MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_020307	GGCGCG	2	12	1178226	1178237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120730
21003	NC_020307	CCA	2	6	1178306	1178311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120730
21004	NC_020307	GCA	2	6	1178318	1178323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120730
21005	NC_020307	GCG	2	6	1178403	1178408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120730
21006	NC_020307	CGA	2	6	1178414	1178419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120730
21007	NC_020307	CGT	2	6	1178475	1178480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120730
21008	NC_020307	TGG	2	6	1178495	1178500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120730
21009	NC_020307	ACA	2	6	1178576	1178581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120730
21010	NC_020307	CGG	2	6	1178602	1178607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120730
21011	NC_020307	TTTA	2	8	1178613	1178620	25 %	75 %	0 %	0 %	452120730
21012	NC_020307	TTG	2	6	1178628	1178633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120730
21013	NC_020307	GAT	2	6	1178689	1178694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120730
21014	NC_020307	T	8	8	1178705	1178712	0 %	100 %	0 %	0 %	452120730
21015	NC_020307	T	7	7	1178806	1178812	0 %	100 %	0 %	0 %	452120731
21016	NC_020307	GC	3	6	1178823	1178828	0 %	0 %	50 %	50 %	452120731
21017	NC_020307	CCGCG	2	10	1178840	1178849	0 %	0 %	40 %	60 %	452120731
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21019	NC_020307	GTG	2	6	1178860	1178865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120731
21020	NC_020307	TCA	2	6	1178930	1178935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120731
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21022	NC_020307	CGC	2	6	1178988	1178993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120731
21023	NC_020307	TGC	2	6	1179007	1179012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120731
21024	NC_020307	CCG	2	6	1179047	1179052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120731
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21031	NC_020307	GC	3	6	1179308	1179313	0 %	0 %	50 %	50 %	452120731
21032	NC_020307	ATG	2	6	1179353	1179358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120731
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21052	NC_020307	GC	3	6	1180137	1180142	0 %	0 %	50 %	50 %	452120732
21053	NC_020307	GTT	2	6	1180549	1180554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120733
21054	NC_020307	TTGT	2	8	1180555	1180562	0 %	75 %	25 %	0 %	452120733
21055	NC_020307	CCAG	2	8	1180767	1180774	25 %	0 %	25 %	50 %	452120733
21056	NC_020307	CCG	2	6	1180793	1180798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120733
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21062	NC_020307	AGT	2	6	1181067	1181072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120734
21063	NC_020307	CATC	2	8	1181142	1181149	25 %	25 %	0 %	50 %	452120734
21064	NC_020307	TGA	2	6	1181150	1181155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120734
21065	NC_020307	GTC	2	6	1181200	1181205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120734
21066	NC_020307	GC	3	6	1181432	1181437	0 %	0 %	50 %	50 %	452120734
21067	NC_020307	TCG	2	6	1181456	1181461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120734
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21082	NC_020307	GTCG	2	8	1182302	1182309	0 %	25 %	50 %	25 %	452120735
21083	NC_020307	CG	3	6	1182332	1182337	0 %	0 %	50 %	50 %	452120735
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21088	NC_020307	GCC	2	6	1182497	1182502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120735
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21099	NC_020307	AGGC	2	8	1182962	1182969	25 %	0 %	50 %	25 %	452120735
21100	NC_020307	CGG	2	6	1182976	1182981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120735
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21104	NC_020307	GCC	2	6	1183095	1183100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120735
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21116	NC_020307	GTT	2	6	1183717	1183722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120736
21117	NC_020307	TGA	2	6	1183739	1183744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120736
21118	NC_020307	CGG	2	6	1183792	1183797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120736
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21221	NC_020307	GCT	2	6	1190665	1190670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120743
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21224	NC_020307	CG	3	6	1190746	1190751	0 %	0 %	50 %	50 %	452120743
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21231	NC_020307	TCA	2	6	1191364	1191369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120743
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21233	NC_020307	CG	3	6	1191414	1191419	0 %	0 %	50 %	50 %	452120743
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21464	NC_020307	T	6	6	1205307	1205312	0 %	100 %	0 %	0 %	452120759
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21467	NC_020307	GGT	2	6	1205620	1205625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120760
21468	NC_020307	CTC	2	6	1205645	1205650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120760
21469	NC_020307	T	6	6	1205654	1205659	0 %	100 %	0 %	0 %	452120760
21470	NC_020307	CCA	2	6	1205710	1205715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120760
21471	NC_020307	TAA	2	6	1205749	1205754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120760
21472	NC_020307	ATAC	2	8	1205807	1205814	50 %	25 %	0 %	25 %	452120760
21473	NC_020307	ATT	2	6	1205825	1205830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120760
21474	NC_020307	ACC	2	6	1205867	1205872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120760
21475	NC_020307	TCTG	2	8	1206142	1206149	0 %	50 %	25 %	25 %	452120760
21476	NC_020307	CTG	2	6	1206152	1206157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120760
21477	NC_020307	TGG	2	6	1206190	1206195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120760
21478	NC_020307	GCG	2	6	1206205	1206210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120760
21479	NC_020307	A	6	6	1206346	1206351	100 %	0 %	0 %	0 %	452120760
21480	NC_020307	ATA	2	6	1206362	1206367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120760
21481	NC_020307	AATA	2	8	1206540	1206547	75 %	25 %	0 %	0 %	452120761
21482	NC_020307	AT	3	6	1206568	1206573	50 %	50 %	0 %	0 %	452120761
21483	NC_020307	AGC	2	6	1206584	1206589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120761
21484	NC_020307	CGC	2	6	1206735	1206740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120762
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21486	NC_020307	ATT	2	6	1206795	1206800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120762
21487	NC_020307	GCT	2	6	1206836	1206841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120762
21488	NC_020307	ATG	2	6	1206928	1206933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120762
21489	NC_020307	CGA	3	9	1206944	1206952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120762
21490	NC_020307	CTGC	2	8	1206986	1206993	0 %	25 %	25 %	50 %	452120762
21491	NC_020307	GC	3	6	1206995	1207000	0 %	0 %	50 %	50 %	452120762
21492	NC_020307	TCA	2	6	1207052	1207057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120762
21493	NC_020307	CAG	2	6	1207083	1207088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120762
21494	NC_020307	CCA	2	6	1207142	1207147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120762
21495	NC_020307	CAG	2	6	1207218	1207223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120762
21496	NC_020307	CCG	2	6	1207273	1207278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120762
21497	NC_020307	CCG	2	6	1207404	1207409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120763
21498	NC_020307	ACA	2	6	1207422	1207427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120763
21499	NC_020307	TTG	2	6	1207466	1207471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120763
21500	NC_020307	TGT	2	6	1207500	1207505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120763

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