MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24119	NC_020307	TTA	2	6	1347947	1347952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120892
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24230	NC_020307	CAGC	2	8	1352953	1352960	25 %	0 %	25 %	50 %	452120895
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24232	NC_020307	GCT	2	6	1353056	1353061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120895
24233	NC_020307	AGC	2	6	1353097	1353102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120895
24234	NC_020307	AAAC	2	8	1353350	1353357	75 %	0 %	0 %	25 %	452120896
24235	NC_020307	TGC	2	6	1353361	1353366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120896
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24238	NC_020307	CGC	2	6	1353640	1353645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120896
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24240	NC_020307	GTT	2	6	1353703	1353708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120896
24241	NC_020307	TCGCCA	2	12	1353768	1353779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	452120896
24242	NC_020307	CGT	2	6	1353892	1353897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120896
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24245	NC_020307	CTG	2	6	1353935	1353940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120896
24246	NC_020307	GC	3	6	1353987	1353992	0 %	0 %	50 %	50 %	452120896
24247	NC_020307	GAG	2	6	1353995	1354000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120896
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24252	NC_020307	GTA	2	6	1354233	1354238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120896
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24256	NC_020307	TGG	2	6	1354311	1354316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120896
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24465	NC_020307	TAAG	2	8	1364787	1364794	50 %	25 %	25 %	0 %	452120908
24466	NC_020307	ATC	2	6	1364798	1364803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24467	NC_020307	TCA	2	6	1364819	1364824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24468	NC_020307	TGC	3	9	1364837	1364845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120908
24469	NC_020307	CGTC	2	8	1365077	1365084	0 %	25 %	25 %	50 %	452120908
24470	NC_020307	TAACAT	2	12	1365087	1365098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452120908
24471	NC_020307	GC	3	6	1365120	1365125	0 %	0 %	50 %	50 %	452120908
24472	NC_020307	TCA	2	6	1365140	1365145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24473	NC_020307	GTT	2	6	1365195	1365200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120908
24474	NC_020307	AAT	2	6	1365204	1365209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120908
24475	NC_020307	ATC	2	6	1365233	1365238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24476	NC_020307	CCA	2	6	1365343	1365348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120908
24477	NC_020307	AAG	2	6	1365365	1365370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120908
24478	NC_020307	CATC	2	8	1365420	1365427	25 %	25 %	0 %	50 %	452120908
24479	NC_020307	CCT	2	6	1365504	1365509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120908
24480	NC_020307	CG	3	6	1365528	1365533	0 %	0 %	50 %	50 %	452120908
24481	NC_020307	GGT	2	6	1365589	1365594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120908
24482	NC_020307	CTG	2	6	1365715	1365720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120908
24483	NC_020307	CGC	2	6	1365765	1365770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120908
24484	NC_020307	GTTT	2	8	1365776	1365783	0 %	75 %	25 %	0 %	452120908
24485	NC_020307	GGC	2	6	1365812	1365817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120908
24486	NC_020307	CCT	2	6	1365846	1365851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120908
24487	NC_020307	TAC	2	6	1365859	1365864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24488	NC_020307	CCG	3	9	1365896	1365904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120908
24489	NC_020307	GAT	2	6	1365921	1365926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120908
24490	NC_020307	T	6	6	1365955	1365960	0 %	100 %	0 %	0 %	452120908
24491	NC_020307	AAT	2	6	1365962	1365967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120908
24492	NC_020307	ATC	2	6	1365979	1365984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120908
24493	NC_020307	ACG	2	6	1366045	1366050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120908
24494	NC_020307	GGC	2	6	1366096	1366101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120908
24495	NC_020307	GCC	2	6	1366106	1366111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120908
24496	NC_020307	GGC	2	6	1366154	1366159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120908
24497	NC_020307	CAG	2	6	1366186	1366191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120908
24498	NC_020307	AAT	2	6	1366192	1366197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120908
24499	NC_020307	TTG	2	6	1366220	1366225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120909
24500	NC_020307	CCAT	2	8	1366283	1366290	25 %	25 %	0 %	50 %	452120909

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