MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA

Total Repeats: 24277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020527	GCTG	2	8	1403	1410	0 %	25 %	50 %	25 %	470183973
2	NC_020527	TGAGGC	2	12	1454	1465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470183973
3	NC_020527	GTC	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183973
4	NC_020527	GAC	3	9	1499	1507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183973
5	NC_020527	TCA	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183973
6	NC_020527	CAT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183973
7	NC_020527	ATC	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183973
8	NC_020527	GCG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183973
9	NC_020527	GGA	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183973
10	NC_020527	TGA	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183973
11	NC_020527	GAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183973
12	NC_020527	CGC	2	6	1871	1876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183973
13	NC_020527	ACC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470183973
14	NC_020527	GC	3	6	1956	1961	0 %	0 %	50 %	50 %	470183973
15	NC_020527	GTC	2	6	2058	2063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
16	NC_020527	GGC	2	6	2067	2072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183974
17	NC_020527	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183974
18	NC_020527	CGACAA	2	12	2255	2266	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470183974
19	NC_020527	CCT	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470183974
20	NC_020527	ACG	2	6	2356	2361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183974
21	NC_020527	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183974
22	NC_020527	TCG	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
23	NC_020527	TGAC	2	8	2425	2432	25 %	25 %	25 %	25 %	470183974
24	NC_020527	CTG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
25	NC_020527	TGG	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470183974
26	NC_020527	GAT	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183974
27	NC_020527	GCCATG	2	12	2649	2660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470183974
28	NC_020527	GCG	3	9	2692	2700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183974
29	NC_020527	GACT	2	8	2737	2744	25 %	25 %	25 %	25 %	470183974
30	NC_020527	G	6	6	2917	2922	0 %	0 %	100 %	0 %	470183974
31	NC_020527	GCC	2	6	2925	2930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183974
32	NC_020527	ATG	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183974
33	NC_020527	CTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183974
34	NC_020527	CATC	2	8	3196	3203	25 %	25 %	0 %	50 %	470183974
35	NC_020527	GGA	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183974
36	NC_020527	C	6	6	3306	3311	0 %	0 %	0 %	100 %	470183974
37	NC_020527	AAGCA	2	10	3316	3325	60 %	0 %	20 %	20 %	470183974
38	NC_020527	TCG	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
39	NC_020527	CGATC	2	10	3398	3407	20 %	20 %	20 %	40 %	470183974
40	NC_020527	CGAA	2	8	3436	3443	50 %	0 %	25 %	25 %	470183974
41	NC_020527	GGA	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183974
42	NC_020527	CGGC	2	8	3532	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	470183974
43	NC_020527	GAC	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183974
44	NC_020527	TG	3	6	3586	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	470183974
45	NC_020527	CAA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470183974
46	NC_020527	CGC	2	6	3642	3647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183974
47	NC_020527	GAC	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183974
48	NC_020527	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183974
49	NC_020527	GCT	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
50	NC_020527	GGGC	2	8	3802	3809	0 %	0 %	75 %	25 %	470183974
51	NC_020527	TCA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183974
52	NC_020527	AGG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183974
53	NC_020527	GACG	2	8	4013	4020	25 %	0 %	50 %	25 %	470183974
54	NC_020527	ACT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183974
55	NC_020527	TTC	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183974
56	NC_020527	GAA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470183974
57	NC_020527	CGG	2	6	4187	4192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183974
58	NC_020527	AAGGCG	2	12	4227	4238	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470183974
59	NC_020527	GTG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470183974
60	NC_020527	TGG	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470183974
61	NC_020527	TCG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183974
62	NC_020527	GAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183974
63	NC_020527	ATG	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183974
64	NC_020527	CCG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
65	NC_020527	CCG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
66	NC_020527	CGC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
67	NC_020527	ACC	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470183975
68	NC_020527	GCC	3	9	4558	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
69	NC_020527	TGCG	2	8	4639	4646	0 %	25 %	50 %	25 %	470183975
70	NC_020527	CTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183975
71	NC_020527	TGCA	2	8	4802	4809	25 %	25 %	25 %	25 %	470183975
72	NC_020527	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183975
73	NC_020527	GAA	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470183975
74	NC_020527	CCG	2	6	5150	5155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
75	NC_020527	GGC	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183975
76	NC_020527	ATGT	2	8	5177	5184	25 %	50 %	25 %	0 %	470183975
77	NC_020527	CCG	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
78	NC_020527	CGC	2	6	5290	5295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
79	NC_020527	GCC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183975
80	NC_020527	AG	3	6	5371	5376	50 %	0 %	50 %	0 %	470183975
81	NC_020527	TCG	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183975
82	NC_020527	GGA	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183975
83	NC_020527	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183975
84	NC_020527	CCAT	2	8	5458	5465	25 %	25 %	0 %	50 %	470183976
85	NC_020527	CCG	2	6	5472	5477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183976
86	NC_020527	CTG	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183976
87	NC_020527	G	6	6	5610	5615	0 %	0 %	100 %	0 %	470183976
88	NC_020527	TGC	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183976
89	NC_020527	GTG	2	6	5649	5654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470183976
90	NC_020527	TTC	2	6	5658	5663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183976
91	NC_020527	TCT	2	6	5677	5682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183976
92	NC_020527	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183976
93	NC_020527	TCT	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183976
94	NC_020527	TCG	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183976
95	NC_020527	TCA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183976
96	NC_020527	TCGA	2	8	5895	5902	25 %	25 %	25 %	25 %	470183976
97	NC_020527	GGC	2	6	5936	5941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183976
98	NC_020527	ATC	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470183976
99	NC_020527	CG	3	6	6006	6011	0 %	0 %	50 %	50 %	470183976
100	NC_020527	CTGG	2	8	6075	6082	0 %	25 %	50 %	25 %	470183976
101	NC_020527	GATC	2	8	6092	6099	25 %	25 %	25 %	25 %	470183976
102	NC_020527	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183977
103	NC_020527	GCC	3	9	6352	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183977
104	NC_020527	GCGTGC	2	12	6388	6399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470183977
105	NC_020527	ATGCC	2	10	6402	6411	20 %	20 %	20 %	40 %	470183977
106	NC_020527	C	6	6	6410	6415	0 %	0 %	0 %	100 %	470183977
107	NC_020527	ATCG	2	8	6416	6423	25 %	25 %	25 %	25 %	470183977
108	NC_020527	G	7	7	6433	6439	0 %	0 %	100 %	0 %	470183977
109	NC_020527	GCA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183977
110	NC_020527	T	6	6	6470	6475	0 %	100 %	0 %	0 %	470183977
111	NC_020527	GCC	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183977
112	NC_020527	CGG	2	6	6537	6542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183977
113	NC_020527	GAT	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183977
114	NC_020527	GAC	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183977
115	NC_020527	CAC	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470183977
116	NC_020527	TGC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183977
117	NC_020527	GGC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183977
118	NC_020527	GC	3	6	6650	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	470183977
119	NC_020527	GCA	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183977
120	NC_020527	GCG	2	6	6717	6722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183977
121	NC_020527	GC	4	8	6768	6775	0 %	0 %	50 %	50 %	470183977
122	NC_020527	CTG	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183977
123	NC_020527	CGT	2	6	6970	6975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183977
124	NC_020527	GAT	2	6	6980	6985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183977
125	NC_020527	TGA	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470183977
126	NC_020527	GCGG	2	8	7033	7040	0 %	0 %	75 %	25 %	470183977
127	NC_020527	CGG	2	6	7129	7134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183978
128	NC_020527	CGC	2	6	7141	7146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183978
129	NC_020527	AGC	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183978
130	NC_020527	GTG	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470183978
131	NC_020527	TTG	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470183978
132	NC_020527	CTG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183978
133	NC_020527	GCT	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183978
134	NC_020527	AGG	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183978
135	NC_020527	GCC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183978
136	NC_020527	GCG	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183978
137	NC_020527	CTG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183978
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142	NC_020527	CGG	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183978
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146	NC_020527	GCT	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183978
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148	NC_020527	GCT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183978
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152	NC_020527	CTGT	2	8	8408	8415	0 %	50 %	25 %	25 %	470183978
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156	NC_020527	GCAAC	2	10	8721	8730	40 %	0 %	20 %	40 %	470183979
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160	NC_020527	CTG	3	9	8851	8859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183979
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169	NC_020527	TCG	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183980
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173	NC_020527	TTG	2	6	9415	9420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470183980
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240	NC_020527	AG	3	6	14165	14170	50 %	0 %	50 %	0 %	470183985
241	NC_020527	CGA	2	6	14256	14261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183985
242	NC_020527	AGA	2	6	14275	14280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470183985
243	NC_020527	GGC	2	6	14301	14306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183985
244	NC_020527	AAC	2	6	14353	14358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470183985
245	NC_020527	GCG	2	6	14383	14388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183985
246	NC_020527	GAG	2	6	14477	14482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183986
247	NC_020527	ACG	3	9	14763	14771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183986
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250	NC_020527	CCG	2	6	15830	15835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183987
251	NC_020527	GAC	2	6	15856	15861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183987
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253	NC_020527	TGC	2	6	15911	15916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183987
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257	NC_020527	TCGCT	2	10	16100	16109	0 %	40 %	20 %	40 %	470183987
258	NC_020527	GAG	2	6	16189	16194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183987
259	NC_020527	GATC	2	8	16208	16215	25 %	25 %	25 %	25 %	470183987
260	NC_020527	CGC	2	6	16316	16321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183988
261	NC_020527	CGG	2	6	16331	16336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183988
262	NC_020527	CTC	2	6	16367	16372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470183988
263	NC_020527	CCCA	2	8	16405	16412	25 %	0 %	0 %	75 %	470183988
264	NC_020527	CGG	2	6	16457	16462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183988
265	NC_020527	TTC	2	6	16482	16487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470183988
266	NC_020527	TGC	2	6	16564	16569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183988
267	NC_020527	CGG	2	6	16610	16615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183988
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269	NC_020527	CGG	2	6	16658	16663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183988
270	NC_020527	GCGA	2	8	16669	16676	25 %	0 %	50 %	25 %	470183988
271	NC_020527	GCC	2	6	16707	16712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183988
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273	NC_020527	TGC	2	6	16912	16917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183988
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275	NC_020527	CTTG	2	8	16941	16948	0 %	50 %	25 %	25 %	470183988
276	NC_020527	CG	3	6	16961	16966	0 %	0 %	50 %	50 %	470183988
277	NC_020527	GGA	2	6	17040	17045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183988
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281	NC_020527	GCC	2	6	17244	17249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183988
282	NC_020527	GCA	2	6	17284	17289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183988
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284	NC_020527	CAG	2	6	17425	17430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183989
285	NC_020527	TCGG	2	8	17431	17438	0 %	25 %	50 %	25 %	470183989
286	NC_020527	CG	3	6	17504	17509	0 %	0 %	50 %	50 %	470183989
287	NC_020527	CGG	2	6	17514	17519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183989
288	NC_020527	GC	3	6	17570	17575	0 %	0 %	50 %	50 %	470183989
289	NC_020527	TCC	2	6	17583	17588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470183989
290	NC_020527	G	6	6	17646	17651	0 %	0 %	100 %	0 %	470183989
291	NC_020527	CT	3	6	17693	17698	0 %	50 %	0 %	50 %	470183989
292	NC_020527	CCA	2	6	17821	17826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470183989
293	NC_020527	CTG	3	9	17894	17902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470183990
294	NC_020527	CAG	2	6	17988	17993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183990
295	NC_020527	AGC	2	6	18019	18024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183990
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299	NC_020527	CGG	2	6	18260	18265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183990
300	NC_020527	AGC	2	6	18289	18294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183990
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333	NC_020527	CGG	2	6	19980	19985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183992
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373	NC_020527	AGC	2	6	22171	22176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183993
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375	NC_020527	CAG	2	6	22218	22223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470183993
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377	NC_020527	GCC	2	6	22334	22339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183993
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382	NC_020527	GGA	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470183993
383	NC_020527	GCTG	3	12	22700	22711	0 %	25 %	50 %	25 %	470183993
384	NC_020527	CGG	2	6	22760	22765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470183993
385	NC_020527	CCG	2	6	22806	22811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470183993
386	NC_020527	TCCTCG	2	12	22816	22827	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470183993
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496	NC_020527	CCT	2	6	28791	28796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184002
497	NC_020527	CGC	2	6	28807	28812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184002
498	NC_020527	CGG	2	6	28885	28890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184002
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500	NC_020527	TCGCCC	2	12	28982	28993	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470184002

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