MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011

Total Repeats: 75190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020528	CCT	2	6	564919	564924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187462
12002	NC_020528	TCG	2	6	564951	564956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187462
12003	NC_020528	TCG	2	6	565032	565037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187462
12004	NC_020528	CTG	2	6	565310	565315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12005	NC_020528	CGT	2	6	565354	565359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12006	NC_020528	CGC	2	6	565372	565377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187463
12007	NC_020528	CATC	2	8	565387	565394	25 %	25 %	0 %	50 %	470187463
12008	NC_020528	TCG	2	6	565425	565430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12009	NC_020528	GCC	2	6	565453	565458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187463
12010	NC_020528	GCT	2	6	565487	565492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12011	NC_020528	TCG	2	6	565551	565556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12012	NC_020528	GGC	2	6	565558	565563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187463
12013	NC_020528	CGA	2	6	565564	565569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12014	NC_020528	CGT	2	6	565573	565578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12015	NC_020528	CGC	3	9	565588	565596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187463
12016	NC_020528	CCGC	2	8	565638	565645	0 %	0 %	25 %	75 %	470187463
12017	NC_020528	TCGCG	2	10	565753	565762	0 %	20 %	40 %	40 %	470187463
12018	NC_020528	CCGG	2	8	565788	565795	0 %	0 %	50 %	50 %	470187463
12019	NC_020528	CTG	2	6	565805	565810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12020	NC_020528	CGC	2	6	565835	565840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187463
12021	NC_020528	TCG	2	6	565863	565868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12022	NC_020528	GCCA	2	8	565874	565881	25 %	0 %	25 %	50 %	470187463
12023	NC_020528	CGC	2	6	565893	565898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187463
12024	NC_020528	CGA	2	6	565945	565950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187463
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12026	NC_020528	CAT	2	6	565978	565983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187463
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12028	NC_020528	CTGTCG	2	12	566027	566038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12029	NC_020528	GCT	2	6	566092	566097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187463
12030	NC_020528	TGG	2	6	566205	566210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187463
12031	NC_020528	CGG	2	6	566284	566289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187463
12032	NC_020528	GAA	2	6	566404	566409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187463
12033	NC_020528	CGCC	2	8	566461	566468	0 %	0 %	25 %	75 %	470187463
12034	NC_020528	AC	3	6	566521	566526	50 %	0 %	0 %	50 %	470187463
12035	NC_020528	GCG	2	6	566740	566745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187464
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12039	NC_020528	CGG	2	6	566895	566900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187464
12040	NC_020528	CTC	2	6	566901	566906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187464
12041	NC_020528	CGAT	2	8	566948	566955	25 %	25 %	25 %	25 %	470187464
12042	NC_020528	ACG	2	6	567047	567052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187464
12043	NC_020528	CGC	2	6	567123	567128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187464
12044	NC_020528	TCG	3	9	567134	567142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187464
12045	NC_020528	TCG	2	6	567152	567157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187464
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12047	NC_020528	CGCTT	2	10	567189	567198	0 %	40 %	20 %	40 %	470187464
12048	NC_020528	CGC	2	6	567213	567218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187464
12049	NC_020528	GCACG	2	10	567237	567246	20 %	0 %	40 %	40 %	470187464
12050	NC_020528	CG	3	6	567245	567250	0 %	0 %	50 %	50 %	470187464
12051	NC_020528	GAAGA	2	10	567259	567268	60 %	0 %	40 %	0 %	470187464
12052	NC_020528	TGC	2	6	567273	567278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187464
12053	NC_020528	TCA	2	6	567308	567313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187464
12054	NC_020528	GCC	2	6	567316	567321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187464
12055	NC_020528	CAG	2	6	567337	567342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187464
12056	NC_020528	GC	3	6	567415	567420	0 %	0 %	50 %	50 %	470187464
12057	NC_020528	CT	3	6	567457	567462	0 %	50 %	0 %	50 %	470187464
12058	NC_020528	AAC	2	6	567472	567477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470187464
12059	NC_020528	CCCG	2	8	567557	567564	0 %	0 %	25 %	75 %	470187464
12060	NC_020528	TTC	2	6	567568	567573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187464
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12062	NC_020528	TTC	2	6	567628	567633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187464
12063	NC_020528	GAT	2	6	567645	567650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187464
12064	NC_020528	TCG	2	6	567683	567688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187464
12065	NC_020528	AGGC	2	8	567731	567738	25 %	0 %	50 %	25 %	470187464
12066	NC_020528	ATC	2	6	567866	567871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187465
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12068	NC_020528	TGC	2	6	567996	568001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
12069	NC_020528	CTT	2	6	568007	568012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187465
12070	NC_020528	CGC	2	6	568033	568038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187465
12071	NC_020528	CGTT	2	8	568060	568067	0 %	50 %	25 %	25 %	470187465
12072	NC_020528	GGTCA	2	10	568124	568133	20 %	20 %	40 %	20 %	470187465
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12076	NC_020528	ATGCG	2	10	568287	568296	20 %	20 %	40 %	20 %	470187465
12077	NC_020528	GCTG	2	8	568308	568315	0 %	25 %	50 %	25 %	470187465
12078	NC_020528	CGT	2	6	568324	568329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
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12082	NC_020528	TCG	2	6	568431	568436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
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12086	NC_020528	TTC	3	9	568529	568537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187465
12087	NC_020528	CTG	2	6	568601	568606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
12088	NC_020528	GCT	2	6	568609	568614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
12089	NC_020528	CGC	2	6	568675	568680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187465
12090	NC_020528	CGA	2	6	568758	568763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187465
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12100	NC_020528	CCTG	2	8	569026	569033	0 %	25 %	25 %	50 %	470187465
12101	NC_020528	TCG	2	6	569049	569054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187465
12102	NC_020528	GC	3	6	569055	569060	0 %	0 %	50 %	50 %	470187465
12103	NC_020528	CG	4	8	569076	569083	0 %	0 %	50 %	50 %	470187465
12104	NC_020528	GAT	2	6	569095	569100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187465
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12107	NC_020528	CGC	2	6	569214	569219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187465
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12116	NC_020528	GAA	2	6	569568	569573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187466
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12118	NC_020528	AGC	2	6	569645	569650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187466
12119	NC_020528	GGC	2	6	569688	569693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187466
12120	NC_020528	TCG	3	9	569735	569743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187466
12121	NC_020528	GCT	2	6	569781	569786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187466
12122	NC_020528	GTCG	2	8	569832	569839	0 %	25 %	50 %	25 %	470187466
12123	NC_020528	AAG	2	6	569911	569916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187466
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12125	NC_020528	GCTC	2	8	569993	570000	0 %	25 %	25 %	50 %	470187466
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12234	NC_020528	GCC	2	6	575192	575197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187471
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12354	NC_020528	TCG	2	6	581243	581248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187477
12355	NC_020528	CGTCT	2	10	581251	581260	0 %	40 %	20 %	40 %	470187477
12356	NC_020528	GTC	2	6	581458	581463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187478
12357	NC_020528	TCC	2	6	581491	581496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187478
12358	NC_020528	GAC	2	6	581664	581669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187478
12359	NC_020528	GCC	2	6	581845	581850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187478
12360	NC_020528	GCCC	2	8	581913	581920	0 %	0 %	25 %	75 %	470187478
12361	NC_020528	TCG	2	6	581924	581929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187478
12362	NC_020528	GCC	2	6	581941	581946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187478
12363	NC_020528	CGT	2	6	581991	581996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187478
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12368	NC_020528	GCA	2	6	582404	582409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187479
12369	NC_020528	TCG	2	6	582475	582480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187479
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12371	NC_020528	ATGG	2	8	582488	582495	25 %	25 %	50 %	0 %	470187479
12372	NC_020528	AAC	2	6	582511	582516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470187479
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12376	NC_020528	ATG	2	6	582730	582735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187479
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12379	NC_020528	TGG	2	6	582820	582825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187479
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12400	NC_020528	CGGCG	2	10	583810	583819	0 %	0 %	60 %	40 %	470187481
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12403	NC_020528	GTC	2	6	583885	583890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187481
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12472	NC_020528	CTTC	2	8	586138	586145	0 %	50 %	0 %	50 %	470187483
12473	NC_020528	CGT	3	9	586146	586154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187483
12474	NC_020528	GTG	3	9	586168	586176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187483
12475	NC_020528	GCT	2	6	586206	586211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187483
12476	NC_020528	CGG	2	6	586232	586237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187483
12477	NC_020528	CGC	2	6	586238	586243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187483
12478	NC_020528	TCG	3	9	586259	586267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187483
12479	NC_020528	GC	3	6	586305	586310	0 %	0 %	50 %	50 %	470187483
12480	NC_020528	GCAG	2	8	586329	586336	25 %	0 %	50 %	25 %	470187483
12481	NC_020528	TCA	2	6	586427	586432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187483
12482	NC_020528	CGC	3	9	586479	586487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187483
12483	NC_020528	TCA	2	6	586556	586561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187483
12484	NC_020528	GCT	2	6	586712	586717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187484
12485	NC_020528	GC	3	6	586731	586736	0 %	0 %	50 %	50 %	470187484
12486	NC_020528	CAC	2	6	586737	586742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470187484
12487	NC_020528	GGC	2	6	586752	586757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187484
12488	NC_020528	ACGG	2	8	586774	586781	25 %	0 %	50 %	25 %	470187484
12489	NC_020528	GC	3	6	586813	586818	0 %	0 %	50 %	50 %	470187484
12490	NC_020528	GCC	2	6	586851	586856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187484
12491	NC_020528	CTC	2	6	586857	586862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187484
12492	NC_020528	GC	3	6	586871	586876	0 %	0 %	50 %	50 %	470187484
12493	NC_020528	TGG	2	6	587063	587068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187484
12494	NC_020528	GCC	2	6	587112	587117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187484
12495	NC_020528	AGG	2	6	587140	587145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470187484
12496	NC_020528	CGAG	2	8	587168	587175	25 %	0 %	50 %	25 %	470187484
12497	NC_020528	GGAGC	2	10	587232	587241	20 %	0 %	60 %	20 %	470187484
12498	NC_020528	CGG	2	6	587502	587507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187485
12499	NC_020528	TCG	2	6	587576	587581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187485
12500	NC_020528	AGC	2	6	587624	587629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187485

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