MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020307	T	7	7	610628	610634	0 %	100 %	0 %	0 %	452120169
11003	NC_020307	ATCTT	2	10	610647	610656	20 %	60 %	0 %	20 %	452120169
11004	NC_020307	CTG	2	6	610774	610779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120169
11005	NC_020307	CGT	2	6	610846	610851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120169
11006	NC_020307	GCTTCA	2	12	610860	610871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452120169
11007	NC_020307	TCTGAA	2	12	610899	610910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452120169
11008	NC_020307	AAT	2	6	611173	611178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120170
11009	NC_020307	AAT	2	6	611185	611190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120170
11010	NC_020307	TAT	2	6	611233	611238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120170
11011	NC_020307	T	6	6	611420	611425	0 %	100 %	0 %	0 %	452120171
11012	NC_020307	GCAAG	2	10	611459	611468	40 %	0 %	40 %	20 %	452120171
11013	NC_020307	CCAGCG	2	12	611609	611620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452120171
11014	NC_020307	CGG	2	6	611641	611646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120171
11015	NC_020307	GGCTTC	2	12	611775	611786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120171
11016	NC_020307	GC	3	6	611816	611821	0 %	0 %	50 %	50 %	452120171
11017	NC_020307	CAT	3	9	611856	611864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120171
11018	NC_020307	GCG	2	6	611930	611935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120171
11019	NC_020307	GCC	2	6	611952	611957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120171
11020	NC_020307	CCAGAA	2	12	611981	611992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452120171
11021	NC_020307	CGC	2	6	612062	612067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120171
11022	NC_020307	GATT	2	8	612078	612085	25 %	50 %	25 %	0 %	452120171
11023	NC_020307	GCG	2	6	612157	612162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120171
11024	NC_020307	CCG	2	6	612218	612223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120171
11025	NC_020307	CG	3	6	612260	612265	0 %	0 %	50 %	50 %	452120171
11026	NC_020307	GGT	2	6	612363	612368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120171
11027	NC_020307	CCG	2	6	612391	612396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120171
11028	NC_020307	CAG	2	6	612456	612461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120171
11029	NC_020307	TGC	2	6	612560	612565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120171
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11031	NC_020307	CAT	2	6	612636	612641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120171
11032	NC_020307	GCA	2	6	612734	612739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120171
11033	NC_020307	CTGG	2	8	612790	612797	0 %	25 %	50 %	25 %	452120171
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11039	NC_020307	CGGCG	2	10	613041	613050	0 %	0 %	60 %	40 %	452120171
11040	NC_020307	CGG	2	6	613062	613067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120171
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11042	NC_020307	TGCC	2	8	613137	613144	0 %	25 %	25 %	50 %	452120171
11043	NC_020307	TGC	2	6	613172	613177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120171
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11052	NC_020307	ATT	2	6	613638	613643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120171
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11054	NC_020307	TCA	2	6	613753	613758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120171
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11056	NC_020307	ACGC	2	8	613822	613829	25 %	0 %	25 %	50 %	452120171
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11059	NC_020307	ATT	2	6	613899	613904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120171
11060	NC_020307	TCA	2	6	613925	613930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120171
11061	NC_020307	GC	3	6	613955	613960	0 %	0 %	50 %	50 %	452120171
11062	NC_020307	CAT	2	6	614133	614138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120171
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11064	NC_020307	ATA	2	6	614169	614174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120171
11065	NC_020307	GC	3	6	614339	614344	0 %	0 %	50 %	50 %	452120171
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11083	NC_020307	GC	3	6	615422	615427	0 %	0 %	50 %	50 %	452120172
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11099	NC_020307	GC	3	6	616335	616340	0 %	0 %	50 %	50 %	452120174
11100	NC_020307	AAC	2	6	616460	616465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120174
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11120	NC_020307	TGG	2	6	617974	617979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120175
11121	NC_020307	GCCGG	2	10	618171	618180	0 %	0 %	60 %	40 %	452120175
11122	NC_020307	CG	3	6	618418	618423	0 %	0 %	50 %	50 %	452120175
11123	NC_020307	TGAT	2	8	618430	618437	25 %	50 %	25 %	0 %	452120175
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11133	NC_020307	TGG	2	6	619017	619022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120175
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11151	NC_020307	TGG	2	6	620266	620271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120177
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11230	NC_020307	CGC	3	9	624213	624221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120180
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11232	NC_020307	CCGC	2	8	624289	624296	0 %	0 %	25 %	75 %	452120180
11233	NC_020307	TGG	2	6	624309	624314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120180
11234	NC_020307	A	7	7	624315	624321	100 %	0 %	0 %	0 %	452120180
11235	NC_020307	A	6	6	624355	624360	100 %	0 %	0 %	0 %	452120180
11236	NC_020307	AAG	2	6	624373	624378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120180
11237	NC_020307	A	6	6	624385	624390	100 %	0 %	0 %	0 %	452120180
11238	NC_020307	CGC	2	6	624661	624666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120180
11239	NC_020307	GCT	2	6	624677	624682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120180
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11351	NC_020307	CCAG	2	8	631026	631033	25 %	0 %	25 %	50 %	452120186
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11359	NC_020307	TGC	2	6	631338	631343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120187
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11361	NC_020307	T	7	7	631529	631535	0 %	100 %	0 %	0 %	452120187
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11483	NC_020307	GCG	2	6	639867	639872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120195
11484	NC_020307	ATGAA	2	10	639892	639901	60 %	20 %	20 %	0 %	452120195
11485	NC_020307	GAT	2	6	639990	639995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120195
11486	NC_020307	AAC	2	6	640117	640122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120195
11487	NC_020307	ACT	2	6	640184	640189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120195
11488	NC_020307	ATG	2	6	640224	640229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120195
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11490	NC_020307	GCA	2	6	640313	640318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120195
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11492	NC_020307	GTC	2	6	640396	640401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120195
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11500	NC_020307	CAG	2	6	640536	640541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120195

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