MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_020307	ATTC	2	8	868506	868513	25 %	50 %	0 %	25 %	452120413
15503	NC_020307	CTC	2	6	868529	868534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120414
15504	NC_020307	CTCTC	2	10	868572	868581	0 %	40 %	0 %	60 %	452120414
15505	NC_020307	AAT	2	6	868674	868679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15506	NC_020307	GACGA	2	10	868732	868741	40 %	0 %	40 %	20 %	452120414
15507	NC_020307	CACG	2	8	868783	868790	25 %	0 %	25 %	50 %	452120414
15508	NC_020307	TTCC	2	8	868834	868841	0 %	50 %	0 %	50 %	452120414
15509	NC_020307	GAC	2	6	868849	868854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120414
15510	NC_020307	GTG	2	6	868918	868923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120414
15511	NC_020307	TTA	2	6	869010	869015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120414
15512	NC_020307	AGT	2	6	869053	869058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120414
15513	NC_020307	T	7	7	869058	869064	0 %	100 %	0 %	0 %	452120414
15514	NC_020307	CATT	2	8	869071	869078	25 %	50 %	0 %	25 %	452120414
15515	NC_020307	TAA	2	6	869138	869143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15516	NC_020307	GTCCA	2	10	869174	869183	20 %	20 %	20 %	40 %	452120414
15517	NC_020307	CAG	2	6	869220	869225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120414
15518	NC_020307	CACC	2	8	869260	869267	25 %	0 %	0 %	75 %	452120414
15519	NC_020307	AATA	2	8	869289	869296	75 %	25 %	0 %	0 %	452120414
15520	NC_020307	CGA	2	6	869571	869576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120414
15521	NC_020307	AAC	2	6	869598	869603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120414
15522	NC_020307	AAAG	2	8	869609	869616	75 %	0 %	25 %	0 %	452120414
15523	NC_020307	GAG	2	6	869651	869656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120414
15524	NC_020307	AACTC	2	10	869710	869719	40 %	20 %	0 %	40 %	452120414
15525	NC_020307	AAT	2	6	869762	869767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15526	NC_020307	CAG	2	6	869786	869791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120414
15527	NC_020307	CTCA	2	8	869852	869859	25 %	25 %	0 %	50 %	452120414
15528	NC_020307	CATAT	2	10	869864	869873	40 %	40 %	0 %	20 %	452120414
15529	NC_020307	ATA	3	9	869886	869894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15530	NC_020307	CCG	2	6	869895	869900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120414
15531	NC_020307	AAC	2	6	869915	869920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120414
15532	NC_020307	AAT	2	6	869921	869926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15533	NC_020307	CTG	2	6	869993	869998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120414
15534	NC_020307	TTTG	2	8	870070	870077	0 %	75 %	25 %	0 %	452120414
15535	NC_020307	ATG	2	6	870165	870170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120414
15536	NC_020307	CCAAC	2	10	870181	870190	40 %	0 %	0 %	60 %	452120414
15537	NC_020307	TCC	2	6	870200	870205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120414
15538	NC_020307	TGT	2	6	870249	870254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120414
15539	NC_020307	GTA	2	6	870303	870308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120414
15540	NC_020307	TAA	2	6	870314	870319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15541	NC_020307	CAT	2	6	870443	870448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120414
15542	NC_020307	TAA	2	6	870461	870466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120414
15543	NC_020307	GAT	2	6	870579	870584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120415
15544	NC_020307	CGG	2	6	870603	870608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120415
15545	NC_020307	AGG	2	6	870619	870624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120415
15546	NC_020307	CAA	2	6	870652	870657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120415
15547	NC_020307	AAT	2	6	870659	870664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120415
15548	NC_020307	AAG	2	6	870734	870739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120415
15549	NC_020307	GCC	2	6	870810	870815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120415
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15551	NC_020307	TCG	2	6	871028	871033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120416
15552	NC_020307	GTT	2	6	871074	871079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120416
15553	NC_020307	GAA	2	6	871106	871111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120416
15554	NC_020307	ATA	2	6	871166	871171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120416
15555	NC_020307	AGT	2	6	871175	871180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120416
15556	NC_020307	GGC	2	6	871199	871204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120416
15557	NC_020307	CTC	2	6	871219	871224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120416
15558	NC_020307	AAC	2	6	871256	871261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120416
15559	NC_020307	ACG	2	6	871264	871269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120416
15560	NC_020307	TGC	2	6	871282	871287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120416
15561	NC_020307	CTC	2	6	871525	871530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120416
15562	NC_020307	T	6	6	871567	871572	0 %	100 %	0 %	0 %	452120416
15563	NC_020307	T	6	6	871574	871579	0 %	100 %	0 %	0 %	452120416
15564	NC_020307	CCG	2	6	871586	871591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120416
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15566	NC_020307	GCA	2	6	871713	871718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120416
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15569	NC_020307	CGT	2	6	871831	871836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120416
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15577	NC_020307	CT	3	6	872497	872502	0 %	50 %	0 %	50 %	452120417
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15585	NC_020307	CAAC	2	8	872815	872822	50 %	0 %	0 %	50 %	452120418
15586	NC_020307	AAT	2	6	872915	872920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120418
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15593	NC_020307	TCA	2	6	873526	873531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120419
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15595	NC_020307	A	6	6	873613	873618	100 %	0 %	0 %	0 %	452120419
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15602	NC_020307	TCT	2	6	873844	873849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120419
15603	NC_020307	CACAT	2	10	873870	873879	40 %	20 %	0 %	40 %	452120419
15604	NC_020307	AAGA	2	8	873885	873892	75 %	0 %	25 %	0 %	452120419
15605	NC_020307	TTA	2	6	873948	873953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120420
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15608	NC_020307	TAA	2	6	874049	874054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120420
15609	NC_020307	TGG	2	6	874069	874074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120420
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15612	NC_020307	CAA	2	6	874303	874308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120421
15613	NC_020307	T	6	6	874333	874338	0 %	100 %	0 %	0 %	452120421
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15617	NC_020307	CATT	2	8	874594	874601	25 %	50 %	0 %	25 %	452120422
15618	NC_020307	TGGCC	2	10	874612	874621	0 %	20 %	40 %	40 %	452120422
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15620	NC_020307	GCT	2	6	874820	874825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120423
15621	NC_020307	CCATC	2	10	874846	874855	20 %	20 %	0 %	60 %	452120423
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15625	NC_020307	ATG	2	6	875093	875098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120423
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15746	NC_020307	CT	3	6	880472	880477	0 %	50 %	0 %	50 %	452120431
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15857	NC_020307	A	6	6	886014	886019	100 %	0 %	0 %	0 %	452120436
15858	NC_020307	CT	3	6	886054	886059	0 %	50 %	0 %	50 %	452120436
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15981	NC_020307	TAT	2	6	893415	893420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120444
15982	NC_020307	CCA	2	6	893453	893458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120444
15983	NC_020307	TCA	2	6	893463	893468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120444
15984	NC_020307	GAC	2	6	893539	893544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120444
15985	NC_020307	AGG	2	6	893591	893596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120444
15986	NC_020307	TCA	2	6	893615	893620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120445
15987	NC_020307	GAA	2	6	893623	893628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120445
15988	NC_020307	GCTG	2	8	893654	893661	0 %	25 %	50 %	25 %	452120445
15989	NC_020307	T	6	6	893683	893688	0 %	100 %	0 %	0 %	452120445
15990	NC_020307	GCC	2	6	893698	893703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120445
15991	NC_020307	A	6	6	893740	893745	100 %	0 %	0 %	0 %	452120445
15992	NC_020307	CGC	2	6	893748	893753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120445
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15994	NC_020307	ACCGC	2	10	893800	893809	20 %	0 %	20 %	60 %	452120445
15995	NC_020307	CGG	2	6	893819	893824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120445
15996	NC_020307	CCGC	2	8	893837	893844	0 %	0 %	25 %	75 %	452120445
15997	NC_020307	GTT	2	6	893898	893903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120445
15998	NC_020307	GCA	2	6	893946	893951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120445
15999	NC_020307	ATT	2	6	893961	893966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120445
16000	NC_020307	TTC	2	6	894130	894135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120445

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