MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_020307	AT	4	8	1366369	1366376	50 %	50 %	0 %	0 %	452120909
24503	NC_020307	T	6	6	1366456	1366461	0 %	100 %	0 %	0 %	452120909
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24506	NC_020307	TACCG	2	10	1366707	1366716	20 %	20 %	20 %	40 %	452120910
24507	NC_020307	AAT	2	6	1366725	1366730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120910
24508	NC_020307	ATA	2	6	1366750	1366755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120910
24509	NC_020307	C	6	6	1366768	1366773	0 %	0 %	0 %	100 %	452120910
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24513	NC_020307	AGC	2	6	1366858	1366863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120910
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24515	NC_020307	TAA	2	6	1366938	1366943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120910
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24517	NC_020307	CAT	2	6	1367025	1367030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120910
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24523	NC_020307	A	6	6	1367390	1367395	100 %	0 %	0 %	0 %	452120910
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24532	NC_020307	CG	3	6	1368653	1368658	0 %	0 %	50 %	50 %	452120911
24533	NC_020307	GAAA	2	8	1368698	1368705	75 %	0 %	25 %	0 %	452120911
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24537	NC_020307	CAT	2	6	1368921	1368926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120911
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24554	NC_020307	CAA	2	6	1369628	1369633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120912
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24598	NC_020307	CA	3	6	1371944	1371949	50 %	0 %	0 %	50 %	452120915
24599	NC_020307	T	6	6	1371956	1371961	0 %	100 %	0 %	0 %	452120915
24600	NC_020307	CCGAT	2	10	1372103	1372112	20 %	20 %	20 %	40 %	452120915
24601	NC_020307	GTC	2	6	1372132	1372137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120915
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24604	NC_020307	CTT	2	6	1372223	1372228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120915
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24607	NC_020307	GC	3	6	1372322	1372327	0 %	0 %	50 %	50 %	452120915
24608	NC_020307	CAA	2	6	1372341	1372346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120915
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24611	NC_020307	CGCTGA	2	12	1372390	1372401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452120915
24612	NC_020307	CCG	2	6	1372402	1372407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120915
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24730	NC_020307	CTC	2	6	1378504	1378509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120923
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24967	NC_020307	GT	3	6	1391233	1391238	0 %	50 %	50 %	0 %	452120935
24968	NC_020307	AAT	2	6	1391283	1391288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120935
24969	NC_020307	TAT	2	6	1391319	1391324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120935
24970	NC_020307	GAT	2	6	1391331	1391336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120935
24971	NC_020307	ACCC	2	8	1391343	1391350	25 %	0 %	0 %	75 %	452120935
24972	NC_020307	T	6	6	1391488	1391493	0 %	100 %	0 %	0 %	452120935
24973	NC_020307	TGC	2	6	1391586	1391591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120935
24974	NC_020307	TAC	2	6	1391620	1391625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120935
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24977	NC_020307	TTTAAG	2	12	1392004	1392015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452120935
24978	NC_020307	CGG	2	6	1392030	1392035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120935
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24980	NC_020307	TTCG	2	8	1392662	1392669	0 %	50 %	25 %	25 %	452120936
24981	NC_020307	CCA	2	6	1392697	1392702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120936
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24991	NC_020307	ATC	2	6	1393228	1393233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120936
24992	NC_020307	TCT	2	6	1393291	1393296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120936
24993	NC_020307	TGG	2	6	1393322	1393327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120936
24994	NC_020307	CTG	2	6	1393337	1393342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120936
24995	NC_020307	TTCT	2	8	1393407	1393414	0 %	75 %	0 %	25 %	452120936
24996	NC_020307	AAC	2	6	1393435	1393440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120936
24997	NC_020307	ATA	2	6	1393510	1393515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120936
24998	NC_020307	TCC	2	6	1393552	1393557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120936
24999	NC_020307	CAGC	2	8	1393568	1393575	25 %	0 %	25 %	50 %	452120936
25000	NC_020307	TTA	2	6	1393594	1393599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120936

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