MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA

Total Repeats: 24277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020527	CTGC	2	8	52446	52453	0 %	25 %	25 %	50 %	470184027
1002	NC_020527	GAG	2	6	52509	52514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184027
1003	NC_020527	GCC	2	6	52681	52686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184027
1004	NC_020527	AGG	2	6	52687	52692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184027
1005	NC_020527	GGC	2	6	52750	52755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184027
1006	NC_020527	GCC	2	6	52806	52811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184027
1007	NC_020527	CGT	2	6	52868	52873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184027
1008	NC_020527	ATG	2	6	52876	52881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184027
1009	NC_020527	GAC	2	6	52888	52893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184027
1010	NC_020527	TCA	2	6	53109	53114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1011	NC_020527	GGA	2	6	53188	53193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184028
1012	NC_020527	CGA	2	6	53272	53277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1013	NC_020527	CAT	2	6	53278	53283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1014	NC_020527	TCA	2	6	53346	53351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1015	NC_020527	CGA	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1016	NC_020527	GAA	2	6	53401	53406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184028
1017	NC_020527	ACG	2	6	53477	53482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1018	NC_020527	GTC	2	6	53582	53587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1019	NC_020527	TAC	2	6	53606	53611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1020	NC_020527	GAG	2	6	53612	53617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184028
1021	NC_020527	CGC	2	6	53665	53670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184028
1022	NC_020527	GC	3	6	53669	53674	0 %	0 %	50 %	50 %	470184028
1023	NC_020527	CAA	2	6	53689	53694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184028
1024	NC_020527	GAG	2	6	53747	53752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470184028
1025	NC_020527	CCT	2	6	53767	53772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184028
1026	NC_020527	ATC	2	6	53882	53887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1027	NC_020527	GGCT	2	8	53924	53931	0 %	25 %	50 %	25 %	470184028
1028	NC_020527	CGCC	2	8	53943	53950	0 %	0 %	25 %	75 %	470184028
1029	NC_020527	GACAAG	2	12	53954	53965	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470184028
1030	NC_020527	CCTACG	2	12	53970	53981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470184028
1031	NC_020527	AAGGCA	2	12	53990	54001	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470184028
1032	NC_020527	CGAA	2	8	54057	54064	50 %	0 %	25 %	25 %	470184028
1033	NC_020527	TCG	2	6	54081	54086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1034	NC_020527	GAA	2	6	54106	54111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184028
1035	NC_020527	GAAGCC	2	12	54127	54138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1036	NC_020527	GAC	2	6	54169	54174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1037	NC_020527	CAA	2	6	54175	54180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184028
1038	NC_020527	CTA	2	6	54241	54246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184028
1039	NC_020527	GGC	2	6	54316	54321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184028
1040	NC_020527	GCA	2	6	54322	54327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1041	NC_020527	CAA	2	6	54370	54375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184028
1042	NC_020527	GAC	2	6	54386	54391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1043	NC_020527	TTC	2	6	54404	54409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184028
1044	NC_020527	ACA	2	6	54414	54419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470184028
1045	NC_020527	CGA	2	6	54508	54513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184028
1046	NC_020527	GGTCGT	2	12	54670	54681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470184029
1047	NC_020527	CGT	2	6	54709	54714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184029
1048	NC_020527	CGC	2	6	54727	54732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184029
1049	NC_020527	GC	3	6	54754	54759	0 %	0 %	50 %	50 %	470184029
1050	NC_020527	GAT	2	6	54772	54777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184029
1051	NC_020527	CGCC	2	8	54778	54785	0 %	0 %	25 %	75 %	470184029
1052	NC_020527	TCA	2	6	54903	54908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184029
1053	NC_020527	CGC	2	6	54943	54948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184029
1054	NC_020527	TCA	2	6	54966	54971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184029
1055	NC_020527	GCG	2	6	54992	54997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184029
1056	NC_020527	GAT	2	6	55030	55035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184029
1057	NC_020527	CTGG	2	8	55069	55076	0 %	25 %	50 %	25 %	470184029
1058	NC_020527	CCT	2	6	55078	55083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184029
1059	NC_020527	GAT	2	6	55084	55089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184029
1060	NC_020527	CCG	2	6	55167	55172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184029
1061	NC_020527	CGC	2	6	55188	55193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184029
1062	NC_020527	CG	3	6	55204	55209	0 %	0 %	50 %	50 %	470184029
1063	NC_020527	CAC	2	6	55210	55215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470184029
1064	NC_020527	GGT	2	6	55291	55296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184029
1065	NC_020527	GC	3	6	55310	55315	0 %	0 %	50 %	50 %	470184029
1066	NC_020527	TGG	2	6	55425	55430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184029
1067	NC_020527	GTG	2	6	55457	55462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184029
1068	NC_020527	TCA	2	6	55500	55505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184029
1069	NC_020527	GATCT	2	10	55517	55526	20 %	40 %	20 %	20 %	470184029
1070	NC_020527	CGAT	2	8	55533	55540	25 %	25 %	25 %	25 %	470184029
1071	NC_020527	GAC	2	6	55605	55610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184030
1072	NC_020527	TGA	2	6	55679	55684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184030
1073	NC_020527	GCC	2	6	55695	55700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184030
1074	NC_020527	ACGG	2	8	55723	55730	25 %	0 %	50 %	25 %	470184030
1075	NC_020527	GC	3	6	55766	55771	0 %	0 %	50 %	50 %	470184030
1076	NC_020527	ATC	2	6	55816	55821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184030
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1078	NC_020527	TGG	2	6	55861	55866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470184030
1079	NC_020527	GCT	2	6	55965	55970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184030
1080	NC_020527	GGC	2	6	56058	56063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184030
1081	NC_020527	CAT	2	6	56091	56096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184030
1082	NC_020527	ATG	2	6	56119	56124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184030
1083	NC_020527	CGG	2	6	56162	56167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184030
1084	NC_020527	GCC	2	6	56211	56216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184030
1085	NC_020527	GC	3	6	56248	56253	0 %	0 %	50 %	50 %	470184030
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1087	NC_020527	TCG	2	6	56506	56511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184031
1088	NC_020527	TCGC	2	8	56541	56548	0 %	25 %	25 %	50 %	470184031
1089	NC_020527	AAG	2	6	56565	56570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470184031
1090	NC_020527	CGG	2	6	56585	56590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184031
1091	NC_020527	CTG	2	6	56616	56621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184031
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1093	NC_020527	TCGG	2	8	56716	56723	0 %	25 %	50 %	25 %	470184031
1094	NC_020527	TGC	2	6	56743	56748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184031
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1096	NC_020527	CGG	2	6	56826	56831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184031
1097	NC_020527	GC	3	6	56832	56837	0 %	0 %	50 %	50 %	470184031
1098	NC_020527	G	6	6	56858	56863	0 %	0 %	100 %	0 %	470184031
1099	NC_020527	CCT	2	6	56912	56917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184031
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1102	NC_020527	TCA	2	6	57019	57024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184031
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1104	NC_020527	CTC	2	6	57150	57155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470184031
1105	NC_020527	GCC	2	6	57193	57198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184031
1106	NC_020527	TCGACA	2	12	57208	57219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470184031
1107	NC_020527	CAT	2	6	57221	57226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184031
1108	NC_020527	CGCGC	2	10	57263	57272	0 %	0 %	40 %	60 %	470184031
1109	NC_020527	G	6	6	57284	57289	0 %	0 %	100 %	0 %	470184031
1110	NC_020527	GACC	2	8	57298	57305	25 %	0 %	25 %	50 %	470184031
1111	NC_020527	CTG	2	6	57308	57313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184032
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1116	NC_020527	ACG	2	6	57467	57472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184032
1117	NC_020527	CCGA	2	8	57500	57507	25 %	0 %	25 %	50 %	470184032
1118	NC_020527	CCGGG	2	10	57540	57549	0 %	0 %	60 %	40 %	470184032
1119	NC_020527	GC	3	6	57568	57573	0 %	0 %	50 %	50 %	470184032
1120	NC_020527	GCTG	2	8	57643	57650	0 %	25 %	50 %	25 %	470184032
1121	NC_020527	CGC	2	6	57651	57656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184032
1122	NC_020527	CGG	2	6	57675	57680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184032
1123	NC_020527	CGG	2	6	57769	57774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184032
1124	NC_020527	CG	3	6	57800	57805	0 %	0 %	50 %	50 %	470184032
1125	NC_020527	TCG	2	6	57825	57830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184032
1126	NC_020527	ATC	2	6	57878	57883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470184032
1127	NC_020527	CTG	3	9	57887	57895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184032
1128	NC_020527	CTCGGC	2	12	57911	57922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470184032
1129	NC_020527	TGA	2	6	57927	57932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470184032
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1133	NC_020527	GGC	2	6	58010	58015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184032
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1143	NC_020527	CGGC	2	8	58502	58509	0 %	0 %	50 %	50 %	470184033
1144	NC_020527	AT	3	6	58535	58540	50 %	50 %	0 %	0 %	470184033
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1222	NC_020527	CCGATC	2	12	64034	64045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470184037
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1231	NC_020527	AGC	2	6	64387	64392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184038
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1233	NC_020527	CGA	2	6	64755	64760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184039
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1235	NC_020527	CA	3	6	64816	64821	50 %	0 %	0 %	50 %	470184039
1236	NC_020527	T	6	6	64830	64835	0 %	100 %	0 %	0 %	470184039
1237	NC_020527	CGG	2	6	64863	64868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184039
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1240	NC_020527	GCT	2	6	65287	65292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184040
1241	NC_020527	CCTTTT	2	12	65346	65357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470184040
1242	NC_020527	GTC	2	6	65505	65510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184041
1243	NC_020527	GC	3	6	65525	65530	0 %	0 %	50 %	50 %	470184041
1244	NC_020527	CTTC	2	8	65567	65574	0 %	50 %	0 %	50 %	470184041
1245	NC_020527	GTTT	2	8	65600	65607	0 %	75 %	25 %	0 %	470184041
1246	NC_020527	CTTC	2	8	65612	65619	0 %	50 %	0 %	50 %	470184041
1247	NC_020527	TC	3	6	65643	65648	0 %	50 %	0 %	50 %	470184041
1248	NC_020527	TCG	2	6	65796	65801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184042
1249	NC_020527	CCG	2	6	65807	65812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184042
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1363	NC_020527	TGT	2	6	71229	71234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470184049
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1367	NC_020527	TGC	2	6	71666	71671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470184050
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1370	NC_020527	GCA	2	6	71999	72004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184051
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1497	NC_020527	CGG	2	6	78043	78048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470184055
1498	NC_020527	TTCG	2	8	78095	78102	0 %	50 %	25 %	25 %	470184055
1499	NC_020527	CGA	2	6	78161	78166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470184055
1500	NC_020527	GCC	2	6	78267	78272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470184055

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