MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_020307	ATC	2	6	1393650	1393655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120936
25003	NC_020307	GAAC	2	8	1393672	1393679	50 %	0 %	25 %	25 %	452120936
25004	NC_020307	T	6	6	1393727	1393732	0 %	100 %	0 %	0 %	452120937
25005	NC_020307	CAG	2	6	1393789	1393794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120937
25006	NC_020307	GAA	2	6	1393819	1393824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120937
25007	NC_020307	C	6	6	1393857	1393862	0 %	0 %	0 %	100 %	452120937
25008	NC_020307	GGC	2	6	1393895	1393900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120937
25009	NC_020307	CAG	2	6	1393901	1393906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120937
25010	NC_020307	TTA	2	6	1394108	1394113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120938
25011	NC_020307	TGT	2	6	1394153	1394158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120938
25012	NC_020307	CAG	2	6	1394256	1394261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120938
25013	NC_020307	CAA	2	6	1394307	1394312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120938
25014	NC_020307	CTC	2	6	1394340	1394345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120938
25015	NC_020307	TAC	2	6	1394356	1394361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120938
25016	NC_020307	TTA	2	6	1394396	1394401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120938
25017	NC_020307	TAA	2	6	1394412	1394417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120938
25018	NC_020307	AAC	2	6	1394440	1394445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120938
25019	NC_020307	CCGCAG	2	12	1394487	1394498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452120938
25020	NC_020307	TCA	3	9	1394537	1394545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120938
25021	NC_020307	TGC	2	6	1394647	1394652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120938
25022	NC_020307	T	6	6	1394669	1394674	0 %	100 %	0 %	0 %	452120938
25023	NC_020307	A	6	6	1394729	1394734	100 %	0 %	0 %	0 %	452120938
25024	NC_020307	CAA	2	6	1394793	1394798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120938
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25027	NC_020307	T	6	6	1395000	1395005	0 %	100 %	0 %	0 %	452120939
25028	NC_020307	AGC	2	6	1395015	1395020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120939
25029	NC_020307	CTT	2	6	1395054	1395059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120939
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25031	NC_020307	TAA	2	6	1395076	1395081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120939
25032	NC_020307	ATCT	2	8	1395122	1395129	25 %	50 %	0 %	25 %	452120939
25033	NC_020307	TAA	2	6	1395154	1395159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120939
25034	NC_020307	GCAG	2	8	1395216	1395223	25 %	0 %	50 %	25 %	452120939
25035	NC_020307	TCC	2	6	1395245	1395250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120939
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25038	NC_020307	ATC	2	6	1395362	1395367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120939
25039	NC_020307	GCTT	2	8	1395375	1395382	0 %	50 %	25 %	25 %	452120939
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25043	NC_020307	T	6	6	1395462	1395467	0 %	100 %	0 %	0 %	452120939
25044	NC_020307	CTG	2	6	1395496	1395501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120939
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25054	NC_020307	ATT	2	6	1396135	1396140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120940
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25061	NC_020307	A	7	7	1397225	1397231	100 %	0 %	0 %	0 %	452120941
25062	NC_020307	CTGA	2	8	1397256	1397263	25 %	25 %	25 %	25 %	452120941
25063	NC_020307	CG	3	6	1397313	1397318	0 %	0 %	50 %	50 %	452120941
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25102	NC_020307	CGCC	2	8	1399599	1399606	0 %	0 %	25 %	75 %	452120943
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25117	NC_020307	ATC	2	6	1400161	1400166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120944
25118	NC_020307	ACC	2	6	1400191	1400196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120944
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25123	NC_020307	CGGT	2	8	1400354	1400361	0 %	25 %	50 %	25 %	452120944
25124	NC_020307	AGCC	2	8	1400362	1400369	25 %	0 %	25 %	50 %	452120944
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25349	NC_020307	CGC	2	6	1412820	1412825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120953
25350	NC_020307	CCG	2	6	1412826	1412831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120953
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25353	NC_020307	GCTG	2	8	1412884	1412891	0 %	25 %	50 %	25 %	452120953
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25452	NC_020307	A	6	6	1417654	1417659	100 %	0 %	0 %	0 %	452120957
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25463	NC_020307	GGC	2	6	1418315	1418320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120958
25464	NC_020307	CGC	2	6	1418330	1418335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120958
25465	NC_020307	T	7	7	1418378	1418384	0 %	100 %	0 %	0 %	452120958
25466	NC_020307	CGT	2	6	1418612	1418617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25467	NC_020307	GGGC	2	8	1418634	1418641	0 %	0 %	75 %	25 %	452120959
25468	NC_020307	GCT	2	6	1418659	1418664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25469	NC_020307	CCTG	2	8	1418718	1418725	0 %	25 %	25 %	50 %	452120959
25470	NC_020307	TGC	3	9	1418727	1418735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25471	NC_020307	GCT	2	6	1418767	1418772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25472	NC_020307	GCT	2	6	1418845	1418850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25473	NC_020307	CCA	2	6	1418862	1418867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120959
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25475	NC_020307	CGC	2	6	1418960	1418965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120959
25476	NC_020307	AGA	2	6	1418971	1418976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120959
25477	NC_020307	CTG	2	6	1419014	1419019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25478	NC_020307	TCG	2	6	1419039	1419044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120959
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25482	NC_020307	AGC	2	6	1419156	1419161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120959
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25485	NC_020307	CGG	2	6	1419283	1419288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120959
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25487	NC_020307	GCCA	2	8	1419311	1419318	25 %	0 %	25 %	50 %	452120959
25488	NC_020307	CTT	2	6	1419331	1419336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120959
25489	NC_020307	CGC	2	6	1419349	1419354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120959
25490	NC_020307	GTG	2	6	1419398	1419403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120959
25491	NC_020307	TGG	2	6	1419467	1419472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120959
25492	NC_020307	CGA	2	6	1419589	1419594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25493	NC_020307	ACGC	2	8	1419634	1419641	25 %	0 %	25 %	50 %	452120959
25494	NC_020307	TTAT	2	8	1419745	1419752	25 %	75 %	0 %	0 %	452120959
25495	NC_020307	CGA	2	6	1419769	1419774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120959
25496	NC_020307	GCG	2	6	1419810	1419815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120959
25497	NC_020307	GAC	2	6	1419896	1419901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120959
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25499	NC_020307	ATTT	2	8	1420057	1420064	25 %	75 %	0 %	0 %	452120959
25500	NC_020307	T	6	6	1420143	1420148	0 %	100 %	0 %	0 %	452120959

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