020529	AAT	2	6	2605078	2605083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192166
47003	NC_020529	TCATA	2	10	2605120	2605129	40 %	40 %	0 %	20 %	470192166
47004	NC_020529	AAT	2	6	2605167	2605172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192167
47005	NC_020529	T	7	7	2605190	2605196	0 %	100 %	0 %	0 %	470192167
47006	NC_020529	TCA	2	6	2605361	2605366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192167
47007	NC_020529	TGT	2	6	2605369	2605374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192167
47008	NC_020529	TGT	2	6	2605393	2605398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192167
47009	NC_020529	TTG	2	6	2605408	2605413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192167
47010	NC_020529	T	6	6	2605424	2605429	0 %	100 %	0 %	0 %	470192167
47011	NC_020529	TGATA	2	10	2605497	2605506	40 %	40 %	20 %	0 %	470192167
47012	NC_020529	CATT	2	8	2605548	2605555	25 %	50 %	0 %	25 %	470192167
47013	NC_020529	T	6	6	2605685	2605690	0 %	100 %	0 %	0 %	470192167
47014	NC_020529	GCA	2	6	2605703	2605708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192167
47015	NC_020529	TTA	2	6	2605751	2605756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192167
47016	NC_020529	TGT	2	6	2605867	2605872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192167
47017	NC_020529	CAT	2	6	2605893	2605898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192167
47018	NC_020529	AT	3	6	2605905	2605910	50 %	50 %	0 %	0 %	470192167
47019	NC_020529	TTC	2	6	2605999	2606004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192167
47020	NC_020529	TAAATG	2	12	2606007	2606018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470192167
47021	NC_020529	ATG	2	6	2606079	2606084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192167
47022	NC_020529	AATG	2	8	2606120	2606127	50 %	25 %	25 %	0 %	470192167
47023	NC_020529	AAT	2	6	2606149	2606154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192167
47024	NC_020529	ATACCT	2	12	2606192	2606203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192167
47025	NC_020529	GCA	2	6	2606204	2606209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192167
47026	NC_020529	ATA	2	6	2606219	2606224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192167
47027	NC_020529	ATG	2	6	2606233	2606238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192167
47028	NC_020529	TAAC	2	8	2607860	2607867	50 %	25 %	0 %	25 %	470192168
47029	NC_020529	TTG	2	6	2607868	2607873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192168
47030	NC_020529	AATA	2	8	2607951	2607958	75 %	25 %	0 %	0 %	470192168
47031	NC_020529	TAT	2	6	2608012	2608017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192168
47032	NC_020529	ACC	2	6	2608043	2608048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192168
47033	NC_020529	AAT	2	6	2608107	2608112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192168
47034	NC_020529	TAA	2	6	2608166	2608171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192168
47035	NC_020529	TCC	2	6	2608200	2608205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192168
47036	NC_020529	CTT	2	6	2608276	2608281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192168
47037	NC_020529	ATC	2	6	2608322	2608327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192168
47038	NC_020529	CTT	3	9	2608390	2608398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192168
47039	NC_020529	CTT	2	6	2608459	2608464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192168
47040	NC_020529	TCA	2	6	2608474	2608479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192168
47041	NC_020529	GCA	2	6	2608572	2608577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192168
47042	NC_020529	CAC	3	9	2608660	2608668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192168
47043	NC_020529	TTCA	2	8	2608721	2608728	25 %	50 %	0 %	25 %	470192168
47044	NC_020529	ATTA	2	8	2608955	2608962	50 %	50 %	0 %	0 %	470192169
47045	NC_020529	ACTA	2	8	2609003	2609010	50 %	25 %	0 %	25 %	470192169
47046	NC_020529	GTC	2	6	2609055	2609060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192169
47047	NC_020529	TACG	2	8	2609114	2609121	25 %	25 %	25 %	25 %	470192169
47048	NC_020529	AGC	2	6	2609138	2609143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192169
47049	NC_020529	GGT	2	6	2609211	2609216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192169
47050	NC_020529	ATT	2	6	2609264	2609269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192169
47051	NC_020529	AGA	2	6	2609270	2609275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192169
47052	NC_020529	AAT	2	6	2609304	2609309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192169
47053	NC_020529	TA	3	6	2609421	2609426	50 %	50 %	0 %	0 %	470192169
47054	NC_020529	ACG	2	6	2609449	2609454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192169
47055	NC_020529	ACA	2	6	2609550	2609555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192169
47056	NC_020529	A	6	6	2609559	2609564	100 %	0 %	0 %	0 %	470192169
47057	NC_020529	ATC	2	6	2609667	2609672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192169
47058	NC_020529	TAA	2	6	2609714	2609719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192169
47059	NC_020529	GAA	2	6	2609724	2609729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192169
47060	NC_020529	GTC	2	6	2609743	2609748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192169
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47062	NC_020529	CAAA	2	8	2609793	2609800	75 %	0 %	0 %	25 %	470192169
47063	NC_020529	GGC	2	6	2609826	2609831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192169
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47066	NC_020529	ATC	2	6	2609965	2609970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192169
47067	NC_020529	CTT	2	6	2610659	2610664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192170
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47069	NC_020529	T	6	6	2610821	2610826	0 %	100 %	0 %	0 %	470192170
47070	NC_020529	AAT	2	6	2610896	2610901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192170
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47074	NC_020529	CGT	2	6	2611114	2611119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192170
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47076	NC_020529	TAC	2	6	2611205	2611210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192170
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47078	NC_020529	TTC	2	6	2611279	2611284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192170
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47080	NC_020529	T	6	6	2611304	2611309	0 %	100 %	0 %	0 %	470192170
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47083	NC_020529	TTGA	2	8	2612266	2612273	25 %	50 %	25 %	0 %	470192171
47084	NC_020529	ATT	2	6	2612291	2612296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192171
47085	NC_020529	TCT	2	6	2612324	2612329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192171
47086	NC_020529	TCATTT	2	12	2612408	2612419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192171
47087	NC_020529	ATGT	2	8	2612554	2612561	25 %	50 %	25 %	0 %	470192171
47088	NC_020529	TAACT	2	10	2612572	2612581	40 %	40 %	0 %	20 %	470192171
47089	NC_020529	TCA	2	6	2612597	2612602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192171
47090	NC_020529	TGAA	2	8	2612603	2612610	50 %	25 %	25 %	0 %	470192171
47091	NC_020529	TCC	2	6	2612621	2612626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192171
47092	NC_020529	CTG	2	6	2612629	2612634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192171
47093	NC_020529	ATA	2	6	2612668	2612673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192171
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47096	NC_020529	TCT	2	6	2612735	2612740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192171
47097	NC_020529	CA	3	6	2612904	2612909	50 %	0 %	0 %	50 %	470192172
47098	NC_020529	ACAA	2	8	2612936	2612943	75 %	0 %	0 %	25 %	470192172
47099	NC_020529	TA	3	6	2613123	2613128	50 %	50 %	0 %	0 %	470192172
47100	NC_020529	ATA	2	6	2613198	2613203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192172
47101	NC_020529	GAA	2	6	2613275	2613280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192172
47102	NC_020529	TGT	2	6	2613316	2613321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192172
47103	NC_020529	ATT	2	6	2613396	2613401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192172
47104	NC_020529	GCA	2	6	2613419	2613424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192172
47105	NC_020529	TGG	2	6	2613488	2613493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192172
47106	NC_020529	CAT	2	6	2613498	2613503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192172
47107	NC_020529	CCA	2	6	2613509	2613514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192172
47108	NC_020529	CAA	2	6	2613674	2613679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192172
47109	NC_020529	GAT	2	6	2613695	2613700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192172
47110	NC_020529	CTA	2	6	2613746	2613751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192172
47111	NC_020529	AGA	2	6	2613823	2613828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192172
47112	NC_020529	TAC	2	6	2613869	2613874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192172
47113	NC_020529	AGA	2	6	2613925	2613930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192172
47114	NC_020529	AT	3	6	2613962	2613967	50 %	50 %	0 %	0 %	470192172
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47116	NC_020529	CA	3	6	2614067	2614072	50 %	0 %	0 %	50 %	470192172
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47351	NC_020529	ATT	2	6	2627633	2627638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192185
47352	NC_020529	AGC	2	6	2627717	2627722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192185
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47466	NC_020529	GTTT	2	8	2636071	2636078	0 %	75 %	25 %	0 %	470192190
47467	NC_020529	GTC	2	6	2636086	2636091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192190
47468	NC_020529	TC	4	8	2636103	2636110	0 %	50 %	0 %	50 %	470192190
47469	NC_020529	TTG	2	6	2636146	2636151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192190
47470	NC_020529	TAAC	2	8	2636160	2636167	50 %	25 %	0 %	25 %	470192190
47471	NC_020529	ATC	2	6	2636170	2636175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47472	NC_020529	CTA	2	6	2636244	2636249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47473	NC_020529	GAT	2	6	2636271	2636276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192190
47474	NC_020529	CTTCAA	2	12	2636289	2636300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47475	NC_020529	TAA	3	9	2636325	2636333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192190
47476	NC_020529	CAT	3	9	2636367	2636375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47477	NC_020529	GTA	2	6	2636401	2636406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192190
47478	NC_020529	TCA	2	6	2636525	2636530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47479	NC_020529	CTA	2	6	2636532	2636537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47480	NC_020529	GTG	2	6	2636586	2636591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192190
47481	NC_020529	TTAAA	2	10	2636652	2636661	60 %	40 %	0 %	0 %	470192190
47482	NC_020529	ACT	2	6	2636681	2636686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47483	NC_020529	CAT	2	6	2636767	2636772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47484	NC_020529	ACA	2	6	2636791	2636796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192190
47485	NC_020529	TGC	2	6	2636932	2636937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192190
47486	NC_020529	CCAT	2	8	2637010	2637017	25 %	25 %	0 %	50 %	470192190
47487	NC_020529	ATC	2	6	2637079	2637084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47488	NC_020529	CGT	2	6	2637088	2637093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192190
47489	NC_020529	ATCC	2	8	2637146	2637153	25 %	25 %	0 %	50 %	470192190
47490	NC_020529	CAT	2	6	2637189	2637194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47491	NC_020529	T	6	6	2637204	2637209	0 %	100 %	0 %	0 %	470192190
47492	NC_020529	ATTT	2	8	2637247	2637254	25 %	75 %	0 %	0 %	470192190
47493	NC_020529	CGTG	2	8	2637258	2637265	0 %	25 %	50 %	25 %	470192190
47494	NC_020529	AGC	2	6	2637334	2637339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192190
47495	NC_020529	AT	3	6	2637341	2637346	50 %	50 %	0 %	0 %	470192190
47496	NC_020529	CAT	2	6	2637373	2637378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192190
47497	NC_020529	TTA	2	6	2637434	2637439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192190
47498	NC_020529	AT	3	6	2637471	2637476	50 %	50 %	0 %	0 %	470192190
47499	NC_020529	TAT	2	6	2637489	2637494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192190
47500	NC_020529	AAT	2	6	2637547	2637552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192190

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