MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_020529	CGTT	2	8	2409439	2409446	0 %	50 %	25 %	25 %	470192020
43502	NC_020529	GTG	2	6	2409493	2409498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192020
43503	NC_020529	CATCA	2	10	2409572	2409581	40 %	20 %	0 %	40 %	470192020
43504	NC_020529	ACA	2	6	2409585	2409590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192020
43505	NC_020529	AAC	2	6	2409659	2409664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192020
43506	NC_020529	CAT	2	6	2409712	2409717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192020
43507	NC_020529	TAA	2	6	2409872	2409877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192020
43508	NC_020529	CCA	2	6	2409909	2409914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192020
43509	NC_020529	CTTT	2	8	2409925	2409932	0 %	75 %	0 %	25 %	470192020
43510	NC_020529	TCA	2	6	2409949	2409954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192020
43511	NC_020529	ATC	2	6	2409965	2409970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192020
43512	NC_020529	CCAA	2	8	2409980	2409987	50 %	0 %	0 %	50 %	470192020
43513	NC_020529	CTGGAA	2	12	2410009	2410020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470192020
43514	NC_020529	AGT	2	6	2410085	2410090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192020
43515	NC_020529	TGAT	2	8	2410094	2410101	25 %	50 %	25 %	0 %	470192020
43516	NC_020529	TTC	2	6	2410187	2410192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192020
43517	NC_020529	ATTTT	2	10	2410200	2410209	20 %	80 %	0 %	0 %	470192020
43518	NC_020529	ATG	2	6	2410227	2410232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192020
43519	NC_020529	GC	3	6	2410290	2410295	0 %	0 %	50 %	50 %	470192020
43520	NC_020529	TTC	2	6	2410304	2410309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192020
43521	NC_020529	TTTGC	2	10	2410354	2410363	0 %	60 %	20 %	20 %	470192020
43522	NC_020529	TAA	2	6	2410533	2410538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192021
43523	NC_020529	TCAT	2	8	2410544	2410551	25 %	50 %	0 %	25 %	470192021
43524	NC_020529	TGC	2	6	2410553	2410558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192021
43525	NC_020529	AAT	2	6	2410592	2410597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192021
43526	NC_020529	CAAT	2	8	2410605	2410612	50 %	25 %	0 %	25 %	470192021
43527	NC_020529	TC	3	6	2410659	2410664	0 %	50 %	0 %	50 %	470192021
43528	NC_020529	TTA	2	6	2410691	2410696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192021
43529	NC_020529	CAA	2	6	2410770	2410775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192021
43530	NC_020529	TTG	2	6	2410789	2410794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192021
43531	NC_020529	GTT	2	6	2410824	2410829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192021
43532	NC_020529	TG	3	6	2410853	2410858	0 %	50 %	50 %	0 %	470192021
43533	NC_020529	CGT	2	6	2410898	2410903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192021
43534	NC_020529	TTCAT	2	10	2410904	2410913	20 %	60 %	0 %	20 %	470192021
43535	NC_020529	CGT	2	6	2411005	2411010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192021
43536	NC_020529	ATC	2	6	2411071	2411076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192021
43537	NC_020529	AAAT	2	8	2411091	2411098	75 %	25 %	0 %	0 %	470192021
43538	NC_020529	GTC	2	6	2411118	2411123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192021
43539	NC_020529	CAA	2	6	2411142	2411147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192021
43540	NC_020529	TTTTGT	2	12	2411202	2411213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470192021
43541	NC_020529	TGG	2	6	2411399	2411404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192022
43542	NC_020529	CAT	3	9	2411473	2411481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192022
43543	NC_020529	T	6	6	2411512	2411517	0 %	100 %	0 %	0 %	470192022
43544	NC_020529	CTT	2	6	2411602	2411607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192022
43545	NC_020529	TAAG	2	8	2411613	2411620	50 %	25 %	25 %	0 %	470192022
43546	NC_020529	ACC	2	6	2411668	2411673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192022
43547	NC_020529	TCA	3	9	2411745	2411753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192022
43548	NC_020529	GTA	2	6	2411769	2411774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192022
43549	NC_020529	CAAT	2	8	2411826	2411833	50 %	25 %	0 %	25 %	470192022
43550	NC_020529	CATG	2	8	2411863	2411870	25 %	25 %	25 %	25 %	470192022
43551	NC_020529	GTT	2	6	2411872	2411877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192022
43552	NC_020529	ATC	2	6	2411913	2411918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192022
43553	NC_020529	ATT	2	6	2412162	2412167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192023
43554	NC_020529	T	6	6	2412266	2412271	0 %	100 %	0 %	0 %	470192023
43555	NC_020529	ATACC	2	10	2412309	2412318	40 %	20 %	0 %	40 %	470192023
43556	NC_020529	GAA	2	6	2412391	2412396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192023
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43558	NC_020529	TAA	2	6	2412447	2412452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192023
43559	NC_020529	ATA	2	6	2412621	2412626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192023
43560	NC_020529	TCT	2	6	2412639	2412644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192023
43561	NC_020529	TAA	2	6	2412700	2412705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192023
43562	NC_020529	AGTT	2	8	2412711	2412718	25 %	50 %	25 %	0 %	470192023
43563	NC_020529	CTAAA	2	10	2412738	2412747	60 %	20 %	0 %	20 %	470192023
43564	NC_020529	CAT	2	6	2412853	2412858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192023
43565	NC_020529	AT	3	6	2412869	2412874	50 %	50 %	0 %	0 %	470192023
43566	NC_020529	GAT	2	6	2412920	2412925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192023
43567	NC_020529	CAA	2	6	2412933	2412938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192023
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43569	NC_020529	CTT	2	6	2413550	2413555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192024
43570	NC_020529	TTG	2	6	2413556	2413561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192024
43571	NC_020529	AT	3	6	2413681	2413686	50 %	50 %	0 %	0 %	470192024
43572	NC_020529	AAT	2	6	2413840	2413845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192024
43573	NC_020529	A	6	6	2413901	2413906	100 %	0 %	0 %	0 %	470192024
43574	NC_020529	TAT	2	6	2413913	2413918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192024
43575	NC_020529	TCT	2	6	2414139	2414144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192025
43576	NC_020529	TTTA	2	8	2414156	2414163	25 %	75 %	0 %	0 %	470192025
43577	NC_020529	ATA	2	6	2414174	2414179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192025
43578	NC_020529	TAA	2	6	2414204	2414209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192025
43579	NC_020529	TCATTA	2	12	2414214	2414225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192025
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43582	NC_020529	ATTTC	2	10	2414430	2414439	20 %	60 %	0 %	20 %	470192025
43583	NC_020529	ATA	2	6	2414483	2414488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192025
43584	NC_020529	TTC	2	6	2414511	2414516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192025
43585	NC_020529	TCA	2	6	2414547	2414552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192025
43586	NC_020529	TAAG	2	8	2414567	2414574	50 %	25 %	25 %	0 %	470192025
43587	NC_020529	GTC	2	6	2414684	2414689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192025
43588	NC_020529	TGAT	2	8	2414750	2414757	25 %	50 %	25 %	0 %	470192025
43589	NC_020529	T	6	6	2414771	2414776	0 %	100 %	0 %	0 %	470192025
43590	NC_020529	TGT	2	6	2414778	2414783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192025
43591	NC_020529	TTTA	2	8	2414786	2414793	25 %	75 %	0 %	0 %	470192025
43592	NC_020529	TGT	2	6	2414803	2414808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192025
43593	NC_020529	AT	3	6	2414886	2414891	50 %	50 %	0 %	0 %	470192025
43594	NC_020529	AAAT	2	8	2415025	2415032	75 %	25 %	0 %	0 %	470192025
43595	NC_020529	TCG	2	6	2415093	2415098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192025
43596	NC_020529	T	6	6	2415104	2415109	0 %	100 %	0 %	0 %	470192025
43597	NC_020529	T	6	6	2415146	2415151	0 %	100 %	0 %	0 %	470192025
43598	NC_020529	CCA	2	6	2415225	2415230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192025
43599	NC_020529	TGA	3	9	2415231	2415239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192025
43600	NC_020529	TTC	2	6	2415242	2415247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192025
43601	NC_020529	GCTTT	2	10	2415310	2415319	0 %	60 %	20 %	20 %	470192025
43602	NC_020529	T	6	6	2415344	2415349	0 %	100 %	0 %	0 %	470192025
43603	NC_020529	ATCTTT	2	12	2415350	2415361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192025
43604	NC_020529	TAG	2	6	2415364	2415369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192025
43605	NC_020529	CTTG	2	8	2415428	2415435	0 %	50 %	25 %	25 %	470192025
43606	NC_020529	AT	3	6	2415442	2415447	50 %	50 %	0 %	0 %	470192025
43607	NC_020529	CTG	2	6	2415484	2415489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192025
43608	NC_020529	TGA	2	6	2415497	2415502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192025
43609	NC_020529	CCA	2	6	2415519	2415524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192025
43610	NC_020529	ATCTTT	2	12	2415581	2415592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470192025
43611	NC_020529	CAT	3	9	2415595	2415603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192025
43612	NC_020529	AAG	2	6	2415641	2415646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192025
43613	NC_020529	TATTT	2	10	2416756	2416765	20 %	80 %	0 %	0 %	470192026
43614	NC_020529	TAA	2	6	2416773	2416778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192026
43615	NC_020529	TAA	2	6	2416826	2416831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192026
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43970	NC_020529	ACC	2	6	2435514	2435519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192043
43971	NC_020529	TGA	2	6	2435742	2435747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192043
43972	NC_020529	AGC	2	6	2435752	2435757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192043
43973	NC_020529	TTA	2	6	2435812	2435817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192043
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43975	NC_020529	ATG	2	6	2435908	2435913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192043
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43977	NC_020529	TA	3	6	2435930	2435935	50 %	50 %	0 %	0 %	470192043
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43980	NC_020529	TTC	2	6	2436064	2436069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192044
43981	NC_020529	CTGT	2	8	2436134	2436141	0 %	50 %	25 %	25 %	470192044
43982	NC_020529	ATT	2	6	2436152	2436157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192044
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43984	NC_020529	TTA	2	6	2436182	2436187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192044
43985	NC_020529	AAC	2	6	2436202	2436207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192044
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43988	NC_020529	ATC	2	6	2436295	2436300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192044
43989	NC_020529	AT	3	6	2436310	2436315	50 %	50 %	0 %	0 %	470192044
43990	NC_020529	GCT	2	6	2436396	2436401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192044
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43997	NC_020529	CAT	2	6	2437196	2437201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192045
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43999	NC_020529	ATCTG	2	10	2437243	2437252	20 %	40 %	20 %	20 %	470192045
44000	NC_020529	ATT	2	6	2437381	2437386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192045

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