MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020307	GCC	2	6	640545	640550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120195
11502	NC_020307	CCA	2	6	640711	640716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120195
11503	NC_020307	A	7	7	640722	640728	100 %	0 %	0 %	0 %	452120195
11504	NC_020307	CCG	2	6	640741	640746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120195
11505	NC_020307	CGG	2	6	640792	640797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120195
11506	NC_020307	GGC	2	6	640802	640807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120195
11507	NC_020307	GGT	2	6	640838	640843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120195
11508	NC_020307	GC	3	6	640876	640881	0 %	0 %	50 %	50 %	452120195
11509	NC_020307	GGC	2	6	640883	640888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120195
11510	NC_020307	ATGA	2	8	640971	640978	50 %	25 %	25 %	0 %	452120195
11511	NC_020307	TGA	2	6	641036	641041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120195
11512	NC_020307	GTCA	2	8	641064	641071	25 %	25 %	25 %	25 %	452120195
11513	NC_020307	CAA	2	6	641100	641105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120195
11514	NC_020307	AGA	2	6	641120	641125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120195
11515	NC_020307	CGG	2	6	641134	641139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120195
11516	NC_020307	GAA	2	6	641151	641156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120195
11517	NC_020307	CGTTT	2	10	641188	641197	0 %	60 %	20 %	20 %	452120195
11518	NC_020307	CGA	2	6	641212	641217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120195
11519	NC_020307	ATC	2	6	641222	641227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120195
11520	NC_020307	CGC	2	6	641322	641327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120196
11521	NC_020307	TCT	2	6	641443	641448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120196
11522	NC_020307	CGTAAT	2	12	641477	641488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452120196
11523	NC_020307	GGCA	2	8	641538	641545	25 %	0 %	50 %	25 %	452120196
11524	NC_020307	GAC	2	6	641610	641615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120196
11525	NC_020307	CAG	2	6	641706	641711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120196
11526	NC_020307	GATC	2	8	641765	641772	25 %	25 %	25 %	25 %	452120196
11527	NC_020307	GCAA	2	8	641791	641798	50 %	0 %	25 %	25 %	452120196
11528	NC_020307	GCC	2	6	641866	641871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120196
11529	NC_020307	CAGCG	2	10	641883	641892	20 %	0 %	40 %	40 %	452120196
11530	NC_020307	GC	3	6	641900	641905	0 %	0 %	50 %	50 %	452120196
11531	NC_020307	CAC	2	6	641913	641918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120196
11532	NC_020307	CGG	2	6	641957	641962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120196
11533	NC_020307	GC	3	6	642026	642031	0 %	0 %	50 %	50 %	452120196
11534	NC_020307	GTT	2	6	642068	642073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120196
11535	NC_020307	GTTC	2	8	642077	642084	0 %	50 %	25 %	25 %	452120196
11536	NC_020307	GCTG	2	8	642100	642107	0 %	25 %	50 %	25 %	452120196
11537	NC_020307	CG	3	6	642129	642134	0 %	0 %	50 %	50 %	452120196
11538	NC_020307	T	7	7	642211	642217	0 %	100 %	0 %	0 %	452120196
11539	NC_020307	CAG	2	6	642580	642585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120197
11540	NC_020307	GTACG	2	10	642597	642606	20 %	20 %	40 %	20 %	452120197
11541	NC_020307	AAT	2	6	642649	642654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120197
11542	NC_020307	AGA	2	6	642741	642746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120197
11543	NC_020307	CAT	2	6	642774	642779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120197
11544	NC_020307	TTA	2	6	642798	642803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120197
11545	NC_020307	TC	4	8	642807	642814	0 %	50 %	0 %	50 %	452120197
11546	NC_020307	GGCG	2	8	642816	642823	0 %	0 %	75 %	25 %	452120197
11547	NC_020307	GCGG	2	8	642942	642949	0 %	0 %	75 %	25 %	452120197
11548	NC_020307	ACG	2	6	643010	643015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120197
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11550	NC_020307	TGA	2	6	643101	643106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120197
11551	NC_020307	CGC	2	6	643190	643195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120197
11552	NC_020307	ATG	2	6	643225	643230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120197
11553	NC_020307	CGC	2	6	643276	643281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120197
11554	NC_020307	TGA	2	6	643344	643349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120197
11555	NC_020307	GC	3	6	643369	643374	0 %	0 %	50 %	50 %	452120197
11556	NC_020307	GTC	2	6	643418	643423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120197
11557	NC_020307	CAG	2	6	643537	643542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120197
11558	NC_020307	ATCC	2	8	643600	643607	25 %	25 %	0 %	50 %	452120197
11559	NC_020307	CGA	2	6	643611	643616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120197
11560	NC_020307	TTC	2	6	643676	643681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120197
11561	NC_020307	GAA	2	6	643822	643827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120197
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11564	NC_020307	GAA	2	6	643969	643974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120198
11565	NC_020307	GCCGC	2	10	644002	644011	0 %	0 %	40 %	60 %	452120198
11566	NC_020307	CGG	3	9	644127	644135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120198
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11568	NC_020307	CGG	3	9	644229	644237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120198
11569	NC_020307	GCC	2	6	644262	644267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120198
11570	NC_020307	GCGCG	2	10	644292	644301	0 %	0 %	60 %	40 %	452120198
11571	NC_020307	GTG	2	6	644305	644310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120198
11572	NC_020307	CGCTG	2	10	644412	644421	0 %	20 %	40 %	40 %	452120198
11573	NC_020307	GGC	2	6	644452	644457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120198
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11578	NC_020307	CGT	2	6	644742	644747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120198
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11583	NC_020307	GCG	2	6	644892	644897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120198
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11585	NC_020307	CGA	2	6	644943	644948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120198
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11588	NC_020307	GCA	2	6	645015	645020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120198
11589	NC_020307	GTAT	2	8	645120	645127	25 %	50 %	25 %	0 %	452120198
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11591	NC_020307	CG	3	6	645242	645247	0 %	0 %	50 %	50 %	452120198
11592	NC_020307	TGC	2	6	645251	645256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120198
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11594	NC_020307	TTA	2	6	645650	645655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120199
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11598	NC_020307	CAAT	2	8	645784	645791	50 %	25 %	0 %	25 %	452120199
11599	NC_020307	GCG	2	6	645821	645826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120199
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11602	NC_020307	ACG	3	9	646000	646008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120199
11603	NC_020307	ACG	2	6	646072	646077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120199
11604	NC_020307	GGCGC	2	10	646140	646149	0 %	0 %	60 %	40 %	452120199
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11609	NC_020307	TAC	2	6	646311	646316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120199
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11620	NC_020307	CGG	2	6	647013	647018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120199
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11981	NC_020307	ATG	2	6	669716	669721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120223
11982	NC_020307	AGC	2	6	669751	669756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120223
11983	NC_020307	GC	3	6	669767	669772	0 %	0 %	50 %	50 %	452120223
11984	NC_020307	GGA	2	6	669774	669779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120223
11985	NC_020307	AGG	2	6	669845	669850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120223
11986	NC_020307	GGT	2	6	669984	669989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120223
11987	NC_020307	TGA	3	9	670005	670013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120223
11988	NC_020307	TCC	2	6	670060	670065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120223
11989	NC_020307	CGGG	2	8	670083	670090	0 %	0 %	75 %	25 %	452120223
11990	NC_020307	CAT	2	6	670245	670250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120223
11991	NC_020307	GCA	3	9	670414	670422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120224
11992	NC_020307	ACG	2	6	670438	670443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120224
11993	NC_020307	CATT	2	8	670457	670464	25 %	50 %	0 %	25 %	452120224
11994	NC_020307	T	6	6	670687	670692	0 %	100 %	0 %	0 %	452120225
11995	NC_020307	ATC	2	6	670712	670717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120225
11996	NC_020307	A	6	6	670746	670751	100 %	0 %	0 %	0 %	452120225
11997	NC_020307	TTGG	2	8	670776	670783	0 %	50 %	50 %	0 %	452120225
11998	NC_020307	AATT	2	8	670884	670891	50 %	50 %	0 %	0 %	452120226
11999	NC_020307	CT	3	6	670893	670898	0 %	50 %	0 %	50 %	452120226
12000	NC_020307	CAA	2	6	670964	670969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120226

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