MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020307	ATT	2	6	552644	552649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120107
10002	NC_020307	CGC	2	6	552671	552676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120107
10003	NC_020307	CCG	2	6	552680	552685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120107
10004	NC_020307	CGC	2	6	552686	552691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120107
10005	NC_020307	CCGT	2	8	552712	552719	0 %	25 %	25 %	50 %	452120107
10006	NC_020307	GCC	2	6	552729	552734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120107
10007	NC_020307	CAGCA	2	10	552825	552834	40 %	0 %	20 %	40 %	452120107
10008	NC_020307	T	7	7	552842	552848	0 %	100 %	0 %	0 %	452120107
10009	NC_020307	ATA	2	6	552862	552867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120107
10010	NC_020307	AGC	2	6	553150	553155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120108
10011	NC_020307	GA	3	6	553223	553228	50 %	0 %	50 %	0 %	452120108
10012	NC_020307	AGGGAT	2	12	553238	553249	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452120108
10013	NC_020307	CA	3	6	553251	553256	50 %	0 %	0 %	50 %	452120108
10014	NC_020307	CAT	2	6	553332	553337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120108
10015	NC_020307	GCCA	2	8	553367	553374	25 %	0 %	25 %	50 %	452120108
10016	NC_020307	T	7	7	553451	553457	0 %	100 %	0 %	0 %	452120108
10017	NC_020307	CCA	2	6	553468	553473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120108
10018	NC_020307	TGA	2	6	553532	553537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120108
10019	NC_020307	TGC	3	9	553583	553591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120108
10020	NC_020307	GGC	2	6	553632	553637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120108
10021	NC_020307	TCA	2	6	553673	553678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120108
10022	NC_020307	ACC	2	6	553837	553842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120108
10023	NC_020307	ATTG	2	8	553852	553859	25 %	50 %	25 %	0 %	452120108
10024	NC_020307	GCTCT	2	10	554026	554035	0 %	40 %	20 %	40 %	452120109
10025	NC_020307	CAA	2	6	554077	554082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120109
10026	NC_020307	TGCG	2	8	554104	554111	0 %	25 %	50 %	25 %	452120109
10027	NC_020307	T	7	7	554270	554276	0 %	100 %	0 %	0 %	452120110
10028	NC_020307	CGG	2	6	554312	554317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120110
10029	NC_020307	T	6	6	554362	554367	0 %	100 %	0 %	0 %	452120110
10030	NC_020307	TCT	2	6	554380	554385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120110
10031	NC_020307	GTT	2	6	554474	554479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120110
10032	NC_020307	GAA	2	6	554551	554556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120110
10033	NC_020307	ATC	2	6	554571	554576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120110
10034	NC_020307	ATCG	2	8	554670	554677	25 %	25 %	25 %	25 %	452120110
10035	NC_020307	GCG	2	6	554888	554893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120110
10036	NC_020307	CGC	2	6	554951	554956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120110
10037	NC_020307	CCAG	2	8	555026	555033	25 %	0 %	25 %	50 %	452120110
10038	NC_020307	A	6	6	555068	555073	100 %	0 %	0 %	0 %	452120110
10039	NC_020307	GCC	2	6	555090	555095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120110
10040	NC_020307	CTGTC	2	10	555145	555154	0 %	40 %	20 %	40 %	452120110
10041	NC_020307	G	6	6	555161	555166	0 %	0 %	100 %	0 %	452120110
10042	NC_020307	C	6	6	555310	555315	0 %	0 %	0 %	100 %	452120110
10043	NC_020307	TCC	2	6	555337	555342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120110
10044	NC_020307	TAA	2	6	555488	555493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120110
10045	NC_020307	TTC	2	6	555576	555581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120110
10046	NC_020307	T	6	6	555619	555624	0 %	100 %	0 %	0 %	452120110
10047	NC_020307	TTA	2	6	555646	555651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120110
10048	NC_020307	CATTGC	2	12	555710	555721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452120110
10049	NC_020307	A	7	7	555723	555729	100 %	0 %	0 %	0 %	452120110
10050	NC_020307	ATAA	2	8	555772	555779	75 %	25 %	0 %	0 %	452120110
10051	NC_020307	AG	3	6	555921	555926	50 %	0 %	50 %	0 %	452120110
10052	NC_020307	CCTGCG	2	12	555929	555940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	452120110
10053	NC_020307	TTA	2	6	555997	556002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120110
10054	NC_020307	TAC	2	6	556023	556028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120110
10055	NC_020307	CAA	2	6	556047	556052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120110
10056	NC_020307	CAG	2	6	556059	556064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120110
10057	NC_020307	T	6	6	556127	556132	0 %	100 %	0 %	0 %	452120110
10058	NC_020307	GA	3	6	556156	556161	50 %	0 %	50 %	0 %	452120110
10059	NC_020307	TCA	2	6	556238	556243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120110
10060	NC_020307	AAT	2	6	556524	556529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120111
10061	NC_020307	GTACC	2	10	556610	556619	20 %	20 %	20 %	40 %	452120111
10062	NC_020307	ACC	2	6	556716	556721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120111
10063	NC_020307	AAT	2	6	556734	556739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120111
10064	NC_020307	TGA	2	6	556895	556900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120111
10065	NC_020307	CAG	2	6	556908	556913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120111
10066	NC_020307	CAAGAC	2	12	556973	556984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452120111
10067	NC_020307	CGA	2	6	557032	557037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120111
10068	NC_020307	CAG	2	6	557148	557153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120111
10069	NC_020307	CG	4	8	557234	557241	0 %	0 %	50 %	50 %	452120111
10070	NC_020307	GCG	2	6	557254	557259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120111
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10072	NC_020307	ATG	3	9	557379	557387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120111
10073	NC_020307	CACT	2	8	557392	557399	25 %	25 %	0 %	50 %	452120111
10074	NC_020307	CTG	2	6	557433	557438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120111
10075	NC_020307	CCAG	2	8	557480	557487	25 %	0 %	25 %	50 %	452120111
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10081	NC_020307	GC	3	6	557617	557622	0 %	0 %	50 %	50 %	452120111
10082	NC_020307	GCA	2	6	557654	557659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120111
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10087	NC_020307	GGC	2	6	558038	558043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120111
10088	NC_020307	CTT	2	6	558068	558073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120111
10089	NC_020307	CGC	2	6	558089	558094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120111
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10091	NC_020307	GAT	2	6	558131	558136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120111
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10093	NC_020307	CGA	2	6	558257	558262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120111
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10097	NC_020307	GC	3	6	558376	558381	0 %	0 %	50 %	50 %	452120111
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10102	NC_020307	AACG	2	8	558720	558727	50 %	0 %	25 %	25 %	452120112
10103	NC_020307	GTC	3	9	558730	558738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120112
10104	NC_020307	TGA	2	6	558753	558758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120112
10105	NC_020307	GGTTG	2	10	558779	558788	0 %	40 %	60 %	0 %	452120112
10106	NC_020307	GGC	2	6	558805	558810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120112
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10116	NC_020307	CG	3	6	559052	559057	0 %	0 %	50 %	50 %	452120112
10117	NC_020307	CACG	2	8	559095	559102	25 %	0 %	25 %	50 %	452120112
10118	NC_020307	CGC	2	6	559129	559134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120112
10119	NC_020307	TGAT	2	8	559169	559176	25 %	50 %	25 %	0 %	452120112
10120	NC_020307	CT	4	8	559301	559308	0 %	50 %	0 %	50 %	452120112
10121	NC_020307	GCG	2	6	559329	559334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120112
10122	NC_020307	CG	3	6	559340	559345	0 %	0 %	50 %	50 %	452120112
10123	NC_020307	ATA	2	6	559348	559353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120112
10124	NC_020307	GCG	2	6	559385	559390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120112
10125	NC_020307	ATCG	2	8	559548	559555	25 %	25 %	25 %	25 %	452120112
10126	NC_020307	GAC	2	6	559598	559603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120112
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10232	NC_020307	CCA	2	6	566416	566421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120118
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10234	NC_020307	TTGC	2	8	566675	566682	0 %	50 %	25 %	25 %	452120119
10235	NC_020307	A	7	7	566711	566717	100 %	0 %	0 %	0 %	452120119
10236	NC_020307	CT	3	6	566765	566770	0 %	50 %	0 %	50 %	452120119
10237	NC_020307	GGAACG	2	12	566808	566819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452120119
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10239	NC_020307	A	7	7	566948	566954	100 %	0 %	0 %	0 %	452120119
10240	NC_020307	ACT	2	6	566984	566989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120119
10241	NC_020307	CTTT	2	8	567450	567457	0 %	75 %	0 %	25 %	452120120
10242	NC_020307	TCG	2	6	567479	567484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120120
10243	NC_020307	CT	3	6	567595	567600	0 %	50 %	0 %	50 %	452120120
10244	NC_020307	TCC	2	6	567670	567675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452120120
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10250	NC_020307	CTG	2	6	567827	567832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120120
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10265	NC_020307	TTG	2	6	569429	569434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120122
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10272	NC_020307	AT	3	6	569744	569749	50 %	50 %	0 %	0 %	452120123
10273	NC_020307	AATT	2	8	569805	569812	50 %	50 %	0 %	0 %	452120123
10274	NC_020307	ACT	2	6	569819	569824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120123
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10345	NC_020307	CTTC	2	8	574019	574026	0 %	50 %	0 %	50 %	452120127
10346	NC_020307	TGG	2	6	574049	574054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120127
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10481	NC_020307	GCG	2	6	581308	581313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120136
10482	NC_020307	CGAAG	2	10	581680	581689	40 %	0 %	40 %	20 %	452120137
10483	NC_020307	TGT	2	6	581694	581699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120137
10484	NC_020307	GAA	2	6	581713	581718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120137
10485	NC_020307	GGCGC	2	10	581863	581872	0 %	0 %	60 %	40 %	452120137
10486	NC_020307	GCA	2	6	581919	581924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120137
10487	NC_020307	GCT	2	6	581937	581942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120137
10488	NC_020307	TAC	2	6	581967	581972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120137
10489	NC_020307	GCG	2	6	582019	582024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120137
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10491	NC_020307	CG	3	6	582103	582108	0 %	0 %	50 %	50 %	452120137
10492	NC_020307	GGC	2	6	582168	582173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120137
10493	NC_020307	CGC	2	6	582240	582245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120137
10494	NC_020307	AGT	2	6	582304	582309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120137
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10496	NC_020307	GGCGCT	2	12	582378	582389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452120137
10497	NC_020307	TGGC	2	8	582517	582524	0 %	25 %	50 %	25 %	452120137
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10499	NC_020307	CAG	2	6	582605	582610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120138
10500	NC_020307	CGG	2	6	582652	582657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120138

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