MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020307	ACTG	2	8	730835	730842	25 %	25 %	25 %	25 %	452120271
13003	NC_020307	TCT	2	6	730856	730861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120271
13004	NC_020307	GCA	2	6	730913	730918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120271
13005	NC_020307	CGA	2	6	731165	731170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120272
13006	NC_020307	GGCGGG	2	12	731198	731209	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	452120272
13007	NC_020307	GACG	2	8	731261	731268	25 %	0 %	50 %	25 %	452120272
13008	NC_020307	GAAA	2	8	731306	731313	75 %	0 %	25 %	0 %	452120272
13009	NC_020307	A	6	6	731417	731422	100 %	0 %	0 %	0 %	452120272
13010	NC_020307	TCA	2	6	731442	731447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120272
13011	NC_020307	GCG	2	6	731463	731468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120272
13012	NC_020307	AAGAT	2	10	731482	731491	60 %	20 %	20 %	0 %	452120272
13013	NC_020307	GCA	2	6	731495	731500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120272
13014	NC_020307	CAA	2	6	731535	731540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120272
13015	NC_020307	AATCA	2	10	731593	731602	60 %	20 %	0 %	20 %	452120272
13016	NC_020307	ATG	2	6	731675	731680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120272
13017	NC_020307	GGC	2	6	731718	731723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120272
13018	NC_020307	CGG	2	6	731728	731733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120272
13019	NC_020307	AAT	2	6	731747	731752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120272
13020	NC_020307	CGT	2	6	731760	731765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120272
13021	NC_020307	CAG	2	6	731898	731903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120272
13022	NC_020307	CCG	2	6	731925	731930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120272
13023	NC_020307	CG	3	6	731929	731934	0 %	0 %	50 %	50 %	452120272
13024	NC_020307	CAGCG	2	10	732406	732415	20 %	0 %	40 %	40 %	452120273
13025	NC_020307	CGT	2	6	732429	732434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120273
13026	NC_020307	A	6	6	732439	732444	100 %	0 %	0 %	0 %	452120273
13027	NC_020307	TTA	2	6	732450	732455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120273
13028	NC_020307	TGA	2	6	732530	732535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120273
13029	NC_020307	TGCGC	2	10	732575	732584	0 %	20 %	40 %	40 %	452120273
13030	NC_020307	AC	3	6	732605	732610	50 %	0 %	0 %	50 %	452120273
13031	NC_020307	GGT	2	6	732992	732997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120274
13032	NC_020307	TGT	2	6	733012	733017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120274
13033	NC_020307	A	7	7	733054	733060	100 %	0 %	0 %	0 %	452120274
13034	NC_020307	CATC	2	8	733062	733069	25 %	25 %	0 %	50 %	452120274
13035	NC_020307	TCA	2	6	733082	733087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120274
13036	NC_020307	T	6	6	733135	733140	0 %	100 %	0 %	0 %	452120274
13037	NC_020307	CAT	2	6	733158	733163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120274
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13039	NC_020307	CCTG	2	8	733248	733255	0 %	25 %	25 %	50 %	452120275
13040	NC_020307	AAT	2	6	733290	733295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120275
13041	NC_020307	CCA	2	6	733317	733322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120275
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13043	NC_020307	GTT	2	6	733359	733364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120275
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13045	NC_020307	ACT	2	6	733590	733595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120276
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13047	NC_020307	TCC	2	6	733703	733708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120276
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13049	NC_020307	TAT	2	6	733760	733765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120276
13050	NC_020307	TGA	2	6	733805	733810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120276
13051	NC_020307	A	6	6	733852	733857	100 %	0 %	0 %	0 %	452120277
13052	NC_020307	CATAC	2	10	733864	733873	40 %	20 %	0 %	40 %	452120277
13053	NC_020307	A	8	8	733885	733892	100 %	0 %	0 %	0 %	452120277
13054	NC_020307	GAA	2	6	733943	733948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120277
13055	NC_020307	GTG	2	6	733973	733978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120277
13056	NC_020307	ATG	2	6	734054	734059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120277
13057	NC_020307	ACACA	2	10	734074	734083	60 %	0 %	0 %	40 %	452120277
13058	NC_020307	CTG	2	6	734288	734293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120278
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13060	NC_020307	CCG	2	6	734327	734332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120278
13061	NC_020307	TGTT	2	8	734354	734361	0 %	75 %	25 %	0 %	452120278
13062	NC_020307	CA	3	6	734380	734385	50 %	0 %	0 %	50 %	452120278
13063	NC_020307	GCTT	2	8	734424	734431	0 %	50 %	25 %	25 %	452120278
13064	NC_020307	ACTG	2	8	734451	734458	25 %	25 %	25 %	25 %	452120278
13065	NC_020307	CAG	2	6	734459	734464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120278
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13069	NC_020307	CTGG	2	8	734601	734608	0 %	25 %	50 %	25 %	452120278
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13073	NC_020307	CCAG	2	8	734920	734927	25 %	0 %	25 %	50 %	452120279
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13089	NC_020307	TAT	2	6	735574	735579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120279
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13091	NC_020307	TTACT	2	10	735627	735636	20 %	60 %	0 %	20 %	452120279
13092	NC_020307	AT	3	6	735782	735787	50 %	50 %	0 %	0 %	452120279
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13101	NC_020307	AATT	2	8	736345	736352	50 %	50 %	0 %	0 %	452120280
13102	NC_020307	TCA	2	6	736355	736360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120280
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13109	NC_020307	ACG	2	6	736753	736758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120281
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13362	NC_020307	GCT	2	6	750539	750544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120293
13363	NC_020307	TA	3	6	750586	750591	50 %	50 %	0 %	0 %	452120293
13364	NC_020307	AGA	2	6	750748	750753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120294
13365	NC_020307	TTC	2	6	750768	750773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120294
13366	NC_020307	CCG	2	6	750780	750785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120294
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13368	NC_020307	ATC	2	6	751103	751108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120294
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13372	NC_020307	TGA	2	6	751191	751196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120294
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13481	NC_020307	GC	3	6	757652	757657	0 %	0 %	50 %	50 %	452120301
13482	NC_020307	TAA	2	6	757664	757669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120301
13483	NC_020307	CCA	3	9	757787	757795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120301
13484	NC_020307	CGCC	2	8	757844	757851	0 %	0 %	25 %	75 %	452120301
13485	NC_020307	TGC	2	6	757858	757863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120301
13486	NC_020307	GACG	2	8	757905	757912	25 %	0 %	50 %	25 %	452120301
13487	NC_020307	TTC	2	6	758095	758100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120302
13488	NC_020307	TTC	2	6	758167	758172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120302
13489	NC_020307	CCG	2	6	758176	758181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120302
13490	NC_020307	CGC	2	6	758228	758233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120302
13491	NC_020307	CGC	2	6	758244	758249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120302
13492	NC_020307	TCG	2	6	758269	758274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120302
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