MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_020529	TCT	2	6	2268642	2268647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191911
41002	NC_020529	TTTG	2	8	2268667	2268674	0 %	75 %	25 %	0 %	470191911
41003	NC_020529	T	6	6	2268721	2268726	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41004	NC_020529	TTCA	2	8	2268737	2268744	25 %	50 %	0 %	25 %	470191911
41005	NC_020529	TTA	2	6	2268948	2268953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41006	NC_020529	TAA	2	6	2269018	2269023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191911
41007	NC_020529	TAC	2	6	2269093	2269098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191911
41008	NC_020529	ACT	2	6	2269115	2269120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191911
41009	NC_020529	ACC	2	6	2269121	2269126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191911
41010	NC_020529	TGCT	2	8	2269202	2269209	0 %	50 %	25 %	25 %	470191911
41011	NC_020529	CTG	2	6	2269261	2269266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191911
41012	NC_020529	TCC	2	6	2269292	2269297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470191911
41013	NC_020529	T	6	6	2269376	2269381	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41014	NC_020529	AAC	2	6	2269394	2269399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191911
41015	NC_020529	CTT	2	6	2269408	2269413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191911
41016	NC_020529	TGT	2	6	2269416	2269421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191911
41017	NC_020529	TTA	2	6	2269422	2269427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41018	NC_020529	T	6	6	2269442	2269447	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41019	NC_020529	TGC	2	6	2269457	2269462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191911
41020	NC_020529	TAA	2	6	2269490	2269495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191911
41021	NC_020529	TAA	2	6	2269502	2269507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191911
41022	NC_020529	AAG	2	6	2269578	2269583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191911
41023	NC_020529	ATA	2	6	2269587	2269592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191911
41024	NC_020529	ATT	2	6	2269611	2269616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41025	NC_020529	GTT	2	6	2269666	2269671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191911
41026	NC_020529	CAA	2	6	2269705	2269710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191911
41027	NC_020529	AATCG	2	10	2269715	2269724	40 %	20 %	20 %	20 %	470191911
41028	NC_020529	AAG	2	6	2269814	2269819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191911
41029	NC_020529	ATA	2	6	2269836	2269841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191911
41030	NC_020529	CGT	2	6	2269850	2269855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191911
41031	NC_020529	ATG	2	6	2269909	2269914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191911
41032	NC_020529	TCA	2	6	2269995	2270000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191911
41033	NC_020529	TAT	2	6	2270179	2270184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41034	NC_020529	TGC	2	6	2270208	2270213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191911
41035	NC_020529	TAT	2	6	2270254	2270259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41036	NC_020529	TTGCCC	2	12	2270276	2270287	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470191911
41037	NC_020529	CAA	3	9	2270350	2270358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191911
41038	NC_020529	TTTATC	2	12	2270363	2270374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470191911
41039	NC_020529	GTG	2	6	2270395	2270400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191911
41040	NC_020529	TTG	2	6	2270407	2270412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191911
41041	NC_020529	CAT	2	6	2270434	2270439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191911
41042	NC_020529	CAG	2	6	2270440	2270445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191911
41043	NC_020529	TTCA	2	8	2270564	2270571	25 %	50 %	0 %	25 %	470191911
41044	NC_020529	T	6	6	2270585	2270590	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41045	NC_020529	AATTT	2	10	2270685	2270694	40 %	60 %	0 %	0 %	470191911
41046	NC_020529	T	6	6	2270705	2270710	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41047	NC_020529	TTC	2	6	2270717	2270722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191911
41048	NC_020529	TAT	2	6	2270740	2270745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191911
41049	NC_020529	TAC	2	6	2270839	2270844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191911
41050	NC_020529	TTG	3	9	2270884	2270892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191911
41051	NC_020529	GTA	2	6	2270923	2270928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191911
41052	NC_020529	AAC	2	6	2270978	2270983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191911
41053	NC_020529	T	6	6	2271030	2271035	0 %	100 %	0 %	0 %	470191911
41054	NC_020529	ATTTTA	2	12	2271182	2271193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191912
41055	NC_020529	AATT	2	8	2271223	2271230	50 %	50 %	0 %	0 %	470191912
41056	NC_020529	AT	3	6	2271249	2271254	50 %	50 %	0 %	0 %	470191912
41057	NC_020529	T	6	6	2271298	2271303	0 %	100 %	0 %	0 %	470191912
41058	NC_020529	ACC	2	6	2271355	2271360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191912
41059	NC_020529	GTT	2	6	2271371	2271376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191912
41060	NC_020529	TCA	2	6	2271399	2271404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191912
41061	NC_020529	A	6	6	2271431	2271436	100 %	0 %	0 %	0 %	470191912
41062	NC_020529	AGA	2	6	2271451	2271456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191912
41063	NC_020529	ATTTT	2	10	2271581	2271590	20 %	80 %	0 %	0 %	470191912
41064	NC_020529	CAT	2	6	2271594	2271599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191912
41065	NC_020529	T	6	6	2271616	2271621	0 %	100 %	0 %	0 %	470191912
41066	NC_020529	GCTT	2	8	2271623	2271630	0 %	50 %	25 %	25 %	470191912
41067	NC_020529	TCT	2	6	2271645	2271650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191912
41068	NC_020529	TTCA	2	8	2271679	2271686	25 %	50 %	0 %	25 %	470191912
41069	NC_020529	CAT	2	6	2271768	2271773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191912
41070	NC_020529	AAG	2	6	2271806	2271811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191912
41071	NC_020529	TAA	2	6	2271943	2271948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191912
41072	NC_020529	TCA	3	9	2271950	2271958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191912
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41074	NC_020529	CTT	2	6	2272170	2272175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191912
41075	NC_020529	CAA	3	9	2272188	2272196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191912
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41077	NC_020529	TTC	2	6	2272296	2272301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191912
41078	NC_020529	TAA	2	6	2272351	2272356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191912
41079	NC_020529	ATC	2	6	2273183	2273188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191913
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41081	NC_020529	AAATC	2	10	2273197	2273206	60 %	20 %	0 %	20 %	470191913
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41083	NC_020529	T	6	6	2273339	2273344	0 %	100 %	0 %	0 %	470191913
41084	NC_020529	TTC	2	6	2273363	2273368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191913
41085	NC_020529	A	6	6	2273378	2273383	100 %	0 %	0 %	0 %	470191913
41086	NC_020529	TGG	2	6	2273384	2273389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191913
41087	NC_020529	TCA	3	9	2273397	2273405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191913
41088	NC_020529	TA	3	6	2273417	2273422	50 %	50 %	0 %	0 %	470191913
41089	NC_020529	TTACC	2	10	2273437	2273446	20 %	40 %	0 %	40 %	470191913
41090	NC_020529	CTA	2	6	2273482	2273487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191913
41091	NC_020529	CAAA	2	8	2273543	2273550	75 %	0 %	0 %	25 %	470191913
41092	NC_020529	ATT	2	6	2273645	2273650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191913
41093	NC_020529	ATG	2	6	2273717	2273722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191913
41094	NC_020529	TA	3	6	2273783	2273788	50 %	50 %	0 %	0 %	470191913
41095	NC_020529	ATGA	2	8	2273789	2273796	50 %	25 %	25 %	0 %	470191913
41096	NC_020529	TAAA	2	8	2274432	2274439	75 %	25 %	0 %	0 %	470191914
41097	NC_020529	T	6	6	2274473	2274478	0 %	100 %	0 %	0 %	470191914
41098	NC_020529	AAGC	2	8	2274539	2274546	50 %	0 %	25 %	25 %	470191914
41099	NC_020529	TATT	2	8	2274588	2274595	25 %	75 %	0 %	0 %	470191914
41100	NC_020529	AAATC	2	10	2274637	2274646	60 %	20 %	0 %	20 %	470191914
41101	NC_020529	ATT	3	9	2274658	2274666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191914
41102	NC_020529	TTTAT	2	10	2274702	2274711	20 %	80 %	0 %	0 %	470191914
41103	NC_020529	T	6	6	2274727	2274732	0 %	100 %	0 %	0 %	470191914
41104	NC_020529	TTA	2	6	2274900	2274905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191914
41105	NC_020529	TAT	2	6	2274931	2274936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191914
41106	NC_020529	ATT	2	6	2274973	2274978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191914
41107	NC_020529	ATA	2	6	2275005	2275010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191914
41108	NC_020529	AAACTG	2	12	2275011	2275022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470191914
41109	NC_020529	TAA	2	6	2275030	2275035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191914
41110	NC_020529	TCA	2	6	2275051	2275056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191914
41111	NC_020529	GCA	2	6	2275172	2275177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191914
41112	NC_020529	TGCTA	2	10	2275193	2275202	20 %	40 %	20 %	20 %	470191914
41113	NC_020529	GATG	2	8	2275240	2275247	25 %	25 %	50 %	0 %	470191914
41114	NC_020529	ATT	2	6	2275262	2275267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191914
41115	NC_020529	TG	3	6	2275303	2275308	0 %	50 %	50 %	0 %	470191914
41116	NC_020529	ATC	2	6	2275381	2275386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191914
41117	NC_020529	TGCAA	2	10	2275387	2275396	40 %	20 %	20 %	20 %	470191914
41118	NC_020529	CAT	2	6	2275488	2275493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191914
41119	NC_020529	CTT	2	6	2275579	2275584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191914
41120	NC_020529	ACC	2	6	2276656	2276661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191915
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41122	NC_020529	ATC	2	6	2276734	2276739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191915
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41124	NC_020529	TGA	2	6	2276863	2276868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191915
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41130	NC_020529	ATT	2	6	2277256	2277261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470191915
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41132	NC_020529	ATC	2	6	2277280	2277285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191915
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41135	NC_020529	GATTT	2	10	2277397	2277406	20 %	60 %	20 %	0 %	470191915
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41141	NC_020529	AT	4	8	2277806	2277813	50 %	50 %	0 %	0 %	470191916
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41154	NC_020529	AACA	2	8	2279095	2279102	75 %	0 %	0 %	25 %	470191917
41155	NC_020529	TTG	2	6	2279111	2279116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191917
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41219	NC_020529	T	7	7	2281832	2281838	0 %	100 %	0 %	0 %	470191921
41220	NC_020529	TG	3	6	2281862	2281867	0 %	50 %	50 %	0 %	470191921
41221	NC_020529	CAA	2	6	2281920	2281925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
41222	NC_020529	TGT	2	6	2281985	2281990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
41223	NC_020529	GT	3	6	2282014	2282019	0 %	50 %	50 %	0 %	470191921
41224	NC_020529	CA	3	6	2282055	2282060	50 %	0 %	0 %	50 %	470191921
41225	NC_020529	GTT	2	6	2282073	2282078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
41226	NC_020529	AAT	2	6	2282160	2282165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
41227	NC_020529	GTT	2	6	2282211	2282216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
41228	NC_020529	TTG	2	6	2282253	2282258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191921
41229	NC_020529	ACA	2	6	2282390	2282395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
41230	NC_020529	CCA	2	6	2282396	2282401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470191921
41231	NC_020529	AAT	2	6	2282476	2282481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
41232	NC_020529	AACGTC	2	12	2282482	2282493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470191921
41233	NC_020529	A	6	6	2282510	2282515	100 %	0 %	0 %	0 %	470191921
41234	NC_020529	TAA	2	6	2282516	2282521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
41235	NC_020529	CAT	2	6	2282602	2282607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191921
41236	NC_020529	TCT	2	6	2282618	2282623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191921
41237	NC_020529	CAA	2	6	2282676	2282681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470191921
41238	NC_020529	AAT	2	6	2282749	2282754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191921
41239	NC_020529	ATTT	2	8	2282770	2282777	25 %	75 %	0 %	0 %	470191921
41240	NC_020529	TAAA	2	8	2282805	2282812	75 %	25 %	0 %	0 %	470191921
41241	NC_020529	TAA	2	6	2283022	2283027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191922
41242	NC_020529	GTA	2	6	2283135	2283140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191922
41243	NC_020529	TAA	2	6	2283167	2283172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191922
41244	NC_020529	TCA	2	6	2283256	2283261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191922
41245	NC_020529	AATT	2	8	2283284	2283291	50 %	50 %	0 %	0 %	470191922
41246	NC_020529	CGT	2	6	2283387	2283392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191922
41247	NC_020529	T	6	6	2283414	2283419	0 %	100 %	0 %	0 %	470191922
41248	NC_020529	ATA	2	6	2283453	2283458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191922
41249	NC_020529	AGT	2	6	2283500	2283505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191922
41250	NC_020529	ATC	2	6	2283554	2283559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191922
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41252	NC_020529	AATT	2	8	2283652	2283659	50 %	50 %	0 %	0 %	470191923
41253	NC_020529	AAG	2	6	2283738	2283743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191923
41254	NC_020529	AT	3	6	2283780	2283785	50 %	50 %	0 %	0 %	470191923
41255	NC_020529	TCA	2	6	2283835	2283840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191923
41256	NC_020529	AATT	2	8	2283878	2283885	50 %	50 %	0 %	0 %	470191923
41257	NC_020529	GTA	2	6	2284048	2284053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191923
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41262	NC_020529	TGC	2	6	2284305	2284310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191924
41263	NC_020529	TCCA	2	8	2284360	2284367	25 %	25 %	0 %	50 %	470191924
41264	NC_020529	CTT	2	6	2284433	2284438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191924
41265	NC_020529	T	7	7	2284460	2284466	0 %	100 %	0 %	0 %	470191924
41266	NC_020529	TA	3	6	2284475	2284480	50 %	50 %	0 %	0 %	470191924
41267	NC_020529	CTT	2	6	2284577	2284582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191924
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41269	NC_020529	TTCAC	2	10	2284639	2284648	20 %	40 %	0 %	40 %	470191924
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41271	NC_020529	T	6	6	2284896	2284901	0 %	100 %	0 %	0 %	470191924
41272	NC_020529	TGC	2	6	2284941	2284946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191924
41273	NC_020529	T	6	6	2284992	2284997	0 %	100 %	0 %	0 %	470191924
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41331	NC_020529	TGAA	2	8	2288014	2288021	50 %	25 %	25 %	0 %	470191928
41332	NC_020529	AGTA	2	8	2288070	2288077	50 %	25 %	25 %	0 %	470191928
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41336	NC_020529	CATTC	2	10	2288280	2288289	20 %	40 %	0 %	40 %	470191928
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41339	NC_020529	TA	3	6	2288365	2288370	50 %	50 %	0 %	0 %	470191928
41340	NC_020529	ATA	2	6	2288430	2288435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191928
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41342	NC_020529	CTT	2	6	2288487	2288492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470191928
41343	NC_020529	A	6	6	2288554	2288559	100 %	0 %	0 %	0 %	470191928
41344	NC_020529	GCAT	2	8	2288561	2288568	25 %	25 %	25 %	25 %	470191928
41345	NC_020529	T	6	6	2288591	2288596	0 %	100 %	0 %	0 %	470191928
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41348	NC_020529	TAA	3	9	2288737	2288745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470191928
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41468	NC_020529	AT	3	6	2295846	2295851	50 %	50 %	0 %	0 %	470191934
41469	NC_020529	GTTTA	2	10	2295947	2295956	20 %	60 %	20 %	0 %	470191934
41470	NC_020529	ATG	2	6	2295971	2295976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470191934
41471	NC_020529	TGTT	2	8	2296010	2296017	0 %	75 %	25 %	0 %	470191934
41472	NC_020529	ATC	2	6	2296118	2296123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191934
41473	NC_020529	CAT	2	6	2296183	2296188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191934
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41475	NC_020529	CTG	2	6	2296286	2296291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470191934
41476	NC_020529	TA	3	6	2296321	2296326	50 %	50 %	0 %	0 %	470191934
41477	NC_020529	GAA	2	6	2296327	2296332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470191934
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41481	NC_020529	AATT	2	8	2296514	2296521	50 %	50 %	0 %	0 %	470191935
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41488	NC_020529	TGG	2	6	2296764	2296769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191935
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41490	NC_020529	TTG	2	6	2296802	2296807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470191935
41491	NC_020529	AT	4	8	2296816	2296823	50 %	50 %	0 %	0 %	470191935
41492	NC_020529	GGT	2	6	2296861	2296866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191935
41493	NC_020529	CAT	2	6	2296931	2296936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470191935
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41495	NC_020529	CGA	2	6	2297007	2297012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470191935
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41498	NC_020529	AATC	2	8	2297193	2297200	50 %	25 %	0 %	25 %	470191936
41499	NC_020529	TA	3	6	2297217	2297222	50 %	50 %	0 %	0 %	470191936
41500	NC_020529	GGT	2	6	2297232	2297237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470191936

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