MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22119	NC_020307	TTG	2	6	1241267	1241272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120806
22120	NC_020307	CTGC	2	8	1241283	1241290	0 %	25 %	25 %	50 %	452120806
22121	NC_020307	CT	3	6	1241293	1241298	0 %	50 %	0 %	50 %	452120806
22122	NC_020307	CAT	2	6	1242055	1242060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120807
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22221	NC_020307	GC	3	6	1247237	1247242	0 %	0 %	50 %	50 %	452120815
22222	NC_020307	ACC	2	6	1247245	1247250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120815
22223	NC_020307	CT	3	6	1247258	1247263	0 %	50 %	0 %	50 %	452120815
22224	NC_020307	CTG	2	6	1247317	1247322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120815
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22227	NC_020307	A	6	6	1247417	1247422	100 %	0 %	0 %	0 %	452120815
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22231	NC_020307	GAC	2	6	1247731	1247736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120815
22232	NC_020307	TACCG	2	10	1247769	1247778	20 %	20 %	20 %	40 %	452120815
22233	NC_020307	CAT	2	6	1247848	1247853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120815
22234	NC_020307	GCC	2	6	1247877	1247882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120815
22235	NC_020307	GAC	2	6	1247992	1247997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120816
22236	NC_020307	GTTG	2	8	1248028	1248035	0 %	50 %	50 %	0 %	452120816
22237	NC_020307	CAC	2	6	1248121	1248126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120816
22238	NC_020307	GC	3	6	1248142	1248147	0 %	0 %	50 %	50 %	452120816
22239	NC_020307	GCG	2	6	1248189	1248194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120816
22240	NC_020307	CAG	2	6	1248197	1248202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120816
22241	NC_020307	GC	3	6	1248207	1248212	0 %	0 %	50 %	50 %	452120816
22242	NC_020307	TCT	2	6	1248246	1248251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120816
22243	NC_020307	CGG	2	6	1248348	1248353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120816
22244	NC_020307	ATC	2	6	1248359	1248364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120816
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22247	NC_020307	CG	5	10	1248572	1248581	0 %	0 %	50 %	50 %	452120817
22248	NC_020307	CGC	2	6	1248602	1248607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120817
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22250	NC_020307	CGGGG	2	10	1248673	1248682	0 %	0 %	80 %	20 %	452120817
22251	NC_020307	CGT	2	6	1248687	1248692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120817
22252	NC_020307	CCT	2	6	1248696	1248701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120817
22253	NC_020307	CGC	2	6	1248790	1248795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120817
22254	NC_020307	GAT	3	9	1248819	1248827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120817
22255	NC_020307	GC	3	6	1248829	1248834	0 %	0 %	50 %	50 %	452120817
22256	NC_020307	CTTC	2	8	1248855	1248862	0 %	50 %	0 %	50 %	452120817
22257	NC_020307	T	6	6	1248925	1248930	0 %	100 %	0 %	0 %	452120817
22258	NC_020307	T	6	6	1248958	1248963	0 %	100 %	0 %	0 %	452120817
22259	NC_020307	CTG	2	6	1248979	1248984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120817
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22262	NC_020307	CGT	2	6	1249081	1249086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120817
22263	NC_020307	TGCC	2	8	1249120	1249127	0 %	25 %	25 %	50 %	452120817
22264	NC_020307	GCC	2	6	1249190	1249195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120817
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22268	NC_020307	GC	3	6	1249425	1249430	0 %	0 %	50 %	50 %	452120817
22269	NC_020307	CGC	2	6	1249481	1249486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120817
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22271	NC_020307	CTG	2	6	1249591	1249596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120817
22272	NC_020307	CG	3	6	1249625	1249630	0 %	0 %	50 %	50 %	452120817
22273	NC_020307	T	6	6	1249666	1249671	0 %	100 %	0 %	0 %	452120817
22274	NC_020307	AAT	2	6	1249684	1249689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120817
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22303	NC_020307	CCG	2	6	1251087	1251092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120818
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22322	NC_020307	GCG	2	6	1252082	1252087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120819
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22334	NC_020307	CTG	2	6	1252597	1252602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120819
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22337	NC_020307	TCG	2	6	1252658	1252663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120819
22338	NC_020307	GC	3	6	1252752	1252757	0 %	0 %	50 %	50 %	452120819
22339	NC_020307	GACGC	2	10	1252844	1252853	20 %	0 %	40 %	40 %	452120819
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22342	NC_020307	GC	3	6	1252991	1252996	0 %	0 %	50 %	50 %	452120819
22343	NC_020307	TGA	2	6	1253058	1253063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120819
22344	NC_020307	TCA	3	9	1253070	1253078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120819
22345	NC_020307	AGC	2	6	1253123	1253128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120819
22346	NC_020307	GTT	2	6	1253173	1253178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120819
22347	NC_020307	CAA	2	6	1253179	1253184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120819
22348	NC_020307	CCG	2	6	1253242	1253247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120819
22349	NC_020307	ATTA	2	8	1253256	1253263	50 %	50 %	0 %	0 %	452120819
22350	NC_020307	CGA	2	6	1253304	1253309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120820
22351	NC_020307	GCT	3	9	1253584	1253592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120820
22352	NC_020307	GGA	2	6	1253673	1253678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120820
22353	NC_020307	CA	3	6	1253684	1253689	50 %	0 %	0 %	50 %	452120820
22354	NC_020307	TTC	2	6	1253702	1253707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120820
22355	NC_020307	CCA	2	6	1253737	1253742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120820
22356	NC_020307	TCC	2	6	1253757	1253762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120820
22357	NC_020307	AG	3	6	1253852	1253857	50 %	0 %	50 %	0 %	452120820
22358	NC_020307	TTC	2	6	1254108	1254113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120821
22359	NC_020307	GC	3	6	1254142	1254147	0 %	0 %	50 %	50 %	452120821
22360	NC_020307	ATG	2	6	1254211	1254216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120821
22361	NC_020307	CAA	2	6	1254256	1254261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120821
22362	NC_020307	GAT	2	6	1254387	1254392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120821
22363	NC_020307	TTGG	2	8	1254428	1254435	0 %	50 %	50 %	0 %	452120821
22364	NC_020307	GAA	2	6	1254442	1254447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120821
22365	NC_020307	AGA	3	9	1254453	1254461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120821
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22368	NC_020307	A	6	6	1254943	1254948	100 %	0 %	0 %	0 %	452120822
22369	NC_020307	CTGG	2	8	1254981	1254988	0 %	25 %	50 %	25 %	452120822
22370	NC_020307	ATG	2	6	1255087	1255092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120822
22371	NC_020307	TGG	2	6	1255130	1255135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120822
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22373	NC_020307	TGGTA	2	10	1255304	1255313	20 %	40 %	40 %	0 %	452120822
22374	NC_020307	GGC	2	6	1255344	1255349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120822
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22377	NC_020307	CTG	2	6	1255503	1255508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120822
22378	NC_020307	AAG	2	6	1255540	1255545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120822
22379	NC_020307	GTA	2	6	1255554	1255559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120822
22380	NC_020307	CCGGCT	2	12	1255569	1255580	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	452120822
22381	NC_020307	TTCAAC	2	12	1255626	1255637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120822
22382	NC_020307	CAG	2	6	1255662	1255667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120822
22383	NC_020307	CAGC	2	8	1255685	1255692	25 %	0 %	25 %	50 %	452120822
22384	NC_020307	CGT	3	9	1255721	1255729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120822
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22389	NC_020307	TCT	2	6	1256151	1256156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120823
22390	NC_020307	T	6	6	1256249	1256254	0 %	100 %	0 %	0 %	452120823
22391	NC_020307	GTTT	2	8	1256307	1256314	0 %	75 %	25 %	0 %	452120823
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22399	NC_020307	CCGCG	2	10	1257012	1257021	0 %	0 %	40 %	60 %	452120824
22400	NC_020307	CA	3	6	1257051	1257056	50 %	0 %	0 %	50 %	452120824
22401	NC_020307	GTC	2	6	1257058	1257063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120824
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22408	NC_020307	TGT	2	6	1257834	1257839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120824
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22412	NC_020307	CG	3	6	1258120	1258125	0 %	0 %	50 %	50 %	452120824
22413	NC_020307	GGGC	2	8	1258134	1258141	0 %	0 %	75 %	25 %	452120824
22414	NC_020307	A	6	6	1258148	1258153	100 %	0 %	0 %	0 %	452120824
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22420	NC_020307	GAC	2	6	1258300	1258305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120824
22421	NC_020307	AGA	2	6	1258568	1258573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120825
22422	NC_020307	CTT	2	6	1258575	1258580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120825
22423	NC_020307	GTG	2	6	1258591	1258596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120825
22424	NC_020307	TGA	2	6	1258642	1258647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120825
22425	NC_020307	CGT	2	6	1258655	1258660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120825
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22428	NC_020307	TGG	2	6	1258807	1258812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120825
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22430	NC_020307	TGGGCG	2	12	1258858	1258869	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	452120825
22431	NC_020307	CATT	2	8	1258922	1258929	25 %	50 %	0 %	25 %	452120825
22432	NC_020307	TGG	2	6	1258984	1258989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120825
22433	NC_020307	GTC	2	6	1258993	1258998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120825
22434	NC_020307	TCC	2	6	1259176	1259181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120826
22435	NC_020307	GCT	2	6	1259614	1259619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120827
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22438	NC_020307	TAA	2	6	1259727	1259732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120827
22439	NC_020307	GGT	2	6	1259808	1259813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120827
22440	NC_020307	CGA	2	6	1259831	1259836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120827
22441	NC_020307	CCAG	2	8	1259838	1259845	25 %	0 %	25 %	50 %	452120827
22442	NC_020307	CCA	2	6	1259867	1259872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120827
22443	NC_020307	ATA	2	6	1260066	1260071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120827
22444	NC_020307	TC	3	6	1260080	1260085	0 %	50 %	0 %	50 %	452120827
22445	NC_020307	GCCA	2	8	1260103	1260110	25 %	0 %	25 %	50 %	452120827
22446	NC_020307	T	6	6	1260135	1260140	0 %	100 %	0 %	0 %	452120827
22447	NC_020307	T	6	6	1260170	1260175	0 %	100 %	0 %	0 %	452120828
22448	NC_020307	CCA	2	6	1260274	1260279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120828
22449	NC_020307	CGC	2	6	1260290	1260295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120828
22450	NC_020307	CGT	2	6	1260341	1260346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120828
22451	NC_020307	CCG	2	6	1260355	1260360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120828
22452	NC_020307	GCT	2	6	1260364	1260369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120828
22453	NC_020307	GACT	2	8	1260375	1260382	25 %	25 %	25 %	25 %	452120828
22454	NC_020307	ATC	2	6	1260471	1260476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120828
22455	NC_020307	GTT	2	6	1260491	1260496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120828
22456	NC_020307	CCA	2	6	1260514	1260519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120828
22457	NC_020307	GCT	2	6	1260545	1260550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120828
22458	NC_020307	AAT	2	6	1260560	1260565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120828
22459	NC_020307	CGG	2	6	1260599	1260604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120828
22460	NC_020307	AGC	2	6	1260690	1260695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120828
22461	NC_020307	ATC	2	6	1260785	1260790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120828
22462	NC_020307	AAAG	2	8	1260818	1260825	75 %	0 %	25 %	0 %	452120828
22463	NC_020307	GCG	2	6	1260868	1260873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120828
22464	NC_020307	T	6	6	1260955	1260960	0 %	100 %	0 %	0 %	452120828
22465	NC_020307	TCG	2	6	1260963	1260968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120828
22466	NC_020307	T	6	6	1260985	1260990	0 %	100 %	0 %	0 %	452120828
22467	NC_020307	CGC	3	9	1261039	1261047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120828
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22472	NC_020307	CGG	2	6	1261334	1261339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120828
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22475	NC_020307	GCA	2	6	1261486	1261491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120828
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22488	NC_020307	CAA	2	6	1262056	1262061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120829
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22492	NC_020307	ATA	2	6	1262258	1262263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120829
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22498	NC_020307	CTG	2	6	1262521	1262526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120829
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