MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020529	GTGC	2	8	281675	281682	0 %	25 %	50 %	25 %	470190514
5502	NC_020529	ACC	2	6	281767	281772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470190514
5503	NC_020529	TAT	2	6	281884	281889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190514
5504	NC_020529	TTG	2	6	281933	281938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190514
5505	NC_020529	AGAATC	2	12	281953	281964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470190514
5506	NC_020529	ATT	2	6	282010	282015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190514
5507	NC_020529	GCA	2	6	282026	282031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190514
5508	NC_020529	GT	3	6	282070	282075	0 %	50 %	50 %	0 %	470190514
5509	NC_020529	AGG	2	6	282096	282101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470190514
5510	NC_020529	AATA	2	8	282102	282109	75 %	25 %	0 %	0 %	470190514
5511	NC_020529	GAT	2	6	282127	282132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190515
5512	NC_020529	TTA	2	6	282163	282168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190515
5513	NC_020529	TGG	2	6	282177	282182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190515
5514	NC_020529	GAA	2	6	282187	282192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190515
5515	NC_020529	ACT	2	6	282231	282236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190515
5516	NC_020529	ATCA	2	8	282238	282245	50 %	25 %	0 %	25 %	470190515
5517	NC_020529	ATT	2	6	282337	282342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190515
5518	NC_020529	GTGC	2	8	282451	282458	0 %	25 %	50 %	25 %	470190515
5519	NC_020529	GAT	2	6	282472	282477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190515
5520	NC_020529	CAA	2	6	282568	282573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190515
5521	NC_020529	ATT	2	6	282577	282582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190515
5522	NC_020529	CA	3	6	282591	282596	50 %	0 %	0 %	50 %	470190515
5523	NC_020529	CATA	2	8	282612	282619	50 %	25 %	0 %	25 %	470190515
5524	NC_020529	ACA	2	6	282640	282645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190515
5525	NC_020529	AT	3	6	282708	282713	50 %	50 %	0 %	0 %	470190515
5526	NC_020529	CAA	2	6	282742	282747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190515
5527	NC_020529	AC	3	6	283420	283425	50 %	0 %	0 %	50 %	470190516
5528	NC_020529	ATT	2	6	283475	283480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190516
5529	NC_020529	A	6	6	283483	283488	100 %	0 %	0 %	0 %	470190516
5530	NC_020529	TCT	2	6	283498	283503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190516
5531	NC_020529	ATT	2	6	283596	283601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190516
5532	NC_020529	CTT	3	9	283604	283612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190516
5533	NC_020529	CAA	2	6	283621	283626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190516
5534	NC_020529	TA	3	6	283645	283650	50 %	50 %	0 %	0 %	470190516
5535	NC_020529	AGG	2	6	283691	283696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470190516
5536	NC_020529	TTA	2	6	283722	283727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190516
5537	NC_020529	ATT	2	6	283728	283733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190516
5538	NC_020529	ATG	2	6	283765	283770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190516
5539	NC_020529	AGC	2	6	283793	283798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190516
5540	NC_020529	GGT	2	6	283836	283841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190516
5541	NC_020529	CAT	2	6	283855	283860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190516
5542	NC_020529	ATT	2	6	283884	283889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190516
5543	NC_020529	TAA	2	6	283901	283906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190516
5544	NC_020529	CA	3	6	283971	283976	50 %	0 %	0 %	50 %	470190516
5545	NC_020529	AGA	2	6	284012	284017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190516
5546	NC_020529	GTT	2	6	284055	284060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190516
5547	NC_020529	TTC	2	6	284091	284096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190516
5548	NC_020529	TATT	2	8	284201	284208	25 %	75 %	0 %	0 %	470190517
5549	NC_020529	TGG	2	6	284301	284306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190517
5550	NC_020529	GTA	2	6	284338	284343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190517
5551	NC_020529	AAT	2	6	284425	284430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190517
5552	NC_020529	ATC	2	6	284453	284458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190517
5553	NC_020529	ATA	2	6	284486	284491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190517
5554	NC_020529	CAT	2	6	284512	284517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190517
5555	NC_020529	TAG	2	6	284544	284549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190517
5556	NC_020529	ATC	2	6	284555	284560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190517
5557	NC_020529	CTTA	2	8	284792	284799	25 %	50 %	0 %	25 %	470190517
5558	NC_020529	AATA	2	8	285066	285073	75 %	25 %	0 %	0 %	470190518
5559	NC_020529	GGT	2	6	285108	285113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190518
5560	NC_020529	TTG	2	6	285124	285129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190518
5561	NC_020529	ATG	2	6	285235	285240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190518
5562	NC_020529	ATTA	2	8	285299	285306	50 %	50 %	0 %	0 %	470190518
5563	NC_020529	AG	3	6	285323	285328	50 %	0 %	50 %	0 %	470190518
5564	NC_020529	AAGTAA	2	12	285376	285387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190518
5565	NC_020529	GTC	2	6	285421	285426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190518
5566	NC_020529	AAG	2	6	285439	285444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190518
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5568	NC_020529	GAA	2	6	285504	285509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190518
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5570	NC_020529	TCAT	2	8	285604	285611	25 %	50 %	0 %	25 %	470190518
5571	NC_020529	GTT	2	6	285695	285700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190518
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5573	NC_020529	ACA	3	9	285722	285730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190518
5574	NC_020529	TTA	2	6	285757	285762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190518
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5580	NC_020529	ATC	2	6	286063	286068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190519
5581	NC_020529	TACG	2	8	286117	286124	25 %	25 %	25 %	25 %	470190519
5582	NC_020529	GAA	2	6	286176	286181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190519
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5587	NC_020529	ATAAAG	2	12	286357	286368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470190519
5588	NC_020529	TAA	2	6	286397	286402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190519
5589	NC_020529	GAA	2	6	286476	286481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190519
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5592	NC_020529	TTA	2	6	286685	286690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190519
5593	NC_020529	A	7	7	286704	286710	100 %	0 %	0 %	0 %	470190519
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5600	NC_020529	TAC	2	6	286835	286840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190519
5601	NC_020529	ACA	2	6	286849	286854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190519
5602	NC_020529	GGT	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190519
5603	NC_020529	TGA	2	6	287015	287020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190519
5604	NC_020529	ATG	2	6	287041	287046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190519
5605	NC_020529	CAG	2	6	287080	287085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190519
5606	NC_020529	GAA	2	6	287177	287182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190519
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5608	NC_020529	ATG	2	6	287215	287220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190519
5609	NC_020529	A	6	6	287244	287249	100 %	0 %	0 %	0 %	470190519
5610	NC_020529	CAA	2	6	287268	287273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190519
5611	NC_020529	T	6	6	287799	287804	0 %	100 %	0 %	0 %	470190520
5612	NC_020529	T	7	7	287886	287892	0 %	100 %	0 %	0 %	470190520
5613	NC_020529	CAA	2	6	287921	287926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190520
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5615	NC_020529	GACATT	2	12	288048	288059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470190520
5616	NC_020529	TGC	2	6	288063	288068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190520
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5619	NC_020529	GTA	2	6	288159	288164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190520
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5989	NC_020529	GAT	2	6	307817	307822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190534
5990	NC_020529	ATG	2	6	307845	307850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190534
5991	NC_020529	A	7	7	307861	307867	100 %	0 %	0 %	0 %	470190534
5992	NC_020529	CAAA	2	8	307910	307917	75 %	0 %	0 %	25 %	470190534
5993	NC_020529	AAGA	2	8	307940	307947	75 %	0 %	25 %	0 %	470190534
5994	NC_020529	TAA	2	6	307957	307962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190534
5995	NC_020529	CAAA	2	8	307977	307984	75 %	0 %	0 %	25 %	470190534
5996	NC_020529	ACT	2	6	307986	307991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190534
5997	NC_020529	TAT	2	6	307992	307997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190534
5998	NC_020529	TGGA	2	8	308000	308007	25 %	25 %	50 %	0 %	470190534
5999	NC_020529	AGGACA	2	12	308011	308022	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470190534
6000	NC_020529	TGA	2	6	308026	308031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190534

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