MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020307	GA	3	6	841132	841137	50 %	0 %	50 %	0 %	452120380
15002	NC_020307	TCA	2	6	841270	841275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120380
15003	NC_020307	CAATA	2	10	841287	841296	60 %	20 %	0 %	20 %	452120380
15004	NC_020307	GCC	2	6	841434	841439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120380
15005	NC_020307	CTG	2	6	841470	841475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120380
15006	NC_020307	TTA	2	6	841583	841588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120381
15007	NC_020307	CG	3	6	841664	841669	0 %	0 %	50 %	50 %	452120381
15008	NC_020307	CAG	2	6	841699	841704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120381
15009	NC_020307	TCA	2	6	841769	841774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120381
15010	NC_020307	CAA	2	6	841809	841814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120381
15011	NC_020307	TTG	2	6	841816	841821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120381
15012	NC_020307	CAG	2	6	841840	841845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120381
15013	NC_020307	ATT	2	6	841859	841864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120381
15014	NC_020307	ATC	2	6	842110	842115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120382
15015	NC_020307	GGT	2	6	842137	842142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120382
15016	NC_020307	CAA	2	6	842161	842166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120382
15017	NC_020307	CGC	2	6	842167	842172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15018	NC_020307	CCG	2	6	842204	842209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15019	NC_020307	GCC	2	6	842233	842238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15020	NC_020307	AGC	2	6	842243	842248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120382
15021	NC_020307	CCG	2	6	842268	842273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15022	NC_020307	TCAGC	2	10	842274	842283	20 %	20 %	20 %	40 %	452120382
15023	NC_020307	CG	4	8	842301	842308	0 %	0 %	50 %	50 %	452120382
15024	NC_020307	GCA	2	6	842390	842395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120382
15025	NC_020307	GCA	2	6	842421	842426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120382
15026	NC_020307	GAA	2	6	842430	842435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120382
15027	NC_020307	CTT	2	6	842445	842450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120382
15028	NC_020307	GC	3	6	842481	842486	0 %	0 %	50 %	50 %	452120382
15029	NC_020307	CATC	2	8	842505	842512	25 %	25 %	0 %	50 %	452120382
15030	NC_020307	GCC	2	6	842584	842589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15031	NC_020307	GCG	2	6	842655	842660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120382
15032	NC_020307	CGC	2	6	842687	842692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15033	NC_020307	CGA	2	6	842727	842732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120382
15034	NC_020307	ATT	2	6	842737	842742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120382
15035	NC_020307	CGA	2	6	842817	842822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120382
15036	NC_020307	GTT	2	6	842841	842846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120382
15037	NC_020307	T	6	6	842956	842961	0 %	100 %	0 %	0 %	452120382
15038	NC_020307	TCA	2	6	843014	843019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120382
15039	NC_020307	GCC	2	6	843023	843028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120382
15040	NC_020307	ACA	2	6	843032	843037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120382
15041	NC_020307	GT	3	6	843416	843421	0 %	50 %	50 %	0 %	452120383
15042	NC_020307	TGA	2	6	843533	843538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120383
15043	NC_020307	CGG	2	6	843560	843565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120383
15044	NC_020307	CGG	2	6	843599	843604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120383
15045	NC_020307	TGGC	2	8	843643	843650	0 %	25 %	50 %	25 %	452120383
15046	NC_020307	TC	3	6	843820	843825	0 %	50 %	0 %	50 %	452120383
15047	NC_020307	TGT	2	6	843907	843912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120384
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15049	NC_020307	CG	3	6	843982	843987	0 %	0 %	50 %	50 %	452120384
15050	NC_020307	ATGA	2	8	843992	843999	50 %	25 %	25 %	0 %	452120384
15051	NC_020307	CGA	2	6	844059	844064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120384
15052	NC_020307	GCT	2	6	844135	844140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120384
15053	NC_020307	GGC	2	6	844182	844187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120384
15054	NC_020307	TGA	2	6	844191	844196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120384
15055	NC_020307	GTT	2	6	844626	844631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120385
15056	NC_020307	TGA	2	6	844665	844670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120385
15057	NC_020307	TC	3	6	844695	844700	0 %	50 %	0 %	50 %	452120385
15058	NC_020307	GTG	2	6	844820	844825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120386
15059	NC_020307	CG	3	6	844858	844863	0 %	0 %	50 %	50 %	452120386
15060	NC_020307	CG	3	6	844875	844880	0 %	0 %	50 %	50 %	452120386
15061	NC_020307	GCA	2	6	844912	844917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120386
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15064	NC_020307	CTGG	2	8	845230	845237	0 %	25 %	50 %	25 %	452120386
15065	NC_020307	CATT	2	8	845310	845317	25 %	50 %	0 %	25 %	452120386
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15069	NC_020307	TTA	2	6	845728	845733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120387
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15091	NC_020307	ATT	2	6	846500	846505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120387
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15120	NC_020307	GTGAT	2	10	847437	847446	20 %	40 %	40 %	0 %	452120387
15121	NC_020307	GAGC	2	8	847447	847454	25 %	0 %	50 %	25 %	452120387
15122	NC_020307	GCG	2	6	847455	847460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120387
15123	NC_020307	GCA	2	6	847462	847467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120387
15124	NC_020307	CAT	3	9	847523	847531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120387
15125	NC_020307	CGC	2	6	847537	847542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120387
15126	NC_020307	GGC	2	6	847552	847557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120387
15127	NC_020307	CGC	2	6	847641	847646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120387
15128	NC_020307	CCG	4	12	847661	847672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120388
15129	NC_020307	CGC	2	6	847701	847706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120388
15130	NC_020307	TCA	2	6	847739	847744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120388
15131	NC_020307	CAT	2	6	847788	847793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120388
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15133	NC_020307	CGG	2	6	847969	847974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120388
15134	NC_020307	GCC	2	6	848005	848010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120388
15135	NC_020307	GAC	2	6	848026	848031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120388
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15141	NC_020307	ACC	2	6	848391	848396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120389
15142	NC_020307	TCA	2	6	848466	848471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120389
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15149	NC_020307	AAT	2	6	848807	848812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120389
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15151	NC_020307	GCG	2	6	848911	848916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120389
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15155	NC_020307	GTT	2	6	849192	849197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120390
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15183	NC_020307	TGG	2	6	850710	850715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120392
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15481	NC_020307	ATC	2	6	867583	867588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120413
15482	NC_020307	CCA	2	6	867594	867599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120413
15483	NC_020307	TC	3	6	867708	867713	0 %	50 %	0 %	50 %	452120413
15484	NC_020307	CGG	2	6	867714	867719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120413
15485	NC_020307	CG	3	6	867734	867739	0 %	0 %	50 %	50 %	452120413
15486	NC_020307	GCAA	2	8	867767	867774	50 %	0 %	25 %	25 %	452120413
15487	NC_020307	GAC	2	6	867775	867780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120413
15488	NC_020307	A	6	6	867799	867804	100 %	0 %	0 %	0 %	452120413
15489	NC_020307	GTG	2	6	867815	867820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120413
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15491	NC_020307	A	6	6	868035	868040	100 %	0 %	0 %	0 %	452120413
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