MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA

Total Repeats: 24277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020527	CGG	2	6	827754	827759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184804
15002	NC_020527	GCCA	2	8	827775	827782	25 %	0 %	25 %	50 %	470184804
15003	NC_020527	CGC	2	6	827835	827840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184804
15004	NC_020527	CGT	2	6	827877	827882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184804
15005	NC_020527	GGC	2	6	828028	828033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184805
15006	NC_020527	CGG	2	6	828074	828079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184805
15007	NC_020527	TCG	2	6	828227	828232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15008	NC_020527	CAT	2	6	828244	828249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184805
15009	NC_020527	GC	3	6	828252	828257	0 %	0 %	50 %	50 %	470184805
15010	NC_020527	GGC	2	6	828306	828311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184805
15011	NC_020527	TCG	2	6	828314	828319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15012	NC_020527	GCC	2	6	828388	828393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184805
15013	NC_020527	AAG	2	6	828422	828427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184805
15014	NC_020527	CGA	2	6	828441	828446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15015	NC_020527	CGT	2	6	828474	828479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15016	NC_020527	CG	4	8	828565	828572	0 %	0 %	50 %	50 %	470184805
15017	NC_020527	GCA	2	6	828599	828604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15018	NC_020527	CGGC	2	8	828654	828661	0 %	0 %	50 %	50 %	470184805
15019	NC_020527	CCG	2	6	828713	828718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184805
15020	NC_020527	TATCGA	2	12	828726	828737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470184805
15021	NC_020527	GGC	2	6	828775	828780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184805
15022	NC_020527	GCCTT	2	10	828782	828791	0 %	40 %	20 %	40 %	470184805
15023	NC_020527	AGC	2	6	828824	828829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184805
15024	NC_020527	TCC	2	6	828860	828865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184805
15025	NC_020527	GCC	2	6	828869	828874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184805
15026	NC_020527	ACC	2	6	828896	828901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184805
15027	NC_020527	CCGGG	2	10	828973	828982	0 %	0 %	60 %	40 %	470184806
15028	NC_020527	CG	3	6	829000	829005	0 %	0 %	50 %	50 %	470184806
15029	NC_020527	CGG	2	6	829019	829024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184806
15030	NC_020527	GC	3	6	829064	829069	0 %	0 %	50 %	50 %	470184806
15031	NC_020527	CCTT	2	8	829169	829176	0 %	50 %	0 %	50 %	470184806
15032	NC_020527	ACGG	2	8	829296	829303	25 %	0 %	50 %	25 %	470184806
15033	NC_020527	CGA	3	9	829323	829331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184806
15034	NC_020527	CCTT	2	8	829334	829341	0 %	50 %	0 %	50 %	470184806
15035	NC_020527	TCG	2	6	829394	829399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184806
15036	NC_020527	AGCC	2	8	829454	829461	25 %	0 %	25 %	50 %	470184806
15037	NC_020527	TGAA	2	8	829466	829473	50 %	25 %	25 %	0 %	470184806
15038	NC_020527	CG	3	6	829507	829512	0 %	0 %	50 %	50 %	470184806
15039	NC_020527	CGC	2	6	829659	829664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184806
15040	NC_020527	ACC	2	6	829676	829681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184806
15041	NC_020527	CAC	2	6	829698	829703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184806
15042	NC_020527	AGC	2	6	829727	829732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184806
15043	NC_020527	CGA	2	6	829753	829758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184806
15044	NC_020527	AAG	2	6	829795	829800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184806
15045	NC_020527	CCCT	2	8	829838	829845	0 %	25 %	0 %	75 %	470184806
15046	NC_020527	GA	3	6	830053	830058	50 %	0 %	50 %	0 %	470184807
15047	NC_020527	AGC	2	6	830068	830073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15048	NC_020527	ATC	2	6	830110	830115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184807
15049	NC_020527	CGA	2	6	830217	830222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15050	NC_020527	CG	3	6	830262	830267	0 %	0 %	50 %	50 %	470184807
15051	NC_020527	ACG	2	6	830297	830302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15052	NC_020527	CGC	2	6	830328	830333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184807
15053	NC_020527	CCG	2	6	830357	830362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184807
15054	NC_020527	ACG	2	6	830420	830425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15055	NC_020527	CT	3	6	830459	830464	0 %	50 %	0 %	50 %	470184807
15056	NC_020527	GCG	2	6	830517	830522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184807
15057	NC_020527	CAC	2	6	830523	830528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184807
15058	NC_020527	CCG	2	6	830549	830554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184807
15059	NC_020527	CTG	2	6	830572	830577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15060	NC_020527	GAC	2	6	830578	830583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15061	NC_020527	GATC	2	8	830595	830602	25 %	25 %	25 %	25 %	470184807
15062	NC_020527	CGT	2	6	830661	830666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15063	NC_020527	CGC	2	6	830708	830713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184807
15064	NC_020527	CGA	2	6	830748	830753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184807
15065	NC_020527	GCG	2	6	830792	830797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184807
15066	NC_020527	GAC	2	6	830905	830910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184808
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15071	NC_020527	ACA	2	6	831112	831117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184808
15072	NC_020527	CGC	2	6	831158	831163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184808
15073	NC_020527	GCACG	2	10	831200	831209	20 %	0 %	40 %	40 %	470184808
15074	NC_020527	TCG	2	6	831322	831327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184808
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15079	NC_020527	GAAG	2	8	831503	831510	50 %	0 %	50 %	0 %	470184808
15080	NC_020527	GCT	2	6	831521	831526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184808
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15087	NC_020527	GCA	2	6	832090	832095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184809
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15089	NC_020527	GA	3	6	832156	832161	50 %	0 %	50 %	0 %	470184809
15090	NC_020527	GA	3	6	832177	832182	50 %	0 %	50 %	0 %	470184809
15091	NC_020527	TGA	2	6	832204	832209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184809
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15101	NC_020527	GCA	2	6	832627	832632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184809
15102	NC_020527	TGC	2	6	832690	832695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184809
15103	NC_020527	CGGCA	2	10	832712	832721	20 %	0 %	40 %	40 %	470184809
15104	NC_020527	GAT	2	6	832757	832762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184809
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15106	NC_020527	CCCG	2	8	832848	832855	0 %	0 %	25 %	75 %	470184809
15107	NC_020527	GGC	2	6	832902	832907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184809
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15109	NC_020527	GT	3	6	832927	832932	0 %	50 %	50 %	0 %	470184809
15110	NC_020527	GCG	2	6	832969	832974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184809
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15114	NC_020527	TCG	2	6	833170	833175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184809
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15119	NC_020527	CGG	2	6	833405	833410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184809
15120	NC_020527	CGC	2	6	833411	833416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184809
15121	NC_020527	TCG	2	6	833422	833427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184809
15122	NC_020527	GGA	2	6	833432	833437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184809
15123	NC_020527	TGA	2	6	833545	833550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184809
15124	NC_020527	GAG	2	6	833573	833578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184809
15125	NC_020527	AAC	2	6	833603	833608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184809
15126	NC_020527	CGC	2	6	833637	833642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184810
15127	NC_020527	CCA	2	6	833753	833758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184810
15128	NC_020527	CTGATC	2	12	833794	833805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470184810
15129	NC_020527	TCA	2	6	833867	833872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184810
15130	NC_020527	ATCCCG	2	12	833909	833920	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470184810
15131	NC_020527	CTC	2	6	833929	833934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184810
15132	NC_020527	GGCAT	2	10	833968	833977	20 %	20 %	40 %	20 %	470184810
15133	NC_020527	GCT	3	9	834060	834068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184810
15134	NC_020527	CGG	2	6	834101	834106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184810
15135	NC_020527	CGG	2	6	834140	834145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184810
15136	NC_020527	ATT	2	6	834164	834169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470184810
15137	NC_020527	TCA	2	6	834194	834199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184810
15138	NC_020527	GTC	2	6	834211	834216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184810
15139	NC_020527	ATG	2	6	834217	834222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184810
15140	NC_020527	GCG	2	6	834269	834274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184810
15141	NC_020527	CCGCT	2	10	834275	834284	0 %	20 %	20 %	60 %	470184810
15142	NC_020527	CAG	2	6	834317	834322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184810
15143	NC_020527	GCT	2	6	834333	834338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184810
15144	NC_020527	GGCA	2	8	834354	834361	25 %	0 %	50 %	25 %	470184810
15145	NC_020527	GGCC	2	8	834381	834388	0 %	0 %	50 %	50 %	470184810
15146	NC_020527	GCC	2	6	834433	834438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184810
15147	NC_020527	ATC	2	6	834439	834444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184810
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15149	NC_020527	CTG	2	6	834493	834498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184810
15150	NC_020527	CTC	2	6	834505	834510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184810
15151	NC_020527	CGG	2	6	834516	834521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184810
15152	NC_020527	CGG	2	6	834551	834556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184810
15153	NC_020527	TCC	2	6	834581	834586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184810
15154	NC_020527	TTC	2	6	834589	834594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184810
15155	NC_020527	CTT	2	6	834609	834614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184810
15156	NC_020527	CTA	2	6	834618	834623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184810
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15168	NC_020527	CGAT	2	8	834991	834998	25 %	25 %	25 %	25 %	470184811
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15182	NC_020527	GCT	2	6	835448	835453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184811
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15192	NC_020527	CTG	2	6	836222	836227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184813
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15207	NC_020527	TTC	2	6	836942	836947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184813
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15213	NC_020527	CTT	2	6	837262	837267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184814
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15219	NC_020527	CG	3	6	837621	837626	0 %	0 %	50 %	50 %	470184814
15220	NC_020527	CGG	3	9	837679	837687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184814
15221	NC_020527	GC	3	6	837698	837703	0 %	0 %	50 %	50 %	470184814
15222	NC_020527	CG	3	6	837744	837749	0 %	0 %	50 %	50 %	470184814
15223	NC_020527	TGG	2	6	837758	837763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184814
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15226	NC_020527	TGG	2	6	837895	837900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184815
15227	NC_020527	TCG	4	12	837937	837948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184815
15228	NC_020527	CTG	2	6	837992	837997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184815
15229	NC_020527	GGA	2	6	838082	838087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184815
15230	NC_020527	TCC	2	6	838090	838095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184815
15231	NC_020527	GCG	2	6	838121	838126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184815
15232	NC_020527	AGCGG	2	10	838220	838229	20 %	0 %	60 %	20 %	470184815
15233	NC_020527	TTC	2	6	838365	838370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184816
15234	NC_020527	GC	3	6	838387	838392	0 %	0 %	50 %	50 %	470184816
15235	NC_020527	CGC	2	6	838435	838440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184816
15236	NC_020527	GAAC	2	8	838478	838485	50 %	0 %	25 %	25 %	470184816
15237	NC_020527	GCA	2	6	838700	838705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184816
15238	NC_020527	CGTC	2	8	838706	838713	0 %	25 %	25 %	50 %	470184816
15239	NC_020527	CAGA	2	8	838724	838731	50 %	0 %	25 %	25 %	470184816
15240	NC_020527	GAA	2	6	838737	838742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184816
15241	NC_020527	GTG	2	6	838771	838776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184816
15242	NC_020527	AACC	2	8	838827	838834	50 %	0 %	0 %	50 %	470184816
15243	NC_020527	TTG	2	6	838981	838986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470184816
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15245	NC_020527	GCA	2	6	839024	839029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184816
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15250	NC_020527	C	7	7	839172	839178	0 %	0 %	0 %	100 %	470184816
15251	NC_020527	CGTG	2	8	839259	839266	0 %	25 %	50 %	25 %	470184816
15252	NC_020527	GCT	2	6	839414	839419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184816
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15255	NC_020527	GTC	2	6	839542	839547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184816
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15259	NC_020527	GGCATC	2	12	839667	839678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470184816
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15268	NC_020527	TCC	2	6	840040	840045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184816
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15358	NC_020527	TCT	2	6	844573	844578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184821
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