MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19503	NC_020307	TCG	2	6	1095108	1095113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120645
19504	NC_020307	CGGCG	2	10	1095127	1095136	0 %	0 %	60 %	40 %	452120645
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19512	NC_020307	T	6	6	1095644	1095649	0 %	100 %	0 %	0 %	452120646
19513	NC_020307	CAG	2	6	1095668	1095673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120646
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19618	NC_020307	GAA	2	6	1102765	1102770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120653
19619	NC_020307	GAA	2	6	1102804	1102809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120653
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19863	NC_020307	GGT	2	6	1114597	1114602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120665
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19875	NC_020307	A	6	6	1115299	1115304	100 %	0 %	0 %	0 %	452120666
19876	NC_020307	A	6	6	1115314	1115319	100 %	0 %	0 %	0 %	452120666
19877	NC_020307	CCG	2	6	1115323	1115328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120666
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19946	NC_020307	CGC	2	6	1118929	1118934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120670
19947	NC_020307	A	6	6	1118935	1118940	100 %	0 %	0 %	0 %	452120670
19948	NC_020307	GACG	2	8	1118983	1118990	25 %	0 %	50 %	25 %	452120670
19949	NC_020307	GC	3	6	1119103	1119108	0 %	0 %	50 %	50 %	452120670
19950	NC_020307	GCA	3	9	1119112	1119120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120670
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19953	NC_020307	TCA	2	6	1119292	1119297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120670
19954	NC_020307	GGTT	2	8	1119307	1119314	0 %	50 %	50 %	0 %	452120670
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19958	NC_020307	CTT	2	6	1119564	1119569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120671
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19960	NC_020307	CGC	2	6	1119597	1119602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120671
19961	NC_020307	TGT	2	6	1119609	1119614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120671
19962	NC_020307	GCCCCT	2	12	1119699	1119710	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	452120671
19963	NC_020307	CAC	2	6	1119763	1119768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120671
19964	NC_020307	TTTCTT	2	12	1119795	1119806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452120671
19965	NC_020307	TCA	2	6	1119905	1119910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120671
19966	NC_020307	A	6	6	1119932	1119937	100 %	0 %	0 %	0 %	452120671
19967	NC_020307	TAA	2	6	1119953	1119958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120671
19968	NC_020307	ACC	2	6	1119998	1120003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120671
19969	NC_020307	GGT	2	6	1120012	1120017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120671
19970	NC_020307	TAC	2	6	1120038	1120043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120671
19971	NC_020307	CG	3	6	1120297	1120302	0 %	0 %	50 %	50 %	452120672
19972	NC_020307	TCT	2	6	1120334	1120339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120672
19973	NC_020307	GTG	2	6	1120356	1120361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120672
19974	NC_020307	T	6	6	1120367	1120372	0 %	100 %	0 %	0 %	452120672
19975	NC_020307	CGT	2	6	1120373	1120378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120672
19976	NC_020307	CAA	2	6	1120467	1120472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120672
19977	NC_020307	GGC	2	6	1120488	1120493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120672
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19979	NC_020307	GC	3	6	1120547	1120552	0 %	0 %	50 %	50 %	452120672
19980	NC_020307	CCA	2	6	1120564	1120569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120672
19981	NC_020307	CTTT	2	8	1120610	1120617	0 %	75 %	0 %	25 %	452120672
19982	NC_020307	CGG	2	6	1120625	1120630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120672
19983	NC_020307	CGC	2	6	1120645	1120650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120672
19984	NC_020307	TGG	2	6	1120660	1120665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120672
19985	NC_020307	AATT	2	8	1120669	1120676	50 %	50 %	0 %	0 %	452120672
19986	NC_020307	CTT	2	6	1120697	1120702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120672
19987	NC_020307	CT	3	6	1120703	1120708	0 %	50 %	0 %	50 %	452120672
19988	NC_020307	TGA	2	6	1120711	1120716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120672
19989	NC_020307	GC	3	6	1120744	1120749	0 %	0 %	50 %	50 %	452120672
19990	NC_020307	GTCTG	2	10	1120783	1120792	0 %	40 %	40 %	20 %	452120672
19991	NC_020307	GCT	2	6	1120841	1120846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120672
19992	NC_020307	TAT	2	6	1120950	1120955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120672
19993	NC_020307	TGC	2	6	1120981	1120986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120672
19994	NC_020307	CTG	2	6	1121017	1121022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120672
19995	NC_020307	TC	3	6	1121054	1121059	0 %	50 %	0 %	50 %	452120672
19996	NC_020307	TGG	2	6	1121170	1121175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120672
19997	NC_020307	ACA	2	6	1121183	1121188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120672
19998	NC_020307	GC	3	6	1121241	1121246	0 %	0 %	50 %	50 %	452120672
19999	NC_020307	TCGC	2	8	1121262	1121269	0 %	25 %	25 %	50 %	452120672
20000	NC_020307	GGC	2	6	1121325	1121330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120672

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