MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_020307	AAT	2	6	1005263	1005268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120547
18004	NC_020307	TGG	2	6	1005304	1005309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120547
18005	NC_020307	TACT	2	8	1005377	1005384	25 %	50 %	0 %	25 %	452120547
18006	NC_020307	ATTG	2	8	1005563	1005570	25 %	50 %	25 %	0 %	452120547
18007	NC_020307	ATT	2	6	1005623	1005628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120547
18008	NC_020307	CGG	2	6	1005688	1005693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120547
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18010	NC_020307	TTG	2	6	1005714	1005719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120547
18011	NC_020307	CGG	2	6	1005726	1005731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120547
18012	NC_020307	TAT	2	6	1005757	1005762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120547
18013	NC_020307	CCG	2	6	1005807	1005812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120547
18014	NC_020307	ATG	2	6	1005846	1005851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120547
18015	NC_020307	AACA	2	8	1005884	1005891	75 %	0 %	0 %	25 %	452120547
18016	NC_020307	ACA	2	6	1005898	1005903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120547
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18019	NC_020307	TTA	2	6	1006014	1006019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120548
18020	NC_020307	CG	3	6	1006031	1006036	0 %	0 %	50 %	50 %	452120548
18021	NC_020307	GGC	2	6	1006178	1006183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120548
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18023	NC_020307	GCTT	2	8	1006208	1006215	0 %	50 %	25 %	25 %	452120548
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18118	NC_020307	T	6	6	1011063	1011068	0 %	100 %	0 %	0 %	452120556
18119	NC_020307	CTG	2	6	1011431	1011436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120557
18120	NC_020307	AAAC	2	8	1011458	1011465	75 %	0 %	0 %	25 %	452120557
18121	NC_020307	TCAA	2	8	1011495	1011502	50 %	25 %	0 %	25 %	452120557
18122	NC_020307	CG	3	6	1011513	1011518	0 %	0 %	50 %	50 %	452120557
18123	NC_020307	ACC	2	6	1011541	1011546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120557
18124	NC_020307	GAT	2	6	1011547	1011552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120557
18125	NC_020307	GAC	2	6	1011628	1011633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120557
18126	NC_020307	GCA	2	6	1011684	1011689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120557
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18128	NC_020307	CCA	2	6	1011782	1011787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120557
18129	NC_020307	ACA	2	6	1011789	1011794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120557
18130	NC_020307	CGGGA	2	10	1011823	1011832	20 %	0 %	60 %	20 %	452120557
18131	NC_020307	TA	3	6	1011842	1011847	50 %	50 %	0 %	0 %	452120557
18132	NC_020307	ACC	2	6	1011909	1011914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120557
18133	NC_020307	CCG	2	6	1011943	1011948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120557
18134	NC_020307	CGT	2	6	1012262	1012267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120558
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18144	NC_020307	TCA	2	6	1012623	1012628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120559
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18148	NC_020307	AGAA	2	8	1013085	1013092	75 %	0 %	25 %	0 %	452120560
18149	NC_020307	GGT	2	6	1013130	1013135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120560
18150	NC_020307	A	6	6	1013145	1013150	100 %	0 %	0 %	0 %	452120560
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18153	NC_020307	A	6	6	1013207	1013212	100 %	0 %	0 %	0 %	452120560
18154	NC_020307	CGC	2	6	1013289	1013294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120560
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18165	NC_020307	CTT	3	9	1014132	1014140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120561
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18220	NC_020307	ATA	2	6	1018079	1018084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120566
18221	NC_020307	TCTT	2	8	1018116	1018123	0 %	75 %	0 %	25 %	452120566
18222	NC_020307	CGC	2	6	1018153	1018158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120566
18223	NC_020307	GC	3	6	1018207	1018212	0 %	0 %	50 %	50 %	452120566
18224	NC_020307	TCA	2	6	1018230	1018235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120566
18225	NC_020307	GC	3	6	1018276	1018281	0 %	0 %	50 %	50 %	452120566
18226	NC_020307	ATG	2	6	1018289	1018294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120566
18227	NC_020307	T	7	7	1018349	1018355	0 %	100 %	0 %	0 %	452120566
18228	NC_020307	AGGC	2	8	1018580	1018587	25 %	0 %	50 %	25 %	452120567
18229	NC_020307	CG	3	6	1018610	1018615	0 %	0 %	50 %	50 %	452120567
18230	NC_020307	GGC	2	6	1018686	1018691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120567
18231	NC_020307	GCC	2	6	1018733	1018738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120567
18232	NC_020307	TCA	2	6	1018785	1018790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120567
18233	NC_020307	AAG	2	6	1018815	1018820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120567
18234	NC_020307	CGC	3	9	1018837	1018845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120567
18235	NC_020307	TTG	2	6	1018882	1018887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120567
18236	NC_020307	ACG	2	6	1019129	1019134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120568
18237	NC_020307	T	7	7	1019157	1019163	0 %	100 %	0 %	0 %	452120568
18238	NC_020307	TTAC	2	8	1019175	1019182	25 %	50 %	0 %	25 %	452120568
18239	NC_020307	TCA	2	6	1019187	1019192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120568
18240	NC_020307	GAT	2	6	1019243	1019248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120568
18241	NC_020307	GGC	2	6	1019256	1019261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120568
18242	NC_020307	T	6	6	1019312	1019317	0 %	100 %	0 %	0 %	452120568
18243	NC_020307	CT	3	6	1019375	1019380	0 %	50 %	0 %	50 %	452120568
18244	NC_020307	ATG	2	6	1019537	1019542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120568
18245	NC_020307	TATTGC	2	12	1019611	1019622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452120568
18246	NC_020307	CTTCG	2	10	1019653	1019662	0 %	40 %	20 %	40 %	452120568
18247	NC_020307	TCG	2	6	1019703	1019708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120568
18248	NC_020307	ATG	2	6	1019715	1019720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120568
18249	NC_020307	ACC	2	6	1019753	1019758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120568
18250	NC_020307	GCG	2	6	1019775	1019780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120568
18251	NC_020307	GTT	2	6	1019806	1019811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120568
18252	NC_020307	GCA	2	6	1019812	1019817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120568
18253	NC_020307	CGT	2	6	1019849	1019854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120568
18254	NC_020307	CCG	2	6	1019888	1019893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120568
18255	NC_020307	ATT	2	6	1019930	1019935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120568
18256	NC_020307	GGT	2	6	1020007	1020012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120568
18257	NC_020307	AATA	2	8	1020038	1020045	75 %	25 %	0 %	0 %	452120568
18258	NC_020307	TAT	2	6	1020076	1020081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120568
18259	NC_020307	GTC	2	6	1020128	1020133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120568
18260	NC_020307	A	6	6	1020187	1020192	100 %	0 %	0 %	0 %	452120568
18261	NC_020307	AGC	2	6	1020336	1020341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120569
18262	NC_020307	TGA	2	6	1020348	1020353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120569
18263	NC_020307	AC	3	6	1020386	1020391	50 %	0 %	0 %	50 %	452120569
18264	NC_020307	TCG	2	6	1020450	1020455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120569
18265	NC_020307	GC	4	8	1020484	1020491	0 %	0 %	50 %	50 %	452120569
18266	NC_020307	CAG	2	6	1020710	1020715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120569
18267	NC_020307	CGCC	2	8	1020721	1020728	0 %	0 %	25 %	75 %	452120569
18268	NC_020307	GTT	2	6	1020765	1020770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120569
18269	NC_020307	ATAA	2	8	1020911	1020918	75 %	25 %	0 %	0 %	452120570
18270	NC_020307	CTCA	2	8	1020961	1020968	25 %	25 %	0 %	50 %	452120570
18271	NC_020307	CGC	2	6	1021051	1021056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120570
18272	NC_020307	CAG	3	9	1021057	1021065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120570
18273	NC_020307	CGC	2	6	1021086	1021091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120570
18274	NC_020307	CCG	2	6	1021232	1021237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120570
18275	NC_020307	TGCTC	2	10	1021342	1021351	0 %	40 %	20 %	40 %	452120570
18276	NC_020307	TGTC	2	8	1021442	1021449	0 %	50 %	25 %	25 %	452120570
18277	NC_020307	GCA	2	6	1021500	1021505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120570
18278	NC_020307	GCA	3	9	1021521	1021529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120570
18279	NC_020307	TCCC	2	8	1021537	1021544	0 %	25 %	0 %	75 %	452120570
18280	NC_020307	ACCA	2	8	1021552	1021559	50 %	0 %	0 %	50 %	452120570
18281	NC_020307	CCA	2	6	1021563	1021568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120570
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18285	NC_020307	CCA	2	6	1021776	1021781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120571
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18291	NC_020307	CCG	3	9	1022101	1022109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120571
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18294	NC_020307	GCC	2	6	1022215	1022220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120571
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18299	NC_020307	CGAT	2	8	1022500	1022507	25 %	25 %	25 %	25 %	452120572
18300	NC_020307	CAC	3	9	1022512	1022520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120572
18301	NC_020307	TAG	2	6	1022619	1022624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120572
18302	NC_020307	C	8	8	1022670	1022677	0 %	0 %	0 %	100 %	452120572
18303	NC_020307	GC	4	8	1022777	1022784	0 %	0 %	50 %	50 %	452120572
18304	NC_020307	T	6	6	1022820	1022825	0 %	100 %	0 %	0 %	452120572
18305	NC_020307	ATT	2	6	1022926	1022931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120572
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18307	NC_020307	ATC	2	6	1023050	1023055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120572
18308	NC_020307	CAG	2	6	1023139	1023144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120572
18309	NC_020307	GC	3	6	1023283	1023288	0 %	0 %	50 %	50 %	452120572
18310	NC_020307	CAG	2	6	1023390	1023395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120572
18311	NC_020307	CCA	2	6	1023396	1023401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120572
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18313	NC_020307	A	6	6	1023425	1023430	100 %	0 %	0 %	0 %	452120572
18314	NC_020307	GAA	2	6	1023436	1023441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120572
18315	NC_020307	TCA	2	6	1023447	1023452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120572
18316	NC_020307	CAGGTC	2	12	1023457	1023468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18317	NC_020307	TCA	2	6	1023472	1023477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120573
18318	NC_020307	GC	3	6	1023515	1023520	0 %	0 %	50 %	50 %	452120573
18319	NC_020307	AGC	2	6	1023571	1023576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18320	NC_020307	CATGCC	2	12	1023577	1023588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	452120573
18321	NC_020307	TCCCA	2	10	1023617	1023626	20 %	20 %	0 %	60 %	452120573
18322	NC_020307	CTG	2	6	1023633	1023638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18323	NC_020307	GAC	2	6	1023864	1023869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18324	NC_020307	GC	3	6	1023892	1023897	0 %	0 %	50 %	50 %	452120573
18325	NC_020307	CCG	2	6	1023915	1023920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120573
18326	NC_020307	CTT	2	6	1023959	1023964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120573
18327	NC_020307	CACG	2	8	1023977	1023984	25 %	0 %	25 %	50 %	452120573
18328	NC_020307	CCAG	2	8	1024002	1024009	25 %	0 %	25 %	50 %	452120573
18329	NC_020307	GC	4	8	1024024	1024031	0 %	0 %	50 %	50 %	452120573
18330	NC_020307	CTG	2	6	1024305	1024310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18331	NC_020307	GC	3	6	1024362	1024367	0 %	0 %	50 %	50 %	452120573
18332	NC_020307	GGC	2	6	1024368	1024373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120573
18333	NC_020307	T	6	6	1024529	1024534	0 %	100 %	0 %	0 %	452120573
18334	NC_020307	CAT	2	6	1024535	1024540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120573
18335	NC_020307	GC	3	6	1024623	1024628	0 %	0 %	50 %	50 %	452120573
18336	NC_020307	CGC	2	6	1024683	1024688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120573
18337	NC_020307	CCAGC	2	10	1024884	1024893	20 %	0 %	20 %	60 %	452120573
18338	NC_020307	GCG	2	6	1024976	1024981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120573
18339	NC_020307	ATC	2	6	1025032	1025037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120573
18340	NC_020307	GTT	2	6	1025057	1025062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120573
18341	NC_020307	TCC	2	6	1025068	1025073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120573
18342	NC_020307	GCA	2	6	1025078	1025083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120573
18343	NC_020307	A	6	6	1025775	1025780	100 %	0 %	0 %	0 %	452120574
18344	NC_020307	T	6	6	1025785	1025790	0 %	100 %	0 %	0 %	452120574
18345	NC_020307	TA	3	6	1025857	1025862	50 %	50 %	0 %	0 %	452120574
18346	NC_020307	A	6	6	1025979	1025984	100 %	0 %	0 %	0 %	452120574
18347	NC_020307	TGT	2	6	1026059	1026064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120574
18348	NC_020307	AAC	2	6	1026079	1026084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120574
18349	NC_020307	TCTGG	2	10	1026381	1026390	0 %	40 %	40 %	20 %	452120575
18350	NC_020307	CTC	2	6	1026455	1026460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120575
18351	NC_020307	GCA	2	6	1026465	1026470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120575
18352	NC_020307	GCT	2	6	1026525	1026530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120575
18353	NC_020307	GAT	2	6	1026540	1026545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120575
18354	NC_020307	T	6	6	1026571	1026576	0 %	100 %	0 %	0 %	452120575
18355	NC_020307	CATG	2	8	1026678	1026685	25 %	25 %	25 %	25 %	452120575
18356	NC_020307	CAG	2	6	1026686	1026691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120575
18357	NC_020307	GTT	2	6	1026696	1026701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120575
18358	NC_020307	TACA	2	8	1026709	1026716	50 %	25 %	0 %	25 %	452120575
18359	NC_020307	ACG	2	6	1026903	1026908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120576
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18361	NC_020307	TAT	3	9	1027102	1027110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120576
18362	NC_020307	CG	3	6	1027124	1027129	0 %	0 %	50 %	50 %	452120576
18363	NC_020307	AAC	2	6	1027197	1027202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120576
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18366	NC_020307	T	6	6	1027299	1027304	0 %	100 %	0 %	0 %	452120576
18367	NC_020307	GATC	2	8	1027398	1027405	25 %	25 %	25 %	25 %	452120576
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18369	NC_020307	CG	3	6	1027498	1027503	0 %	0 %	50 %	50 %	452120576
18370	NC_020307	ATC	2	6	1027511	1027516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120576
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18381	NC_020307	AAAAT	2	10	1029021	1029030	80 %	20 %	0 %	0 %	452120578
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18408	NC_020307	A	6	6	1032705	1032710	100 %	0 %	0 %	0 %	452120582
18409	NC_020307	TTTG	2	8	1033175	1033182	0 %	75 %	25 %	0 %	452120583
18410	NC_020307	TCA	2	6	1033238	1033243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120583
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18416	NC_020307	AAG	2	6	1034137	1034142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120584
18417	NC_020307	TGA	2	6	1034198	1034203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120584
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18419	NC_020307	TGT	2	6	1034276	1034281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120584
18420	NC_020307	TCG	2	6	1034525	1034530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120585
18421	NC_020307	ATC	2	6	1034581	1034586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120585
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18451	NC_020307	ATCC	2	8	1037069	1037076	25 %	25 %	0 %	50 %	452120589
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18455	NC_020307	T	6	6	1037259	1037264	0 %	100 %	0 %	0 %	452120589
18456	NC_020307	GA	3	6	1037364	1037369	50 %	0 %	50 %	0 %	452120589
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18459	NC_020307	C	7	7	1037513	1037519	0 %	0 %	0 %	100 %	452120589
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18461	NC_020307	ACC	2	6	1037542	1037547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120589
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18463	NC_020307	ATTT	2	8	1037771	1037778	25 %	75 %	0 %	0 %	452120590
18464	NC_020307	CAT	2	6	1037808	1037813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120590
18465	NC_020307	TTA	2	6	1037889	1037894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120590
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18468	NC_020307	CT	3	6	1038103	1038108	0 %	50 %	0 %	50 %	452120590
18469	NC_020307	CAT	2	6	1038118	1038123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120590
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18492	NC_020307	TA	3	6	1040128	1040133	50 %	50 %	0 %	0 %	452120592
18493	NC_020307	A	7	7	1040224	1040230	100 %	0 %	0 %	0 %	452120592
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18497	NC_020307	T	6	6	1040636	1040641	0 %	100 %	0 %	0 %	452120592
18498	NC_020307	AG	4	8	1040643	1040650	50 %	0 %	50 %	0 %	452120592
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