MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_020307	GCC	2	6	1289685	1289690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120846
23003	NC_020307	CG	4	8	1289694	1289701	0 %	0 %	50 %	50 %	452120846
23004	NC_020307	CAGA	2	8	1289716	1289723	50 %	0 %	25 %	25 %	452120846
23005	NC_020307	CGC	3	9	1289779	1289787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120846
23006	NC_020307	CGCC	2	8	1289811	1289818	0 %	0 %	25 %	75 %	452120846
23007	NC_020307	TCC	2	6	1289823	1289828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120846
23008	NC_020307	TCA	2	6	1289919	1289924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120846
23009	NC_020307	AAAG	2	8	1290091	1290098	75 %	0 %	25 %	0 %	452120847
23010	NC_020307	GCT	2	6	1290160	1290165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120847
23011	NC_020307	TGGC	2	8	1290215	1290222	0 %	25 %	50 %	25 %	452120847
23012	NC_020307	GCTATT	2	12	1290223	1290234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452120847
23013	NC_020307	CTG	2	6	1290260	1290265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120847
23014	NC_020307	CTACC	2	10	1290283	1290292	20 %	20 %	0 %	60 %	452120847
23015	NC_020307	AT	3	6	1290316	1290321	50 %	50 %	0 %	0 %	452120847
23016	NC_020307	CGG	3	9	1290331	1290339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120847
23017	NC_020307	TTAA	2	8	1290377	1290384	50 %	50 %	0 %	0 %	452120847
23018	NC_020307	CGG	2	6	1290457	1290462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120847
23019	NC_020307	CGG	2	6	1290489	1290494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120847
23020	NC_020307	ATT	2	6	1290542	1290547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120847
23021	NC_020307	GAA	3	9	1290572	1290580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120847
23022	NC_020307	GCC	3	9	1290581	1290589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120847
23023	NC_020307	GAT	2	6	1290655	1290660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120847
23024	NC_020307	TTTC	2	8	1290661	1290668	0 %	75 %	0 %	25 %	452120847
23025	NC_020307	CGAT	2	8	1290714	1290721	25 %	25 %	25 %	25 %	452120847
23026	NC_020307	CGC	2	6	1290723	1290728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120847
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23028	NC_020307	CGC	2	6	1290942	1290947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120848
23029	NC_020307	ATGA	2	8	1290951	1290958	50 %	25 %	25 %	0 %	452120848
23030	NC_020307	GC	3	6	1290970	1290975	0 %	0 %	50 %	50 %	452120848
23031	NC_020307	CT	3	6	1291040	1291045	0 %	50 %	0 %	50 %	452120848
23032	NC_020307	GCAG	2	8	1291120	1291127	25 %	0 %	50 %	25 %	452120848
23033	NC_020307	GAAG	2	8	1291176	1291183	50 %	0 %	50 %	0 %	452120848
23034	NC_020307	CGT	2	6	1291253	1291258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120848
23035	NC_020307	GC	3	6	1291412	1291417	0 %	0 %	50 %	50 %	452120848
23036	NC_020307	AGC	2	6	1291455	1291460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120848
23037	NC_020307	TGC	2	6	1291560	1291565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120848
23038	NC_020307	AGT	2	6	1291577	1291582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120848
23039	NC_020307	CAA	2	6	1291691	1291696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120848
23040	NC_020307	TTCCA	2	10	1291721	1291730	20 %	40 %	0 %	40 %	452120848
23041	NC_020307	GC	3	6	1291950	1291955	0 %	0 %	50 %	50 %	452120849
23042	NC_020307	GTC	2	6	1291967	1291972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120849
23043	NC_020307	GGCGAC	2	12	1292006	1292017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452120849
23044	NC_020307	T	6	6	1292023	1292028	0 %	100 %	0 %	0 %	452120849
23045	NC_020307	CGG	2	6	1292103	1292108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120849
23046	NC_020307	CG	3	6	1292117	1292122	0 %	0 %	50 %	50 %	452120849
23047	NC_020307	TCG	2	6	1292206	1292211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120849
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23050	NC_020307	ATC	2	6	1292373	1292378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120849
23051	NC_020307	TCG	2	6	1292412	1292417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120849
23052	NC_020307	GC	3	6	1292475	1292480	0 %	0 %	50 %	50 %	452120849
23053	NC_020307	CGC	2	6	1292494	1292499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120849
23054	NC_020307	AAT	2	6	1292546	1292551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120849
23055	NC_020307	ATG	2	6	1292664	1292669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120849
23056	NC_020307	ACG	2	6	1292670	1292675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120849
23057	NC_020307	TCA	2	6	1292693	1292698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120850
23058	NC_020307	AATT	2	8	1292779	1292786	50 %	50 %	0 %	0 %	452120850
23059	NC_020307	GAT	2	6	1292836	1292841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120850
23060	NC_020307	GAT	2	6	1292853	1292858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120850
23061	NC_020307	ATG	2	6	1292916	1292921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120851
23062	NC_020307	CG	3	6	1292988	1292993	0 %	0 %	50 %	50 %	452120851
23063	NC_020307	GCA	2	6	1293008	1293013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120851
23064	NC_020307	TCC	2	6	1293071	1293076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120851
23065	NC_020307	GCA	2	6	1293165	1293170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120851
23066	NC_020307	CGC	2	6	1293193	1293198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120851
23067	NC_020307	GCTGC	2	10	1293237	1293246	0 %	20 %	40 %	40 %	452120851
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23069	NC_020307	AAT	2	6	1293391	1293396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120851
23070	NC_020307	CTG	3	9	1293397	1293405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120851
23071	NC_020307	TCAGG	2	10	1293432	1293441	20 %	20 %	40 %	20 %	452120851
23072	NC_020307	GTA	2	6	1293454	1293459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120851
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23074	NC_020307	GC	4	8	1293496	1293503	0 %	0 %	50 %	50 %	452120851
23075	NC_020307	TAT	2	6	1293504	1293509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120851
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23084	NC_020307	CGC	2	6	1293909	1293914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120851
23085	NC_020307	CCAG	2	8	1293930	1293937	25 %	0 %	25 %	50 %	452120851
23086	NC_020307	ACA	2	6	1293992	1293997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120851
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23088	NC_020307	GGC	2	6	1294036	1294041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120851
23089	NC_020307	GCA	2	6	1294094	1294099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120851
23090	NC_020307	GCT	2	6	1294231	1294236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120852
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23098	NC_020307	CGCC	2	8	1294558	1294565	0 %	0 %	25 %	75 %	452120852
23099	NC_020307	CGC	2	6	1294573	1294578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120852
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23105	NC_020307	GCC	2	6	1294758	1294763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120852
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23108	NC_020307	GTC	2	6	1294863	1294868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120852
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23111	NC_020307	CACGC	2	10	1294937	1294946	20 %	0 %	20 %	60 %	452120852
23112	NC_020307	CCA	2	6	1294960	1294965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120852
23113	NC_020307	TTACCG	2	12	1294986	1294997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452120852
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23116	NC_020307	GCA	2	6	1295116	1295121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120852
23117	NC_020307	ACCAG	2	10	1295144	1295153	40 %	0 %	20 %	40 %	452120852
23118	NC_020307	CAG	2	6	1295215	1295220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120853
23119	NC_020307	TGG	2	6	1295289	1295294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120853
23120	NC_020307	AG	3	6	1295315	1295320	50 %	0 %	50 %	0 %	452120853
23121	NC_020307	TCA	2	6	1295396	1295401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120853
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23123	NC_020307	GAT	2	6	1295491	1295496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120853
23124	NC_020307	TTG	2	6	1295519	1295524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120853
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23129	NC_020307	TCA	2	6	1295723	1295728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120853
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23132	NC_020307	CG	3	6	1295899	1295904	0 %	0 %	50 %	50 %	452120853
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23225	NC_020307	ACG	2	6	1300984	1300989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120856
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23228	NC_020307	GA	3	6	1301241	1301246	50 %	0 %	50 %	0 %	452120856
23229	NC_020307	TCT	2	6	1301267	1301272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120856
23230	NC_020307	TAC	2	6	1301389	1301394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120856
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23232	NC_020307	CAC	2	6	1301418	1301423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120856
23233	NC_020307	CGGG	2	8	1301437	1301444	0 %	0 %	75 %	25 %	452120856
23234	NC_020307	TTC	2	6	1301464	1301469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120856
23235	NC_020307	GC	3	6	1301631	1301636	0 %	0 %	50 %	50 %	452120857
23236	NC_020307	CAG	3	9	1301702	1301710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120857
23237	NC_020307	CGATCG	2	12	1301737	1301748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452120857
23238	NC_020307	TCC	2	6	1301836	1301841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120857
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23240	NC_020307	GGC	2	6	1301945	1301950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120857
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23252	NC_020307	CAG	2	6	1302622	1302627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120858
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23345	NC_020307	GAC	3	9	1307166	1307174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120862
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23347	NC_020307	GC	3	6	1307204	1307209	0 %	0 %	50 %	50 %	452120862
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23350	NC_020307	CGG	2	6	1307509	1307514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120862
23351	NC_020307	CGT	2	6	1307603	1307608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120862
23352	NC_020307	TGCTT	2	10	1307634	1307643	0 %	60 %	20 %	20 %	452120862
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23450	NC_020307	T	7	7	1313075	1313081	0 %	100 %	0 %	0 %	452120865
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23457	NC_020307	TGA	2	6	1313555	1313560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120866
23458	NC_020307	TGG	2	6	1313576	1313581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120866
23459	NC_020307	GCA	2	6	1313646	1313651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120866
23460	NC_020307	CA	3	6	1313666	1313671	50 %	0 %	0 %	50 %	452120866
23461	NC_020307	CTG	2	6	1313844	1313849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120867
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23464	NC_020307	GGC	3	9	1314065	1314073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120867
23465	NC_020307	CGG	2	6	1314085	1314090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120867
23466	NC_020307	GCAG	2	8	1314103	1314110	25 %	0 %	50 %	25 %	452120867
23467	NC_020307	A	6	6	1314140	1314145	100 %	0 %	0 %	0 %	452120867
23468	NC_020307	TGAT	2	8	1314201	1314208	25 %	50 %	25 %	0 %	452120867
23469	NC_020307	CTG	2	6	1314212	1314217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120867
23470	NC_020307	ATGA	2	8	1314254	1314261	50 %	25 %	25 %	0 %	452120867
23471	NC_020307	CCA	2	6	1314268	1314273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120867
23472	NC_020307	GAC	2	6	1314380	1314385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120867
23473	NC_020307	GAT	2	6	1314386	1314391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120867
23474	NC_020307	A	6	6	1314438	1314443	100 %	0 %	0 %	0 %	452120867
23475	NC_020307	CTG	2	6	1314449	1314454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120867
23476	NC_020307	GAA	2	6	1314497	1314502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120867
23477	NC_020307	GCC	2	6	1314523	1314528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120867
23478	NC_020307	A	6	6	1314530	1314535	100 %	0 %	0 %	0 %	452120867
23479	NC_020307	CGT	2	6	1314882	1314887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120868
23480	NC_020307	CAG	2	6	1314905	1314910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120868
23481	NC_020307	AGGC	2	8	1315020	1315027	25 %	0 %	50 %	25 %	452120868
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23483	NC_020307	AAC	2	6	1315172	1315177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120868
23484	NC_020307	AGC	2	6	1315191	1315196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120868
23485	NC_020307	GTT	2	6	1315208	1315213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120868
23486	NC_020307	AT	3	6	1315329	1315334	50 %	50 %	0 %	0 %	452120868
23487	NC_020307	GCG	2	6	1315392	1315397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120868
23488	NC_020307	ATA	2	6	1315481	1315486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120868
23489	NC_020307	CAT	2	6	1315532	1315537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120868
23490	NC_020307	TCT	2	6	1315651	1315656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120868
23491	NC_020307	CCA	2	6	1315662	1315667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120868
23492	NC_020307	TGG	2	6	1315690	1315695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120868
23493	NC_020307	CAA	2	6	1315843	1315848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120868
23494	NC_020307	ACAA	2	8	1315893	1315900	75 %	0 %	0 %	25 %	452120868
23495	NC_020307	ACG	2	6	1315926	1315931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120868
23496	NC_020307	CAATG	2	10	1315976	1315985	40 %	20 %	20 %	20 %	452120868
23497	NC_020307	ACA	2	6	1316223	1316228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120868
23498	NC_020307	TAA	2	6	1316248	1316253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120868
23499	NC_020307	TGT	2	6	1316269	1316274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120868
23500	NC_020307	CAG	2	6	1316577	1316582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120869

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